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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Se presenta un protocolo detallado de un modelo de ratón para enterohemorrágica e. coli (EHEC) colonización utilizando bacterias etiquetado bioluminiscencia. La detección de estas bacterias bioluminiscentes por un no-invasivo en vivo sistema de animales vivos de imagen puede avanzar nuestra comprensión actual de la colonización de EHEC.
Enterohemorrágica e. coli (EHEC) O157: H7, que es un patógeno de transmisión alimentaria que causesdiarrhea, colitis hemorrágica (HS), y síndrome urémico hemolítico (SUH), colonizar en el tracto intestinal de los seres humanos. Para estudiar el mecanismo detallado de la colonización de EHEC en vivo, es imprescindible disponer de modelos animales para controlar y cuantificar la colonización de EHEC. Se demuestra aquí un modelo de colonización de ratón-EHEC transformando el plásmido expresando bioluminiscente a EHEC para monitorear y cuantificar la colonización de EHEC en anfitriones de vida. Animales inoculados con ECEH etiquetado bioluminiscencia muestran intensas señales bioluminiscentes en ratones por la detección con un no-invasivo en vivo sistema de imagen. Después de 1 y 2 días post infección, señales bioluminiscentes todavía se podían detectar en los animales infectados, lo cual sugiere que EHEC colonizan en anfitriones de al menos 2 días. También demostramos que estos EHEC bioluminiscente localizar al intestino de ratón, específicamente en el ciego y el colon, de imágenes de ex vivo . Este modelo de colonización de ratón-EHEC puede servir como una herramienta para avanzar en el conocimiento actual del mecanismo de colonización de EHEC.
ECEH O157: H7 es un patógeno que causa diarrea1, HS2, HUS3y falta renal aguda incluso4 a través de agua o alimentos contaminados. EHEC es un patógeno Enterobacter y coloniza en el tracto gastrointestinal de los seres humanos1. Cuando EHEC primero se adhieren al epitelio intestinal del anfitrión, inyectan los factores de colonización en las células del huésped a través del sistema de la secreción del III tipo (T3SS) que funciona como una jeringa molecular induciendo una fijación y borrar (A/E) lesión posteriormente para hacer cumplir adherencia (colonización)5. Estos genes involucrados en la formación de la lesión A/E son codificados por el locus de la isla de patogenicidad del enterocyte effacement (LEE)5.
Bioluminescence es una reacción química produzca luz, en la cual luciferase cataliza su luciferin del substrato para generar luz visible6. Este proceso enzimático requiere con frecuencia la presencia de oxígeno o trifosfato de adenosina (ATP)6. Bioluminiscencia (BLI) la proyección de imagen permite a los investigadores la visualización y cuantificación de las interacciones huésped-patógeno en animales vivos7. BLI puede caracterizar el ciclo de infección bacteriana en animales vivos siguiendo las bacterias bioluminiscentes que migran e invaden diferentes tejidos7; Esto revela una evolución dinámica de la infección. Por otra parte, la carga bacteriana en los animales se relaciona con la señal bioluminiscente8; por lo tanto, es un indicador conveniente para estimar las condiciones patológicas de los animales experimentales en una forma simple y directa.
El plásmido utilizado aquí contenida el operón de la luciferasa, luxCDABE, que es de la bacteria Photorhabdus luminescens que codifica su propia luciferase sustrato7,9. Al transformar este plásmido de expresión de luciferasa en las bacterias, los procesos de colonización y la infección pueden controlarse mediante la observación de estas bacterias bioluminiscentes en animales vivos. En general, BLI y bacterias etiquetado bioluminiscencia permiten a los investigadores a monitorear los números bacterianos y ubicación, viabilidad bacteriana con tratamiento de antibióticos y la expresión génica bacteriana en infección/colonización6, 7. se han reportado numerosas bacterias patógenas que expresar el operón luxCDABE para examinar su expresión de ciclo o gen de infección en infección. Estas bacterias, incluyendo uropatógenos Escherichia coli10, EHEC8,11,12,13, enteropatógeno e. coli (EPEC)8, Citrobacter Rodentium14,15, Salmonella typhimurium16, Listeria monocytogenes17, Yersinia enterocolitica18,19, y Vibrio cholerae20, han sido documentados.
Varios modelos experimentales se han desarrollado para facilitar el estudio de ECEH colonización in vitro e in vivo21,22,23. Sin embargo, hay una falta de modelos animales adecuados para el estudio de la colonización la EHEC en vivoy, por tanto, la escasez resultante de los datos. Para facilitar el estudio de la EHEC colonización mecanismo en vivo, es valioso para construir modelos animales para observar y cuantificar la colonización de ECEH en los animales vivos en un método no invasivo.
Este manuscrito describe un modelo de colonización de EHEC de mouse que utiliza un sistema de expresión bioluminiscente para controlar la colonización de la ECEH en el tiempo de vida acoge. Ratones se inoculan intragástrica con EHEC etiquetado bioluminiscencia y se detecta la señal bioluminiscente en ratones con un no-invasivo en vivo imágenes del sistema13. Ratones infectan con ECEH etiquetado bioluminiscencia mostró significativas señales bioluminiscentes en su intestino después de 2 días post infección, lo que sugiere que las bacterias colonizan en el intestino del anfitrión después de 2 días post infección. Ex vivo imagen datos demostraron que esta colonización es específicamente en el ciego y el colon de los ratones. Mediante este modelo de ratón-EHEC, la colonización bioluminiscente de EHEC puede detectarse en la vida de acogida un en vivo sistema, para estudiar los mecanismos detallados de la colonización de bacterias entéricas, que puede promover la comprensión más en la proyección de imagen Inducida por la EHEC cambios fisiológicos y patológicos.
PRECAUCIÓN: ECEH O157: H7 es un nivel de bioseguridad 2 (BSL-2) patógeno según los centros para el Control de enfermedades y prevención de enfermedades (CDC) Instrucciones de seguridad de la biotecnología (https://www.cdc.gov/). Por lo tanto, deben realizarse todos los procedimientos experimentales que EHEC en una facilidad BSL-2. Use guantes y batas de laboratorio al realizar el experimento. Trabajo en una gabinete de la bioseguridad certificada (BSC). Desinfectar el Banco experimental antes y después del procedimiento experimental con etanol al 70%. Todos los instrumentos o equipos que EHEC contacto (o potencialmente contacto) debe ser desinfectado con etanol al 70% o blanqueador. Desechos contaminados (o potencialmente contaminados) deben ser cuidadosamente sellado y esterilizado. Use una máscara, protección ocular, guantes doble o un mono, si es necesario. Los ratones hembra de 6 semanas de edad C57BL/6 fueron comprados y mantenidos en el laboratorio Animal centro de National Cheng Kung University (NCKU). Los experimentos con animales fueron aprobados por el cuidado de Animal institucional y Comité de uso de NCKU (número 104-039).
1. generación de las bacterias EHEC Bioluciferase-etiquetado
2. preparación de bacterias EHEC bioluminiscente para inoculación Oral
Nota: El diagrama de flujo de línea de tiempo de los procedimientos experimentales para la preparación de EHEC y sonda oral ratón se presenta en la figura 1 para ayudar en la preparación experimental.
3. ratón Oral por sonda nasogástrica de EHEC
4. visualización
5. adquisición de datos
Nota: El software utilizado para la adquisición de datos se muestra en la Tabla de materiales.
Administramos la bioluminiscencia etiquetado EHEC (~ 109 células bacterianas) a 6 - semanas de edad hembra C57BL/6 ratones por sonda oral. Después de la inoculación oral de EHEC para ratones dentro de 1 h, los animales fueron examinados para bioluminiscente de la señal por el sistema generador de imágenes en vivo como se muestra en la figura 7. Los resultados mostraron una fuerte señal bioluminiscente en ratones por sonda nasogástrica con EHEC etiquetado bioluminiscencia. Examinamos las señales en 2 días post infección. Como se muestra en la figura 8A, los ratones inoculan con etiquetado bioluminiscencia tipo EHEC EDL933 mostró señales bioluminiscentes intenso incluso después de 2 días post infección, que sugirió que EHEC colonizados en los anfitriones por 2 días. Nosotros también intragástricamente infectados etiquetado bioluminiscencia EDL933ΔrfaD (ΔrfaD) a los ratones (figura 8A). Este mutante, desertó en lipopolisacárido (LPS), se ha demostrado para reducir la colonización en el host en nuestro estudio anterior. Como se muestra en la figura 8A, no hay ninguna señal bioluminiscente en ΔrfaD-ratones infectados, lo que sugiere que hay bacterias no o menos células colonizaron en los ratones. Cuantificación de la señal fluorescente se muestra en la figura 8B. A continuación, se determinó la ubicación de estas bacterias etiquetado bioluminiscencia. Los ratones infectados fueron sacrificados humanitariamente y quitado su intestino entero. Los intestinos de ratones 2 días post infección se colocaron en platos de Petri de 9 cm y reflejada ex vivo (Figura 9A). Los tejidos intestinales de ratones infectados EDL933 etiquetado bioluminiscencia revelaron un aumento significativo de señales bioluminiscentes en el ciego y el colon, que sugieren que estos EHEC bioluminiscente colonizados en el ciego y el colon de ratones infectados por 2 días en menos. En contraste, ratones infectados con etiquetado bioluminiscencia ΔrfaD (Figura 9A), reveló disminución de señal bioluminiscente en su tejido intestinal, lo cual es consistente con la imagen en vivo (figura 8A ). Cuantificación de la señal fluorescente se muestra en la figura 9B.

Figura 1 : Línea de tiempo del diagrama de flujo preparación experimental.
Resumen de la sincronización necesaria para preparar bacterias bioluminiscentes de EHEC y trate de ratones con estreptomicina. (A) ECEH preparación. (B) preparación de ratones. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2 : En vivo panel de control sistema adquisición de imágenes.
Antes las muestras de la proyección de imagen, abra el Panel de Control de adquisición de IVIS. Seleccione "Luminiscente", "fotografía" y "Superposición". Tiempo de exposición determinado como "Auto." Establecer Binning como "Medio." Establecer ƒ/parada 1 luminiscente y 8 para la fotografía. Ƒ/stop controles la cantidad de luz recibida por el detector del CCD. Una vez que las muestras están listas para la proyección de imagen, haga clic en "Adquirir" para adquirir imágenes. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3 : Panel de paleta de herramientas.
Después de la adquisición de la imagen, utilice el panel de la paleta de herramientas para cuantificar la intensidad bioluminiscente. Abra el panel de la paleta de herramientas y los datos de la imagen. ¡Elegir una de las herramientas de ROI para las señales bioluminiscentes en imágenes de la gama. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4 : Señal bioluminiscente de muestra para la cuantificación.
Zona bioluminiscente señal en las imágenes rodeado por herramientas de ROI. Todas las señales bioluminiscentes que se muestra aquí son en el círculo rojo. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5 : Las mediciones de ROI.
Después de circundar las señales bioluminiscentes y haciendo clic en "ROIs de medida" en el panel de la paleta de herramientas, se presentan los valores como se muestra. Los valores de la columna de flujo Total (p/s) se utilizan para la cuantificación de la intensidad bioluminiscente. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 6 : Añadir información de cuantificación diferentes.
Haciendo clic en la medida de configurar en la esquina izquierda del panel de mediciones de ROI, puede seleccionar otros valores de cuantificación deseada e información. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 7 : Imagen representativa de los ratones después de inoculados con ECEH bioluminiscente.
Imagen representativa de los ratones inoculados con ECEH bioluminiscente por sonda oral dentro de 1 h. La escala de color representa la radiancia (/sr p/s/cm2). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 8 : Imágenes de ratones inocularon con ECEH etiquetado bioluminiscencia después de 2 días.
(A) representan imagen de ratones inoculados con salvaje-tipo bioluminiscente EDL933 EHEC y EDL933:ΔrfaD por sonda oral después de 2 días post infección. (B) cuantificación de la intensidad de la bioluminiscencia de ratones infectados con ECEH. Barras de error indican la desviación estándar. Se muestran imágenes representativas. Todos los experimentos se llevaron a cabo independientemente tres veces con 2-3 animales cada vez, y barras de error indican la desviación estándar. Los valores de P indican los resultados del análisis estadístico por t-test. La escala de color representa la radiancia (/sr p/s/cm2). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 9 : Imágenes de los tejidos intestinales de ratones infectados con ECEH etiquetado bioluminiscencia.
(A) 2 días después de la inoculación con bioluminiscencia-etiquetado EHEC, los ratones fueron sacrificados y tejidos todo intestinales fueron quitados y reflejada ex vivo. Se muestran imágenes representativas. (B) cuantificación de la intensidad de la bioluminiscencia de los tejidos intestinales de ratones infectados con ECEH. Todos los experimentos se llevaron a cabo independientemente tres veces con 2-3 animales cada vez, y barras de error indican la desviación estándar. Los valores de P indican los resultados del análisis estadístico por t-test. La escala de color representa la radiancia (/sr p/s/cm2). Barra de escala representa 1 cm. haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Pasos | Temperatura | Tiempo | Número de ciclos de |
| Desnaturalización inicial | 95 ° C | 10 min | 1 |
| Desnaturalización | 95 ° C | 30 seg. | 35 |
| De recocido | 58,4 ° C | 30 seg. | |
| Extensión | 72 ° C | 1,5 min | |
| Extensión final | 72 ° C | 10 min | 1 |
| Mantenga | 4 ° C | ∞ | 1 |
Tabla 1: Condiciones de reacción en cadena (PCR) de polimerasa
| Nombre de cartillas | Secuencia de |
| nptII F | 5' CCTATGCATAATAATTCCGCTAGCTTCACG3' |
| nptII R | 5' GCTCCACCGATAATATTCCTGAGTCATACT3' |
Tabla 2: secuencias de la cartilla utilizadas para amplificar nptII
Los autores no tienen nada que revelar.
Se presenta un protocolo detallado de un modelo de ratón para enterohemorrágica e. coli (EHEC) colonización utilizando bacterias etiquetado bioluminiscencia. La detección de estas bacterias bioluminiscentes por un no-invasivo en vivo sistema de animales vivos de imagen puede avanzar nuestra comprensión actual de la colonización de EHEC.
Reconocemos a Chi-Chung Chen del Departamento de investigación médica, centro médico de Chi Mei (Tainan, Taiwan) la ayuda del ratón para la infección y el apoyo del centro de animales de laboratorio de la Universidad Nacional Cheng Kung. Este trabajo es apoyado por el Ministro de ciencia y tecnología (MOST) subvenciones (más 104-2321-B-006-019, 105-2321-B-006-011,-005 de and106-2321-B-006) a CC.
| Incubadora agitadora | YIH DER | LM-570R incubación de | bacterias |
| Incubadora de agitación orbital | FIRSTEK | S300 | incubación de bacterias |
| pBSL180 | fuente del gen nptII | ||
| pAKlux2 | fuente del operón luxCDABE | ||
| T& Un kit de clonación | Yeastern Biotech | FYC001-20P | uso para la clonación de TA |
| Nsi I | NEB | R0127S | uso para la clonación de plásmidos |
| Sca I | NEB | R0122S | uso para la clonación de plásmidos |
| Spe I-HF | NEB | R0133S | uso para la clonación de plásmidos |
| Sma I | Uso de NEB | R0141S | para la clonación de plásmidos |
| Uso de la ligasa | T4 NEB | M0202S | para la clonación de plásmidos |
| Ex Taq | TaKaRa | RR001A | uso para amplificación de PCR |
| 10X Ex Taq Buffer | TaKaRa | RR001A | uso para amplificación de PCR |
| Mezcla dNTP | TaKaRa | RR001A | uso para amplificación de PCR |
| PCR | máquina de PCR aplicado Biosistema | 2720 termociclador | para amplificación por PCR |
| Glicerol | SIGMA | G5516-1L | uso para solución de almacenamiento de bacterias |
| NaCl | Sigma | 31434-5KG-R | químico para hacer medio LB, 10 g/L |
| Triptona | CONDA pronadisa | Cat 1612.00 | producto químico para hacer medio LB, 10 g/L |
| Extracto de levadura en polvo | Affymetrix | 23547-1 KG | químico para hacer medio LB, 5 g/L |
| Agar | CONDA pronadisa | Cat 1802.00 | químico para la fabricación de agar LB |
| kanamicina | Antibióticos Sigma | K4000-5G | , uso para la estreptomicina seleciton |
| Sigma | S6501-100G | antibióticos, eliminan la microbiota en ratones | |
| EDL933 célula competente El | métodocasero | está en documento complementario | |
| Electroporador | MicroPulser | para electroporación | |
| Cubetas de electroporación | Gene Pulser/MicroPulser | 1652086 | para electroporación |
| Centrífuga de alta velocidad | Beckman Coulter | Avanti, J-26S XP | uso para centrifugar bacterias |
| Rotor de ángulo fijo | Beckman Coulter | JA25.5 | uso para centrifugar bacterias |
| Rotor de ángulo fijo | Beckman Coulter | JLA10.5 | uso para centrifugar bacterias |
| botellas de centrífuga | Beckman Coulter | REF357003 | uso para centrifugar bacterias |
| botellas de centrífuga | Thermo Fisher scientific | 3141-0500 | uso para centrifugar bacterias |
| Biofotómetro Eppendorf Plus | eppendorf | AG 22331 hamburgo | para medir el valor OD600 de bacterias |
| C57BL/6 ratones | Bata de laboratorio del Centro de Animales de Laboratorio de NCKU | ||
| , guantes | para la protección del personal | ||
| isoflurano | Panion & BF Biotech Inc. | G-8669 | para anestesia de ratones, |
| jeringa de 1 ml de grado farmacéutico | uso para sonda oral de ratones | ||
| de | alimentación reutilizable con punta de bola de 22 G | φ 0,9 mm X L 50 mm | uso para sonda oral de ratones |
| quirúrgico tijeras | uso para experimentos con ratones | ||
| Sistema de imágenes Xenogen IVIS 200 | Perkin Elmer | IVIS | uso del espectro para la captura de imágenes bioluminiscentes |
| Living Image Software | Perkin Elmer | versión 4.1 | uso para cuantificar los datos de la imagen |