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Research Article
Tatsuya Osaki1,2, Siu Yu A. Chow1,2, Yui Nakanishi1,2, Joel Hernández1,3, Jiro Kawada4, Teruo Fujii1, Yoshiho Ikeuchi1,2
1Institute of Industrial Science,The University of Tokyo, 2Department of Chemistry and Biotechnology, School of Engineering,The University of Tokyo, 3Faculty of Science and Engineering,Tecnologico de Monterrey, 4Jiksak Bioengineering, Inc.
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo proporciona un procedimiento integral para fabricar organoide nervioso motor derivado de células iPS humanas a través del montaje espontáneo de un robusto conjunto de axones extendidos a partir de un esferoide en un chip de cultivo de tejido.
Un fascículo de axones es uno de los principales motivos estructurales observados en el sistema nervioso. La interrupción de los fascículos de axón podría causar enfermedades del desarrollo y neurodegenerativas. Aunque se han realizado numerosos estudios de axones, nuestra comprensión de la formación y disfunción de los fascículos de axón sigue siendo limitada debido a la falta de modelos in vitro tridimensionales robustos. Aquí, describimos un protocolo paso a paso para la rápida generación de un organoide nervioso motor (MNO) a partir de células madre pluripotentes inducidas por humanos (iPS) en un chip de cultivo de tejido a base de microfluídico. En primer lugar, se describe la fabricación de chips utilizados para el método. A partir de células iPS humanas, se forma un esferoide de neuronas motoras (MNS). A continuación, el MNS diferenciado se transfiere al chip. A partir de entonces, los axones crecen espontáneamente a partir del esferoide y se ensamblan en un fascículo dentro de un microcanal equipado en el chip, que genera un tejido MNO que lleva un paquete de axones extendidos desde el esferoide. Para el análisis posterior, los MNO se pueden sacar del chip para que se fije para análisis morfológicos o se diseccione para análisis bioquímicos, así como imágenes de calcio y grabaciones de matrices multi-electrodos. Las MNO generadas con este protocolo pueden facilitar las pruebas y el cribado de fármacos y pueden contribuir a comprender los mecanismos subyacentes al desarrollo y las enfermedades de los fascículos de axón.
Las neuronas motoras espinales (MN) extienden los axones a los músculos esqueléticos para controlar el movimiento corporal. Sus trayectorias axoales están altamente organizadas y reguladas en el proceso de desarrollo. A pesar de muchos estudios sobre la extensión del axón y la orientación1,los mecanismos para la formación de paquetes de axones organizados todavía están siendo investigados. Los axones de las neuronas motoras a menudo son dañados por enfermedades neurodegenerativas como la esclerosis lateral amiotrófica (ELA)2,pero los mecanismos fisiofisiológicos del daño en los fascículos del axón son mal entendidos. Por lo tanto, se requiere un modelo fisiológico y patológico para recapitular la formación y regresión del haz axón en el campo.
Una neurona motora derivada de células madre humanas es una plataforma prometedora para entender el desarrollo y enfermedades como la ELA3. Las células madre pluripotentes inducidas por el hombre (células iPS) se pueden utilizar para modelar enfermedades utilizando células derivadas del paciente. Hasta la fecha, se han notificado varios métodos de diferenciación de células madre pluripotentes en MN4,5,6. Sin embargo, los axones de las neuronas en el cultivo bidimensional están orientados aleatoriamente y no recapitulan el microambiente vivo dentro de los nervios en desarrollo en los que los axones se ensamblan unidireccionalmente a través de interacciones axo-axoales densas7. Para superar este problema, hemos desarrollado una técnica para generar un tejido tridimensional que se asemeja al nervio motor de las células iPS humanas8,y hemos nombrado el tejido como organoide nervioso motor (MNO). El MNO consiste en cuerpos celulares ubicados en un esferoide de neuronas motoras (MNS) y un fascículo axonal extendido desde el esferoide. Los axones en la fascículo están orientados unidireccionalmente, que se asemeja a los axones en el desarrollo de nervios motores. Por lo tanto, los MNO proporcionan de forma única un microambiente axonal fisiológico, que no fue realizado por ningún otro método de cultivo neuronal previamente desarrollado.
En este protocolo, describimos métodos para la fabricación de chips de cultivo de tejidos, la diferenciación rápida de las neuronas motoras y la formación de organoides nerviosos motores en chips desarrollados. Nuestro chip de cultivo de tejidos es muy simple, y sólo contiene un compartimento para aceptar un esferoide, un microcanal para formar un paquete de axones y un compartimento para albergar terminales de axón. El dispositivo no contiene estructuras complejas incluyendo microgrooves o filtros de micropore que se utilizan a menudo para separar axones y cuerpos celulares por tamaño9,10. Por lo tanto, nuestros dispositivos se pueden fabricar fácilmente siguiendo los pasos descritos en este protocolo si hay una configuración de fotolitografía disponible.
La rápida diferenciación de las células iPS humanas se logra con una combinación optimizada de factores de inducción y patrón (SB431542, LDN-193189, ácido retinoico (AR) y agonista suavizado (SAG)) y factores de aceleración (SU5402 y DAPT). Se ha informado que la combinación de SU5402 y DAPT acelera la diferenciación de las neuronas periféricas y las células de cresta neural11. En este protocolo, ofrecemos tres métodos diferentes para generar MNOs, para que los lectores puedan decidir sobre un método más adecuado a sus necesidades. Recomendamos realizar la diferenciación de las células iPS humanas después de formar un esferoide (el método 3D), ya que el MNS diferenciado se puede transferir directamente a un chip de cultivo de tejido. Alternativamente, las células iPS humanas se pueden diferenciar en neuronas motoras en cultivo monocapa (2D), y luego se crean en esferoides de neuronas motoras tridimensionales como informamos previamente8. Hemos actualizado el protocolo, y con el método de diferenciación tridimensional descrito en este protocolo, se puede evitar la transición de 2D a 3D y se pueden obtener MNO con un tiempo de diferenciación más corto, menos pasos y riesgos técnicos reducidos sin el paso de disociación. Las neuronas disponibles comercialmente también se pueden utilizar para generar MNS para reducir el tiempo de diferenciación.
Para generar un MNO, cultivamos un MNS en el chip de cultivo de tejidos. Los axones se alargan del esferoide y se extienden hasta el microcanal en el que los axones se reúnen y se alinean unidireccionalmente. Esto facilita la interacción axo-axonal y la formación espontánea de un tejido de haz unidireccional estrechamente montado de axones en el microcanal, que se logra de forma única mediante este protocolo, mientras que la formación espontánea de paquetes o la orientación axonal guiada por sí sola se puede lograr mediante otros protocolos12,13,14. En un experimento típico, pocas células migran de esferoides al microcanal y la mayoría de las células permanecen cerca de los esferoides. Este método permite separar espontáneamente los axones de los esferoides sin utilizar barreras físicas dependientes del tamaño (por ejemplo, microgrooves o filtros de micropobras) para separar los axones de los cuerpos celulares.
El MNO resultante puede ser sometido a varios exámenes, incluyendo análisis morfológicos, bioquímicos y físicos. El cuerpo celular y el paquete de axón extendido se pueden aislar físicamente mediante el corte y se pueden analizar por separado para experimentos posteriores, por ejemplo, ensayos bioquímicos. Los materiales biológicos, incluyendo ARN y proteínas, pueden aislarse de sólo unos pocos haces de axón para ensayos bioquímicos regulares, incluyendo RT-PCR y hinchazón occidental. Aquí, describimos un protocolo para generar organoide nervioso motor a partir de células iPS, que ofrece un modelo fisiológico y patológico atractivo para estudiar el mecanismo subyacente al desarrollo y la enfermedad de los fascículos de axón.
1. Fabricación de moldes SU-8 por fotolitografía
NOTA: Este procedimiento involucra productos químicos peligrosos. Utilice campana de humo y PPE en todas partes.
2. Fabricación de chips de cultivo de tejidos basados en microfluídicos PDMS
3. Preparación de la cultura
4. Mantenimiento de células iPS
NOTA: Las células iPS indiferenciadas se mantienen en mTeSR Plus medianas y subculturadas cuando se observa la confluencia de ≥ el 90% en una placa de 6 pozos en este protocolo. Es posible que se requieran ajustes menores para las celdas iPS cultivadas en otros medios.
5. Diferenciación de las células iPS en las neuronas motoras
NOTA: Todas las opciones siguientes (5,2, 5,3 y 5,4) producen MNO con > 90% de eficiencia.
6. Preparación del chip de cultivo de tejido para la formación de organoides nerviosos motores (MNO)
7. Formación de organoide nervioso motor (MNO)
8. Análisis intermedio de MNO
Las neuronas motoras se diferenciaron en un plazo de 12-14 días en procedimientos de diferenciación 3D(Figura 4 y Figura 5). Es importante destacar que más del 60% de las células expresaron marcador de neurona motorA HB9 durante la diferenciación. La inmunohistoquímica reveló que aproximadamente el 80% de las células en el MNS eran neuronas motoras SMI32 positivas. HB9 y SMI32 son los marcadores de neuronas motoras de etapa temprana establecidos15,16. La expresión de HB9 y SMI32 son los parámetros clave que deben confirmarse para garantizar la identidad celular de las neuronas motoras. Después de la introducción de un MNS en el chip de referencia cultural, los axones se extienden en el canal y se forma un paquete de axones. Debido a los microcanales que sirven como guías físicas, los axones se alargan del MNS y forman un paquete por interacción axo-axonal (Figura 6A). Es esencial confirmar la formación del paquete de axón mediante observación microscópica para confirmar la generación de un MNO. Un MNO exitoso lleva un paquete de axones de más de 50 μm y pocos axones aislados fuera del paquete en el canal. La alargamiento inicial de los axones se puede observar 24 horas después de la introducción del esferoide. En los siguientes 3-4 días, los axones llegaron al centro del microcanal y luego llegan al otro extremo dentro de 10 días adicionales(Figura 6A). En consecuencia, los axones ensamblaron y formaron un paquete recto y unidireccional en 2-3 semanas en un chip, y las actividades neuronales se observaron a partir de entonces.
Los organoides nerviosos motores se pueden recoger del chip desvinculando el PDMS del vidrio del microscopio para su análisis biológico(Figura 6B). Los haces de axón y los cuerpos celulares se pueden diseccionar y aislar cortando con un cuchillo quirúrgico o pinza bajo un microscopio(Figura 6B). Estos materiales biológicos, incluyendo ARN y proteínas, se pueden utilizar para ensayos bioquímicos regulares como RT-PCR y hinchazón occidental. En los paquetes de axones de MNO, las proteínas nucleares o dendriticas no se detectan en la hinchazón occidental (Figura 6C).
En combinación con un indicador de calcio (Fluo-4 AM), la actividad neuronal se puede capturar en el chip de cultivo de tejido. Se observó actividad espontánea de las neuronas motoras en el esferoide y el haz de axón dentro de la MNO. Además, las actividades neuronales se observaron mediante el uso de un sistema de matriz multi-electrodos.

Figura 1: La dimensión del chip de cultivo de tejido PDMS.
(A) Fotomasa del chip de cultivo de tejido. (B) Dimensiones del microcanal en el chip de cultivo de tejido. El diámetro de la cámara base para sostener esferoide de neurona motora es de 2 mm y el agujero de PDMS por encima de la cámara es de 1,5 mm. La anchura y la altura de un microcanal que puentea dos cámaras son de 150 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Ilustración esquemática de la diferenciación de las neuronas motoras.
(A) Los pasos de diferenciación implicaron inducción neuronal, patrón en linaje de neuronas motoras, y maduración de las neuronas motoras. (B) Dos opciones para crear esferoides de neuronas motoras (MNS) a partir de células iPS: protocolo 3D, y un protocolo 2D con paso de disociación de las neuronas motoras. El organoide nervioso motor (MNO) se puede obtener mediante ambos protocolos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Protocolo paso a paso para el recubrimiento de matriz de membrana del sótano y la introducción de esferoides de neuronas motoras.
(A) Recubrimiento de matriz de membrana del sótano en el canal del chip de cultivo de tejido. (B) Introducción MNS en el agujero del chip. (C) Cultura medio cambio por aspiración de medio agotado. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Diferenciación de neuronas motoras 2D y 3D.
(A) Curso de tiempo de diferenciación 3D MNS representativa (protocolo 3D). El tamaño del MNS aumentó gradualmente con el tiempo. Escala: 500 μm. (B) Curso de tiempo de diferenciación 2D en -D2, D0, D1, D6, D12 (protocolo 2D). Escala: 500 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5: Caracterización de las neuronas motoras.
(A) (Izquierda) Una criosección de un MNS manchado con anticuerpos SMI-32 y DAPI. (Medio) Imagen de contraste de fase del MNS recabierto en una superficie recubierta de matriz de membrana del sótano. Se observó alargamiento axonal. (Derecha) Axones de MNS recaídos manchados con anticuerpos Synapsin I y Tuj1. Barra de escala: 500 μm (izquierda y media) y 50μm (derecha). B) Una imagen representativa de las neuronas motoras 2D inmunodeprimido con anticuerpos Tuj y HB9. Escala: 200 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 6: Caracterización de un organoide nervioso motor (MNO) generado en un chip de cultivo.
(A) Imágenes representativas de alargamiento de axón y formación gruesa de paquetes de axón en D32. Escala: 500 μm. (B) Inmunodetención del organoide nervioso motor (MNO) por SMI-32 y DAPI. Los axones y los cuerpos celulares pueden aislarse cortando físicamente. Barra de escala: 1 mm. (C) Pureza de la proteína de axones y cuerpos celulares cuantificados por la hinchazón occidental. MAP2, un marcador dendrítico, no se detectó en la proteína axonal, mientras que el marcador axonal Tau1 se enriquece en la proteína axonal. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
En parte de este protocolo, se ha autorizado una patente a Jiksak Bioengineering, Inc., fundada por Jiro Kawada.
Este protocolo proporciona un procedimiento integral para fabricar organoide nervioso motor derivado de células iPS humanas a través del montaje espontáneo de un robusto conjunto de axones extendidos a partir de un esferoide en un chip de cultivo de tejido.
Este estudio fue apoyado por las Subvenciones en Ayuda para la Investigación Científica de la Sociedad japonesa para la Promoción de la Ciencia (JSPS) 17H05661 y 18K19903, el programa Core-2-core y el Instituto Beyond AI.
| (Tridecafluoro-1,1,2,2-tetrahidrooctilo)-1-triclorosilano | Sigma | 440302 | |
| 16% Solución acuosa de paraformaldehído (formaldehído) | Ciencias de la Microscopía Electrónica | 15710 | |
| 200µ l Puntas de pipeta de diámetro ancho | BMBio | BMT-200WRS | |
| Placas de 6 pocillos | Violamo | 2-8588-01 | |
| Accutase | ICT | AT104 | |
| B-27 Suplemento (50X) | Gibco | 17504044 | |
| Albúmina sérica bovina | Sigma | A6003 | |
| Factor neurotrófico derivado del cerebro (BDNF) | Wako | 020-12913 | |
| Incubadora de CO2 | Panasonic | MCO-18AIC | |
| Cryostor CS10 | Stem Cell Technologies | 07959 | |
| DAPT | Sigma | D5942 | |
| DMEM/F12 | Sigma | D8437 | |
| Fluo-4 AM | Dojindo Laboratories | CS22 | |
| GlutaMAX Suplemento | Gibco | 35050-061 | |
| Factor de crecimiento reducido Matrigel (matriz de membrana basal) | Corning | 354230 | |
| HB9 Anticuerpo | Santa Cruz | sc-22542 | |
| HBSS | Wako | 085-09355 | |
| Hoechst 33342 | Sigma | 14533 | |
| Neurona motora iCell (neuronas motoras derivadas de células iPS humanas disponibles comercialmente) | Cellular Dynamics | R1051 | |
| Alcohol isopropílico (IPA) | Wako | 166-04836 | |
| Knock Out Serum Reemplazo | Gibco | 10828028 | |
| LDN193189 | Sigma | SML0559 | |
| Sonda MEA | Alpha MED Scientific inc | MED-P5004A | |
| MEM Solución de aminoácidos no esenciales (100x) (NEAA) | Sigma | M7145 | |
| Microscopio de vidrio | Matsunami | S9111 | |
| mTeSR Plus | Stem Cell Technologies | 05825 | |
| N2 suplemento | Wako | 141-08941 | |
| Medio neurobasal | Gibco | 21103049 | |
| Penicilina-estreptomicina | Gibco | 15140122 | |
| Photoresist SU-8 2100 | Microchem | #SU-8 2100 | |
| Superficie Prime 96U | Sumitomo Baquelita | MS-9096U | |
| ReLeSR (reactivo de paso) | Stem Cell Technologies | 05872 | |
| Ácido retinoico | Wako | 186-01114 | |
| SAG | Sigma | SML1314 | |
| SB431542 | Wako | 192-16541 | |
| Oblea de silicona | SUMCO | PW-100-100 | |
| Silpot 184 w/c kit | Dow Toray | Silpot 184 c/c kit | |
| Smi32 Anticuerpo | Biolegend | 801701 | |
| SU5402 | Sigma | SML0443 | |
| SU-8 Revelador | Microchem | Y020100 | |
| Sinapsina I Anticuerpo | Millipore | Ab1543 | |
| TrypLE Express líquido sin rojo fenol (solución de disociación) | Gibco | 12604-021 | |
| Tuj1 Anticuerpo | Biolegend | 801202 | |
| Y-27632 | Wako | 030-24021 |