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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Drosophila se utiliza ampliamente como un sistema modelo para estudiar la neurodegeneración. Este protocolo describe un método por el cual la degeneración, como se determina por la formación de vacuolas en el cerebro, se puede cuantificar. También minimiza los efectos debido al procedimiento experimental por el procesamiento y control de seccionamiento y moscas experimentales como una muestra.
enfermedades neurodegenerativas progresivas, como la enfermedad de Alzheimer (EA) o la enfermedad de Parkinson (EP) son una amenaza creciente para la salud humana en todo el mundo. Aunque los modelos de mamíferos han aportado importantes conocimientos sobre los mecanismos subyacentes de la patogenicidad, la complejidad de los sistemas de mamíferos, junto con sus altos costos están limitando su uso. Por lo tanto, la simple pero bien establecido modelo de sistema de Drosophila ofrece una alternativa para la investigación de las vías moleculares que se ven afectados en estas enfermedades. Además de anomalías de comportamiento, enfermedades neurodegenerativas se caracterizan por fenotipos histológicos tales como la muerte neuronal y axonopatía. Para cuantificar la degeneración neuronal y para determinar cómo se ve afectada por factores genéticos y ambientales, usamos un enfoque histológico que se basa en la medición de las vacuolas en el cerebro de moscas adultas. Para minimizar los efectos del error sistemático y la comparación directa de las secciones de control y experimental moscas en una preparación, que utilizan el método de "cuello" de las secciones de parafina. La neurodegeneración se evalúa a continuación, midiendo el tamaño y / o número de vacuolas que se han desarrollado en el cerebro de la mosca. Esto se puede hacer ya sea centrándose en una región específica de interés o mediante el análisis de todo el cerebro mediante la obtención de secciones en serie que abarcan la cabeza completa. Por lo tanto, este método permite medir no sólo la degeneración severa, pero también fenotipos relativamente suaves que sólo son detectables en algunas secciones, como ocurre durante el envejecimiento normal.
Con el aumento de la esperanza de vida, las enfermedades neurodegenerativas como el Alzheimer o el Parkinson se han convertido en una amenaza creciente para la salud de la población en general. De acuerdo con los Institutos Nacionales de la Salud, 115 millones de personas en todo el mundo se prevé que se afectados por la demencia en 2050. Aunque se han hecho progresos significativos en la identificación de los genes y los factores de riesgo implicados en al menos algunas de estas enfermedades, para muchos de ellos, el subyacente mecanismos moleculares aún no se conocen o no se entiende bien.
Simples organismos modelo de invertebrados como Caenorhabditis elegans y Drosophila melanogaster ofrecen una variedad de ventajas experimentales para estudiar los mecanismos de las enfermedades neurodegenerativas, incluyendo un ciclo de corta vida, gran número de progenie, y la disponibilidad de métodos genéticos y moleculares bien establecidos y, a veces únicos 1 -12. Además, estos organismos son susceptibles de imparcialpantallas de interacción que pueden identificar los factores que contribuyen a estas enfermedades por sus efectos agravantes o mejorar en fenotipos neurodegenerativos.
El análisis de estas interacciones genéticas y la evaluación de los efectos del envejecimiento requiere protocolos cuantitativos para detectar la neurodegeneración y para medir su gravedad. Esta evaluación puede hacerse con relativa facilidad en la medición de los aspectos de comportamiento en Drosophila, como el aprendizaje olfativo, geotaxis negativos, o fototaxis rápido, que proporcionan un valor numérico rendimiento 13-21. También es posible determinar los efectos sobre la supervivencia neuronal contando las neuronas. Sin embargo, esto sólo es posible cuando se centra en una población específica que se pueda identificar claramente, al igual que las neuronas dopaminérgicas que se ven afectados en la enfermedad, e incluso entonces, los resultados han sido controvertidos 22-24.
El protocolo descrito aquí utiliza el método de cuello para realizar secciones en serie de parafina, un métodoque fue desarrollado originalmente por Heisenberg y Böhl, que lo utilizó para aislar mutantes anatómicas cerebrales en Drosophila 25. El uso del método de cuello posteriormente se ha adaptado, incluso en criosecciones, vibratome secciones y secciones de plástico de 26-28. Aquí, se emplea este método para obtener secciones en serie de toda la cabeza de la mosca, que luego se puede utilizar para medir las vacuolas que se desarrollan en las moscas con fenotipos neurodegenerativas 16,21,29-32. Estas mediciones se pueden hacer en áreas específicas del cerebro o pueden cubrir todo el cerebro; el último enfoque permite identificar incluso débiles fenotipos degenerativas, como se observa durante el envejecimiento. Por último, cuando se utilizan los collares, hasta 20 moscas pueden ser procesados como una preparación, que no sólo es menos tiempo, sino que también permite el análisis de control y las moscas experimentales en la misma preparación, minimizando artefactos debido a ligeros cambios en la preparación.
1. La fijación de la cabeza sobre los cuellos y inclusión en parafina
Nota: Todos los pasos en el proceso de fijación debe hacerse en una campana de humos. Metilbenzoato, mientras que no plantean un riesgo para la salud, tiene un olor muy distinto, que puede ser abrumador si no se manejan en una campana de humos.
2. seccionamiento y de montaje
3. Fotografiar y análisis de las Secciones
Utilizando los resultados método descrito en secciones seriadas teñidas por el pigmento del ojo 33 que abarcan toda la cabeza de la mosca. A parte de esto se muestra en la Figura 1B, donde las secciones de una cabeza individuales se muestran de arriba a abajo. Las secciones de diferentes moscas son vistos de izquierda a derecha en este ejemplo. Para facilitar la orientación y la identificación de las moscas, una mosca sin ojos (oculis sinusoidales) se inserta como un marcador en la posición 3 (flecha, Figura 1B).
Para cuantificar la neurodegeneración, medimos la formación de vacuolas que se pueden detectar en estas secciones. Las vacuolas se definen como redondo, manchas oscuras que están dentro del neurópila verde fluorescente (puntas de flecha en la Figura 2 y 3) o de la corteza y que son visibles en al menos 2 secciones consecutivas del cerebro de la mosca. La cuantificación de la neurodegeneración porvacuolas de medición o bien se puede hacer por centrarse en una región específica del cerebro o mediante el análisis de todo el cerebro. La limitación del análisis a una región específica del cerebro es útil en los casos en que una mutación solamente afecta a una región específica, como los lóbulos olfativos en el futsch 'olk mutante 34, pero también se puede utilizar cuando hay degeneración severa en todos o muchos regiones del cerebro. Un ejemplo de esto último es el queso suizo (SWS) mutante (Figura 2), donde la medición de todas las vacuolas sería demasiado tiempo. Por lo tanto, tomamos sólo una imagen y, para asegurar que las mediciones se realizaron siempre en el mismo nivel, tomamos todas las imágenes a nivel de la gran comisura (GC, figura 2A), que sólo está contenida en una o dos secciones. Mientras que no se detectó la formación de vacuolas en SWS 1 día de edad '1 Las moscas (datos no mostrados), un alelo de pérdida de función 35, algunas vacuolas eran detectables in 7 días de edad SWS '1 Las moscas (puntas de flecha, Figura 2A). Envejecimiento las moscas a 14 d (Figura 2B) y 21 d (Figura 2C) aumentado aún más este fenotipo, mostrando su naturaleza progresiva. Contar el número de vacuolas en el neuropilo deutocerebral (dn) utilizando el método descrito confirmó un aumento significativo en el número de vacuolas con la edad. Además, el área combinada comprendida por vacuolas aumentó significativamente con el envejecimiento (Figura 2D).
Sin embargo, no todos los mutantes muestran un fenotipo tan severa como SWS, y en esos casos, las diferencias en la degeneración son difíciles de determinar cuando se centra en un área pequeña. Del mismo modo, la degeneración que se produce durante el envejecimiento es bastante suave (Figura 3A - C) y por lo tanto, se analizó la totalidad del cerebro cuando la cuantificación de este fenotipo. La determinación de la suma de todas las vacuolas en el cerebro reveladoun aumento significativo con la edad, y esto también fue el caso cuando se mide el área combinada de estas vacuolas (Figura 3D).

Figura 1. parafina secciones en serie. A) Usando el método de cuello, moscas experimentales y de control se pueden procesar como una muestra enroscando ellos en una sola collar. Sin ojos moscas oculis seno se insertan de orientación (flechas). B) Esquema que muestra la orientación de las cabezas de moscas en el cuello. C) En esta imagen, las secciones de diferentes cabezas de moscas están orientados de izquierda a derecha en la diapositiva. De arriba a abajo en la diapositiva, las secciones de serie de la misma cabeza de mosca se pueden ver. En este caso, una mosca oculis sine se insertó en la posición tres (flecha). Las secciones se tiñeron por el pigmento fluorescente ojo que lava sobre el secciones después del corte. La barra de escala en A = 5 mm y en C = 0,5 mm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2. La neurodegeneración progresiva en el mutante queso suizo. Jefe de sección de parafina de 7-día-(A), 14-día-(B) y 21-día-(C) viejos SWS '1 Las moscas. Las puntas de flecha apuntan a vacuolas que se han desarrollado con el envejecimiento. La degeneración relacionada con la edad se cuantificó contando el número de vacuolas y midiendo su área combinada (D). El SEM y el número de moscas analizadas se indica. La barra de escala = 25 micras. *** P <0,001.csource.jove.com/files/ftp_upload/54809/54809fig2large.jpg "target =" _ blank "> Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3. La neurodegeneración se produce con la edad. Sección de la cabeza de parafina de 10-día-(A), 30-día-(B) y 60-día-(C) de edad de tipo salvaje moscas. Las puntas de flecha apuntan a vacuolas que se han desarrollado en las moscas de edad. La degeneración relacionada con la edad se cuantificó contando el número de vacuolas y midiendo su área combinada (D). El SEM y el número de moscas analizadas se indica. La barra de escala = 25 micras. *** P <0,001. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura. </ A>
Los autores no tienen nada que revelar.
Drosophila se utiliza ampliamente como un sistema modelo para estudiar la neurodegeneración. Este protocolo describe un método por el cual la degeneración, como se determina por la formación de vacuolas en el cerebro, se puede cuantificar. También minimiza los efectos debido al procedimiento experimental por el procesamiento y control de seccionamiento y moscas experimentales como una muestra.
Este trabajo fue apoyado por subvenciones a D.K. de la Fundación de Investigación Médica de Oregón y de NIH/NINDS (NS047663). E.S. fue apoyado por una beca de capacitación de los NIH (T32AG023477).
| Nombre del reactivo/equipo | Número | decatálogo | de la empresa |
| Collar | Genesee Scientific | TS 48-100 | Estamos utilizando collares hechos a medida que están hechos de una sola pieza de metal en lugar de capas como los de Genesee. Una descripción sobre cómo hacer collares se puede encontrar en http://flybrain.neurobio.arizona.edu/Flybrain/html/atlas/fluorescent/index.html |
| Bandeja de cubitos de hielo de goma para incrustar | Tiendapara el hogar | El tamaño se puede hacer a medida pegando paredes adicionales | |
| Plato de cristalización | Fisher Scientific company | 08-762-3 | |
| Ether | Fisher Scientific Company | E138-1 | |
| Ethanol | Decon Laboratories Inc. | 2701 | |
| Choloroformo | Fisher Scientific Company | C298-500 | |
| Ácido acético glacial | Fisher Scientific Company | A38-212 | |
| Metilbenzoato | Fisher Scientific Company | M205-500 | Olor distintivo - ¡Uso en campana extractora! |
| Cera de parafina de bajo punto de fusión | Fisher Scientific Company | T565 | Asegúrese de mantener extra derretido en un 65° C |
| Microtomo | de baño de aguaLeica Biosystems | Reichert Jung 2040 Autocut | |
| Portaobjetos de microscopio | Fisher Scientific Company | 12-550D | |
| Cubierta de cristal del microscopio | Fisher Scientific Company | 12-545-M | |
| SafeClear | Fisher Scientific Company | 314-629 | Tres recipientes diferentes para lavados |
| Tarro de tinción vertical con Portada | Ted Pella Inc. | 432-1 | |
| Permount | Fisher Scientific Company | SP15-500 | |
| Solución de poli-L-lisina (PLL) | Sigma Life Science | P8290-500 |