| Técnica de preparación de extractos | Detalles | Ventajas | Desventajas | Análisis descendente | Referencia |
| Prensa francesa: Homogeneizador de alta presión (también conocido como Microfluidizer) con pretratamiento enzimático con Zymolyase | Zymolyase-20T, un homogeneizador de alta presión Microfluidizer. El disruptor consiste en una bomba de alta presión accionada por aire (relación 1:250; presión de aire requerida 0,6-l MPa) y una cámara de interrupción especial con una unidad de contrapresión adicional. Se requiere un tamaño mínimo de muestra de 20 ml para el procesamiento. | La interrupción total final obtenida con el protocolo combinado se acercó al 100 % con 4 pasadas a una presión de 95 MPa, en comparación con sólo una interrupción del 32 % con 4 pasadas a 95 MPa utilizando sólo homogeneización sin la Zymolyase. | No es adecuado para aplicaciones a pequeña escala. Las enzimas pueden ser costosas para preparaciones a gran escala. | Purificación de proteínas | 6 |
| Batidor de cuentas: Zymolyase células tratadas con dosel con cuentas de vidrio en un instrumento fastprep | Aproximadamente, se añade un volumen igual de cuentas de vidrio frías, secas y lavadas con ácido de 0,5 mm a un volumen determinado de pellet celular en el tampón de la lysis y las células se interrumpen por agitación manual vigorosa. | Es particularmente útil cuando se producen extractos de muchos cultivos de levadura pequeñas diferentes para fines de ensayo en lugar de para la purificación de proteínas. | Durante el procedimiento de perlas de vidrio, las proteínas se tratan duramente causando una espuma extensa que conduce a la desnaturalización de proteínas. La cantidad de rotura celular varía, mientras que la proteólisis, así como la modificación de las proteínas pueden resultar del calentamiento del extracto por encima de 4oC durante la rotura mecánica. | Principalmente análisis de ADN y ARN, pero también análisis de proteínas mediante la desnaturalización de gel electropheoresis, ya sea con o sin hinchazón occidental. | 8 |
| Tratamiento con zymolyase seguido de lelisis mediante una combinación de shock osmótico y homogeneización de Dounce | Después de la digestión enzimática de las paredes celulares, los esferoplastos se liszan con 15 a 20 golpes de un pestillo ajustado (despeje de 1 a 3 m) en un homogeneizador dounce. | Ventajoso para usar cepas deficientes en proteasa como BJ926 o EJ101. Esta es la forma más suave de romper las células de levadura y por lo tanto es más adecuado para la preparación de extractos que pueden llevar a cabo funciones enzimáticas complejas (por ejemplo, traducción, transcripción, replicación del ADN) y en las que se debe mantener la integridad de las estructuras macromoleculares (por ejemplo, ribosomas, empalmes). También es útil para aislar núcleos intactos que se pueden utilizar para estudios de cromatina (Bloom y Carbon, 1982) o para extractos de proteínas nucleares (Lue y Kornberg, 1987). | Las principales desventajas del procedimiento de lysis esferoplastia son que es relativamente tedioso y caro, especialmente para preparaciones a gran escala (>10 litros), y los largos períodos de incubación pueden conducir a la proteólisis o modificación de proteínas. Para las preparaciones de cromatina, parecen ser de diferente o menor calidad que las producidas por la centrifugación diferencial (basada en la integridad de la escalera nucleosoma). | Aislamiento de núcleos intactos para estudios de cromatina, extractos que pueden llevar a cabo funciones enzimáticas complejas, extractos que requieren la integridad de macromoleculares, extractos de proteínas nucleares. | 2 |
| Interrupción celular de las células congeladas parpadeantes mediante la molienda de nitrógeno líquido utilizando un mortero/pestle o una licuadora | Las células se congelan inmediatamente en nitrógeno líquido y luego se aleban moliendo manualmente en un mortero usando un pestillo, o usando una licuadora Waring en presencia de nitrógeno líquido. | El protocolo es rápido y fácil. Puede acomodar diferentes cantidades de células de levadura incluyendo cultivos muy grandes. Su principal ventaja es que las células se toman inmediatamente del estado de crecimiento activo en nitrógeno líquido (-196 oC), disminuyendo las actividades enzimáticas degradativas como proteasas y nucleasas, así como actividades que modifican proteínas (por ejemplo, fosfatasas y quinasas). Es especialmente adecuado para la fabricación de extractos de células enteras de un solo cultivo de levadura para la purificación de proteínas a gran escala. | Un poco desordenado y potencialmente peligroso para el investigador descuidado. Las muestras pequeñas (es decir, cultivos de levadura de 10 a 100 ml) no se procesan fácilmente porque no hay suficiente masa de grumos de células congeladas para fracturarse eficazmente en la licuadora. Es lento procesar muestras individuales y limpiar el equipo entre usos. | Extractos de células enteras de un solo cultivo de levadura para la purificación de proteínas a gran escala. | 2 |
| Autolisis, Molino de cuentas | pH 5,0, 50 oC, 24 h, 200 rpm / 0,5 mm, 5 × 3 min/3 min | La lelisis rápida y eficiente, especialmente para la preparación de extractos a pequeña escala | La generación de calor conduce a la desnaturalización y degradación de las macromoléculas. Se requiere equipo de batido de cuentas. | Análisis a pequeña escala. | 10 |
| Autolisis, Sonicación | pH 5,0, 50 oC, 24 h, 200 rpm, 4 × 5 min/2 min, pulsador 80%, potencia 80% | Los equipos de sonicación suelen estar disponibles en la mayoría de las instituciones. | La generación de calor conduce a la desnaturalización y degradación de las macromoléculas. Se requiere equipo de sonicación. La lelisis lenta puede tardar más de 24 horas. | Preparaciones de la pared celular de levadura. |
| Proceso de ebullición y congelación | No se necesita ningún equipo especializado que no sea un congelador estándar y un bloque de calefacción o baño de agua caliente. | Eficiente, reproducible, sencillo y barato. | La generación de calor conduce a la desnaturalización y degradación de las macromoléculas. | Análisis de ADN por PCR. | 5 |