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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Describimos un método para medir la velocidad de los fagosomas que se mueven hacia el centro celular en células vivas infectadas con o sin el virus de inmunodeficiencia humana (VIH) tipo 1, utilizando microscopía de fluorescencia confocal de disco giratorio para identificar células infectadas fluorescentes y microscopía de campo claro para detectar fagosomas.
Los macrófagos son células fagocíticas que desempeñan un papel importante en la encrucijada entre la inmunidad innata y la específica. Pueden ser infectados por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH)-1 y, debido a su resistencia a sus efectos citopáticos, pueden considerarse reservorios virales persistentes. Además, los macrófagos infectados por el VIH exhiben funciones defectuosas que contribuyen al desarrollo de enfermedades oportunistas.
Se desconoce el mecanismo exacto por el cual el VIH-1 altera la respuesta fagocítica de los macrófagos. Anteriormente habíamos demostrado que la absorción de diversos materiales particulados por parte de los macrófagos se inhibía cuando estaban infectados con el VIH-1. Esta inhibición fue solo parcial y se formaron fagosomas dentro de los macrófagos infectados por el VIH. Por lo tanto, nos centramos en analizar el destino de estos fagosomas. La maduración de los fagosomas se acompaña de la migración de estos compartimentos hacia el centro celular, donde se fusionan con los lisosomas, generando fagolisosomas, responsables de la degradación del material ingerido. Utilizamos glóbulos rojos de oveja opsonizados con IgG como diana para la fagocitosis. Para medir la velocidad del movimiento centrípeto de los fagosomas en macrófagos individuales infectados por el VIH, utilizamos una combinación de microscopía confocal de campo claro y fluorescencia. Establecimos un método para calcular la distancia de los fagosomas hacia el núcleo, y luego para calcular la velocidad de los fagosomas. Las células infectadas por el VIH se identificaron gracias a un virus que expresa GFP, pero el método es aplicable a células no infectadas o a cualquier tipo de infección o tratamiento.
Los macrófagos desempeñan un papel importante en el sistema inmunitario innato y en la homeostasis. Son fagocitos profesionales que internalizan y eliminan patógenos y desechos mediante un proceso llamado fagocitosis 1,2. El fagosoma, el compartimento cerrado que se forma después de la inmersión del material particulado, sufre una serie de eventos de fusión y fisión con compartimentos endocíticos, lo que conduce a un compartimento degradativo llamado fagolisosoma. Este compartimento tiene un pH ácido, debido a la adquisición de v-ATPasas que bombean protones, contiene enzimas hidrolíticas y está enriquecido en proteínas de membrana asociadas a lisosomales (LAMP). La maduración de los fagosomas se acompaña de su migración en los microtúbulos 3,4 hacia el centro celular para llegar a una localización perinuclear donde se acumulan los lisosomas.
Se ha reportado que muchos patógenos secuestran la maduración del fagosoma, incluyendo bacterias con estilos de vida intracelulares que modifican el ambiente vacuolar donde residen 5. El Virus de Inmunodeficiencia Humana (VIH)-1 se dirige a los macrófagos además de a las células T. Como los macrófagos son resistentes a los efectos citopáticos del virus, a diferencia de las células T, pueden considerarse como un reservorio del virus. Además, los macrófagos infectados con el VIH-1 muestran funciones fagocíticas defectuosas y contribuyen a la aparición de enfermedades oportunistas. En particular, la enfermedad invasiva grave por Salmonella no tifoidea causada por Salmonella Typhimurium ST313 ha sido prevalente durante las últimas tres décadas en niños o adultos del África subsahariana infectados por el VIH 6. Se ha estimado que el riesgo de contraer tuberculosis es más de 20 veces mayor en las personas que viven con el VIH que en las que no están infectadas por el VIH.
Por todas estas razones, es importante definir mejor los mecanismos moleculares que subyacen a los defectos fagocíticos en los macrófagos infectados por el VIH. Hemos demostrado que la absorción de material particulado, partículas opsonizadas, bacterias u hongos, se inhibió en los macrófagos infectados por el VIH 7. Dado que esta inhibición es parcial, nos propusimos analizar el destino de los fagosomas internalizados en macrófagos humanos infectados por VIH 8. Debido a que la maduración del fagosoma está estrechamente relacionada con la migración al centro celular y la fusión con los lisosomas, un defecto en la maduración del fagosoma puede deberse a modificaciones de las modalidades de tráfico en la célula infectada. El método descrito aquí utiliza glóbulos rojos de oveja opsonizados con IgG (IgG-SRBC) como modelo para dirigirse a la fagocitosis mediada por receptores y, en particular, a los receptores de la porción Fc de las inmunoglobulinas (FcR). Estas partículas son más fáciles de visualizar en campo claro (BF) que las perlas de látex porque los SRBC extracelulares e intracelulares muestran diferentes propiedades de refracción. Para medir la velocidad de los fagosomas que se mueven hacia el núcleo en los macrófagos infectados por el VIH, utilizamos un virus fluorescente 10 y establecimos un método de seguimiento manual simple que se describe aquí. El método no requiere programación avanzada y simplemente utiliza ImageJ. Es susceptible a las células adherentes y a cualquier tipo de partícula o patógeno que pueda visualizarse con microscopía de campo claro o con imágenes fluorescentes.
El protocolo tiene que ser llevado a cabo en estricta conformidad con las legislaciones nacionales e internacionales y reglamentos locales. La sangre de donantes sanos que dieron su consentimiento para donar sangre con fines de investigación se ha obtenido a partir de los centros de transfusión de sangre con la que las instituciones han firmado un acuerdo. protecciones especiales se deben tomar cuando se utiliza la sangre humana. Los experimentos con VIH-1 deberán efectuarse en un nivel de bioseguridad 3 o 2 (BSL-3 o 2) de laboratorio de acuerdo con la legislación local.
1. Preparación de macrófagos derivados de monocitos humanos (hMDMs) por centrifugación en gradiente de densidad y selección por adherencia
2. Producción y cuantificación de VIH-1 reservas virales
NOTA: NLR4.3 VIH-1 Gag-IGFP (proteína verde fluorescente) que lleva un sobre R5-trópico, obsequio de M. Schindler 10 se usa para infectar a los macrófagos y para ver las células infectadas en tiempo real.
3. La infección de hMDMs con VIH-1
4. La opsonización de ovejas Glóbulos rojos
5. Ensayo en vivo de la célula microscopía de vídeo fagocitosis
6. Análisis de las películas a intervalos


Fagocitosis mediada por FcR hMDMs infectados por el VIH-1 y no infectados se describe aquí usando SRBCs opsonized-IgG como objetivos modelo (Figura 1). Los pasos críticos de este protocolo son la preparación de hMDMs y la infección con el VIH-1. De hecho, el rendimiento y la calidad de macrófagos diferenciados varía entre los donantes, así como la tasa de infección con eficiencias en el rango de 10-40%. Además, la preparación de IgG-opsonizado-SRBC también es importante para evitar daños en los eritrocitos, porque esto podría inducir su reconocimiento y captación como los desechos en lugar de por fagocitosis mediada por FcR. opsonización óptima se asegurará de fagocitosis eficaz.
movimiento fagosoma en vivir los macrófagos infectados por el VIH se analiza en tiempo real con el canal de BF en un microscopio confocal de disco giratorio en el laboratorio BSL-3. Los ajustes del canal BF son t críticoo ver el núcleo (Figura 2, círculo azul) y para discriminar el exterior (Figura 2, las puntas de flecha rojos) a partir de los SRBC internalizadas (figura 2, círculos rojos). La microscopía de BF se considera como la técnica de iluminación microscopía óptica simple suficiente para ver los fagosomas, que son menos refringente de los SRBC externos.
El primer paso después de la adquisición de secuencias de imágenes es el seguimiento manual del software ImageJ (Figura 3). Este punto puede ser particularmente largo y tedioso, ya que es preferible realizar un seguimiento de cada fagosoma, uno por uno para todas las secuencias de imágenes y se considera que los experimentos necesitan ser repetidas con al menos 3 donantes por condición para llegar a un tamaño de la muestra lo suficientemente grande para análisis estadístico (por lo menos 30 fagosomas con 3 donantes diferentes).
El segundo paso es el análisisen una hoja de cálculo para calcular la velocidad fagosoma durante los primeros 5 minutos después de la internalización por cada SRBCs internalizados (Figura 4). Para ello, se traza para cada fagosoma la distancia recorrida durante los primeros 5 minutos para el tiempo. Un ejemplo representativo se muestra en hMDMs no infectados en la figura 5A. Siguiente se obtiene la velocidad del fagosoma, que es la pendiente de la curva de regresión lineal. Se encontró una velocidad de 0,5384 m / min para este fagosoma.
Es de destacar que es posible analizar la velocidad fagosoma durante los primeros minutos después de la internalización, tal como se describe aquí o en Dumas et al. 8, o más tarde mediante el análisis de la velocidad en escalas de tiempo más largos. En nuestro estudio, se observó que la velocidad fagosoma durante los primeros 5 minutos después de la internalización en hMDMs infectados por el VIH es menor en comparación con hMDMs no infectadas (Figura 5B).

Figura 2. adquisición en tiempo real durantefagocitosis por el control representativo y hMDMs infectados por el VIH. hMDMs se preparan y se infectaron como se describe en la Figura 1. Se detectan las células NLR4.3 VIH-1Gag-IGFP infectadas con el láser de 491 nm. Z-pilas de disco giratorio confocal de imágenes se adquieren y se analizaron mediante el software de adquisición de microscopio y ImageJ (paneles de la izquierda). Galerías de imágenes BF representan un (paneles superiores correspondientes a la película 1) no infectadas y un NLR4.3 VIH-1Gag-IGFP infectados (paneles inferiores correspondientes a la película 2) celular durante una adquisición de 45 min (46 imágenes con el tiempo indicados como hh : mm). La membrana celular (línea de puntos negro), el núcleo (círculo azul), los eritrocitos de cordero externos (algunos de ellos indican con flechas rojas) y los eritrocitos de cordero internos (algunos de ellos indican con círculos rojos) son detectables en las imágenes BF. Bar = 10 micras. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3. Los pasos de manejo para el análisis de imágenes con el plugin Seguimiento manual en ImageJ. Después de abrir el plugin "Manual de Seguimiento" (1) y cargar el video de lapso de tiempo en el canal de BF (2), entran en los parámetros de la adquisición (3). Haga clic en "Añadir pista" (4) e inicie la medición del seguimiento haciendo clic en uno fagosoma (5) para obtener una nueva ventana con las posiciones X e Y del fagosoma elegido (6, caja roja). Para seguir el fagosoma en la secuencia de tiempo por conveniencia, variar el brillo y el contraste (5 '). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4. Los pasos de manejo para el análisis de datos de velocidad de migración fagosoma en el software de hoja de cálculo. (A) Montar la posición X e Y del núcleo y cada fagosoma (cuadro rojo) en una tabla de hoja de cálculo. En otra columna (caja púrpura), calcular la distancia entre el fagosoma y el núcleo con el teorema de Pitágoras, donde c representa la longitud entre el núcleo y la SRBC y a y b de las longitudes de los otros dos lados de un triángulo rectángulo ( B). (C) Finalmente, se calcula la distancia recorrida por los fagosomas en cada momento (caja verde) restando la distancia entre el SRBC y el núcleo en un momento dado de la distancia inicial en el momento 0. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
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Figura 5. La cuantificación de la velocidad de migración fagosoma en el control y hMDMs infectados por el VIH. (A) Para cada SRBC y justo después de la internalización SRBC, la distancia recorrida hacia el núcleo se mide y se representa frente al tiempo. Su velocidad durante los primeros 5 minutos se calcula mediante regresión lineal en el software de hoja de cálculo. Un experimento representativo se muestra (la SRBC interna de la figura 3-4). (B) Todas las velocidades durante los primeros 5 minutos se miden durante 66 fagosomas en (5) donantes no infectados y 60 fagosomas en las células infectadas por el VIH (4 donantes). Los datos representan la media ± SEM (t de Student no pareada con corrección de Welch; **, P <0,01). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Película 2: movimiento Fagosoma en un macrófago infectado por el VIH representativa. (Haga clic derecho para descargar). VIH-1 (VIH-1 NLR4.3 Gag IGFP) infectados por macrófagos fueron identificados después de la iluminación con el láser 491. Se detectó el movimiento de las células rojas de la sangre en el canal opsonizadas BF durante 45min de la fagocitosis con una imagen por minuto (46 imágenes con el tiempo indicados como hh: mm). Bar = 10 micras.
Los autores no tienen nada que revelar.
Describimos un método para medir la velocidad de los fagosomas que se mueven hacia el centro celular en células vivas infectadas con o sin el virus de inmunodeficiencia humana (VIH) tipo 1, utilizando microscopía de fluorescencia confocal de disco giratorio para identificar células infectadas fluorescentes y microscopía de campo claro para detectar fagosomas.
Agradecemos al Dr. Jamil Jubrail por leer el manuscrito. Este trabajo ha contado con el apoyo de subvenciones del CNRS, el Inserm, la Université Paris Descartes, la Agence Nationale de la Recherche (2011 BSV3 025 02), la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM DEQ20130326518 incluyendo una beca doctoral para GLB) y la Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales (ANRS, incluyendo una beca postdoctoral para CD) a FN. A. Dumas ha sido apoyado por becas doctorales de la Université Paris Descartes y Sidaction.
| Placa de cultivo celular tratada con TC Falcon de 100 mm | Corning | 353003 | Para la producción viral |
| Placas con fondo de vidrio de 35 mm sin recubrimiento 1.5 | Corporación MatTek | P35G-1.5-14-C Caja | Para adquisición |
| Placas de cultivo de tejidos Falcon Thermo | Fischer Scientific | Corning de 6 pocillos. Inc. 353934 | Para macrófagos derivados de monocitos humanos |
| Ficoll-Plaque PLUS | Dominique Dutscher | 17-1440-03 | un polisacárido hidrofílico neutro, muy ramificado, de alta masa, en solución para centrifugación por densidad |
| DPBS, sin calcio, sin magnesio | Thermo Fischer Scientific | 14190-094 | RT |
| Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) 1x, líquido (alta glucosa) | GIBCO, Sondas moleculares | 31966-021 | Conservado a 4 & grados; C ; para el cultivo de células HEK |
| RPMI 1640 medio GLUTAMAX Suplemento | Life technologies | 61870-010 | Conservado en 4 ° C; para la cultura de hMDMs |
| Fœ suero de pantorrilla (FCS) | Eurobio | CVFSVF0001 | Conservado a -20 ° C ; |
| Penicilina-Estreptomicina descomplementada (10.000 U/ml) | Thermo Fischer Scientific | 15140-122 | Conservado a -20 ° C ; para hMDMs cultivo |
| RPMI 1640 medio, sin rojo fenol (10x 500 ml) | Life technologies | 11835-105 | Warm in 37 ° C baño de agua antes de usar; para ensayo de fagocitosis |
| FuGENE6 Reactivo de transfección | Promega | E2692 | Conservado a 4 & grados; C ; para la producción viral |
| Glóbulos rojos de oveja (SRBC) | Eurobio | DSGMTN00-0Q | Conservado en tampón Alsever a 4 & grados; C antes |
| de usar Glóbulos rojos anti-ovejas IgG | MP Biomedicals | 55806 | Conservado a 4 & deg; C |
| Fracción de choque térmico de albúmina sérica bovina, pH 7, ≥ 98% | Sigma | A7906 | Conservado a -20 ° C |
| Microscopio invertido DMI600 | Leica | ||
| Confocal Spinning Disk Unit CSU-X1M1 | Yokogawa | ||
| 491 nm 50 mW láser | COBOLT CALYPSO | ||
| HCX PL APO CS Objectif | Leica | Lente de objetivo ; Aumento 100X ; Apertura numérica 1,40 ; Aceite de inmersión | |
| CoolSnap HQ2 (FireWire) Cámara | Fotometría | Tamaño de píxel 6.45 y micro; m x 6,45 y micro; m ; Definición 1.392 x 1.040 ; Codificación de la imagen en el | |
| software Metamorph 7.7.5 | de 14 bitsMolecular Devices | Para el control del microscopio | |
| Software | GraphPad Prism | Para el análisis estadístico |