La microscopía intravital del intestino mediante imágenes confocales permite la observación en tiempo real del desprendimiento de células epiteliales y la fuga de barreras en animales vivos. Por lo tanto, la mucosa intestinal de los ratones anestesiados se tiñe tópicamente con tinción inespecífica (acriflavina) y un marcador fluorescente (dextrano rhodamine-B), montado en una placa enjuacida con solución salina e imágenes directamente con un microscopio confocal. Esta técnica puede complementar otras técnicas no invasivas para identificar fugas de permeabilidad intestinal, como el paso transmucoso de trazados administrados por vía oral. Además de esto, el enfoque presentado aquí permite la observación directa de eventos de desprendimiento de células en tiempo real. En combinación con ratones reportero fluorescentes apropiados, este enfoque es adecuado para arrojar luz en mecanismos celulares y moleculares que controlan la extrusión de células epiteliales intestinales, así como a otros procesos biológicos. En las últimas décadas, interesantes estudios con microscopía intravital han contribuido al conocimiento sobre permeabilidad endotelial, localización del intestino de las células inmunitarias, comunicación inmune-epitelial e invasión de componentes luminales, entre otros. Juntos, el protocolo presentado aquí no sólo ayudaría a aumentar la comprensión de los mecanismos que controlan la extrusión de células epiteliales, sino que también podría ser la base para el desarrollo de otros enfoques que se utilizarán como instrumentos para visualizar otros procesos celulares altamente dinámicos, incluso en otros tejidos. Entre las limitaciones técnicas, las propiedades ópticas del tejido específico, así como la tecnología de imagen seleccionada y la configuración del microscopio, a su vez, determinarían la distancia de trabajo de la imagen y la resolución de las imágenes adquiridas.