Durante la diferenciación testicular de la célula de germen, la estructura de la cromatina nuclear cambia dinámicamente. A continuación se describe un método diseñado para preservar la disposición tridimensional de la cromatina de las células germinales testiculares que se encuentran en ratones; este método se ha denominado como el método de diapositiva tridimensional (3D). En este método, los túbulos testiculares se tratan directamente con un paso de permeabilización que elimina el material citoplasmático, seguido de un paso de fijación que fija los materiales nucleares. Los túbulos se disocian, la suspensión celular es citospun, y las células se adhieren a los portaobjetos. Este método mejora la sensibilidad hacia la detección de estructuras subnucleares y es aplicable para la inmunofluorescencia, el ADN y la hibridación in situ de fluorescencia de ARN (FISH) y la combinación de estos métodos de detección. Como ejemplo de una posible aplicación del método de deslizamiento 3D, se muestra que un COT-1 RNA FISH detecta ARN nacientes. El método de deslizamiento 3D facilitará el examen detallado de las relaciones espaciales entre la estructura de la cromatina, el ADN y el ARN durante la diferenciación testicular de las células germinativas.