La citometría de flujo se ha utilizado durante los últimos 40 años para definir y analizar el fenotipo de linfoide y otras células hematopoyéticas. Inicialmente restringida al análisis de unos fluorocromos, actualmente hay de diferentes colorantes fluorescentes decenas, y hasta 14-18 colorantes diferentes se pueden combinar a la vez. Sin embargo, varias limitaciones todavía en menoscabo de las capacidades analíticas. Debido a la multiplicidad de sondas fluorescentes, análisis de datos se ha vuelto cada vez más compleja debido a la necesidad de matrices, de compensación multi-paramétricos grandes. Además, los modelos de ratones mutantes que llevan las proteínas fluorescentes para detectar y rastrear tipos específicos de células en diferentes tejidos han estén disponibles, así se requiere el análisis (por citometría de flujo) de las suspensiones celulares de auto-fluorescente obtenidos a partir de órganos sólidos. Espectral citometría de flujo, que distingue las formas de los espectros de emisión a lo largo de una amplia gama de longitudes de onda continuas, aborda algunos de estos problemas. Los datos se analizan wITH un algoritmo que reemplaza matrices de compensación y trata la auto-fluorescencia como un parámetro independiente. Por lo tanto, espectral citometría de flujo debe ser capaz de discriminar fluorocromos con picos de emisión similares y puede proporcionar un análisis multi-paramétrico sin requisitos de compensación.
Este protocolo describe el flujo espectral citometría de análisis, lo que permite un parámetro 21 (19 sondas fluorescentes) caracterización y la gestión de una señal de auto-fluorescente, proporcionando alta resolución en la detección de la población menor. Los resultados presentados aquí muestran que el flujo espectral presenta citometría de ventajas en el análisis de las poblaciones de células a partir de tejidos difíciles de caracterizar en citometría de flujo convencional, tales como el corazón y el intestino. Espectral citometría de flujo por lo tanto demuestra la capacidad de análisis multi-paramétrico de gestión de alto rendimiento citometría de flujo convencional sin el requisito para la compensación y permite auto-fluorescencia.