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Extracción de ADN es uno de los pasos más esenciales en biología molecular. El desarrollo de métodos de extracción de ácidos nucleicos tiene gran impacto en los campos emergentes de la genómica, la metagenómica, la epigenética y la transcriptómica. Hay una amplia gama de aplicaciones biotecnológicas para el aislamiento de la DNA incluyendo médicos (herramientas forenses y diagnóstico y pronóstico) y aplicaciones medioambientales (diversidad biológica de la metagenómica, prevalencia del patógeno y vigilancia). Ha habido una creciente demanda para purificar y aislar ADN de diversos materiales y en diferentes escalas como sangre, orina, tierra, madera y otros tipos de muestras. 1 , 2 , 3 , 4
Partículas de tamaño nano y micro son convenientes para el aislamiento de ADN debido a su alta área superficial y, en particular cuando puede ser inmovilizados por un campo magnético. Propiedades fisicoquímicas de las partículas, tales como tamaño o carga, pueden influir mucho su capacidad objetivo biomoléculas. 5 para mejorar aún más la Unión de biomoléculas y estabilizar las partículas, se pueden utilizar diferentes modificaciones químicas (capas superficiales). Las muchas estrategias diferentes para el atascamiento se clasifican según las interacciones covalentes y no covalentes. 6 el tamaño de las partículas afecta directamente a sus propiedades de magnetización, considerando que la composición de partículas puede ser adaptado por la incorporación de metal, aleación u otros materiales que pueden influir en su densidad, porosidad y superficie. 7 hay no hay manera confiable para medir la carga superficial de las partículas pequeñas. En cambio, se puede medir potencial eléctrico en el plano de deslizamiento (lejos de superficie de nanopartículas). 8 este valor se llama zeta potencial y es una potente herramienta que se utiliza generalmente para la evaluación de estabilidad de nano y micropartículas por DLS. 9 puesto que su valor depende no sólo el pH y fuerza iónica del medio dispersivo, sino también en las características superficiales de las partículas, puede también probar los cambios en esta superficie causado por la interacción entre el partículas y moléculas de interés. 10
Por otra parte, estructura del ADN en condiciones deshidratado (forma A-ADN) exposiciones conformaciones compactada que facilitan su precipitación (agregación) en comparación a comúnmente ocurriendo forma de B-DNA. Electrostática (iónico y el enlace H) son las principales fuerzas controlando el atascamiento de la DNA a otros materiales debido a su accesible sterically fosfato y nitrógeno bases (sobre todo guanina). 7 , 10
En este trabajo se analizan tres modificaciones químicas representativas de nanopartículas magnéticas y micropartículas (figura 1A). Se describen el método de síntesis y modificación química de nanopartículas y micropartículas. Una solución vinculante, acuerdos de principios teóricos de la precipitación de ADN (pH, fuerza iónica y deshidratación) se utiliza para evaluar la elución y atascamiento de la DNA. PCR cuantitativa se utiliza para evaluar la eficacia de la elución de la DNA de la representante de nanopartículas y micropartículas (figura 1B). Granulometría, índice de polidispersidad y potencial zeta son parámetros importantes que se utilizan para visualizar los cambios fisicoquímicos que ocurren en la superficie de la partícula (figura 1). Es importante destacar en la caracterización química de la superficie de la partícula magnética. Mientras que este paso era más allá del alcance de este protocolo, pueden aplicarse varias técnicas modernas para investigar la eficacia de modificaciones químicas. 11 , 12 , 13 , 14 espectroscopia de infrarrojo de transformación de Fourier (FTIR) puede utilizarse para evaluar el espectro infrarrojo de la superficie de la partícula y se compara con el espectro de modificadores químicos gratis. Espectroscopía de fotoelectrones de rayos x (XPS) es otra técnica que puede utilizarse para identificar la composición elemental de la superficie del material. Pueden utilizar otros métodos electroquímicos, microscópicas y espectroscópicas para arrojar luz sobre la calidad de síntesis de partículas. Este trabajo pone de relieve una nueva perspectiva para el análisis de ADN magnético interacciones de partículas a través de DLS.