El protocolo presenta la utilización del enfoque de biopsia química seguido de un análisis metabolómico y lipidémico completo para la evaluación de la calidad de los injertos renales asignados para el trasplante.
Artículo de método
* These authors contributed equally
El protocolo presenta la utilización del enfoque de biopsia química seguido de un análisis metabolómico y lipidémico completo para la evaluación de la calidad de los injertos renales asignados para el trasplante.
El trasplante de riñón es un tratamiento que salva vidas para un gran número de personas con disfunción renal terminal en todo el mundo. El procedimiento se asocia con una mayor tasa de supervivencia y una mayor calidad de vida del paciente en comparación con la diálisis convencional. Lamentablemente, la transplantología sufre de la falta de métodos confiables para la evaluación de la calidad de los órganos. Las técnicas de diagnóstico estándar se limitan a la inspección de apariencia macroscópica o a la biopsia de tejido invasiva, que no proporcionan información completa sobre el injerto. El protocolo propuesto tiene como objetivo introducir la microextracción de fase sólida (SPME) como un método analítico ideal para la metabolómica integral y el análisis lipidémico de todos los compuestos moleculares bajos presentes en los riñones asignados para el trasplante. El pequeño tamaño de la sonda SPME permite el rendimiento de una biopsia química, que permite la extracción de metabolitos directamente del órgano sin ninguna recolección de tejido. La mínima invasividad del método permite la ejecución de múltiples análisis a lo largo del tiempo: directamente después de la recolección de órganos, durante su conservación, e inmediatamente después de la revascularización en el cuerpo del receptor. Se presume que la combinación de este novedoso método de muestreo con un espectrómetro de masas de alta resolución permitirá la discriminación de un conjunto de compuestos característicos que podrían servir como marcadores biológicos de la calidad del injerto y los indicadores del posible desarrollo de la disfunción orgánica.
Según la Red de Adquisiciones y Trasplantes de Órganos de los Estados Unidos, había 94.756 pacientes esperando trasplantes de riñón en los Estados Unidos en 2019; mientras que en Europa en 2018, esa cifra fue de 10.791. Cada diez minutos, alguien es añadido a la lista nacional de espera de trasplantes en los EE.UU., y se estima que 20 personas mueren cada día esperando un trasplante1,2. El trasplante de riñón es un tratamiento que salva vidas para un gran número de personas que sufren de disfunción renal terminal en todo el mundo. El procedimiento se asocia con una mayor tasa de supervivencia y una mayor calidad de vida en comparación con la diálisis convencional.
Sin embargo, el trasplante enfrenta muchos problemas graves, como la escasez de órganos o la falta de herramientas eficaces para la evaluación de la calidad de los órganos. Los protocolos estándar se limitan a la inspección de apariencia macroscópica o biopsia de tejido invasiva, que no proporcionan información completa sobre la calidad del injerto. Mientras que una evaluación visual permite la identificación de tumores visibles para el ojo, anomalías anatómicas o daños extensos a los injertos, este enfoque es muy subjetivo, variando en su eficacia de acuerdo con la experiencia de los observadores. La biopsia, por otro lado, puede proporcionar información valiosa sobre trastornos renales preexistentes, y por lo tanto se considera un método de valor objetivo y evidenciado para determinar los resultados del injerto. Sin embargo, el procedimiento de biopsia no está libre de defectos; existe el riesgo de complicaciones potenciales como sangrado y se requieren 4-5 horas adicionales de preparación de la muestra, lo que prolonga significativamente el tiempo isquémico en frío. Por lo tanto, especialmente en Europa, el uso del análisis directo de tejidos se limita a criterios ampliados donantes (ECD) y donantes después de la muerte circulatoria (DCD)3,4.
Metabolómica y lipidómica han sido recientemente reconocidos como enfoques prometedores para lograr una mejor comprensión de los cambios en las vías bioquímicas que ocurren durante la preservación de órganos. El perfilado metabolómico y lipidomico permite monitorizar las respuestas inmediatas del sistema a cambios ambientales repentinos relacionados con la extracción de órganos con consecuencias posteriores: isquemia, estrés oxidativo o respuestas inflamatorias5,,6,,7,,8. El riñón es un órgano que se asocia en gran medida con procesos metabólicos, por lo tanto, las mediciones de metabolitos y concentraciones de lípidos pueden permitir la identificación de biomarcadores de calidad de órganos potenciales y permitir mejores predicciones del resultado del injerto.
Dadas las complicaciones y limitaciones anteriores asociadas con los métodos actuales de evaluación de la calidad de los órganos, se necesita una solución de diagnóstico menos invasiva para una evaluación rápida y compleja de la calidad de los órganos. La microextracción de fase sólida (SPME) cumple con estos requisitos como un método analítico mínimamente invasivo que permite la cobertura de un amplio espectro de metabolitos y lípidos. La técnica se basa en la inserción de una sonda de aleación de titanio-níquel biocompatible (200 m) cubierta con una fase de extracción selectiva en el órgano examinado durante un corto período de tiempo. Cabe destacar que SPME previene la extracción de proteínas, y por lo tanto permite la inhibición del metabolismo ya en la etapa de recolección de muestras, lo que es una ventaja significativa sobre los métodos alternativos. Además, la miniaturización del dispositivo permite la ejecución de análisis repetitivos y simultáneos de pocas estructuras del órgano9,,10,,11.
Todos los animales recibieron atención humana de conformidad con los "Principios de Cuidado Animal de Laboratorio" formulados por la Sociedad Nacional de Investigación Médica y la "Guía para el Cuidado de Animales de Laboratorio" publicada por el Instituto Nacional de Salud de Ontario, Canadá. El Comité de Cuidado Animal del Instituto General de Investigación de Toronto aprobó todos los estudios. La investigación involucraba a sujetos humanos fue aprobada por el Comité Bioético en Collegium Medicum en la Universidad Bydgoszcz Nicolaus Copernicus en Torun.
NOTA: Obtenga la aprobación de las juntas éticas apropiadas. Recuerde usar siempre guantes de seguridad. No toque la fase de extracción de las sondas SPME. Se recomienda el uso de viales de vidrio desactivado para análisis lipidómicos.
1. Preparación de sondas
2. Extracción
3. Transporte y almacenamiento
4. Desorción
5. Análisis LC-MS
6. Análisis de datos
La recolección de muestras se realizó de acuerdo con el método SPME descrito anteriormente, utilizando sondas recubiertas con una fase de extracción de modo mixto de 7 mm. El muestreo se realizó directamente desde el tejido del injerto (in vivo antes del trasplante), ex vivo en la cámara renal después de 1 h, 3 h, 5 h y 7 h de perfusión, y in vivo después de la revascularización en el receptor. Los análisis metabolómicos y lipidómicos no dirigidos se llevaron a cabo con el uso de cromatografía líquida (RP, HILIC) junto con espectrometría de masas de alta resolución, con el analizador de masas establecido en modo de ionización positiva. Para evaluar la calidad de los datos y obtener información general sobre los resultados, los datos se someten al análisis de componentes principales (PCA). Como se muestra en la Figura 1, lasmuestras de control de calidad formaron un clúster apretado, confirmando la calidad de los análisis. Los grupos estudiados presentan una separación relativamente buena, lo que permite la visualización de las diferencias en los perfiles metabólicos y lipidómicos antes y después del trasplante, así como durante la perfusión de órganos (Figura 2). El muestreo SPME permite el perfilado metabólico del órgano con el tiempo. Las gráficas de box-whisker de metabolitos seleccionados sirven para ejemplificar alteraciones en los niveles de metabolitos a lo largo del experimento (Figura 3). El amplio espectro de entidades extraídas separadas en las columnas RP e HILIC se muestra en la Figura 4.

Figura 1: Análisis de componentes principales que muestran la agrupación de muestras de control de calidad para análisis metabolómicos de fase invertida (A), HILIC (B) y fase invertida lipidémica (C), HILIC (D). El control de calidad es necesario en el análisis no dirigido para monitorear cualquier posible cambio inducido por la inestabilidad instrumental. Un grupo apretado de muestras de control de calidad garantiza que todos los cambios observados sean de origen biológico. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Análisis de componentes principales que muestran diferencias metabolómicas (A) y lipidómicas (B) entre puntos de muestreo particulares. El perfilado no dirigido del riñón con SPME-LC-HRMS permite observar diferencias bioquímicas en los órganos en los pasos posteriores de su preservación. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Gráficas de bóxer de compuestos seleccionados que muestran alteraciones en metabolitos (A, B) y lípidos (C, D) durante el período peritransplano. Después de la selección e identificación de compuestos discriminantes, las parcelas de box-whisker permiten monitorear los cambios en los niveles de estos compuestos en los pasos posteriores del protocolo y comparar los niveles de metabolitos en órganos sometidos a diferentes protocolos de preservación o cosechados de diferentes donantes, por ejemplo, donantes que laten corazón o donantes después de la muerte cardíaca. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Mapa de iones (m/z frente al tiempo de retención) de las entidades obtenidas mediante el análisis LC-MS con (A) fase invertida y (B) separación HILIC. La gráfica permite estimar el número total de características obtenidas con el protocolo propuesto (desde la extracción hasta la detección) y evaluar la cobertura de analitos en función de la polaridad. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
La evaluación de la calidad de los órganos sigue siendo un gran desafío para los médicos, que deben tomar decisiones rápidas y informadas sobre si un órgano determinado es viable para el trasplante o si debe desecharse. Múltiples factores, como la edad del donante, la duración de la isquemia, las infecciones y los procesos inflamatorios, pueden afectar el resultado del injerto a largo plazo. Mientras que se han desarrollado diversos métodos hasta la fecha para diagnosticar la función de aloinjerto renal, la inspección histopatológica sigue siendo el estándar de oro en esa materia3,4,12. Aunque el procedimiento de biopsia puede producir información significativa sobre la enfermedad del donante preexistente y los cambios vasculares, no está libre de defectos. Los errores de muestreo asociados a la variabilidad entreobservados y al muestreo de glomérulos insuficientes para obtener información completa sobre la función de los órganos siguen siendo preocupaciones típicas a este respecto. Además, la preparación de muestras trae algunas cuestiones, como una evaluación incompleta del injerto en caso de secciones congeladas, y la extensión del tiempo de procedimiento para la sección de parafina. Sin embargo, el mayor riesgo de hemorragia, que puede aparecer agudamente como hematuria microscópica o grave, es la principal complicación potencialmente mortal asociada con el procedimiento de biopsia. Por esta razón, el número de biopsias permitidas está estrictamente limitado en los procedimientos de trasplante, un factor que dificulta la captura de cambios dinámicos y análisis de series temporales a través de este método12,,13,,14. Los beneficios de un análisis histológico deben sopesarse con los riesgos asociados con la metodología. El valor de los hallazgos histológicos es indiscutible, pero no explican los mecanismos moleculares de las aberraciones.
Metabolómica y lipidómica son los dominios más jóvenes de la familia científica "-omics". El conjunto completo de metabolitos y lípidos humanos bajos moleculares (<1,200 Da) conectados dentro de una red metabólica se define como un metaboloma humano. El genoma permanece relativamente constante a lo largo de su vida útil, con ligeras modificaciones causadas por mutaciones que ocurren con poca frecuencia. El metaboloma es el producto de la expresión génica, que es altamente sensible a los cambios en todos los procesos biológicos, así como factores ambientales. La naturaleza dinámica de los metabolitos y lípidos los convierte en indicadores perfectos de la condición actual del órgano7,8,15,16. El método SPME propuesto en el protocolo antes mencionado permite la detección de los cambios que se producen en el órgano durante su conservación, partiendo de la extracción de órganos del cuerpo del donante hasta la revascularización en el receptor. El pequeño diámetro de la sonda (200 m) proporciona una mínima invasividad y permite varios muestreos del mismo órgano sin causar ningún daño al tejido. La realización de estudios utilizando el riñón, como el órgano trasplantado con más frecuencia, permite una mejor comprensión y posterior caracterización de las vías metabólicas responsables de la disminución de la calidad y función de los injertos. La posibilidad de monitorear las modificaciones a lo largo del tiempo sin duda es una ventaja importante de la técnica en comparación con los métodos invasivos convencionales como la biopsia. El análisis presentado actualmente identificó concentraciones alteradas de varios grupos de lípidos y metabolitos, especialmente de aminoácidos esenciales, purinas, nucleósidos de purina y glucerofosfolípidos. Estos resultados son consistentes con los informes de análisis de tejidos anteriores5,6,17,18,19,20. Hasta la fecha, la mayoría de los informes científicos que utilizan metabolómica o lipidómica para explicar los procesos que inducen complicaciones después del trasplante o de la isquemia/lesión por reperfusión (IRI) se han limitado al análisis de biofluidos21,,22,,23.
Cada aplicación clínica requiere la optimización del protocolo de muestreo para garantizar que el rendimiento del método analítico cumpla los criterios esperados. A este respecto, el beneficio de utilizar SPME es la posibilidad de ajustar las condiciones para diversos diseños experimentales. La variedad de fases de extracción accesibles proporciona un amplio espectro de metabolitos extraídos con polaridades diversificadas. Al mismo tiempo, esto podría considerarse como una limitación del método debido al hecho de que cada sorbente proporciona selectividad hacia características específicas y no extrae todos los compuestos presentes en la matriz de muestra. Cabe señalar que los recubrimientos SPME se extraen sólo a través de moléculas libres, y simplemente no interactúan con una fracción enlazada del analito. La biocompatibilidad de los recubrimientos no introduce toxicidad en el tejido al tiempo que se restringe la extracción de moléculas grandes como proteínas; como consecuencia, los procesos enzimáticos se inhiben ya en la etapa de recolección de muestras y se minimiza la presencia de artefactos, lo que es una gran ventaja sobre los métodos de muestreo alternativos. La longitud del recubrimiento influye en la eficiencia de la extracción (es decir, la longitud del recubrimiento designa el área de superficie y el volumen de fase de extracción); por lo tanto, los recubrimientos más largos producen mayores recuperaciones. Por otro lado, los recubrimientos más cortos permiten una mayor resolución espacial. Para obtener resultados fiables, es crucial sumergir la sonda a la misma profundidad exacta de la corteza renal. La inserción demasiado profunda causa el riesgo de entrar en la médula renal. El tiempo de extracción también es proporcional a la eficiencia de extracción. Por lo tanto, la selección del tiempo de extracción óptimo es uno de los pasos más críticos en el desarrollo del método SPME. La precisión de la medición del tiempo proporciona la repetibilidad más alta. En aplicaciones biológicas como la discutida, siempre existe un compromiso entre la sensibilidad y la repetibilidad del protocolo analítico y las restricciones del procedimiento médico. Mientras que la extracción de equilibrio proporciona la mayor sensibilidad, por razones de seguridad, las condiciones de pre-equilibrio se utilizan a menudo en tales aplicaciones, ya que el tiempo de extracción no debe afectar la duración total de la cirugía. La eficiencia de la desorción viene determinada por el momento del proceso y la composición del disolvente de desorción, que debe ser compatible con la fase móvil utilizada para la separación cromatográfica9,10,11.
Uno de los principales requisitos para la instrumentación diagnóstica utilizada para las evaluaciones intraquirúrgicas es el tiempo de análisis. Se están realizando intentos actuales para desarrollar una herramienta rápida para la extracción de SPME in vivo acoplada directamente a un espectrómetro de masas a través de una interfaz abierta microfluídica (MOI)24 o pulverización de cuchilla recubierta (CBS)25. Estos enfoques permitirían la divulgación de resultados analíticos en tiempo real o cercano al tiempo real. El uso de estos métodos para los análisis previos a la intervención de perfiles metabólicos y lipídicos podría mejorar el proceso de toma de decisiones durante los procedimientos de trasplante, permitiendo el mejor enfoque personalizado posible y una respuesta rápida en caso de fallo de órganos.
Como resumen, se presume que el protocolo propuesto permitirá la realización de perfiles metabólicos y lipídicos completos de los injertos renales, lo que a su vez proporcionaría una evaluación exhaustiva de la calidad de los órganos y la caracterización de los procesos responsables de la lesión por isquemia-reperfusión. La novedad del proyecto incluye la utilización de la microextracción de fase sólida (SPME), ofreciendo un muestreo poco invasivo de sistemas vivos, en combinación con una de las tecnologías más innovadoras disponibles para el análisis metabolómico y lipidómico (por ejemplo, el espectrómetro de masas de alta resolución Orbitrap). SPME combina la recolección de muestras, la extracción y el enfriamiento de metabolitos en un solo paso, lo que la convierte en una herramienta perfecta para un análisis rápido. Se espera que este protocolo ayude a responder preguntas relacionadas con qué condiciones previas al trasplante del riñón son responsables de la función retardada del órgano o sus disfunciones después del trasplante, así como de cómo el protocolo de preservación del injerto influye en la bioquímica del órgano. Estos conocimientos no sólo tendrían un impacto significativo en la prevención de posibles complicaciones relacionadas con el trasplante, sino que pueden ayudar a mejorar los protocolos actuales de preservación del injerto, minimizando la pérdida de tejido de trasplante viable, así como la pérdida de vidas. La solución propuesta abrirá la puerta a nuevas investigaciones en este campo, incluida la validación de biomarcadores potenciales específicos y la mejora de los resultados terapéuticos en la trasplanteología.
Los autores desean reconocer a MilliporeSigma (Merck KGaA, Darmstadt, Alemania) por proporcionar dispositivos SPME y Thermo Fisher Scientific para el acceso al espectrómetro de masas Q-Exactive Focus Orbitrap.
El estudio fue apoyado por la concesión Opus UMO-2017/27/B/NZ5/01013 del Centro Nacional de Ciencias. Los autores desean reconocer a MilliporeSigma, una empresa de Merck KGaA, Darmstadt, Alemania, por proporcionar dispositivos SPME. El negocio de ciencias de la vida de Merck opera como MilliporeSigma en los Estados Unidos y Canadá. Además, los autores quieren agradecer a Thermo Fisher Scientific por el acceso al espectrómetro de masas orbitrap Q-Exactive Focus. Los autores desean dar las gracias a la Dra. Aleksandra Woderska-Jasi-ska y al personal del Departamento de Trasplantes y Cirugía General de Bydgoszcz por su amable asistencia en el proyecto. BB quiere agradecer al profesor Janusz Pawliszyn por la oportunidad de la recolección de muestras en el Hospital General de Toronto durante su estancia en la Universidad de Waterloo.
| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| Ácido acético | Merck | 5330010050 | Aditivo de fase móvil |
| Acetonitrilo | Alchem | 696-34967-4X2.5L | Disolvente de HPLC |
| Acetato de amonio | Merck | 5330040050 | Aditivo de fase móvil |
| BATIDORA DE BANCO XL VÓRTICE MULTITUBO | Benchmark Scientific | BV1010 | Mezclador de vórtice |
| Caps | Perlan Technologies | 5183-2076 | Azul scrw tp, PTFE/Si spta precortado, 100PK |
| Cloroformo | Merck | 1024441000 | |
| Discovery HS F5 Cartucho Supelguard, 3 μ m, L y veces; Diámetro interior 2 cm y veces; 2,1 mm | Merck | 567570-U Columna de protección para | HPLC |
| Discovery HS F5, 2,1 mm x 100 mm, 3 μ m | Merck | 567502-U | Columna de HPLC |
| Ácido fórmico | Alchem | 497-94318-50ML | Aditivo de fase móvil |
| Viales de vidrio | Perlan Technologies | 5182-0714 | |
| HILIC Luna 3 μ m, 200A, 100 x 2,0 mm | Shim-Pol | PHX-00D-4449-B0 | Columna de HPLC |
| Cartucho HILIC SecurityGuard, 3 μ m, 4 x 2,0 mm | Shim-Pol | PHX-AJ0-8328 Columna de | protección para HPLC |
| Isopropanol | Alchem | 231-AL03262500 | Disolvente de HPLC |
| Metanol | Alchem | 696-34966-4X2.5L | Disolvente de HPLC |
| Agua nanopura | Disolvente | 1037281002 HPLC | |
| Merck Q Exactive Focus cuadrupolo híbrido-Orbitrap MS | Thermo Scientific | Q Exactive Focus | Mass Espectrómetro |
| SeQuant ZIC-cHILIC 3µ m,100Å 100 x 2,1 mm | Columna de HPLC | 1506570001 Merck | |
| Kit de protección SeQuant ZIC-HILIC 20 x 2,1 mm | Columna de protección de 1504360001 HPLC | DE MERCK | |
| Sondas de fibra LC SPME, modo mixto | Fibras prototipo de | Supelco | |
| HPLC UltiMate 3000 | HPLC | Thermo Scientific | UltiMate 3000 |
| Insertos de viales (desactivados) | Perlan Technologies | 5181-8872 | |
| XSelect CSH C18 3.5μ m 2.1x75mm | Columna | de HPLC | |
| 186005644 de Aguas XSelect CSH C18 VanGuard Cartucho 3.5μ m, 2,1 x 5 mm | Waters 186007811 | columna de protección HPLC |
An erratum was issued for: Using a Chemical Biopsy for Graft Quality Assessment. One of the affiliations was updated.
The third affiliation was updated from:
Department of Transplantation and General Surgery, University Hospital, University of Nicolaus Copernicus Torun"
to:
Department of Transplantology and General Surgery, Collegium Medicum in Bydgoszcz, Antoni Jurasz University Hospital No. 1 in Bydgoszcz, Nicolaus Copernicus University in Torun, Bydgoszcz, Poland