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Artículo de método

Simulación de un laboratorio de hierro (II) ricos sistema de afloramiento Precámbrico marina para explorar el crecimiento de bacterias fotosintéticas

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DOI:

10.3791/54251

24 de julio de 2016

En este artículo

Resumen

Hemos simulado un sistema de afloramiento marino ferruginosa Precámbrico en una columna de flujo continuo vertical, a escala de laboratorio. El objetivo era comprender cómo los perfiles geoquímicos de O 2 y Fe (II) evolucionar a medida que las cianobacterias producen O2. Los resultados muestran el establecimiento de una chemocline debido a la oxidación Fe (II) por fotosintéticamente producido O 2.

Resumen

Un concepto convencional para la deposición de algunas formaciones de hierro bandeado Precámbricos (BIF) parte de la premisa de que el hierro ferroso [Fe (II)] afloramiento de fuentes hidrotermales en el océano Precámbrico se oxida por el oxígeno molecular [O 2] producido por las cianobacterias. Los BIFs más antiguos, depositados antes de la Gran Oxidación (GOE) en alrededor de 2,4 billón años (Gy) hace, podrían haberse formado por la oxidación directa de Fe (II) mediante anoxigénicas photoferrotrophs en condiciones anóxicas. Como método para probar los patrones geoquímicas y mineralógicas que se desarrollan en diferentes escenarios biológicos, hemos diseñado una columna de flujo continuo vertical de 40 cm de largo para simular un anóxica Fe (II) ricos representante de un antiguo océano sistema de afloramiento marino a escala de laboratorio . El cilindro se llena con una matriz de perlas de vidrio poroso para estabilizar los gradientes geoquímicos, y muestras líquidas para la cuantificación de hierro podría ser tomado a lo largo de la columna de agua. El oxígeno disuelto sedetectado de forma no invasiva a través de optodes desde el exterior. Los resultados de los experimentos bióticos que participan los flujos de corrientes ascendentes de Fe (II) de la parte inferior, un gradiente de luz distinta de la parte superior, y cianobacterias presentes en la columna de agua, muestran una clara evidencia de la formación de Fe (III) precipitados minerales y el desarrollo de un chemocline entre Fe (II) y O 2. Esta columna nos permite probar las hipótesis para la formación de los BIFs mediante el cultivo de cianobacterias (y en el futuro photoferrotrophs) en condiciones simuladas marinos precámbricos. Por otra parte la hipótesis de que nuestra columna concepto permite la simulación de diversos ambientes químicos y físicos - incluyendo los sedimentos marinos o lacustres superficiales.

Introducción

El Precámbrico (4.6 a 0,541 Gy atrás) ambiente experimentó un aumento gradual de la fotosíntesis produce oxígeno (O2), quizás marcada por cambios bruscos en la denominada "Gran Oxidación" (GOE) aproximadamente a 2,4 Gy atrás, y de nuevo en el Neoproterozoico (1 a 0,541 Gy atrás) como O 2 atmosférico se acercó a los niveles modernos 1. Las cianobacterias son los restos evolutivos de los primeros organismos capaces de fotosíntesis oxigénica 2. Geoquímicas y la evidencia de modelado estudios apoyan el papel de los ambientes costeros poco profundos en albergar comunidades activas de cianobacterias o organismos capaces de fotosí....

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Protocolo

1. Preparación de cultivo Medio

Nota: La información sobre el equipo necesario, los productos químicos y materiales para la preparación del medio de cultivo se muestra en la Tabla 1 itálicos códigos alfanuméricos entre paréntesis se refieren a los equipos detallados en la Tabla 2 y se muestra en la Figura 1..

  1. Preparar 5 litros de Marina fototrofo (MP) medio (denominado en lo sucesivo como "medio") siguiendo el protocolo de Wu et al. 16. Ajustar el pH a 6,8 usando HCl anóxica y estéril de 1 o 0,5 M NaCO3. Como fuente para el Fe (II), añadir 3,5 ml ....

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Resultados

experimento de control

Experimentos de control abiótico (10 días) muestran que las concentraciones consistentemente bajos de oxígeno (O2 <0,15 mg / L) sin fluctuaciones significativas en el Fe (II) -profile toda la columna de agua afloramiento. La formación de precipitados (presumiblemente Fe (III) (oxyhydr-) óxidos) en el depósito de medio y la ligera disminución de la concentración.......

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Discusión

Las comunidades microbianas en el océano Precámbrico fueron regulados por, o modificados como resultado de, su actividad y las condiciones geoquímicas imperantes. En la interpretación de los orígenes de BIF, los investigadores generalmente inferir la presencia o actividad de los microorganismos basado en la sedimentología o geoquímica de BIF, por ejemplo, Smith et al. 23 y Johnson et al. 24. El estudio de los organismos modernos en ambientes modernos que tienen análogos g.......

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Divulgaciones

Los autores tienen nada que revelar.

Agradecimientos

Marcos Nordhoff ayudó en el diseño e implementación de conexiones de la tubería. Ellen Struve ayudó a seleccionar y adquirir los equipos utilizados.

....

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Matraz Widdel (5 L)Ochs110015labor-ochs.de
Frascos de vidrio (5 L)RotilaboY682.1
carlroth.com Pipetas de vidrio (5 ml)51714labor-ochs.de
0.22 µ m Unidad de filtro Steritop (0.22  y micro; m Membrana de polietersulfona)MilliporeX337.1carlroth.com
Papel
Jeringa estéril de vidrio Luer Lock, rellena de algodónC681.1carlroth.com
Agujas de acero inoxidable Luer Lock (150 mm, 1.0  mm ID)201015labor-ochs.de
NaClSigma433209sigmaaldrich.com
MgSO4Sigma208094sigmaaldrich.com
CaCl2SigmaC4901sigmaaldrich.com
NH4ClSigmaA9434sigmaaldrich.com
KH< sub>2PO4SigmaP5655sigmaaldrich.com
KBrSigmaP3691sigmaaldrich.com
KClSigmaP9541sigmaaldrich.com
CilindroY310.1carlroth.com
7377.2carlroth.comPerlas
de vidrio (ø 0.55 - 0.7& nbsp; mm)11079105biospec.com
Tapón de caucho butílico (ø 1,2 cm)271024
labor-ochs.de Placa de Petri, vidrio (ø 8.0  cm)T939.1carlroth.com
PegamentoOTTOSEAL S68adchem.de
Lámina óptica del sensor de oxígeno (para el análisis de oxígeno, ver más abajo)– a petición –presens.de
Tubo de goma (35 mm, 7  mm ID)770350labor-ochs.de
Conector de tubo Luer Lock (3,0 mm, Luer lock macho = LLM)P343.1carlroth.com
Conector de tubo Luer Lock (3,0 mm, Luer lock hembra = LLF)P335.1carlroth.com
Tubo de goma (25 mm, 0,72 mm de diámetro interior)2600185newageindustries.com
Tubo de goma (50 mm, 7  mm ID)770350 labor-ochs.de
Aguja de acero inoxidable Luer Lock (150 mm, 1,0 mm ID)201015labor-ochs.de
Jeringa de vidrio Luer Lock (10 ml)C680.1carlroth.com
Algodón suelto 
Tapón de caucho butílico (ø 1,75 cm)271050labor-ochs.de
Aguja de acero inoxidable (40 mm, 1,0  mm ID)Sterican4665120bbraun.de
Aguja de acero inoxidable Luer Lock (150 mm, 1,5 mm ID)201520labor-ochs.de
: Pieza del conector hembra Luer Lock en C.7
PegamentoOTTOSEAL S68adchem.de
Aguja de acero inoxidable (120 mm, 0,7 mm ID)Sterican4665643bbraun.de
Tubo de caucho (40 mm, 0,74 mm de diámetro interior)2600185newageindustries.com
Tubo termorretráctil (35  mm, 3 mm ID encogido)541458 - 62conrad.de
Abrazaderade tubo STHC-C-500-4tekproducts.com
Conector de tubo Luer Lock (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Tapón de plástico Luer Lock (LLM)CT69.1carlroth.com
Botella de vidrio (5 L)RotilaboY682.1carlroth.com
Tapón de caucho butílico (para GL45)444704labor-ochs.de
Capilar de acero inoxidable (300 mm, 0,74 mm de diámetro interior)56736sigmaaldrich.com
Capilar de acero inoxidable (50 mm, 0,74 mm de diámetro interior)56737sigmaaldrich.com
Tubo retráctil (35 mm, 3  mm de diámetro interior reducido)541458 - 62conrad.de
Tubo de goma (100 mm, 0,74 mm de diámetro interior)2600185newageindustries.com
Conector de tubo Luer Lock (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Jeringa de vidrio Luer Lock (10 ml)C680.1carlroth.com
Algodón suelto 
Tapón de caucho butílico (ø 1,75 cm)271050labor-ochs.de
Aguja de acero inoxidable (40 mm, 0,8  mm ID)Sterican4657519bbraun.de
Jeringa de vidrio Luer lock (5 ml)C679.1carlroth.com
Tapón de caucho butílico (ø 1,75 mm)271050labor-ochs.de
Tubo de goma (40 mm, 0,74 mm DI)2600185newageindustries.com
Botella de vidrio (2 L)RotilaboX716.1carlroth.com
Tapón de caucho butílico (para GL45)444704labor-ochs.de
Capilar de acero inoxidable (50 mm, 0,74 mm de diámetro interior)56736sigmaaldrich.com
Tubo de caucho (30 mm x 0,74 mm de diámetro interior)2600185
newageindustries.com Tubo de caucho (100 mm x 0,74 mm de diámetro interior)2600185newageindustries.com
Conector de tubo Luer Lock (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Luer Lock Conector de 3 vías (LLF, 2x LLM)6134cadenceinc.com
Fuente de luzSamsungSI-P8V151DB1USsamsung.com
Bomba peristalicaIsmatecEW-78017-35coleparmer.com
Tubería de bombeo (0.89  mm ID)EW-97628-26coleparmer.com
Capilar de acero inoxidable (200 mm, 0,74 mm DI)56736sigmaaldrich.com
Capilar de acero inoxidable (400 mm, 0,74 mm ID)56737sigmaaldrich.com
Lámina Supel-Inerte (Tedlar - PFC) Paquete de gas (10 L)30240-Usigmaaldrich.com
Tubo de goma (30 mm, 6  mm ID)770300labor-ochs.de Conector
tubo Luer Lock (3,0 mm, LLM)P343.1carlroth.com
Conector de tubo Luer Lock (3,0 mm, LLF)P335.1carlroth.com
Jeringa hermética al gas (20  ml)C681.1carlroth.com
Quemador
Medidor de oxígeno de fibra óptica para la cuantificación de oxígenoPresensTR-FB-10-01presens.de
Bomba
Pegamento de silicona para ópdos de oxígenoPresensPS1presens.de
de aluminio de vidrio Lana de vidrio para polímeros Posición de polímeros de Bunsen de vacío

Referencias

  1. Lyons, T. W., Reinhard, C. T., Planavsky, N. J. The rise of oxygen in Earth's early ocean and atmosphere. Nature. 506 (7488), 307-315 (2014).
  2. Raymond, J., Blankenship, R. E. The origin of the oxygen-evolving complex. Coord. Chem. Rev. 252 (3-4), 377-383 (2008).
  3. Kendall, B., Reinha....

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Reimpresiones y permisos

Etiquetas

Oxidación de hierro(II)crecimiento de cianobacteriasformación ferruginosa bandeadacolumna de flujo continuomatriz de perlas de vidriodetección de oxígeno disueltocondiciones anóxicasflujo de Fe(II)gradiente de luz