El cáncer de ovario epitelial (EOC) es la principal causa de muerte por neoplasia maligna ginecológica en los Estados Unidos. La mortalidad se debe al diagnóstico del 75% de las mujeres con enfermedad en estadio tardío, cuando ya hay metástasis. La COE se caracteriza por metástasis intraperitoneales difusas y ampliamente diseminadas. Las células que se desprenden del tumor primario se anclan en el mesotelio que recubre la cavidad peritoneal, así como en el epiplón, lo que da lugar a metástasis multifocales, a menudo en presencia de ascitis peritoneal. Los esfuerzos en nuestro laboratorio están dirigidos a una comprensión más detallada de los factores que regulan el éxito de la metástasis de la EOC. Sin embargo, la cuantificación de la carga tumoral metastásica representa un desafío técnico importante debido al gran número, pequeño tamaño y amplia distribución de las lesiones en todo el peritoneo. En este trabajo describimos un método para el análisis de la metástasis de EOC utilizando células marcadas con proteína fluorescente roja (RFP) junto con imágenes multiespectrales in vivo. Después de la inyección intraperitoneal de células tumorales marcadas con RFP, los ratones se someten a imágenes semanales hasta el momento del sacrificio. En este momento, la cavidad peritoneal se expone quirúrgicamente y se obtienen imágenes de los órganos in situ. A continuación, los órganos disecados se colocan en una plantilla transparente etiquetada y se obtienen imágenes ex vivo. La eliminación de la autofluorescencia tisular durante el procesamiento de imágenes mediante la desmezcla multiespectral permite una cuantificación precisa de la carga tumoral relativa. Este método es útil en una variedad de aplicaciones, incluidos los estudios terapéuticos para evaluar compuestos que pueden inhibir la metástasis y, por lo tanto, mejorar la supervivencia general.