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La radiación ionizante (IR) induce numerosas aberraciones cromosómicas estables e inestables. Las aberraciones inestables, en las que la morfología de los cromosomas se ve sustancialmente comprometida, pueden identificarse fácilmente mediante técnicas convencionales de tinción cromosómica. Sin embargo, la detección de aberraciones estables, que implican el intercambio o la translocación de materiales genéticos sin una modificación considerable en la morfología cromosómica, requiere sofisticadas técnicas de pintura cromosómica que se basan en la hibridación in situ de sondas de ADN marcadas con fluorescencia, una técnica de pintura cromosómica conocida popularmente como fluorescencia in situ hibridación (FISH). Las sondas FISH pueden ser específicas para cromosomas completos o subregiones precisas de cromosomas. El método no solo permite la visualización de aberraciones estables, sino que también puede permitir la detección de los cromosomas o secuencias específicas de ADN involucradas en la formación de una aberración en particular. Hay una variedad de técnicas de pintura cromosómica disponibles en citogenética; aquí se discuten dos métodos altamente sensibles, la hibridación in situ de fluorescencia múltiple (mFISH) y el cariotipo espectral (SKY), para identificar las aberraciones estables intercromosómicas que se forman en las células de la médula ósea de ratones después de la exposición a la irradiación corporal total. Aunque ambas técnicas se basan en sondas de ADN marcadas con fluorescencia, el método de detección y el proceso de adquisición de imágenes de las señales fluorescentes son diferentes. Estas dos técnicas se han utilizado en diversas áreas de investigación, como la biología de la radiación, la citogenética del cáncer, la biodosimetría de radiación retrospectiva, la citogenética clínica, la citogenética evolutiva y la citogenética comparativa.