Extensos estudios han caracterizado el desarrollo y la diferenciación de las células B murinas en los órganos linfoides secundarios. Los anticuerpos secretados por las células B han sido aislados y desarrollados en terapias bien establecidas. La validación del desarrollo de células B murinas, en el contexto de ratones propensos a la autoinmunidad, o en ratones con sistemas inmunes modificados, es un componente crucial del desarrollo o prueba de agentes terapéuticos en ratones y es un uso apropiado de la citometría de flujo. Se pueden utilizar parámetros citométricos de flujo de células B bien establecidos para evaluar el desarrollo de células B en el peritoneo murino, la médula ósea y el bazo, pero se deben seguir una serie de mejores prácticas. Además, el análisis citométrico de flujo de los compartimentos de células B también debe complementar las lecturas adicionales del desarrollo de células B. Los datos generados utilizando esta técnica pueden ampliar nuestra comprensión de los modelos de ratón propensos autoinmunes de tipo salvaje, así como de los ratones humanizados que se pueden usar para generar anticuerpos o moléculas similares a anticuerpos como terapéuticos.