En este artículo se describen los protocolos de determinación de la expresión, purificación, cristalización y la estructura de la proteína del dominio N-terminal del receptor de rianodina de polilla del diamondback (xylostella de Plutella).
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Artículo de método
* These authors contributed equally
En este artículo se describen los protocolos de determinación de la expresión, purificación, cristalización y la estructura de la proteína del dominio N-terminal del receptor de rianodina de polilla del diamondback (xylostella de Plutella).
Desarrollo de insecticidas potentes y eficientes dirigidos a receptores de insectos rianodina (RyRs) ha sido de gran interés en el área de control de plagas agrícolas. Hasta la fecha, varios de diamida de insecticidas contra plagas que ryrs han sido comercializados, que genera ingresos anuales de 2 billones de dólares. Pero la comprensión del modo de acción de insecticidas dirigidas a RyR es limitada por la falta de información estructural sobre insectos RyR. Esto a su vez restringe la comprensión del desarrollo de resistencia a los insecticidas en las plagas. La polilla del diamondback (DBM) es una plaga devastadora destruyendo cultivos crucíferos a nivel mundial, que también se ha reportado que muestran resistencia a los insecticidas de la diamida. Por lo tanto, es de gran importancia práctica para el desarrollo de nuevos insecticidas contra el RyR DBM, especialmente dirigidos a una región diferente del sitio de unión de la diamida tradicional. Aquí, presentamos un protocolo para caracterizar estructuralmente el dominio N-terminal de RyR de DBM. La estructura cristalina de la radiografía fue solucionada por reemplazo molecular con una resolución de 2.84 Å, que muestra un motivo plegamiento beta-trébol y una hélice alfa que flanqueaban. Este protocolo puede ser adaptado para la expresión, purificación y caracterización estructural de otros dominios o proteínas en general.
Receptores de rianodina (RyRs) son canales iónicos específicos que median la penetración de iones de Ca2 + en las membranas del retículo sarcoplásmico (SR) en las células musculares. Por lo tanto, juegan un papel importante en la contracción excitación proceso de acoplamiento. En su forma funcional, la RyR monta como un homo-tetrámero con una masa molecular de > 2 MDa, con cada subunidad compuesta por residuos del aminoácido del ~ 5000. En los mamíferos, existen tres isoformas: RyR1 de tipo músculo esquelético, músculo cardiaco tipo de RyR2 - y RyR3-ubicuo se expresa en diferentes tejidos1.
En insectos hay....
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1. clonación de genes, expresión de la proteína y purificación
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Purificación del
El dominio N-terminal de DBM RyR se expresó como proteína de fusión con una etiqueta de hexahistidine, una etiqueta MBP y un sitio de la hendidura de proteasa TEV. Hemos seguido una estrategia de cinco pasos de purificación para obtener una proteína altamente pura, adecuada para el propósito de la cristalización. En primer lugar, la proteína de fusión fue purificada de la fracción soluble de lisado de células por c.......
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En este papel, describimos el procedimiento para expresar por vía recombinante, purificar, cristalizar y determinar la estructura de DBM RyR NTD. Para la cristalización, un requisito crucial es obtener proteínas con homogeneidad, pureza y alta solubilidad. En nuestro protocolo, decidimos utilizar vector pET-28a-HMT ya que contiene un hexahistidine etiqueta y etiqueta de la MBP, que pueden ser utilizados para que la purificación obtener una mayor pureza de doblez. Además, el MBP etiqueta SIDA en la solubilidad de la prote.......
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Los autores no tienen nada que revelar.
La financiación para esta investigación fue proporcionada por: nacionales de investigación clave y programa de desarrollo de China (2017YFD0201400, 2017YFD0201403), nacional naturaleza ciencia Fundación de China (31320103922, 31230061) y proyecto de nacional investigación básica (973) programa de China (2015CB856500, 2015CB856504). Estamos muy agradecidos al personal en la línea BL17U1 en instalaciones de Radiación Sincrotrón Shanghai (SSRF).
....Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.
| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| pET-28a-HMT | Este vector pET modificado contiene una marca de hexahistidina, una proteína de fusión MBP y un sitio de escisión de la proteasa TEV en el extremo N-terminal (Lobo y Van Petegem, 2009) | ||
| E. coli BL21 (DE3) cepa | Novagen | 69450-3CN | |
| Columna HisTrapHP (5 mL) | GE Healthcare | 45-000-325 | |
| Columna de resina de amilosa | Nueva Inglaterra Biolabs | E8021S | |
| Q Columna de alto rendimiento Sepharose | GE Healthcare | 17-1154-01 | |
| Concentradores Amicon (10 kDa MWCO) | Millipore | UFC901008 | |
| Superdex 200 26/600 columna de filtración de gel | GE Healthcare | 28-9893-36 | |
| Sistema robótico automatizado de manejo de líquidos | Art Robbins Instruments | Gryphon | |
| 96 Well CrystalQuick | Greiner bio-one | 82050-494 | |
| Uni-Puck | Dimensiones moleculares | MD7-601 | |
| CryoLoop montado - 20 micras | Hampton Research | HR4-955 | |
| CryoWand | Dimensiones moleculares | MD7-411 | |
| Herramienta de carga Puck dewar | Molecular Dimensiones | MD7-607 | |
| Nano drop | Thermo Scientific | Incubadora NanoDrop One | |
| Crystal | Dimensiones moleculares | MD5-605 | |
| Difracactor de rayos X | Rigaku | FRX | |
| Máquina de PCR | Eppendorf | Nexus GX2 | |
| Mini-kit de preparación de plásmidos | Qiagen | 27104 | |
| Extracción de gel kit | Qiagen | 28704 | |
| SspI endonucleasa de restricción | NEB | R0132S | |
| T4 ADN polimerasa | Novagen | 2868713 | |
| Kanamicina | Scientific Chemical | 25389940 | |
| IPTG | Genview 367931 | ||
| HEPES | Genview | 7365459 | |
| β-mercaptoetanol | Centrífuga Genview | 60242 | |
| Thermo | Scientific | Sorvall LYNX 6000 | |
| Sonnicator | Scientz | II-D | |
| Sistema de purificación de proteínas | GE Healthcare | Akta Microscopio de luz pura | |
| Nikon | SMZ745 | ||
| IzIt tinte cristalino | Hampton Research | HR4-710 | |
| Unidad de electroforesis | Bio-Rad | 1658005EDU | |
| Incubadora agitadora | Zhicheng | ZWYR-D2401 | |
| Pantalla de cristal de índice | Hampton Research | HR2-144 | |
| Estructura pantalla de cristal | Dimensiones moleculares | MD1-01 | |
| Pantalla de cristal ProPlex | Dimensiones moleculares | MD1-38 | |
| PACT pantalla de cristal premier | Dimensiones moleculares | MD1-29 | |
| Pantalla de cristal JCSG-plus | Molecular Dimensiones | MD1-37 |
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