La producción de biocombustibles a partir de biomasa lignocelulósica es altamente deseable debido a su abundancia actual en los EE.UU. 1, y en el caso de la cosecha sostenible de los residuos agrícolas y forestales, la capacidad de no competir directamente por las tierras de cultivo utilizado para la alimentación animal y la producción de piensos. Sin embargo, a diferencia de grano de maíz, que es la principal fuente de biocombustible se está generando en los EE.UU., los materiales lignocelulósicos son significativamente más complejo y difícil de romper. Además de la hidratos de carbono de cadena larga, celulosa y hemicelulosa, que son las principales fuentes de azúcares durante la fermentación de materiales lignocelulósicos, muchos tipos de paredes de células vegetales también contienen lignina, un polímero de fenilpropanoides que proporciona fuerza, la defensa contra el ataque de patógenos, y la hidrofobicidad a las paredes celulares. Mientras que es necesario para el crecimiento vegetal y la supervivencia, la lignina también presenta una barrera significativa para la conversión enzimática con éxito de la celulosa y hemicelluperder a los azúcares solubles. Los materiales con alto contenido de lignina son generalmente materiales menos deseables, tanto para el biocombustible (a través de las vías de conversión biológica) y las industrias de pulpa y papel, debido a los impactos negativos sobre las características de procesamiento y la calidad del producto. Por lo tanto, la manipulación genética de los materiales vegetales para la reducción de la lignina en un nivel que no interfiera con la resistencia estructural de los cultivos y los sistemas de defensa podría ser importante para la reducción de los costos de producción, tanto para el biocombustible lignocelulósico y las industrias de pulpa y papel.
En el maíz (Zea mays), la lignina es covalentemente reticulado para la hemicelulosa en la pared celular primaria a través de ferulato y puentes diferulato 2. El complejo lignina-hemicelulosa se une a las microfibrillas de celulosa a través de enlaces de hidrógeno, formando una matriz compleja que confiere la integridad y la fuerza a la pared celular secundaria. La resistencia mecánica de las paredes celulares de la planta está determinada en gran medida por el tipo de Lignin subunidades 3-5. En estudios anteriores, la alteración de las proporciones de las subunidades de lignina ha mostrado ninguna tendencia clara en la digestibilidad enzimática 6-11. Sin embargo, las reducciones en el contenido de lignina en general, muestran una mejora en las conversiones de 12,13 y pueden ser una clave para el aumento de la digestibilidad de la materia vegetal por las enzimas hidrolíticas incluyendo endocellulases, celobiohidrolasas, y β-glucosidasas 14.
La ingeniería genética de regular el nivel de expresión de las transcripciones ha sido ampliamente practicada para mejorar características de los cultivos. Las técnicas avanzadas, incluyendo anti-sentido 15 y cosupresión 16 tecnologías, permiten efectiva la baja regulación de los genes diana. Completar gen knock-out también se ha conseguido utilizando construcciones de genes que codifican ARN intrón-empalmado con una estructura de horquilla 17. Además, una interferencia de ARN de doble cadena técnica (dsRNAi), es decir, un medio de expresión génica potente y eficazTor que funciona por cualquiera de focalización degradación de transcripción o traducción represión, proporciona un potente medio para inducir una amplia gama de efectos de supresión en el ARNm diana 18. Técnicas de silenciamiento génico muestran varias limitaciones. Estas técnicas no regulan con precisión el nivel de la transcripción y que podría causar efectos de silenciamiento inesperadas en otros genes homólogos.
En este método, hemos empleado el bombardeo de partículas para llevar a la dsRNAi construye en el genoma de maíz. Hasta la fecha, una gran variedad de especies de plantas se han transformado con éxito utilizando bombardeo de partículas, transformación mediada por Agrobacterium, electroporación, y los métodos de microinyección. En la transformación genética del maíz, el método de bombardeo de partículas es ventajoso con respecto a todos los otros métodos, ya que es el más eficiente. El bombardeo de partículas no depende de las bacterias, por lo que el método es libre de limitaciones biológicas, tales como el tamaño de los genes, especies de gen oigin, o el genotipo de la planta. El sistema de suministro de transgén física permite ADN de alto peso molecular y múltiples genes a ser introducidos en los genomas de plantas y en ciertos casos en los cloroplastos en alta eficiencia de transformación 19. La reducción de la lignina en el sistema vascular de la hoja de nervadura puede ser visualizado a través de microscopía electrónica de barrido (SEM) que es beneficioso para el examen de la topografía y la composición de las muestras.
En las plantas de maíz, dos de la reductasa de cinamoílo-CoA reductasa (ZmCCR1: X98083 y ZmCCR2: Y15069) se encontraron genes en el genoma del maíz 20. Cinamoil-CoA reductasa cataliza la conversión de los ésteres hidroxicinamoil-CoA reductasa en aldehídos de cinamilo. Elegimos el gen ZmCCR1 para regular a la baja esta enzima debido a que el gen se expresa en todos los tejidos lignifying. Los 523 nucleótidos en el extremo 3 'del gen ZmCCR1 se eligieron para un dsRNAi construir porque las secuencias parecían sermás diversa en comparación con los de ZmCCR2. Por lo tanto, la construcción dsRNAi ataría precisamente sólo para ZmCCR1, evitando fuera del objetivo silenciar a 21. Una construcción ZmCCR1_RNAi fue diseñado en el sistema de expresión citoplásmica ImpactVector1.1-tag (IV 1,1) que contiene el promotor específico de tejido verde, ribulosa-1, carboxilasa oxigenasa 5-bifosfato-carboxilasa/oxigenasa (RuBisCO).
Para estudiar los efectos de la dsRNAi construir en plantas transgénicas, se cuantificó el contenido de lignina. La medición de lignina Klason (insoluble en ácido) es conocido por ser más precisa en comparación con los métodos de cuantificación de lignina detergente ácido que solubilizan algunos de la lignina 22. Por lo tanto, la lignina Klason se midió en tallos de maíz transgénicas. Este procedimiento consiste en una hidrólisis ácida de dos pasos que convierte los carbohidratos poliméricos solubles en monosacáridos 23. A continuación, la biomasa hidrolizada se fraccionó en ácido Materi soluble e insolubleALS y la lignina insoluble en ácido se midió de acuerdo con estudios anteriores 23,24. Idealmente, el análisis de lignina debe incluir extracciones con agua y etanol antes de la etapa de hidrólisis, con el fin de eliminar los materiales solubles que pueden interferir con los resultados, y una combustión después de la hidrólisis del residuo de lignina para dar cuenta de cualquier ceniza presente en el residuo. Sin estos pasos, el contenido de lignina de la muestra podría ser inflado artificialmente. El método de integración global se presenta aquí, sin embargo, para nuestros experimentos hemos podido llevar a cabo estos dos pasos debido al pequeño volumen de material disponible para la prueba
También se analizaron otros dos componentes de la pared celular, la celulosa y la hemicelulosa en la lignina líneas de maíz transgénico-hacia abajo regulado. Se ha informado de que las plantas transgénicas que han sido regulados hacia abajo, ya sea en su fenilalanina amoníaco-liasa (PAL) 25, 4-cumarato: CoA ligasa (4CL) 26, o una de cinamilodeshidrogenasa l alcohol (CAD) 27 muestran un aumento de otros componentes estructurales de la pared celular. Como un primer paso en nuestros estudios, celulosa cristalina se midió utilizando el método Updegraff 28. Este método fue ideado originalmente para la determinación de la celulosa en un gran número de bacterias celulolíticas y hongos. Brevemente, las existencias de maíz molidos fueron tratados con Updegraff reactivo (ácido acético: ácido nítrico: agua) para eliminar la hemicelulosa, lignina, y xylosans. La celulosa cristalina fue completamente hidrolizada en glucosa a través de Saeman hidrólisis mediante la adición de H 2 SO 4. A continuación, la celulosa cristalina se ensayó usando el método colorimétrico de antrona 29. Para verificar si se cambiaron el contenido de hemicelulosa, los extractos de monosacáridos de tallos molidos se hidroliza usando ácido trifluoroacético, derivatizados utilizando el método del acetato de alditol y se analizaron por cromatografía de gases (GC) 30. Los procedimientos detallados para cel cristalinaanálisis de composición de contenido lulosa y de la matriz de polisacáridos se describen en Foster et al. (2010) 31.
A continuación, describimos los procedimientos utilizados para la lignina baja regulación en el maíz a través de una tecnología de RNAi, la transformación por bombardeo de partículas, y el análisis de la lignina para la deconstrucción acelerada de maíz de biomasa lignocelulósica en azúcares fermentables para los biocombustibles.