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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Son muy deseables nuevos modelos y ensayos que mejorarían el proceso de desarrollo temprano de fármacos antituberculosos de próxima generación. Aquí, describimos un ensayo rápido, económico y compatible con BSL-2 para evaluar la eficacia de un fármaco contra Mycobacterium tuberculosis que se puede adaptar fácilmente para el cribado de alto rendimiento.
El proceso temprano de desarrollo de fármacos antituberculosos se ve obstaculizado por la ineficiente traducción de compuestos con actividad in vitro a la eficacia en el entorno clínico. Es probable que esto se deba a la falta de consideración de las barreras de penetración celular fisiológicamente relevantes que existen en el huésped infectado. Recientemente establecimos un modelo de infección alternativo que genera grandes estructuras agregadas de macrófagos que contienen M. tuberculosis (Mtb) densamente empaquetada en su núcleo, que era adecuado para las pruebas de susceptibilidad a los medicamentos. Este modelo de infección es barato, rápido y, lo que es más importante, compatible con BSL-2. Aquí, describimos los procedimientos experimentales para generar estructuras agregadas de Mtb/macrófagos que producirían Mtb pasadas por macrófagos para pruebas de susceptibilidad a medicamentos. En particular, demostramos cómo este sistema de infección podría adaptarse directamente al formato de placa de 96 pocillos, mostrando capacidad de rendimiento para el cribado de bibliotecas de compuestos contra Mtb. En general, este ensayo es una valiosa adición a la caja de herramientas de descubrimiento de fármacos Mtb actualmente disponible debido a su simplicidad, rentabilidad y escalabilidad.
La tuberculosis (TB) sigue siendo una grave amenaza mundial de la salud a pesar de la disponibilidad de regímenes de quimioterapia contra la tuberculosis durante más de 40 años 1. Esto se debe en parte a la necesidad de largos períodos de tratamiento de más de 6 meses utilizando múltiples combinaciones de fármacos, lo que conduce a paciente incumplimiento 2. La aparición de la tuberculosis resistente a los medicamentos en los últimos años se ha agravado aún más los problemas en un campo en el éxito del desarrollo de fármacos clínicamente aprobados es prácticamente inexistente 3. De hecho, a pesar del desarrollo exhaustiva fármaco anti-TB, sólo un único fármaco ha sido aprobado por la FDA para uso clínico en los últimos 40 años 4. Por lo tanto, se necesitan urgentemente nuevas generaciones de fármacos antituberculosos para hacer frente a este problema.
Un problema clave en el descubrimiento de fármacos TB es la falta de éxito de la transferencia a partir de compuestos con actividad in vitro de la eficacia en el ámbito clínico= "xref"> 5, 6, 7. Inicialmente, los enfoques basados diana se utilizan para la detección de drogas anti-Mtb 5, que no se tradujo en células bacterianas enteras. Incluso cuando se utilizan células Mtb, a menudo se lleva a cabo utilizando cultivos de caldo crecido, que no predicen con precisión la eficacia del fármaco in vivo 8, 9. Estos problemas han sido reconocidos y ensayos de cribado de fármacos contra macrófagos que contienen Mtb o latente Mtb se han establecido con éxito 8, 10, 11, 12. Sin embargo, incluso estos ensayos más avanzados no dan suficiente consideración a las barreras de penetración que los medicamentos encuentran en las lesiones pulmonares no vascularizados, y en los focos necróticos en el sitio de la infección. En efecto, Incluso para la primera línea de la tuberculosis rifampicina fármaco, la dosis subóptima ha sido cuestionada debido a insuficiente en el tejido vivo y el líquido cefalorraquídeo (LCR) La penetración de 13, 14, 15, así como una disminución de la eficacia contra intracelular Mtb 8, 9. Como tal, los nuevos modelos y ensayos que tengan en cuenta estos parámetros durante el proceso de desarrollo temprana ventaja, mejoraría sin duda los esfuerzos de descubrimiento de fármacos antituberculosos.
Para hacer frente a esta necesidad, hemos establecido recientemente un modelo de bajo costo, rápida, y BSL-2 compatibles alternativa infección para las pruebas de eficacia de drogas Mtb 16. Este modelo de infección producida densamente poblado Mtb dentro de grandes estructuras de agregados de macrófagos, que recapitula las barreras de penetración celular fisiológicamente relevantes y generó macrófagos passaged Mtb. Mtb derivado de este modelo de infección se combinó con el ensayo de la resazurina de microtitulación (REMA) para evaluar la eficacia del fármaco, que produjo resultados consistentes con otros modelos de infección intracelular y se correlacionó bien con la capacidad reportada de medicamentos comunes de TB para conseguir altas concentraciones de CSF en relación con las concentraciones séricas 16.
A continuación se describe en detalle la generación de estructuras agregadas MTB / macrófagos para producir macrófagos pases Mtb adecuada para las pruebas de sensibilidad a los medicamentos utilizando REMA. En particular, se muestra cómo este sistema la infección podría ser adaptado a un formato de 96 pocillos para la compatibilidad con la detección rendimiento de los fármacos antituberculosos de candidatos.
NOTA: Como M. tuberculosis mc 2 6206 es una cepa no virulenta 17, 18, todos los trabajos en este protocolo se puede realizar en una instalación de Bioseguridad Nivel 2 (BSL-2).
1. Condiciones de cultivo para la proteína verde fluorescente que expresan M. tuberculosis mc 2 6206 (Mtb-GFP)
NOTA: La M. tuberculosis H37Rv derivado auxótrofo cepa 6206 mc 2 (Δ PANCD, Δ leuCD) transformada con el plásmido que expresa GFP pMN437 se utiliza en este protocolo 16. Es posible sustituir la cepa Mtb-GFP con no expresan GFP cepa de tipo salvaje para permitir un acceso más fácil de la cepa para los investigadores. Sin embargo, la expresión de GFP es deseable para permitir la confirmación visual de la fagocitosis y la formación de agregados de Mtb / macrófagos. para long almacenamiento a largo plazo, Mtb-GFP se congelaron a -80 ° C en 7H9 medio completo (descrito en el paso 1.1) suplementado con 20% de glicerol.
2. Las condiciones de cultivo para THP-1 células
3. Protocolo de infección para generar estructuras de Mtb / macrófagos de agregado
4. Ensayo de inhibición del crecimiento para evaluar la eficacia de medicamentos contra Mtb Derivado de MTB / agregados de macrófagos
5. La cuantificación de la eficacia de medicamentos usando el ensayo de microtitulación resazurina
Para confirmar la solidez de la adaptación de este modelo de infección al formato de placa de 96 pocillos, que aquí examinamos la sensibilidad a los medicamentos de Mtb derivado de nuestra 96 pocillos adaptada modelo de infección a la rifampicina (RIF) y moxifloxacina (moxi) de acuerdo con la plantilla dada en la figura 1A. Se demuestra que la generación de estructuras de agregados de macrófagos MTB / clave para este ensayo se puede producir de forma fiable en un formato de placa de 96 pocillos (Figura 2), lo que permite la compatibilidad rendimiento (Figura 1B). Macrófagos passaged Mtb producido de esta manera se puede utilizar directamente para las pruebas de la eficacia del fármaco usando el ensayo de microtitulación de resazurina bien caracterizado (Figura 3).
Como el ensayo de la resazurina se basa en las especies oxidativas producidas por Mtb metabólicamente activa para convertir la resazurina azul a la fluorescent resorufina rosa, el cambio de color y la fluorescencia se puede utilizar como un marcador sustituto para determinar la cantidad de crecimiento bacteriano. En la Figura 3A, se muestra que hay suficiente sensibilidad en el ensayo de la resazurina a detectar de forma fiable las bacterias Mtb viables capaces de replicarse en ausencia de fármacos después de sólo 3 días de incubación. Mientras que la confirmación visual de cambio de color de punto final es solamente una evaluación aproximada del crecimiento, podemos cuantificar con precisión mediante la medición de esta cinéticamente la conversión de la resazurina a su metabolito fluorescente resorufina usando un lector de placas (Figura 3B). Usando estos datos, la normalización para el control de crecimiento positivo (ausencia de fármacos) permite el cálculo de las curvas de la matanza de susceptibilidad para visualizar la eficacia del fármaco contra Mtb macrófagos a pases (Figura 4).
Aquí, los resultados representativos en las figuras 3 4 muestran que la concentración mínima inhibitoria (MIC), definida como la concentración más baja del antibiótico a la que se observó la inhibición del crecimiento del 90%, es mayor que 2 g / ml tanto para la rifampicina y moxifloxacina contra Mtb derivado de nuestro modelo de infección. Esto demuestra que nuestro modelo de infección predice la eficacia de los medicamentos contra Mtb que están más en línea con los valores de MIC contra determinados intracelular Mtb 8, y por lo tanto refleja las propiedades de barrera de difusión que son abandonados en la mayoría de los ensayos de sensibilidad a los medicamentos Mtb utilizando células bacterianas en caldo crecido.
Es importante destacar que los datos obtenidos mediante el ensayo descrito en el formato de 96 pocillos mostraron resultados altamente comparables a los que habíamos determinado previamente para la rifampicina y moxifloxacina contra Mtb macrófagos passaged 16.

Figura 2: Generación de Mtb / estructuras agregadas de macrófagos en placas de 96 pocillosformato. (A) Representante de campo claro y GFP se fusionaron imágenes de Mtb agregados -macrophage el día 9 después de la infección. Las imágenes fueron capturadas con un objetivo 4X usando un programa de formación de imágenes de células automatizado que documenta todo el pozo por la costura de un montaje de 3 por 3 imágenes capturadas de forma individual. (B) Una imagen individual no cosido del campo visual se muestra en (A). Imagen del campo brillante y GFP (C) Un representante fusionada de una estructura agregada Mtb / macrófagos capturado con un objetivo de 10X. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Usando el ensayo de microtitulación resazurina para medir la viabilidad de Mtb. (A) La presencia de viablcélulas e Mtb se pueden determinar simplemente mediante la conversión del colorante resazurina azul a su rosa, forma reducida. Los resultados representativos se muestran aquí usando rifampicina (RIF) y moxifloxacina (moxi) de acuerdo con la plantilla en la Figura 1A. (B) Para medir cuantitativamente la conversión de la resazurina, la fluorescencia de los pocillos individuales (que corresponde a la figura 3A) se controla cinéticamente durante 24 h como se describe en el paso 5. representativos mini-gráficos muestran unidades de fluorescencia relativa (eje y) frente al tiempo (x -eje). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Determinación de la susceptibilidad al fármaco matar curvas a partir de datos REMA. unidades de fluorescencia relativa en el momento de máxima resazseñal urin en rifampicina (A) y (B) tratado con moxifloxacino pozos (de la Figura 3B) se normalizaron a la no control de drogas (crecimiento Mtb máxima) como 100% de supervivencia. control de fondo señales (en blanco) se restaron de cada pocillo de muestra. El porcentaje de supervivencia se trazó para cada concentración individual de tratamiento de drogas para generar una curva de muerte. Los datos de esta figura representan la media ± SD de tres experimentos independientes. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Los autores no tienen nada que revelar.
Son muy deseables nuevos modelos y ensayos que mejorarían el proceso de desarrollo temprano de fármacos antituberculosos de próxima generación. Aquí, describimos un ensayo rápido, económico y compatible con BSL-2 para evaluar la eficacia de un fármaco contra Mycobacterium tuberculosis que se puede adaptar fácilmente para el cribado de alto rendimiento.
Agradecemos al Dr. Frank Wolschendorf por el acceso al lector automático de placas de imágenes Cytation 3. Este trabajo fue financiado en parte por la subvención R01-AI104499 de los NIH a OK. Partes del trabajo se realizaron en las instalaciones del CFAR de la UAB y por el UAB CFAR Flow Cytometry Core/Joint UAB Flow Cytometry Core, que están financiados por el AI027767 P30 de los NIH/NIAID y por el NIH 5P30 AR048311.
| 7H9 | BD Difco | 271310 | Siga las recomendaciones del fabricante |
| Middlebrook OADC | BD Biosciences | 212351 | |
| Tyloxapol | Sigma | T8761 | Prepare una solución madre al 20% en H2O; filtro esterilizar |
| sal hemicálcica de ácido D-pantoténico | Sigma | P5710 | Prepare una solución madre de 24 mg/mL en H2O; filtro esterilizar |
| L-leucina | MP Biomedicals 194694 | Prepare una solución madre de 50 mg/ml en H2O; filtro de esterilización | |
| Hygromycin B | EMD Millipore | 400051 | Prepare una solución madre de 200 mg/mL en H2O |
| Nalgene Square Botella de medios de PETG Thermo | Fisher | 2019-0030 | |
| RPMI 1640 medios | Hyclone | SH30027.01 | |
| Suero fetal bovino | Atlanta Biologicals | S12450H | |
| L-glutamina | Corning | MT25005CI | |
| HEPES | Hyclone | SH30237.01 | |
| Citación 3 lector de placas | Biotek | Intercambiable con cualquier lector de placas fluorescente y microscopio | |
| Gen5 Software Biotek | Registro y análisis de coversión de rezasurin | ||
| rifampicina | Fisher Scientific | BP2679250 | Prepare una solución madre de 10 mg/ml en H2O |
| Clorhidrato de moxifloxacina | Acros Organics 457960010 | Prepare una solución madre de 10 mg/mL en H2O | |
| Resazurin Sodium Salt Sigma | R7017 | Prepare 800 μ g/mL de solución madre en H2O; esterilizar por filtro | |
| Tween-80 | Fisher Scientific T164500 | Prepare una solución madre al 20% en H2O; esterilizar por filtro |