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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
El procedimiento de protocolo de medición y análisis de los datos se dan para la obtención de la coherencia transversal de una fuente de rayos X de sincrotrón de radiación a lo largo de cuatro direcciones simultáneamente usando una sola fase de tablero de ajedrez 2-D rejilla. Esta sencilla técnica se puede aplicar para la caracterización de la coherencia transversal completa de fuentes de rayos X y la óptica de rayos-X.
Un procedimiento para una técnica para medir la coherencia transversal de fuentes de rayos X de radiación de sincrotrón utilizando una sola fase se informó interferómetro rejilla. Las mediciones fueron demostrados en el 1-BM flexión línea de luz imán de la Fuente Avanzada de Fotones (APS) en el Laboratorio Nacional de Argonne (ANL). Mediante el uso de un tablero de ajedrez 2-D π / 2 por desplazamiento de fase rallado, longitudes de coherencia transversales se obtuvieron a lo largo de las direcciones vertical y horizontal, así como a lo largo de los 45 ° y 135 ° direcciones a la dirección horizontal. Siguiendo los detalles técnicos especificados en este documento, interferogramas se midieron en diferentes posiciones aguas abajo de la rejilla de fase a lo largo de la dirección de propagación del haz. valores de visibilidad de cada interferograma se extrajeron de análisis de picos armónicos en su imagen transformada de Fourier. En consecuencia, la longitud de coherencia a lo largo de cada dirección se puede extraer de la evolución de la visibilidad como una función de la rejilla-a-DETECtor distancia. La medición simultánea de la coherencia longitudes en cuatro direcciones ayudaron a identificar la forma elíptica de la zona de coherencia de la fuente de rayos X en forma de Gauss. La técnica informado para la caracterización de la coherencia de múltiples dirección es importante para la selección del tamaño apropiado de la muestra y la orientación, así como para la corrección de los efectos de coherencia parciales en experimentos de coherencia de dispersión. Esta técnica también se puede aplicar para evaluar la coherencia preservar las capacidades de la óptica de rayos X.
Los rayos X dura la radiación sincrotrón de tercera generación, tales como el APS en ANL, Lemont, IL, EE.UU. (http://www.aps.anl.gov), han tenido enormes repercusiones sobre el desarrollo de las ciencias de rayos X . Una fuente de radiación sincrotrón genera un espectro de radiaciones electromagnéticas, desde el infrarrojo hasta longitudes de onda de rayos X, cuando las partículas cargadas, tales como electrones, están hechos para moverse cerca de la velocidad de la luz en una órbita circular. Estas fuentes tienen propiedades muy únicas, tales como alto brillo, estructura de temporización de impulsos y pico-segundos, y gran coherencia espacial y temporal. Haz de rayos X coherencia espacial es un parámetro importante de la tercera y cuarta generación de fuentes de sincrotrón y el número de experimentos que hacen uso de esta propiedad ha aumentado dramáticamente en las últimas dos décadas 1. Las futuras actualizaciones de estas fuentes, tales como la red planificada acromático Multi-doble (MBA) para el anillo de almacenamiento de APS, aumentarán drásticamente el flujo coherente de haz (http: //www.aps.anl.gov/Upgrade/). El haz de rayos X se puede ajustar utilizando un monocromador de cristal para lograr una mayor coherencia temporal. La coherencia transversal de las fuentes de sincrotrón es significativamente mayor que la de las fuentes de rayos X de laboratorio con base a causa de la emitancia de haz de electrones de baja y de larga distancia de propagación desde la fuente hasta la estación experimental.
Normalmente, experimento de doble agujero de alfiler o de la doble rendija de Young se utiliza para medir la coherencia espacial del haz a través de la inspección de la visibilidad de las franjas de interferencia 2. Para obtener la función de coherencia complejo completo (CCF), las mediciones sistemáticas son necesarios con las dos ranuras colocadas en diferentes posiciones con diferentes separaciones, lo que es, sobre todo para los rayos X duros, incómodos y poco prácticos. Uniformemente redundante (URA) también se puede utilizar para la medición de la coherencia del haz empleando como una máscara de desplazamiento de fase 3. Aunque la técnica puede proporcionar el marco para la cooperación completa, No está libre de modelo. Más recientemente, las técnicas de interferometría basados en el efecto Talbot fueron desarrolladas utilizando la propiedad de auto-formación de imágenes de objetos periódicas. Estos interferómetros hacen uso de la visibilidad interferograma medido a unos distancias auto-imagen aguas abajo de la rejilla para la obtención de la viga transversal coherencia 4-9. Las mediciones de coherencia transversal utilizando dos sistemas de rejilla también se reportaron 7.
Mapeo de la coherencia viga transversal, simultáneamente a lo largo direcciones vertical y horizontal se informó por primera vez por JP Guigay et al. 5. Recientemente, los científicos en el Grupo de Óptica de la División de Ciencias de rayos X (XSD), de APS han reportado dos nuevas técnicas para medir la viga atraviesa la coherencia a lo largo de más de dos direcciones simultáneamente utilizando dos métodos: uno con rejilla de una fase de tablero de ajedrez 8, y el otro con rejilla una fase circular 9.
En este artículo el measurprocedimientos ement y análisis de datos se describen para la obtención de la coherencia transversal de la viga a lo largo del 0 °, 45 °, 90 °, y 135 ° direcciones respecto a la dirección horizontal, de forma simultánea. Las mediciones se llevaron a cabo en la línea de luz 1-BM de APS con un tablero de ajedrez π fase / 2 de rejilla. Los detalles de esta técnica aparece en las secciones de protocolo incluyen: 1) la planificación del experimento; 2) preparación de la fase de tablero de ajedrez 2-d rejilla; 3) Montaje del ensayo y la alineación en la instalación de sincrotrón; 4) la realización de mediciones de coherencia; 5) Análisis de datos. Además, los resultados representativos se muestran para ilustrar la técnica. Estos procedimientos se pueden llevar a cabo en muchas líneas de luz de sincrotrón con cambios mínimos en el diseño de rejilla.
1. Planificación del experimento
2. Preparación del tablero de damas Ph 2-Dase Reja




3. Configuración de un experimento y alineación en la instalación de sincrotrón
4. la realización de mediciones de coherencia
Análisis 5. Datos
NOTA: Actualmente no existe software estándar disponible para el análisis de datos.

Si bien los resultados de simulación y experimentales detallados se podían encontrar en otros lugares 8, en esta sección sólo se muestra una selección de resultados para ilustrar los procedimientos de medición y análisis de datos anteriores. La figura 1 representa la configuración de la prueba en la APS 1-BM-B línea de luz. El tamaño del haz se define por una ranura 1 × 1 mm 2 colocado aguas arriba de la doble monocromador de cristal (DCM) y 25 m de la fuente imán de curvado. El DCM se sintoniza a la salida de energía de los fotones de 18 keV. El haz de rayos X pasa a través de varias ventanas de berilio (1 mm de espesor total) colocados en diferentes lugares a lo largo de la trayectoria del haz.
Figura 2 (a) muestra la parte central de la imagen microscopio electrónico de barrido de la fase de tablero de ajedrez 2-D rejilla fabricado en el Centro de Materiales a nanoescala (CNM) en ANL. El periodo de rejilla es p = 4,8 m. Las plazas son blanquecinas los bloques formados en AuSi la membrana 3 N 4. La rejilla se coloca en el haz de rayos X de tal manera que es perpendicular a la dirección del haz y las diagonales de los bloques de oro cuadrados son paralelas a las direcciones horizontal y vertical, como se muestra en la Figura 2 (b). Tal orientación sirve para dos propósitos: (i) que garantiza una mayor visibilidad a lo largo de las direcciones primarias, que son a lo largo de las direcciones horizontal y vertical, y (ii) se reduce el efecto de la incertidumbre fabricación del periodo de rejilla a lo largo de las direcciones primarias 8.
Interferogramas se registraron a diferentes distancias de rejilla a detector, d, cubriendo por lo menos cinco V theta (d) picos en cada dirección transversal, según se define en la ecuación (1). La figura 3 muestra la parte central de los interferogramas medidos en (a) d 1,0 ° = 83 mm y (b) d 4,0 </ sub> ° = 579 mm, que corresponden a las posiciones primera y cuarta de pico a lo largo de θ = 0 ° dirección (p 0 ° = 3,4 m). A estas distancias Talbot se replica tablero de ajedrez 2-D (auto-imagen). La propiedad coherencia del haz de rayos X se incorpora en la visibilidad interferograma, que se recupera a partir del análisis de Fourier de cada imagen grabada.
La transformada de Fourier de la interferograma medido produce picos armónicos que son representativos de la naturaleza periódica del interferograma a lo largo de diferentes direcciones. Como un ejemplo, las Figuras 3 (c) y (d) son las imágenes de FT de las figuras 3 (a) y (b), respectivamente, llevado a cabo por la Transformada Rápida de Fourier (FFT). Debido a la simetría central de la imagen FT, cuatro picos independientes 1 er orden están presentes a lo largo de cuatro direcciones, a saber <em> θ = 0 °, 45 °, 90 ° y 135 °, como se define en la figura 2 (b). La periodicidad (θ p) en cada dirección se puede determinar a partir de la posición del pico con relación al pico de orden 0 TH central. Tomar la Figura 3 (c) como un ejemplo, el pico de armónicos de 1er orden a lo largo de 0 ° dirección revela una estructura periódica con p 0 ° = 3,4 micras, que puede ser fácilmente identificado como la estructura de tipo de línea en la Figura 3 (a). La visibilidad es dada por la relación de la amplitud del pico de orden 1 st (A θ, 1) a la de la pico orden 0 ° (A θ, 0), o V θ = 2 A θ, 1 / A θ, 0 10. En la práctica, se obtuvo el siguiente protocolo visibilidad de los pasos 5.5 a 5.7 con las cajas de cultivo se muestran en la Figures 3 (c) y (d). Es evidente que la intensidad del pico 1 para st a 0 ° es mucho más pequeño en la Figura 3 (d) que en la Figura 3 (c), que indica una visibilidad reducida a D = 579 mm. Esto también se evidencia en la falta de estructura periódica a lo largo de 0 ° en la figura 3 (b).
Siguiendo el protocolo los pasos 5.8 a 5.12, la Figura 3 (e) muestra la evolución visibilidad como función de d. El accesorio gaussiano a los datos seleccionados de todo θ V (d) picos da σ 0 ° = 180 mm. La longitud de coherencia horizontal es, pues, ξ 0 ° = 3,6 micras siguiente ecuación (5).
Similar a la Figura 3, la Figura 4 presenta los resultados a lo largo del θ = 45 ° dirección. Roboimágenes [cf. Figura 4 (c) y (d)] indican un período de 45 ° p = 2,4 m. Por lo tanto, V θ (d) picos de 45 ° aparece en las distancias más cortas (d 1,45 ° = 43 mm y 4,45 ° d = 293 mm) en comparación con la correspondiente a 0 °. A esta distancia, por 45 °, los interferogramas son un patrón de tipo malla [cf. Figura 4 (a) y (b)]. La evolución visibilidad muestra en la Figura 4 (e) da la longitud de coherencia ξ 45 ° = 5,0 m. Mediante la aplicación de el mismo procedimiento de análisis de datos a las cuatro direcciones disponibles, el área de la coherencia transversal del haz de rayos X se asigna.

Figura 1. Configuración experimental. Esquemática de laconfiguración de la línea de luz en la línea de luz 1-BM-B de las APS. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2. 2-D de tablero de ajedrez rejilla. (A) imagen SEM del tablero de ajedrez de rejilla con un período de 4,8 micras. (B) Grating orientación en el plano transversal perpendicular a la dirección de propagación del haz (señalando hacia dentro o fuera del papel). Los números en rojo indican θ. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3. Visibilidad Meas medi- lo largo de 0 ° Dirección. interferogramas registrados a d 1, 0 ° = 83 mm (a) y d 4,0 ° = 579 mm (b), correspondiente a la primera y cuarta V 0 Posiciones ° (d) de pico a lo largo de 0 ° dirección (ecuación (1) con p 0 ° = 3,4 micras), respectivamente. Su transformada de Fourier imágenes se muestran en (c) y (d), con las regiones de puntos y trazos rojos verdes que indican el 0 º y 1 st imágenes armónicas, respectivamente. (E) La evolución visibilidad como una función de la distancia de la rejilla a detector, d. Los círculos azules son todos los datos experimentales, mientras que las balas rojas son datos seleccionados alrededor de cada distancias Talbot para el sobre de Gauss ajuste (curva roja punteada).t = "_ blank"> Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4. Visibilidad de medición a lo largo de 45 ° Dirección. Interferogramas registrados a d 1,45 ° = 43 mm (a) y d 4,45 ° = 293 mm (b), correspondiente a la primera y cuarta V 45 ° (d) pico posiciones a lo largo 45 ° dirección (ecuación (1) con p = 45 ° 2,4 micras), con sus imágenes de FT que se muestran en (c) y (d), respectivamente. (E) La evolución visibilidad como función de d. Ver Figura 3 subtítulo para más detalles. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5. Área de Coherencia Mapa. La coherencia visualizado utilizando la coherencia transversal medido a lo largo de las longitudes de las cuatro direcciones. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Los autores no tienen nada que revelar.
El procedimiento de protocolo de medición y análisis de los datos se dan para la obtención de la coherencia transversal de una fuente de rayos X de sincrotrón de radiación a lo largo de cuatro direcciones simultáneamente usando una sola fase de tablero de ajedrez 2-D rejilla. Esta sencilla técnica se puede aplicar para la caracterización de la coherencia transversal completa de fuentes de rayos X y la óptica de rayos-X.
El uso de la Fuente Avanzada de Fotones y el Centro de Materiales a Nanoescala, Oficina de Ciencia de las Instalaciones de Usuario operados para la Oficina de Ciencia del Departamento de Energía de los Estados Unidos (DOE) por el Laboratorio Nacional Argonne, fue apoyado por el Departamento de Energía de los Estados Unidos bajo el Contrato No. DE-AC02-06CH11357. Agradecemos al Dr. Han Wen, NHLBI / Institutos Nacionales de Salud, Bethesda, MD 20892, EE. UU., por muchas sugerencias útiles durante el procesamiento de datos.
| 1-BM-B imán de flexión Fuente de rayos X Fuente de fotones | avanzada/ Argonne National Lab | http://www.aps.anl.gov/Xray_Science_Division/Optics/Beamline/ | |
| LYSO Scintillator | Proteus Inc | http://www.apace-science.com/ proteus/lyso.htm#top | |
| Coolsnap HQ2 Detector CCD | Fotometría< | a href="http://www.photometrics.com/products/ccdcams/coolsnap_hq2.php">http://www.photometrics.com/products/ccdcams/coolsnap_hq2.php | |
| ATC 2000 Sistema de deposición catódica UHV | AJA International Inc | http:// www.ajaint.com/systems_atc.htm | |
| MICROPOSIT S1800 fotorresistente | Dow | ||
| Desarrollador de MICROPOSIT 351 | Dow | ||
| Sistema de litografía MA/BA6 | SUSS MicroTec | http://www.suss.com/en/products-solutions/products/mask-aligner/maba6/overview.html | |
| Máquina de recubrimiento por centrifugado WS-400-6NPPB | Laurell Technologies Corporation | http://www.laurell.com/spin-coater/?model=WS-400-6NPP-LITE | |
| JBX-9300FS sistema de litografía por haz de electrones | JEOL | http://www.jeolusa. com/PRODUCTS/PhotomaskDirectWriteLithography/ElectronBeamLithography/JBX-9500FS/tabid/245/Default.aspx | |
| CS-1701 Sistema RIE | Nordson March | http://www.nordson.com/EN-US/DIVISIONS/MARCH/PRODUCTS/LEGACY/Pages/CS-1701-Anisotropic-RIE-Plasma-System.aspx | |
| Techni Gold 25E | Technic | http://www.technic.com/eu/applications/industrial/industrial-chemistry/plating-chemistry | |
| Dektak-8 perfiladora de superficies | Bruker | http://brukersupport.com/ProductDetail/ 1136 | |
| MICROPOSIT 1165 | removedor Dow |