ATAC requiere la implementación exitosa de varias técnicas para la neuromodulación exitosa de circuitos neuronales específicos, incluida la orientación precisa guiada por resonancia magnética, FUS-BBBO y la evaluación histológica de la expresión génica. Se desarrollaron componentes imprimibles en 3D para simplificar la focalización de pequeñas estructuras cerebrales con FUS-BBBO guiado por imágenes.
La administración de ultrasonido focalizado guiado por resonancia magnética (MRIgFUS, por sus siglas en inglés) plantea una serie de desafíos. En primer lugar, la bobina de resonancia magnética típica tiene un espacio limitado que está diseñado para acomodar solo una muestra y no el hardware de ultrasonido. Los orificios más grandes de las resonancias magnéticas aumentan el costo del equipo y disminuyen la calidad de la imagen, ya que la señal está relacionada con el factor de llenado de una bobina32. En consecuencia, cualquier hardware FUS colocado en la parte superior de una imagen animal en la resonancia magnética comprometerá la calidad de la imagen. En segundo lugar, el diseño de dispositivos compatibles con la resonancia magnética es difícil y costoso. Los materiales compatibles con la resonancia magnética deben ser diamagnéticos, tener una baja propensión a crear corrientes de Foucault durante la irradiación de radiofrecuencia y tener una baja susceptibilidad magnética en campos magnéticos altos. En cualquier material conductor, la creación de corrientes de Foucault o su susceptibilidad magnética también afectará negativamente a la calidad de la imagen. Por último, los materiales disponibles compatibles con la resonancia magnética tienen módulos de Young y durabilidad más bajos que los metales que se utilizan normalmente en la producción de máquinas de puntería precisa, por ejemplo, monturas estereotáxicas. Los motores utilizados para los ajustes de posición deben ser compatibles con la RMN y colocarse fuera del orificio de la RMN debido a su tamaño. Estos motores deben conectarse a distancia al transductor dentro de un orificio de resonancia magnética utilizando materiales compatibles con resonancia magnética. Los problemas de deformación del plástico, la falta de espacio suficiente dentro del orificio para implementar componentes de tamaño robusto y el espacio insuficiente para cambiar las posiciones de puntería en todo el cerebro han afectado a la precisión de la puntería en trabajos anteriores.
Para resolver estos problemas, se tomó la decisión de realizar imágenes en la RM y la administración de FUS-BBBO fuera del escáner. Para permitir la guía por resonancia magnética, los ratones se colocaron dentro de una restricción impresa en 3D que tenía una guía de orientación visible por resonancia magnética que podría usarse para localizar las estructuras cerebrales del ratón tanto en la resonancia magnética como en el espacio de coordenadas estereotasis. Dado que tanto el cráneo del ratón como la guía de orientación están firmemente sujetos a los soportes de la barra de la oreja (Figura 1 a, b), se puede utilizar una guía de orientación para correlacionar las coordenadas espaciales dentro de la imagen de resonancia magnética y poner a cero los instrumentos estereotáxicos. La restricción no tiene partes móviles y no contiene un transductor, lo que nos permitió hacerla robusta y lo suficientemente pequeña como para caber dentro de una resonancia magnética y eliminó la interferencia de la señal de la electrónica del transductor. El espacio dentro de la guía de orientación se ha vaciado, ya que el soporte impreso en 3D para algunos materiales es visible en la resonancia magnética (Figura 1c). Se introdujeron orificios en el conjunto para permitir la calibración estereográfica (Figura 3). El transductor de ultrasonido se conectó a un portaelectrodos de una estereotasa y la focalización se realizó como se describe en la sección 4 (Figura 1d). El transductor debe estar soportado a lo largo de su longitud por la carcasa de las barras de los oídos, evitando cualquier desviación del plano de nivel. La focalización en la dirección dorso-ventral se puede lograr utilizando desplazamientos de fase en una matriz anular.
La precisión práctica de la orientación está determinada por el enfoque ultrasónico y la atenuación del cráneo. El procedimiento FUS-BBBO se ha descrito en detalle para ratas 11 y se ha implementado en otros organismos modelo23,33,34 y en humanos 16,17. La relación entre el tamaño del foco de ultrasonido es inversamente proporcional a la frecuencia, donde las frecuencias más altas pueden dar lugar a una entrega más precisa. Sin embargo, la atenuación del cráneo aumenta con frecuencias35, lo que puede provocar calentamiento del cráneo y daños en las áreas corticales. La estrategia de focalización exacta dependerá del sitio del cerebro. Los sitios donde una presión media máxima de ancho completo encaja dentro del tejido cerebral permiten una apertura predecible y segura de la BHE en muchas estructuras cerebrales, como el cuerpo estriado, el mesencéfalo y el hipocampo. Las regiones cercanas a la base del cerebro plantean un desafío específico en ratones. El cerebro del ratón mide aproximadamente 8-10 mm en dirección dorso-ventral, lo que es comparable a la mitad del tamaño máximo de ancho completo de muchos transductores disponibles comercialmente. En consecuencia, apuntar a la parte inferior del cráneo puede conducir a la reflexión ultrasónica de los huesos y el aire presente en los canales auditivos, la boca o la tráquea, lo que puede conducir a patrones impredecibles de presiones altas y bajas36. Algunas de estas presiones pueden cruzar un umbral de cavitación inercial que se ha demostrado que causa hemorragias y daño tisular37. Para dirigirse a las regiones que se encuentran cerca de la base del cráneo, puede ser preferible utilizar el ATAC7 interseccional, donde la genética interseccional38 se utiliza para restringir la expresión génica a un área más pequeña que la que se dirige con el haz FUS. En el ejemplo publicado de ATAC interseccional, un animal transgénico que expresa una enzima de edición genética (Cre38) en células dopaminérgicas ha sido atacado con ultrasonido en la subsección de la región que contiene células dopaminérgicas. Por último, las regiones corticales pueden ser atacadas con FUS, pero la difracción y la reflexión de los ultrasonidos pueden producirse, lo que da lugar a perfiles de presión desiguales. Este protocolo no cubre la focalización de regiones corticales, ya que dependerá en gran medida de la especie utilizada; sin embargo, se ha observado cierta orientación de la corteza por encima del hipocampo 7 (por ejemplo, Figura 7), lo que indica que, al menos en ratones, es posible.
La elección de un activador quimiogenético y la dosificación dependerán de las necesidades experimentales específicas. Varios estudios, incluido uno de los estudios de los autores7, no mostraron una respuesta inespecífica significativa39,40, mientras que dosis más altas (p. ej., 10 mg/kg) pueden producir efectos secundarios, al menos en algunos casos41. Sin embargo, al igual que con todos los experimentos conductuales, los controles adecuados31 son esenciales debido a la posible actividad fuera del objetivo de CNO y sus metabolitos42. Dichos controles podrían incluir la administración de controles de CNO y solución salina a animales que expresen DREADD y la administración de CNO a animales de tipo salvaje o, en algunos casos específicos, una comparación de sitios ipsi y contralaterales del cerebro que expresan y no expresan receptores quimiogenéticos, respectivamente. Además, investigaciones recientes revelaron una serie de nuevos agonistas de DREADD con especificidad mejorada28,29,43. Otros receptores quimiogenéticos 5,25,44 también se pueden utilizar junto con el procedimiento ATAC.
La evaluación histológica de la expresión génica es necesaria post mortem para cada animal. Una pequeña fracción de los animales muestra una expresión génica deficiente después de FUS-BBBO7. Además, es necesario demostrar la precisión espacial y la especificidad de la expresión génica, ya que es posible que se dirijan mal. Cabe destacar que algunos AAV pueden mostrar una capacidad de rastreo retrógrada o anterógrada45 y pueden causar transfección lejos del sitio objetivo con ultrasonido a pesar de la precisión de la orientación del ultrasonido. Si el receptor quimiogenético expresado se fusiona con un fluoróforo o lo coexpresa, las imágenes del fluoróforo en secciones de tejido pueden ser suficientes para evaluar la localización y la intensidad de la expresión. Sin embargo, muchas proteínas fluorescentes son dañadas por el proceso de fijación tisular, y la inmunotinción para la proteína mCherry que se usa con frecuencia con DREADDs produjo una mejor señal en estudios previos7. Por último, debido a la densidad de neuronas en ciertas partes del cerebro (por ejemplo, la capa de células granulares en el hipocampo), el uso de fluoróforos localizados nuclearmente expresados en IRES, en lugar de fusiones, para realizar recuentos celulares puede ser beneficioso, ya que los núcleos pueden segmentarse fácilmente y contrateñirse con tinciones nucleares, como DAPI o TO-PRO-3. Para evaluar la neuromodulación mediante tinción de c-Fos, es imprescindible realizar la contratinción nuclear y contar los núcleos positivos de c-Fos, en lugar de cualquier señal de fluorescencia. En algunos casos, los desechos celulares pueden mostrar fluorescencia y confundir las mediciones de las células positivas.
Las limitaciones de la administración de fármacos y genes con FUS-BBBO incluyen una resolución más baja que la administración con inyecciones intracraneales invasivas y la necesidad de mayores cantidades de fármacos inyectados o vectores virales. Además, mientras que una inyección directa en el cerebro da como resultado una administración exclusiva en un sitio inyectado, FUS-BBBO utiliza una vía intravenosa que da como resultado una posible administración a los tejidos periféricos. Las limitaciones del uso de la quimiogenética para la neuromodulación incluyen una escala de tiempo lenta, que puede ser inadecuada para algunos protocolos conductuales que requieren cambios rápidos en la intensidad de la neuromodulación.