Se presenta un procedimiento para el refolding el dCACHE periplasmic dominio obligatorio del ligand del jejuni del Campylobacter quimioreceptor Tlp3 de cuerpos de inclusión y de la purificación para producir cantidades de miligramos de proteína.
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Se presenta un procedimiento para el refolding el dCACHE periplasmic dominio obligatorio del ligand del jejuni del Campylobacter quimioreceptor Tlp3 de cuerpos de inclusión y de la purificación para producir cantidades de miligramos de proteína.
Identificación de ligandos naturales de los quimioreceptores y estudios estructurales dirigidos a la aclaración de las bases moleculares de la especificidad del ligando puede facilitarse grandemente por la producción de cantidades del miligramo de dominios de unión a ligando pura, doblado. Intentos de expresar heterologously dominios de unión a ligando periplasmic de quimioreceptores bacterianos en Escherichia coli (e. coli) a menudo resultan en su focalización en los cuerpos de inclusión. Aquí, se presenta un método para la recuperación de proteínas de cuerpos de inclusión, refolding y purificación, mediante el dominio de enlace de ligando dCACHE periplasmic de Campylobacter jejuni (C. jejuni) quimioreceptor Tlp3 como ejemplo. El enfoque implica la expresión de la proteína de interés con un escindibles sus6-etiqueta, aislamiento y solubilización de urea-mediada de cuerpos de inclusión, refolding por agotamiento de la urea y purificación mediante cromatografía de afinidad, la proteína seguido por cromatografía de retiro y exclusión de tamaño de etiqueta. La espectroscopía de dicroísmo circular se utiliza para confirmar el estado plegado de la proteína pura. Se ha demostrado que este protocolo es generalmente útil para la producción de cantidades del miligramo de dominios de unión a ligando periplasmic dCACHE de otros quimiorreceptores bacterianas en forma soluble y cristalizables.
Quimiotaxis y motilidad han demostrado que desempeñan papeles importantes en la patogénesis del jejuni del Campylobacter promoviendo la colonización bacteriana y la invasión de los host1,2,3. Quimiotaxis permite que las bacterias lograr un ambiente óptimo para el crecimiento, como guiados por señales químicas. Este proceso implica el reconocimiento de señales químicas intracelulares y ambientales por un conjunto de proteínas denominadas quimiorreceptores o transductor-como proteínas (Tlps). La mayoría quimioreceptores son proteínas embebido en la membrana con un extracytoplasmic ligando vinculante dominio (LBD), un dominio transmembrana y un dominio citoplásmico de señalización, que interactúa con las proteínas de señalización citosólicas que transmiten la señal los motores flagelares4,5,6,7.
Once quimioreceptores diferentes se han identificado en el genoma de C. jejuni 4,8. Hasta la fecha, sólo algunos de estos quimioreceptores han sido caracterizados y se sabe la especificidad del ligando de Tlp19Tlp310,11, Tlp411, Tlp712y Tlp1113 . Identificación de ligandos naturales de los quimioreceptores restantes en esta especie y numerosos Quimioreceptores en otras bacterias, puede facilitarse grandemente por la producción de plegado y altamente puro recombinante quimioreceptor LBDs14, 15 , 16. sin embargo, los intentos de expresar heterologously periplasmic LBDs de quimioreceptores bacterianos en Escherichia coli a menudo resultan en su focalización en los cuerpos de inclusión17,18,19 . Sin embargo, este fenómeno puede facilitar la fácil aislamiento y recuperación de la proteína en la mano. Aquí, se presenta un método para recuperación de proteína de cuerpos de inclusión, refolding y purificación, con el LBD periplasmic de la C. jejuni quimioreceptor Tlp3 como ejemplo. Este ejemplo fue elegido porque Tlp3-LBD pertenece a la familia de dCACHE20 de dominios de detección que se encuentran abundantemente en dos componentes histidina quinasas y quimiorreceptores en procariotas20,21, 22 , 23.
En este enfoque, la construcción de la expresión, basada en un vector de pET151/D-TOPO, ha sido diseñada para incorporar un N-terminal su6-etiqueta seguida de un tabaco etch virus (TEV) proteasa escote sitio para etiqueta posterior retiro19. El protocolo describe la sobreexpresión de la proteína en e. coli, el aislamiento y la urea mediada la solubilización de los cuerpos de inclusión y la proteína refolding por agotamiento de la urea. Después refolding, la muestra se purifica mediante cromatografía de afinidad, con cromatografía de retiro y exclusión de tamaño de etiqueta opcional. El estado plegado de la proteína purificada se confirma mediante espectroscopía de dicroísmo circular. Esta es una versión modificada del método que se ha desarrollado anteriormente para recuperar y purificar el LBD de un quimioreceptor diferentes, Helicobacter pylori TlpC19. Este procedimiento, resumido en la figura 1, rinde 10 a 20 mg de puro, sin etiquetar Tlp3-LBD por 1 L de cultivo bacteriano, con una pureza de la proteína de > 90% estimados por SDS-PAGE.
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1. expresión de su6-Tlp3-LBD en e. coli
2. aislamiento y desnaturalización de cuerpos de inclusión
3. proteína Refolding
4. purificación de su6-etiquetado de proteínas mediante cromatografía de afinidad de iones metálicos inmovilizados
5.6-etiqueta la eliminación usando proteasa TEV (opcional)
6. cromatografía exclusión de tamaño (filtración de Gel) de Tlp3-LBD
7. SDS-PAGE de análisis de las muestras tomadas en diferentes etapas de purificación de proteínas
8. circular dicroísmo (CD) espectroscopia análisis de estructura secundaria de proteínas pura replegado
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Expresión recombinante de su6-Tlp3-LBD en e. coli dio lugar a la deposición de la proteína en los cuerpos de inclusión. El rendimiento de la expresión de 1 L de cultivo bacteriano calculado en el paso 2.13 fue de aproximadamente 100 mg de su6-Tlp3-LBD depositado en cuerpos de inclusión. El procedimiento de aislamiento de proteínas, aquí descrito e ilustrado en la figura 1, consiste en la solubilización de los cuerpos de inclusió...
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Se presenta un procedimiento sencillo para la expresión y refolding de cuerpos de inclusión de la LBD periplasmic del quimioreceptor bacteriana Tlp3. Preparación de la proteína pura implica la sobre expresión del gen pET plasmídico de e. coli, la purificación y la solubilización de los cuerpos de inclusión, refolding de la proteína desnaturalizada y su purificación por afinidad consecutiva y pasos de cromatografía por exclusión de tamaño. La desnaturalización facilitado por urea y dilución/diálisis-mediada refol...
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Los autores no declaran a intereses financieros en competencia.
Damos las gracias por sus primeros trabajos en la producción de LBD Tlp3 Yu C. Liu. Mayra A. Machuca está en deuda con Departamento Admistrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación COLCIENCIAS Beca doctoral.
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| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Tris base | AMRESCO | 497 | |
| Cloruro de sodio (NaCl) | MERK MILLIPORE | 1064041000 | |
| Ampicilina | G-BIOSCIENCES | A051-B | |
| Fluoruro de fenilmetanosulfonilo (PMSF) | MERCK | 52332 | |
| Triton x-100 | AMRESCO | 694 | |
| Isopropilo β-D-tiogalactósido (IPTG) | ASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD | ||
| Urea | AMRESCO | VWRC0568 | |
| Dithiothreitol | ASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD | C-1029 | |
| L-arginina monoclorhidrato | SIGMA-ALDRICH | A5131 | |
| L-glutatión reducido | SIGMA-ALDRICH | G4251 | |
| L-glutatión oxidado | SIGMA-ALDRICH | G4376 | |
| Fosfato de sodio dibásico (Na2HPO4) | SIGMA-ALDRICH | 7558-79-4 | |
| Fosfato de sodio monobásico (NaH2PO4) | SIGMA-ALDRICH | 10049-21-5 | |
| Ácido etilendiaminotetraacético sal disódica deshidratada (EDTA) | AMRESCO | VWRC20302.260 | |
| Imidazol | SIGMA-ALDRICH | I2399 | |
| Glicerol | ASTRAL SCIENTIFIC PTY LTD | ||
| Cloruro de níquel (NiCl2) | SIGMA-ALDRICH | 339350 | |
| Glicina | AMRESCO | VWRC0167 | |
| Dodecil sulfato de sodio (SDS) | SIGMA-ALDRICH | L4509 | |
| Escalera de proteínas sin teñir, amplia Rango (10-250 kDa) | NEW ENGLAND BIOLABS | P7703 | |
| Concentrador centrífugo Amicon Ultracel (Millipore) | MERCK | UFC901096 | |
| 50 mL Tubo Falcon | FALCON | BDAA352070 | |
| Tubo de diálisis | LIVINGSTONE INTERNATIONAL PTY | Diálisis Tubo de diálisis | |
| piel de serpiente | THERMO SCIENTIFIC™ | 68100 | |
| Columna HP quelante HiTrap preempaquetada | GE HEALTHCARE LIFE SCIENCES | 17-0408-01 | |
| EmulsiFlex-C5 homogeneizador de alta presión | AVESTIN | EmulsiFlex™ - C5 | |
| Bomba peristáltica P-1 | GE HEALTHCARE LIFE SCIENCES | 18-1110-91 | |
| Superdex 200 HiLoad 26/60 columna de exclusión de tamaño | GE HEALTHCARE CIENCIAS DE | ||
| JASCO J-815 espectropolarímetro | JASCO | J-815 |
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