Desarrollo de un tallo robótico plataforma de cultivo celular placa basada.
La demanda de iPSCs está creciendo debido a su utilidad en el desarrollo de fármacos y la medicina regenerativa. Sin embargo, la producción escalable se ha centrado en el cultivo en suspensión 32 en un equipo relativamente complejo que excluye a muchos investigadores y se aparta de los métodos de cultivo adherentes establecidos. En lugar de alterar drásticamente madre basada métodos de cultivo de células de la placa probada, como el cambio a un cultivo en suspensión o utilizando un microsoporte, nos centramos en la miniaturización y automatización de nuestras técnicas de cultivo de IPSC adherentes existentes. El primer objetivo era automatizar la alimentación y pases para normalizar todo el proceso de cultivo. También se requiere una plataforma capaz de rápida hasta la escala con la tecnología existente. Para alcanzar estos objetivos se ideó un método para cultivar células madre en una placa de 96 pocillos utilizando un sistema automatizado de tratamiento de líquidos (Figura 1). El protPROTOCOLOS desarrollados aquí con el robot de manejo de líquidos para la alimentación y el paso no requieren una etapa de centrifugación o un control continuo por un técnico. Estos protocolos se desarrollaron con dos alimentadores gratuitas líneas IPSC; uno derivado de fibroblastos y el otro a partir de células adiposas 33.
El sistema de manejo de líquidos controlados por computadora (Figura 1) consiste en una plataforma que se mueve adelante y atrás. La cama tiene nueve, unos huecos numerados 5 x 3,3 pulgadas con pinzas de retención de aceptar placas de cultivo celular estándar, depósitos de líquidos y otros hardware personalizado presión. La cabeza se mueve de pipeta de izquierda a derecha (perpendicular al movimiento de la cama), así como arriba y abajo. Junto con la cama, la cabeza de la pipeta puede ser programado para eliminar o entregar los medios de comunicación en cualquier lugar en la cama después de recoger las puntas de pipeta de un estante rellenable. Si es necesario, cada uno de los 96 pocillos se puede mantener separado para eliminar la contaminación cruzada. En la presente configuración, 0 a200 l de los medios de comunicación se pueden mover por cada punta de la cabeza de la pipeta, pero otros rangos de volumen son posibles en función del tamaño de punta.
Cuando pases las células madre en placas estándar, enzimática o la disociación química normalmente requiere la incubación a 37 ° C. Las pruebas iniciales confirmó disociación con un reactivo de disociación proteolítica y colagenolítica o un reactivo de base EDTA obtenido mejores resultados a 37 ° C que RT tanto para el tiempo a la disociación y la homogeneidad del tamaño de la colonia producido para nuestros dos de 96 pocillos líneas de IPSC (datos no mostrados). Para automatizar el proceso de división y evitar platos que entran y salen de una incubadora, rampas inclinadas, con temperatura controlada y reproducible que acepten colocar placas de cultivo estándar se construyeron (Figura 1). Cuando las rampas se calentaron a 37 ° C, un reactivo de disociación proteolítica y colagenolítica o EDTA basado disociación de las células iPS de placas de 96 pocillos fue comparable a las placas colocadas en una incubadora a 37ºC (datos nmuestra ot). Las rampas inclinadas también se utilizaron para permitir puntas de pipeta para recoger el contenido de toda una pocillos (menos de 5 ul volumen residual) al alcanzar el punto más bajo en el pozo mientras que la aspiración de una placa plana dejó un volumen residual de aproximadamente 10 a 15 l, lo que resulta en la pérdida de células. La rampa inclinada también permitió a los pozos para lavar (trituran) expulsando medios de comunicación en la parte superior de la pendiente y así para recoger al fondo.
Robotic cultura de células madre en el formato de placa de 96 pocillos; alimentación y pases.
Cultura de iPSCs utilizando el sistema de manejo de líquidos robótico tiene dos fases; pasaje y la alimentación. Cuando una colonia está listo para el paso, se divide en una relación predeterminada a las semillas de una nueva placa que se alimenta entonces a intervalos regulares hasta que está listo para pasaje de nuevo (Figura 1B). Cultivos congelados o no de 96 pocillos se pueden iniciar en el formato de 96 pocillos y entran de inmediato el paso / alimentaciónciclo. Las células que no se utilizan para mantener la colonia, que es la mayoría de una placa, se cosechan para otros usos y representan la componente de producción de este sistema.
La alimentación de 96 pocillos iPSCs cultivadas se logra cuando todos o algunos de los medios de comunicación se retira después de un período de la cultura y depositado en un depósito de residuos. Entonces se dividió en alícuotas medio fresco a la misma placa. El robot puede usar los nuevos consejos y valles medios para segregar todos los pozos para la alimentación totalmente personalizable, incluyendo la mezcla de medio condicionado con nuevos medios de comunicación.
Pasaje típico de células madre requiere un método de disociación y, a menudo una etapa de centrifugación. Los protocolos descritos aquí tiene como objetivo normalizar la disociación y eliminar la centrifugación. El protocolo pasaje comienza cuando el robot entrega reactivo de disociación a placas de 96 pocillos montado sobre 37 ° C rampas inclinadas. Después de un tiempo predeterminado, las células disociadas se recogen con una acción de lavado, donde el usuario tiene control sobre la posición, la repetición, el volumen y la velocidad de trituración. Enzyme tiempo, la tasa de trituración y el número de repeticiones de trituración fueron suficientes para variar tamaño de la colonia disociado y la homogeneidad (Figura 2), pero cada parámetro es ajustable para adaptarse a los requisitos de una línea celular dada. Este control elimina la variabilidad introducida por los técnicos que pipeta con tasas diferentes, posiciones y repeticiones. Una vez que las células disociadas se recogen y se agruparon en un depósito con medio fresco, se distribuyen a una nueva placa. Para evitar centrifugación y siembra problemas de degradación del sustrato o la muerte celular debido a la acción de la enzima, el reactivo de disociación se diluyó hasta el punto mínimo de la disociación aceptable que resultó en la siembra fiable. Esta técnica era eficaz para un reactivo de disociación proteolítica y colagenolítica en medio mTeSR1 34, que tiene un contenido relativamente alto de proteína, pero también eficaz en medios bajos en proteína como esencial-8 35 , ambos de los cuales son compatibles con este sistema (datos E8 no mostrados).
El control de la densidad de siembra de células madre después del paso es de suma importancia para cultivo de células madre de rutina y exitosa. Siembra demasiado bajo o alto puede dar lugar a la diferenciación ectópica y la pérdida de pluripotencia además de causar intervalos de paso irregulares. Cultivo de células madre típica se basa en relación de división en un pocillo de una placa de 6 pocillos se utiliza para sembrar una placa de 6 pocillos nueva entera (un 1: split 6). Con el robot de manipulación de líquidos esta relación se puede ajustar para adaptarse a las necesidades del usuario (por ejemplo, 1: 6, 1: 9, 1:12, etc.) y que tiene la mayor influencia en el intervalo de paso. El robot puede cosechar menos de una columna, una columna entera (8 pozos), o más de una columna, dependiendo de las necesidades del usuario, que deberían determinarse empíricamente. Los iPSCs adiposo y fibroblastos derivados mantienen un horario de alimentación regular de tres días con pasaje en el cuarto día cuando dividir 01:12. En este caso una columna se recogió y se utiliza para sembrar una nueva placa de 96 pocillos, la creación de una división 1:12 con cada ciclo (Figura 3A). Los 11 pozos restantes eran entonces disponible para aplicaciones posteriores. Para cosechar estos 11 pozos de producción, el protocolo de paso se repitió excepto que las células se depositaron en un canal para la colección. Alternativamente, las células se pueden dejar en la placa y se usó directamente.
Para lograr el paso densidad de siembra constante al paso sin contar, y mantener un horario división de rutina, nuestros protocolos llaman para dividir el mismo número predeterminado de columnas cuando la colonia está en una densidad ideal para pasaje. Para ayudar a los usuarios a identificar la densidad apropiada para el paso, se generó una serie de imágenes que muestran una gama de densidades con una densidad de paso ideales resaltado (Figura 3B). Para determinar cuándo paso, un técnico examina su plato y lo compara con la escala de la imagen de la densidad. La ideal densidad a paso se determinó a partir del cultivo de las células iPS derivadas de tejido adiposo y de fibroblastos y se encontró que cuando el espacio entre la mayoría de las colonias era aproximadamente un 25% del diámetro colonia adyacente. Es importante que las colonias se distribuirán homogéneamente. Esta cantidad de separación colonia se correlaciona con la densidad máxima deseable porque un ciclo de alimentación adicional daría lugar a colonias que tocan, que es un disparador para la diferenciación ectópico.
Un protocolo es necesario aquí desarrollado aborda cómo iniciar una cultura en el formato de 96 pocillos y cómo restablecer una cultura después de un problema de densidad. Cuando se inicia una nueva cultura, la mejor densidad de siembra y el número de ciclos de alimentación antes de pases son desconocidos. Para asegurar una densidad utilizable después de la siembra, el robot distribuye células existentes o descongeladas a través de una placa de 96 pocillos en una dilución en serie (Figura 4A). Ejemplo de resultados de un gradiente tal se muestran en la Figura 4B-E. Después de varios alimentaciónciclos, algunas columnas se aproximan a la densidad ideales para dividir, momento en el que un técnico utiliza el robot para sembrar una placa de diluido de manera uniforme a empezar de cultivo regular. Este protocolo de gradiente de densidad también se utilizó para restaurar intervalos regulares de paso y homogeneidad colonia a una placa irregular. Si pasaje se retrasa o se pierde, densidad y tamaño de las colonias se vuelven demasiado alta, mientras que si el paso es demasiado pronto, la densidad de colonia es demasiado baja y las colonias individuales puede llegar a ser demasiado grande sin ser distribuido uniformemente a través del pozo. El protocolo de gradiente de densidad resuelve estos problemas y permite al usuario para reiniciar al recoger un conjunto ideal sembrado de pozos.
Dos líneas de IPSC mantuvo pluripotentes después de 3 meses de la cultura robótica.
Mantenimiento de la pluripotencia de células madre puede ser afectada adversamente por las condiciones de cultivo 36,37. Para evaluar si adiposo y fibroblastos derivados IPSC líneas (a-IPSC, f-IPSC, respectivamente) mantenido pluripotency cuando se cultivan robóticamente en placas de 96 pocillos durante un período prolongado de tiempo, las dos líneas se cultivaron en el robot de manipulación como se describe anteriormente durante 3 meses y luego se examinaron los marcadores de pluripotencia líquido. Para este período ambas líneas se pasaron con un reactivo de disociación proteolítica y colagenolítica mayor que 20 veces sin centrifugación. Placas de 96 pocillos fija de un-IPSC y líneas f-IPSC se tiñeron para Oct4 y Nanog exhibieron la acumulación nuclear de estos marcadores mientras que se observó SSEA-4 en la superficie celular (Figura 5A-L). Esto es coherente con los informes anteriores para iPSCs pluripotentes 38-41. Contratinción con DAPI no reveló células adicionales que no estaban también positivo para los tres marcadores de pluripotencia. Las anomalías cromosómicas son comúnmente observados durante el cultivo de células madre 42,43 pero no pueden afectar a la distribución de los marcadores de pluripotencia como los que se muestran en la Figura 5A-L. Kanálisis aryotype revelado ambas líneas IPSC robóticamente a pases tenían 46 cromosomas normales, lo que sugiere el método de cultivo robótico no introdujo inestabilidad cromosómica más allá de lo que normalmente podría ocurrir (Figura 5M-N).
Para sondear establecida la expresión génica de células madre marcadores 1,41,44,45 en los robóticamente cultivadas líneas IPSC, el ARN total se recogió de forma paralela a las manchas y el análisis de cariotipo. Ambas placas de 96 pocillos líneas IPSC tenían expresión similar de marcadores de pluripotencia NANOG, POU5f1 y REX1 mientras que los cardiomiocitos diferenciados de cada línea no lo hicieron, ni una línea separada de los fibroblastos dérmicos humanos (HDF) (Figura 6). Los cardiomiocitos derivados de ambas líneas fueron MYL7 positivo mientras que los HDF y células madre no expresaron MYL7. Ambas líneas IPSC se diferencian en cardiomiocitos con la molécula pequeña, técnica de manipulación vía Wnt descrito recientemente 46 . Cuando manchado, cardiomiocitos de ambas líneas eran cTnT positiva con la formación sarcómero clara (Figura 7). La diferenciación en cardiomiocitos en el formato de 96 pocillos fue exitosa en mayor que 80% de los pozos (datos no mostrados). Juntos, estos datos sugieren 3 meses y más de 20 pasajes de la cultura robótico resultaron en células cromosómicamente normales exhiben un programa de transcripción consistente con la pluripotencia que también eran capaces de diferenciación en cardiomiocitos.

Figura 1. Descripción general del equipo de cultivo de células madre robótica y la típica rutina de la cultura IPSC. (A) Robótica sistema de manejo de líquidos se muestra con el diseño típico de la cama de 96 pocillos de cultivo de células madre. Reactivos líquidos Nuevos consejos estériles pipeta (Consejos), contenedor de residuos punta desmontable (residuos), multi-canal, así autoclave CELEBRARÁ necesarios (líquidos), placas de 96 pocillos se colocan una d soportado en una temperatura controlada, rampa inclinada (placas de 96 pocillos), 8 canales cabeza pipeta robótico que se mueve de izquierda / derecha y arriba / abajo (cabeza pipeta). Placa tapa sosteniendo cremallera (PLHR). Números de posición cama se muestran a continuación en la tabla. Cultura (B) Robótica IPSC tiene dos fases: La alimentación y el Pasaje. El ciclo de producción de células comienza cuando una placa colonia está listo para el paso. El usuario elige la relación deseada a paso en y las semillas de robot un nuevo grupo de placas de 96 pocillos continuación alimentados a intervalos regulares hasta que esté listo para el paso de nuevo. Cuando las placas están dispuestos a paso, la mayor parte de cada placa no se utiliza para sembrar placas de colonias posteriores y está disponible para otros usos, por lo que representa la fase de producción del sistema. Líneas de células congeladas o existentes se pueden introducir en cualquier momento y se mantienen en el ciclo de alimentación / pasaje. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
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La Figura 2. Parámetros de manejo de líquidos robóticos se puede utilizar para controlar IPSC características de disociación colonia. Cada imagen representativa muestra de fibroblastos derivados iPSCs disocian después del tratamiento indicado mientras que todavía suspendido en el 96 pocillos. (Fila superior,
A -
C) Enzima Tiempo, sin trituración. CMPI fibroblastos derivados cultivadas en placas de 96 pocillos fueron sometidos a tiempos de disociación proteolítica y colagenolítica reactivo de disociación y no trituración robótico creciente se realizó. (Oriente Fila,
D -
F) Indice de trituración, 3 minutos enzima. Las células fueron expuestas a tres minutos de proteolítica y tratamiento reactivo de disociación colagenolítica y luego se aplicó medios de cultivo de 175 l y cada pocillo pipeta arriba y hacia abajo una vez a la velocidad indicada. mu l / s = p microlitroser segundo. (Fila inferior,
G -
I) La trituración repeticiones, 3 minutos enzima, 160 l / seg. Las células fueron expuestas a proteolítica y el reactivo de disociación colagenolítica durante 3 minutos, se aplicó 175 medios de cultivo l, después se trituró a 160 l / s para el número indicado de repeticiones.
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Figura 3. adiposo típica y de fibroblastos IPSC esquema de mantenimiento de la colonia y una serie de imágenes de densidad colonia para determinar cuándo pasaje para mantener un ciclo de alimentación / paso regular. (A) A partir de una adiposo o de fibroblastos de 96 pocillos colonia IPSC listo para pasaje, una columna de células se pasó en el robot sin centrifugación y se diluye12 nuevas columnas que fueron alimentados a intervalos específicos a partir de entonces hasta que la placa estaba listo para el paso de nuevo. Para la producción de células, las columnas que no se utilizan para mantener la colonia se pasaron y se recogen para su uso posterior. Cualquier número de columnas puede ser pasado para controlar la velocidad de expansión. (B) Para determinar cuándo paso, una serie de imágenes de densidad capturó cada 24 horas fue proporcionada a los usuarios. En el cuadro rojo superior (dentro de 72 horas después de la siembra inicial) la colonia no es lo suficientemente densa como para pasaje y debe ser alimentado. Cuando la densidad de los partidos que se muestra en el cuadro verde (en ~ 96 h), la colonia está en una densidad ideal para pasaje. Por 120 horas, la colonia es demasiado denso para pasaje y este escenario se debe evitar. Esto último puede ser resuelto con un gradiente de densidad de siembra, pero la cultura de rutina en esta densidad no es recomendable. Barra blanca es igual a 200 mM. Por favor, haga clic aquí para ver una versi más grandesen esta figura.

La Figura 4. 96 pocillos sistema de cultivo robótico permite a los usuarios comienzan culturas partir de líneas celulares congeladas o activos y realizan un gradiente de siembra. (A) Una solución de células se prepara por el usuario a partir de una célula madre congelada o después de la cosecha de un cultivo activo y se coloca en el robot. El sistema robótico a continuación, realiza un protocolo de dilución en serie para distribuir la solución de células inicial a lo largo de la placa de 96 pocillos con el gradiente de densidad distribuido por columna. (B - E) Ejemplos de densidad celular de cuatro de los doce columnas de A, 48 horas después de la siembra protocolo de gradiente de densidad. Las líneas blancas son iguales a 225 micras. Haga clic aquí para ver una versión más grande de estafigura.

Figura 5. Pluripotencia se mantiene durante adiposo y de fibroblastos derivados de líneas de IPSC durante 96 pocillos de cultivo para robótico 22 (adiposo) o 23 (fibroblastos) pasajes (~ 3 meses). (A - L) adiposo y de fibroblastos de líneas celulares derivadas de IPSC eran robóticamente Fed y se pasaron como se describe en el texto sin centrifugación en placas de 96 pocillos durante 22 o 23 pasajes luego fijadas y teñidas de marcadores de pluripotencia Oct4, Nanog, o SSEA4 con contratinción DAPI. Barra blanca es igual a 100 micras. (M - N). Culturas paralelas a las descritas en A se presentaron para el análisis de cariotipo, que reveló en un complemento de 46 cromosomas Haga clic aquí para ver una versión más grande of esta cifra.

Figura 6. adiposo (96-A) y fibroblastos (96-F) derivado iPSCs cultivaron durante más de 20 pasajes en el formato de 96 pocillos robótico mantenido la expresión de genes pluripotencia y diferenciarse en cardiomiocitos. ARNm total fue extraído de las dos líneas de IPSC robóticamente cultivadas así como cardiomiocitos diferenciados de ambas líneas (CM-A = adiposas cardiomiocitos derivados de IPSC, CM-F = fibroblastos IPSC deriva cardiomiocitos, se recogió 14 días después de la inducción de diferenciación) y se utiliza para RT-PCR para investigar marcadores de pluripotencia NANOG, POU5F1, REX1, cardiomiocitos MYL7 marcador y GAPDH control de carga. Fibroblastos dérmicos humanos (HDF), también se recogieron y se usaron como un no-IPSC, control no cardiomiocitos. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 7. fibroblastos y células iPS derivadas de tejido adiposo mantienen la capacidad de diferenciarse en cardiomiocitos después de largo plazo de 96 pocillos de cultivo robótico (A - H). Adiposo y CMPI fibroblastos cultivados en el formato de 96 pocillos robótico durante más de 20 pasajes se diferenciaron en cardiomiocitos . 14 días después de la inducción de diferenciación, de 96 pocillos de placas con destino cardiomiocitos fueron disociadas y replated a una densidad baja en portaobjetos de vidrio para la inmunotinción de troponina T (rojo), F-actina (verde) y núcleos (azul). Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta cifra.
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Figura 8. La ampliación de 96 pocillos placa de cultivo de células madre. Escala de producción de células madre depende del número de placas utilizadas para sembrar el grupo posterior de las placas. El usuario puede mantener un nivel de producción o bien por pases el mismo número de placas en cada oportunidad dividida o ampliar la producción mediante la siembra de más placas. Por ejemplo, en el ciclo 0, una placa de 96 pocillos es pasado a doce nuevas placas (Ciclo 1), creando una expansión 12 veces. Esta tasa puede mantenerse si uno de los doce placas es pasado a un nuevo conjunto de doce placas (Ciclo 1-2) o expandido en pases múltiples placas (Ciclo 2-3). Durante el paso, los platos no se utilizan para mantener la colonia están disponibles para aplicaciones posteriores. Por lo tanto, pases 12 placas rutinariamente podría producir hasta 144 placas en dos pasajes: 12 para el mantenimiento de la colonia y 132 para otros usos."> Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 9. Eficacia de la cultura basado placa de 96 pocillos para la producción de células excede en gran medida el cultivo manual. Como se ha indicado en la figura 8, una placa puede ser pasado a las semillas doce placas, que luego pueden ser pasados a 144 placas. Esta tasa de expansión se puede lograr en dos oportunidades divididas. Un técnico requiere alrededor de 3,5 minutos para alimentar a una placa de 6 pocillos mientras que pasan cerca de 30 segundos con una placa de 96 pocillos para examinarlo en el microscopio y lo coloca en el robot. Si el técnico está llevando a 144 platos, que gastarán alrededor de 1,2 placas de manejo de recursos humanos cuando se alimenta con el robot, mientras que la cultura Manual requerirá una dedicación de 8 horas para alimentarse. Por favor, haga clic aquí para vIEW una versión más grande de esta figura.