El pH intracelular está estrechamente regulado y se han reportado diferencias en el pH entre el citoplasma y los orgánulos1. La regulación del pH celular es crucial para el control homeostático de los procesos fisiológicos que incluyen: síntesis de proteínas, ADN y ARN, tráfico vesicular, crecimiento celular y división celular. Las alteraciones en la homeostasis del pH celular pueden conducir a cambios funcionales perjudiciales y promover la progresión de diversas enfermedades2. Existen varios métodos para medir el pH intracelular, pero muy pocos de ellos permiten la medición simultánea del pH en el citoplasma y en los orgánulos. En este trabajo describimos en detalle un método rápido y preciso para la medición simultánea del pH citoplasmático y orgonelar mediante el uso de microscopía confocal en células vivas3. Este objetivo se logra con el uso de dos tintes radiométricos sensibles al pH que poseen una partición selectiva del compartimento celular. Por ejemplo, SNARF-1 está compartimentado dentro del citoplasma, mientras que HPTS está compartimentado dentro de orgánulos endosómicos/lisosomales. Aunque el HPTS se usa comúnmente como un indicador de pH citoplasmático, este colorante puede marcar específicamente vesículas a lo largo de la vía endosómica-lisosomal después de ser absorbido por la pinocitosis3,4. Con el uso de estas sondas sensibles al pH, es posible medir simultáneamente el pH dentro de los compartimentos endocítico y citoplasmático. La longitud de onda de excitación óptima de HPTS varía en función del pH, mientras que para SNARF-1, es la longitud de onda de emisión óptima la que varía. Después de la carga con SNARF-1 y HPTS, las células se cultivan en diferentes soluciones calibradas con pH para construir una curva estándar de pH para cada sonda. La obtención de imágenes celulares por microscopía confocal permite la eliminación de artefactos y ruido de fondo. Debido a las propiedades espectrales del HPTS, esta sonda es más adecuada para la medición del compartimento endosomal ligeramente ácido o para demostrar la alcalinización de los orgánulos endosómicos/lisosomales. Este método simplifica el análisis de datos, mejora la precisión de las mediciones de pH y se puede utilizar para abordar preguntas fundamentales relacionadas con la modulación del pH durante las respuestas celulares a desafíos externos.