Los testículos de Drosophila son un poderoso sistema modelo para estudiar procesos biológicos, incluida la biología de células madre, la arquitectura nuclear, la meiosis y el desarrollo de espermatozoides. Sin embargo, el immunolabeling del testículo entero de Drosophila se asocia a menudo a la no uniformidad significativa de la coloración debido a la penetración del anticuerpo. Las preparaciones aplastadas solo superan parcialmente el problema, ya que disminuye la calidad 3D de los análisis. Adjunto, describimos un protocolo del entero-montaje usando NP40 y heptano durante la fijación junto con immunolabeling en medios líquidos. Conserva el volumen adecuado para la microscopía confocal junto con un etiquetado reproducible y fiable. Mostramos diferentes ejemplos de reconstitución 3D de los núcleos de espermatocitos de secciones confocales. La reproducibilidad intra e inter-testículo permite la cuantificación 3D y la comparación de la fluorescencia entre células individuales de diferentes genotipos. Se utilizaron diferentes componentes de la estructura intranuclear MINT (Mad1-que contiene intra territorio nuclear), así como dos componentes asociados con el complejo de poros nucleares para ilustrar este protocolo y sus aplicaciones en las células más grandes del testículo, los espermatocitos S4-S5.