Nuestro laboratorio y muchos otros han explotado el alto poder resolutivo de la microscopía electrónica de transmisión para estudiar la morfología y la organización espacial de las vesículas sinápticas. Con el fin de obtener micrografías electrónicas de alta calidad que pueden producir el grado de detalle morfológico necesario para el análisis cuantitativo de la distribución de las vesículas presinápticas, la preparación óptima de la muestra es fundamental. La fijación química es el primer paso en el proceso de preparación de la muestra, y de máxima importancia para preservar la ultraestructura fina. La fijación vascular con una solución de glutaraldehído-formaldehído, seguida por el tratamiento de las muestras seccionadas por vibratome con tetroóxido de osmio, estabiliza el número máximo de moléculas, especialmente las proteínas y los lípidos, y resulta en una conservación superior de ultrestructure. A continuación, el tejido se procesa con antimanchas, deshidratación secuencial e incrustación de resina. La tinción en bloque con acetato de uranil (es decir, tinción de tejido seccionado con vibratome antes de la incrustación de resina) mejora el contraste endógeno y estabiliza los componentes celulares contra la extracción durante el procesamiento de muestras. El contraste se puede aumentar aún más aplicando el acetato de uranil como un post-mancha en las secciones ultrafinas. La doble tinción de secciones ultrafinas con citrato de plomo después del tratamiento con acetato de uranil también mejora la resolución de la imagen, intensificando la opacidad del electrón de las estructuras que contienen ácido nucleico mediante la Unión selectiva del plomo al acetato de uranil. La microscopía electrónica de transmisión es una poderosa herramienta para la caracterización de los detalles morfológicos de las vesículas sinápticas y la cuantificación de su tamaño y organización espacial en el Bouton terminal. Sin embargo, debido a que utiliza tejido fijo, la microscopía electrónica de transmisión solo puede proporcionar información indirecta con respecto a los procesos vivos o en evolución. Por lo tanto, deben tenerse en cuenta otras técnicas cuando el objetivo principal es estudiar aspectos dinámicos o funcionales del tráfico de vesículas sinápticas y la exocitosis.