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1. Preparación del medio y las soluciones (todo esterilizada por filtración)
- Células de músculo de ratón C2C12 (estudios de diferenciación)
- Preparar 500 ml de medio de crecimiento para C2C12 mantenimiento de cultivo celular: DMEM de alta glucosa suplementado con 10% FBS y 2 mM de L-glutamina.
- Preparar 100 ml medio de diferenciación (DM) para la diferenciación de C2C12: DMEM de alta glucosa suplementado con 2% de suero de caballo.
- Células HeLa (estudios en células mitóticas)
- Preparar 500 ml aMEM para HeLa RFP-H2B mantenimiento y experimentos de cultivo de células: aMEM suplementado con FBS 10% y 2 mM L-glutamina (aMEM 10%).
- Preparar 500 ml aMEM-menos (sin desoxirribonucleósidos / ribonucleósidos) para HeLa sincronización celular RFP-H2B: aMEM-menos suplementado con 10% FBS y 2 mM L-glutamina (aMEM-menos 10%).
- Preparar 20 ml aMEM sin rojo fenol para HeLa-RFP-H2B live adquisición celular: aMEM sin rojo fenol suplementado con FBS 10% y 2 mM L-glutamina.
- Preparar timidina 100 mM: disolver 24,2 mg en 1 ml de H2O a 37 ° C por agitación. Filtro de esterilizar y mantener a 4 ° C.
- Las soluciones comunes
- Preparar 0,05% de tripsina / EDTA: 0,05% de tripsina, EDTA 0,625 mM en solución salina tamponada con fosfato 1x (PBS). Filtro de esterilizar y almacenar alícuotas a -20 ° C. Una vez descongelado, mantenga alícuota a 4 ° C.
- Preparar HBS2x: NaCl 280 mM, HEPES 50 mM, 1,5 mM Na 2 HPO 4. Ajustar el pH entre 7.1 a 7.5 exactamente con NaOH 10 N. Filtro estéril y mantener a 4 ° C.
2. Recubrimiento de las placas de cultivo celular con fibronectina y Chapado de células HeLa-RFP-H2B
NOTA: Antes del experimento, cada manipulador debe establecer las condiciones óptimas de chapado de células para conseguir una densidad adecuada de las células ya que las variaciones pueden OCcur entre cada manipulador y cada línea celular diferente.
- El día antes del experimento, las células HeLa expanda-RFP-H2B para asegurarse de que están dentro de la fase exponencial de crecimiento en el día de la siembra. Hacer 2 1/3 sucesivas diluciones en placas de 10 cm a partir de una placa de 1x10 cm confluente 80%.
NOTA: Planificar el número de placas para el experimento. Calcula cada condición como duplicados, uno para formación de imágenes en vivo de células a corto plazo y uno para la proteína de los extractos para determinar la eficacia de la caída y expresión de la proteína exógena mediante análisis de transferencia Western. Planificar una placa adicional para determinar el número de células antes de la transducción de virus. - Antes de la célula de recubrimiento, platos de fondo de cristal abrigo con 10 mg / ml de fibronectina. Añadir 1 ml de una dilución 1: 100 de 1 mg / ml de fibronectina (diluido en PBS estéril 1x) por 35 mm plato para así cubrir toda la superficie y se incuba durante 1 hora a 37 ° C, 5% de CO 2.
- Durante la incubación, aMEM pre-calentamiento complementado wiTH 10% de FBS (aMEM 10%) y 0,05% de tripsina / EDTA a 37 ° C.
- Después de 45 min de incubación, comenzar a preparar la solución de células. En la campana estéril, aspirar el medio de una placa de 10 cm, lavar suavemente dos veces con 1,5 ml de tripsina al 0,05% / EDTA, y dejar 0,5 ml de tripsina / EDTA a la última aspiración.
- Se incuban las células durante 2-3 min a 37 ° C, 5% de CO 2. Golpeando suavemente la placa y la observación bajo el microscopio, verifique que todas las células se hayan separado. Añadir 10 ml de aMEM 10% y de pipeta suavemente varias veces para separar las células. Contar una muestra de 10 l de la suspensión celular utilizando un hemocitómetro.
- solución de fibronectina aspirado de las placas de fondo de cristal. No permita que la fibronectina se seque antes de chapado celular.
- Plate 1.5x10 5 células por placa de 35 mm en 2 ml aMEM 10% y se incuba a 37 ° C, 5% de CO 2. Verificar después de 30 a 45 minutos bajo el microscopio que las células son bien SEPAclasificar, ya que tienen la tendencia a acumularse en el centro de la placa.
- Si fuera necesario, agitando suavemente las placas en sentido transversal para redistribuir las células. Plate uno 35 mm placa adicional para el número de condiciones con el fin de contar el número de células antes de la transducción de virus.
- Se cultivan las células hasta el día siguiente para lograr una densidad de células de al menos 50%. A menor densidad celular de 50% resulta en una disminución significativa de la eficiencia de transducción de virus, el aumento de las variaciones de la expresión de proteína por célula, y el aumento de la toxicidad celular.
NOTA: El recubrimiento de los platos de cristal con fibronectina mejora el crecimiento celular y la morfología y promueve la progresión adecuada de células a través de la mitosis. Por lo general, se puede sustituir por gelatina comercialmente disponible que es más barato.
3. Adenovirus Transducción y proteína endógena Knockdown de siRNA transfección en células HeLa-RFP-H2B Usando CAPI precipitados
¡Precaución! Trabajoción con los virus requiere precauciones especiales y una disposición adecuada de todo el material que ha estado en contacto con el virus.
¡Atención! En nuestras manos, CAPI precipita a menudo tienen efectos más indeseables, por ejemplo, en los procesos biológicos relacionados con el tráfico de vesículas (por ejemplo, la autofagia). Por consiguiente, se recomienda el uso de un reactivo de transfección de lípidos catiónicos (ver abajo) y esperar al menos 48 horas antes de los análisis.
NOTA: Un adenovirus de control que lleva un gen no relacionado (es decir, LacZ) o ningún gen se utiliza para llegar a un MOI mínimas en todos los Adenofections (10-20 pfu / célula), utilizando la menor cantidad de adenovirus recombinante que lleva el gen de interés.
NOTA: Este procedimiento se ha demostrado que ayuda a normalizar la expresión por célula en una población de células grandes.
- Un día después de la siembra de células, contar el número de células de la placa de chapado adicional. Aspirar el medio yenjuagar una vez con 1 ml 0,05% de tripsina / EDTA. Añadir de nuevo 1 ml de 0,05% de tripsina / EDTA y se incuba a 37 ° C, 5% de CO 2 hasta que todas las células se han separado. Se separan las células bien con una pipeta de 1 ml y contar el número de células por ml utilizando un hemocitómetro.
- Determinar la cantidad de virus necesaria para la transducción de células a una multiplicidad de infección (MOI) de 2 unidades formadoras de placa (UFP) de la proteína de interés (POI) por célula y 18 PFU por célula de un vector vacío (por ejemplo, LacZ) para tener un total de 20 PFU por célula. Al mismo tiempo transducir 4 PFU de cada uno de baculovirus (actina y αTubulin, GFP y RFP-etiquetados respectivamente). Transducir las células utilizando el siguiente protocolo adenofection. Se utilizaron los virus como se describe en Fuchs et al. 14
- Preparar en una campana estéril un tubo de plástico 1,5 ml para cada condición y añadir 400 l de tibia aMEM-menos 10%.
- Descongelar una alícuota de los virus lentamente en hielo y, si es necesario, diluir tél stock de virus con el fin de pipeta un volumen superior a 1 l de reducir al mínimo los errores de pipeteo.
- Añadir la cantidad de virus calculado por condición a cada tubo de plástico de 1,5 ml que contenía 400 aMEM-menos l 10% y mezclar suavemente con la pipeta. Coloque la solución madre de virus inmediatamente de nuevo a -80 ° C para mantener su actividad.
- Aspirar el medio de las células y pipetear suavemente la mezcla de virus gota a gota. Se incuban las células a 37 ° C, 5% de CO 2 y agitar las placas cuidadosamente bajo la campana estéril cada 15 min durante 1 hora para cubrir así las células con el virus. El uso de una pequeña cantidad de medio facilita el contacto del virus con las células.
- Después de la incubación, pipetear suavemente 1,6 ml aMEM-menos 10% a cada placa para obtener un volumen total de 2 ml, iniciar la sincronización de células mediante la adición de timidina 2 mM y se incuban las células durante un 2 hr a 37 ° C, 5% de CO 2 .
- Mientras tanto, preparar las followi mezcla de transfección siRNAng el método de transfección CAPI (véase la Figura 1). Si hay siRNA es necesario, reemplazar la cantidad de siRNA de agua estéril para realizar una transfección vacía.
- Calcular 200 l de mezcla para cada condición, resultando en 400 l por duplicado. El siguiente ejemplo se da para una concentración de siRNA final de 50 nM y tiene que ser adaptado para cada proteína de interés. En un tubo de plástico de 1,5 ml, pipeta de 50 l 1 M CaCl 2 y 11 l de 20 mM de siRNA en 139 l de H 2 O estéril y mezclar mediante agitación. Después de una vuelta rápida, añadir con cuidado gota a gota 200 l HBS2x (NaCl 280 mM, HEPES 50 mM, 1,5 mM Na 2 HPO 4, pH 7.1 a 7.5).
NOTA: El menor tamaño de las gotas más pequeñas son el los precipitados, lo que resulta en una mejor eficiencia de transfección. Mezclar suavemente tres veces por inyección de aire usando una pipeta de l-200. - Incubar la mezcla durante 30 min a RT. Agregar lentamente gota a gota 200 l de mezcla de transfección a cada placa yagitar en sentido transversal. La transferencia de las placas a 37 ° C, 5% de CO2 durante 16 horas.
- El día siguiente, enjuagar las células dos veces con 2 ml de HEPES cálidos (KCl 6,7 mM, NaCl 150 mM, HEPES 10 mM, pH 7,3) y se añade 2 ml aMEM-menos 10%. No continúe con más de cuatro placas de las células en un momento dado que las variaciones en la temperatura afectan a la longitud del ciclo celular.
- Visualizar la eficiencia de infección con un microscopio fluorescente invertido con un aumento de 20-40x (aire) y adquirir tres imágenes representativas por condición en ambos canales fluorescentes y de transmisión para la documentación. Siete horas después, añadir timidina 2 mM y se incuba durante otras 16 horas a 37 ° C, 5% de CO 2.
- Al día siguiente, 48 horas después de siRNA transfección e infección por el virus, lavar las células dos veces con 2 ml de solución salina tampón fosfato caliente (PBS) y la liberación durante 7 horas en 2 ml aMEM 10% w / o rojo de fenol para imágenes de células vivas o con fenol rojo para la extracción de proteínas.
- Células de cosecha para cada condición de 48 horas después de la transfección para la preparación de extractos de proteína y análisis de transferencia Western para determinar la eficiencia de la precipitación y la expresión de la proteína endógena 15.
NOTA: Utilice anticuerpos contra la proteína de interés, así como los anticuerpos apropiados que sirven como controles de carga. La eficiencia de la precipitación debe ser determinada por la carga de cantidades decrecientes de los lisados de células de control (transfectadas con ARNsi de control), para proporcionar una curva de valoración (es decir, 1, ½, ¼, ⅛).
4. La transducción de adenovirus y la proteína endógena Knockdown de siRNA transfección en células HeLa El uso de un reactivo de transfección lípido catiónico
NOTA: Aquí se presenta un protocolo que fue adaptado para experimentos que no implican la sincronización de células y / o cuando siRNA transfección no se puede realizar por el método CAPI, por ejemplo para evitar efectos tóxicos indeseables en algunas células linES. Este protocolo también incluye una etapa replating celular después de adenofection el fin de trabajar a una densidad celular adecuada. Sólo hemos probado el reactivo de transfección lípido catiónico.
¡Atención! El trabajo con los virus requiere precauciones especiales y una disposición adecuada de todo el material que ha estado en contacto con el virus.
- Placa de 1,75 x 10 5 células por placa de 35 mm en 2,5 ml aMEM 10% y se incuba a 37 ° C, 5% de CO 2. Plate uno 35 mm placa adicional para el número de condiciones con el fin de contar el número de células antes de la transducción de virus.
- Se cultivan las células hasta el día siguiente para lograr una densidad de células de al menos 50%. Una densidad celular de menos de 50% resulta en una disminución significativa de la eficiencia de transducción de virus, el aumento de las variaciones de la expresión de proteína por célula, y el aumento de la toxicidad celular.
- Un día después de la siembra de células, contar el número de células de la placa de chapado adicional. Aspirarel medio y enjuague una vez con 1 ml 0,05% de tripsina / EDTA. Añadir de nuevo 1 ml de 0,05% de tripsina / EDTA y se incuba a 37 ° C, 5% de CO 2 hasta que todas las células se han separado. células separadas pocillo usando una pipeta de 1 ml y contar el número de células por ml.
- Determinar la cantidad de virus necesaria para la transducción de una multiplicidad de infección (MOI) de 20-40 unidades formadoras de placas (UFP) de la proteína de interés (POI) por célula y 0-20 PFU por célula de un vector vacío (por ejemplo, LacZ) que tiene un total de 40 PFU por célula.
- Preparar en una campana estéril un tubo de plástico de 1,5 ml para cada condición y añadir 400 l de aMEM tibia 10%.
- Descongelar una alícuota de los virus lentamente en hielo y, si es necesario, diluir la solución madre de virus con el fin de pipeta un volumen superior a 1 l para minimizar los errores de pipeteado.
- Añadir la cantidad de virus calculada por condición a cada tubo de plástico de 1,5 ml que contenía 400 l aMEM 10% y mezclar suavemente con la pipeta. º lugare stock de virus inmediatamente de nuevo a -80 ° C para mantener su actividad.
- Aspirar el medio de las células y pipetear suavemente la mezcla de virus gota a gota. Se incuban las células a 37 ° C, 5% de CO 2 y agitar las placas cuidadosamente bajo la campana estéril cada 15 min durante 1 hora para cubrir así las células con la dilución de virus. El uso de una pequeña cantidad de medio facilita el contacto del virus con las células.
- Mientras tanto, preparar la mezcla de transfección siRNA siguiendo el método de transfección. Si hay siRNA es necesario, reemplazar la cantidad de ARNsi por medio sin suero para realizar una transfección vacía.
- El siguiente ejemplo se da para una concentración de siRNA final de 50 nM y tiene que ser adaptado para cada proteína de interés. Para cada adenofection, preparar uno 1,5 ml tubo de plástico que contiene 416 nM siRNA en 150 l de medio sin suero (por ejemplo, 6,25 l 20 siRNA mu M + 144 l de medio sin suero) y uno containi tubo de plástico de 1,5 mlng reactivo de transfección de lípidos 6,25 l catiónico + 144 l de medio sin suero.
- Mezclar el contenido de cada tubo de plástico pipeteando arriba y abajo varias veces con una pipeta de 200 l. Combinar el contenido de ambos tubos y mezclar pipeteando arriba y abajo varias veces con una pipeta de 200 l. Incubar durante 5 min a TA.
- Después de la incubación con el virus, una pipeta suavemente 1,8 ml aMEM 10% a cada placa para obtener un volumen total de 2,2 ml e inmediatamente se añade lentamente gota a gota la mezcla de transfección de siRNA a cada placa y agitar en sentido transversal. La transferencia de las placas a 37 ° C, 5% de CO2 durante 24 horas.
- El siguiente día, re-placa de las células de cada placa de 35 mm en cuatro nuevas placas de 35 mm en 2,5 ml aMEM 10% cada uno y se incuba durante otras 24 horas adicionales a 37 ° C, 5% de CO 2.
- El día siguiente, 48 horas después de la transfección de ARNsi y la infección por virus, células de la cosecha de una placa para cada condición para la preparación deextractos de proteína y análisis de transferencia Western para determinar la eficiencia de la precipitación y la expresión de la proteína endógena 15.
NOTA: Con las placas restantes, proceder a la fijación de células, utilizando el protocolo de elección y someter las muestras a análisis de inmunofluorescencia con los anticuerpos de interés 14.
5. Imágenes de células vivas de células mitóticas y Análisis de Datos
- Realizar experimentos de imágenes de células vivas a corto plazo sobre las células mitóticas con un microscopio invertido equipado con una cámara húmeda / 5% de CO 2 / termo-regulada.
NOTA: En este estudio, se utilizó un microscopio confocal de disco giratorio (40X, 0,75 NA), equipado con un EMCCD enfrió la cámara de carga acoplada a -50 ° C. - Antes de la adquisición, compruebe que la cámara ha alcanzado la temperatura adecuada de 37 ° C.
NOTA: Este proceso puede tardar varias horas dependiendo del sistema microscópico. - Colocar las placas de cultivo en el micrcámara oscope 1 hr antes de la adquisición para permitir el equilibrio adecuado de el medio y evitar la deriva de enfoque debido a cambios de temperatura. Supervisar el estado mitótico de las células. En este punto, el 10-15% de las células deben estar en las primeras fases de la mitosis (profase-prometaphase).
- Durante el tiempo de equilibrio, configurar los parámetros de adquisición según lo determinado en los experimentos anteriores. Típicamente, un tiempo de exposición para ambos canales (488 y 594) de 0,2 a 3 segundos con una intensidad de láser de 100% y una sensibilidad de 121 a 130 son parámetros adecuados en nuestras manos.
En primer lugar se deben hacer pruebas para determinar la intensidad del láser y la adquisición de tiempo / intervalo mínimo que se traducen en una resolución apropiada con photobleaching mínimo que provoca daños celulares y perturba la progresión mitótico: NOTA. - Elija varios campos por condición para obtener un número significativo de células para analizar sin exceder el intervalo de adquisición. El uso de un sistema confocal disco giratorio, una configuración típica enCLUDE cuatro condiciones diferentes campos, 7 por placa y 2 canales de color (488 y 594) con un intervalo de 1,5-2 min durante un período de 75 min-.
- Elija las células que se encuentran en la entrada mitótico, vuelva a ajustar el foco una vez que todos los campos han sido elegidos y comenzar la adquisición lo más rápido posible.
- Monitorear la estabilidad del sistema por al menos tres puntos de tiempo y volver a ajustar el enfoque si es necesario.
- Después de la primera imagen de células vivas a corto plazo de 75 min, nuevos campos de las células mitóticas pueden ser elegidos para adquirir una segunda serie de películas para aumentar el número de células que se analizan.
- Determinar criterios bien definidos para analizar los fenotipos de la mitosis de las células, lo cual dependerá de los marcadores fluorescentes se utilizan. Los defectos en la mitosis pueden incluir el tiempo pasado en la mitosis prolongada (de la descomposición nuclear hasta la anafase), desalineación cromosoma, oscilación del eje, y la corteza formación de ampollas en el 14.
6. LifeAct-TagGFP2 Adenovirus Transducción en Differentiating ratón C2C12 mioblastos
NOTA: El protocolo adenofection es también aplicable a los mioblastos C2C12 de ratón difíciles de infectar sometidos a la diferenciación.
- Plate 2 x 10 5 C2C12 células en placas de cultivo de 35 mm en medio de crecimiento en plástico o en un sustrato de elección.
NOTA: La diferenciación celular se mejora en los platos gelatine- o matrigel recubierto. Planificar una placa adicional para determinar el número de células antes de la transducción de virus. - El día siguiente, las células debería haber alcanzado 80% de confluencia. Inducir la diferenciación de mioblastos por lavado de las células dos veces con PBS caliente y la adición de 2 ml de medio de diferenciación (DM).
- El día siguiente, etiquetado como día 1 (D1) de la diferenciación, transducir miocitos con adenovirus LifeAct-TagGFP2 para visualizar el citoesqueleto de actina en células vivas. Contar el número de células de la placa adicional como se describe en el punto 3.2. Calcular 5 UFP / célula de adenovirus LifeAct-TagGFP2 y 45 UFP AdLacZ / celular tras el examenPLE describe en la Tabla 1. La cantidad total de virus es 50 PFU / célula. Se utilizaron los virus como se ha descrito 14
- Preparar en una campana estéril un tubo de plástico de 1,5 ml para cada condición y añadir 400 l de tibia DM.
- Descongelar una alícuota de los virus lentamente en hielo y, si es necesario, diluir la solución madre de virus con el fin de pipeta un volumen superior a 1 l para minimizar los errores de pipeteado.
- Añadir la cantidad apropiada de partículas de virus por condición a cada tubo de plástico 1,5 ml que contiene 400 l DM y mezclar suavemente pipeteando. Coloque la solución madre de virus inmediatamente de nuevo a -80 ° C para mantener su actividad.
- Aspirar el medio de las placas y la pipeta suavemente la mezcla de virus gota a gota. Se incuban las células a 37 ° C, 5% de CO 2 y agitar las placas cuidadosamente bajo la campana estéril cada 15 min durante un total de 1 hr para cubrir así las células con el virus.
- Después de la incubación, la pipeta suavemente 1,6 ml DM en cada plato y continuar con la incubation para un 2 h más a 37 ° C, 5% de CO 2.
- Mientras tanto, preparar una mezcla de transfección vacía siguiendo el método de transfección CAPI. Calcular 200 l de mezcla para cada condición. Utilice el ejemplo siguiente para un volumen total de 400 l de mezcla.
- En un tubo de plástico de 1,5 ml, pipeta de 50 l 1 M de CaCl2 en 150 l de H 2 O estéril y mezclar mediante agitación. Después de una vuelta rápida, añadir con cuidado gota a gota 200 l HBS2x (NaCl 280 mM, HEPES 50 mM, 1,5 mM Na 2 HPO 4, pH 7.1 a 7.5). Mezclar suavemente por inyección de aire tres veces con una pipeta de 200 l.
- Incubar la mezcla durante 30 min a RT. Añadir lentamente gota a gota 200 l de la mezcla de transfección a cada placa y agitar en sentido transversal. La transferencia de las placas a 37 ° C, 5% de CO2 durante 16 horas.
- Al día siguiente, lavar las células dos veces con 2 ml de HEPES cálidos (KCl 6,7 mM, NaCl 150 mM, HEPES 10 mM, pH 7,3) y añadir 2 ml DM. Visualizar el infeeficiencia cción bajo un microscopio de fluorescencia invertida con un aumento de 20-40X (aire) y adquirir tres imágenes representativas por condición en ambos canales fluorescentes y de transmisión para la documentación.
- Dependiendo de la configuración de la prueba deseada, siga la diferenciación en miotubos durante varios días. Las células pueden ser fijos y posteriormente sometidos a análisis de inmunofluorescencia o estudios de imágenes de células vivas se puede realizar.