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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aquí se presenta un protocolo para la fabricación de un dispositivo de imágenes esferoides. Este dispositivo permite imágenes dinámicas o longitudinales de fluorescencia de esferoides de células cancerosas. El protocolo también ofrece un procedimiento simple de procesamiento de imágenes para el análisis de la invasión de células cancerosas.
La invasión de células cancerosas del tumor primario a los tejidos sanos adyacentes es un paso temprano en la metástasis. Las células cancerosas invasivas plantean un gran desafío clínico porque no existe ningún método eficiente para su eliminación una vez que su diseminación está en marcha. Una mejor comprensión de los mecanismos que regulan la invasión de células cancerosas puede conducir al desarrollo de nuevas terapias potentes. Debido a su parecido fisiológico con los tumores, esferoides incrustados en colágeno he sido ampliamente utilizado por los investigadores para estudiar los mecanismos que rigen la invasión de células cancerosas en la matriz extracelular (ECM). Sin embargo, este ensayo está limitado por 1) la falta de control sobre la incrustación de esferoides en el ECM; (2) alto costo de los platos inferiores de colágeno I y vidrio, (3) etiquetado inmunofluorescente poco fiable, debido a la penetración ineficiente de anticuerpos y colorantes fluorescentes y (4) procesamiento de imágenes que consume mucho tiempo y cuantificación de los datos. Para hacer frente a estos desafíos, optimizamos el protocolo esferoide tridimensional (3D) para crear imágenes de células cancerosas etiquetadas fluorescentemente incrustadas en el colágeno I, ya sea usando videos de lapso de tiempo o imágenes longitudinales, y analizamos la invasión de células cancerosas. En primer lugar, describimos la fabricación de un dispositivo de imágenes esferoides (SID) para incrustar esferoides de forma fiable y en un volumen mínimo de colágeno I, reduciendo el costo del ensayo. A continuación, delineamos los pasos para el etiquetado robusto de fluorescencia de esferoides vivos y fijos. Por último, ofrecemos una macro de Fiji fácil de usar para el procesamiento de imágenes y la cuantificación de datos. En conjunto, esta metodología simple proporciona una plataforma confiable y asequible para monitorear la invasión de células cancerosas en el colágeno I. Además, este protocolo se puede modificar fácilmente para adaptarse a las necesidades de los usuarios.
Durante la progresión del cáncer, las células cancerosas pueden adquirir un fenotipo motil e invasivo, lo que les permite escapar de la masa tumoral e invadir los tejidos circundantes1. Con el tiempo, estas células cancerosas invasivas pueden alcanzar y crecer dentro de órganos secundarios, un proceso llamado metástasis del cáncer1. La metástasis causa más del 90% de las muertes relacionadas con el cáncer2. Una de las razones de esto es que, si bien los tumores localizados son clínicamente manejables, no existen métodos eficientes para la eliminación de las células cancerosas invasivas una vez que se ha producido la propagación metastásica. Por lo tanto, la aparición de células cancerosas invasivas y la transición de una enfermedad localizada a una enfermedad invasiva está planteando un gran desafío clínico. Determinar cómo las células cancerosas inician y sostienen un comportamiento invasivo puede conducir al desarrollo de nuevas terapias potentes.
El modelo esferoide 3D es una plataforma ideal para investigar el comportamiento motil de las células cancerosas bajo control, pero condiciones fisiológicamente relevantes3. De hecho, en este ensayo, los esferoides de las células cancerosas están incrustados dentro de la matriz extracelular (ECM), por ejemplo el colágeno I, que imita un tumor simplificado. A continuación, las imágenes se utilizan para visualizar la invasión de las células cancerosas del esferoide a la matriz del colágeno. Sin embargo, varios desafíos limitan este procedimiento.
El primer desafío se produce en el paso de incrustación, donde la matriz de colágeno líquido puede extenderse a través de la superficie del plato, haciendo que el esferoide toque la parte inferior del plato. En consecuencia, las células del esferoide se propagan en la superficie bidimensional (2D), rompiendo la morfología esferoide tridimensional (3D). Aumentar el volumen de colágeno es una solución eficiente, pero costosa. Para evitar que las células se propaguen en la superficie 2D, manteniendo un volumen mínimo de colágeno, desarrollamos un dispositivo de imágenes esferoides (SID) delimitando un inserto de polidimetilesiloxano (PDMS) de 1 mm de espesor y 3 agujeros en un plato inferior de vidrio.
El segundo desafío del ensayo esferoide es el etiquetado de las células cancerosas en esferoides, que está limitado por la mala penetración de anticuerpos y colorantes fluorescentes, un efecto que aumenta con el tamaño del esferoide. Si bien la solución ideal para etiquetar células es el establecimiento de líneas celulares que expresan permanentemente proteínas fluorescentes, esta opción se limita principalmente a líneas celulares inmortalizadas y está limitada por la disponibilidad de quimeras de proteína fluorescente. Aquí, describimos un protocolo optimizado para la tinción de inmunofluorescencia de esferoides fijos, así como el uso eficiente de un tinte citoplasmático para etiquetar las células inmediatamente antes de incrustar el esferoide.
El tercer desafío del ensayo esferoide es la falta de macros simples de Fiji para la cuantificación semiautomática de la invasión celular con el tiempo. Para abordar este desafío, describimos una metodología sencilla para analizar el área esferoide a lo largo del tiempo. Ilustramos las ventajas de este protocolo utilizando las líneas celulares 4T1 y 67NR como ejemplos.
1. Fabricación de un dispositivo de imágenes esferoides (SID) para optimizar la incrustación esferoide (duración 1 día)
2. Formación de esferoides e incrustación en colágeno (Duración 4 días)
NOTA: Para imágenes en vivo de esferoides, longitudinalmente o en videos de lapso de tiempo, utilice una línea celular que exprese una proteína fluorescente citoplasmática y/o nuclear. Si dicha línea celular está disponible, siga los pasos descritos en esta sección. Alternativamente, en la sección 3, se propone un protocolo para etiquetar las células cancerosas en esferoides usando un tinte citoplasmático.
3. Etiquetado de fluorescencia de esferoides
4. Procesamiento de imágenes para analizar la invasión del cáncer con el tiempo
NOTA: El formato necesario para esta macro es una imagen x,y,t de un solo canal guardada como un archivo .tiff.
Debido a su biocompatibilidad, PDMS es ampliamente utilizado para la microfabricación de pozos de confinamiento, sellos y moldes, que revolucionaron los dispositivos micropatternantes y microfluídicos. En el método descrito aquí, se utiliza para crear SIDs, pozos personalizables que optimizan el procedimiento de incrustación e imágenes esferoides. La Figura 1 ilustra los componentes principales utilizados en la fabricación de los SID. Para fundar el molde PDMS, un espaciador de 1 mm de espesor está impreso en 3D(Figura 1A,B),colocado entre las dos placas de vidrio, selladas con clips grandes. Verter y hornear PDMS en el espacio entre las placas forma una hoja de 1 mm de espesor de PDMS. El esquema SID (Figura 1C) indica las dimensiones del dispositivo óptimo, sin embargo, se produce una ligera variación en las distancias de taladro, debido al punzonado manual de agujeros utilizando punzonados de biopsia (Figura 1D). La Figura 1D,F indica cortes circulares limpios con agujeros espaciados uniformemente dentro de la plaquita PDMS.
El uso de los SID facilita la incrustación eficiente, y por lo tanto el registro de la invasión de células cancerosas dentro del colágeno I utilizando time-lapse (Figura 2, Video 1) o imágenes longitudinales (Figura 3). A pesar de utilizar las mismas frecuencias de inversión para todos los SID durante la polimerización del colágeno I, las posiciones esferoides dentro del tapón de colágeno variarán ligeramente. Por lo tanto, es importante utilizar un objetivo con una larga distancia de trabajo (>1 mm). De lo contrario, enfocar e imágenes puede ser difícil para los esferoides situados cerca de la parte superior del tapón de colágeno. Por el contrario, los esferoides situados cerca de la parte inferior del tapón de colágeno, tendrán células que se mueven a la superficie de vidrio y migran sobre el vidrio, en lugar de invadir en la matriz del colágeno I. Los videos de estos esferoides necesitan ser descartados. El espesor del tapón de colágeno, aquí aproximadamente 800 μm, es controlado por el volumen dispensado en cada agujero del SID y ajustado a las distancias de invasión que los esferoides exhiben en este protocolo. El grosor del tapón de colágeno se puede reducir dispensando un menor volumen de colágeno I en cada agujero del SID, cuando se utilizan esferoides más pequeños o menos invasivos.
Para un análisis adecuado de la invasión utilizando la macro de Fiji, es fundamental que las células cancerosas se etiquete correctamente en el transcurso de la sesión de imágenes. Como se indica en el paso 4.17., el paso de procesamiento de imágenes permite la corrección de imagen si el etiquetado es sub-óptimo. Si bien ilustramos las imágenes longitudinales en el transcurso de 6 días(Figura 3),que requiere la expresión estable de proteína fluorescente citoplasmática y/o nuclear, se podrían realizar imágenes longitudinales similares durante un tiempo más corto utilizando el etiquetado con colorantes.
Después de la toma de imágenes en vivo, presentamos algunos resultados del procedimiento de inmunoetiquetado para la cadherina epitelial (E-cadherin), cortactina y F-actin (Figura 4). En estos ejemplos, usamos las líneas de celda 4T1 y 67NR. La Figura 5 muestra la ilustración paso a paso del procedimiento de procesamiento de imágenes utilizando la macro de Fiji para medir el área del esferoide a lo largo del tiempo.

Figura 1: Fabricación de los SID. (A) Representación esquemática de vista superior del espaciador. (B) espaciador impreso en 3D. (C) Representación esquemática de vista superior del SID. Una plaquita PDMS de 3 orificios (D) se enlaza a una placa inferior de vidrio (E), creando el SID final (F). Las dimensiones son en milímetros. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Imágenes en vivo de esferoides. Representante 20 h y 40 h puntos de tiempo de Video 1, proyección máxima de un esferoide 4T1. Las células 4T1 fueron etiquetadas con un tinte citoplasmático. Barra de escala, 100 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Imágenes longitudinales de esferoides. Micrografos representativos (proyección máxima) de un esferoide mixto 4T1/67NR con imágenes diarias. Las células 4T1 y 67NR expresan de forma estable el mScarlet citoplasmático y la proteína fluorescente verde (GFP), respectivamente. Barra de escala, 100 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Imagen de inmunofluorescencia de esferoides. Se etiquetaron micrografos representativos (proyección máxima) de un esferoide 4T1 fijado 2 días después de incrustar en colágeno I. E-cadherin (cian, A), cortactina (amarillo, B) y F-actin (magenta, A y B). Barra de escala, 100 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5: Análisis de procesamiento de imágenes. Ilustración paso a paso del procedimiento de procesamiento de imágenes utilizando la macro de Fiji (A) para medir el área del esferoide a lo largo del tiempo (B). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Vídeo 1: El vídeo representativo de un esferoide 4T1 que se muestra cada 10 minutos durante 46 h y 10 min. 4T1 células fueron etiquetados con un tinte citoplasmático. Escala bar, 100 μm. Por favor, haga clic aquí para descargar este video.
Archivo suplementario 1: Modelo 3D del espaciador (archivo STL). Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo suplementario 2: Macro SpheroidAreaTime. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Los autores no tienen nada que revelar.
Aquí se presenta un protocolo para la fabricación de un dispositivo de imágenes esferoides. Este dispositivo permite imágenes dinámicas o longitudinales de fluorescencia de esferoides de células cancerosas. El protocolo también ofrece un procedimiento simple de procesamiento de imágenes para el análisis de la invasión de células cancerosas.
Nos gustaría dar las gracias a los miembros de La Bioingeniería del Templo por sus valiosos debates. Agradecemos a David Ambrose en el núcleo de citometría de flujo (Lewis Katz School of Medicine) por su asistencia con la clasificación celular y a Tony Boehm del CENTRO IDEAS (College of Engineering, Temple University) por su ayuda con la impresión 3D. También agradecemos nuestros recursos de financiación: American Cancer Society Research Scholar Grant 134415-RSG-20-034-01-CSM, Conquer Cancer Now / Young Investigator Award, National Institutes of Health, R00 CA172360 y R01 CA230777, todo a BG.
| 1 N NaOH | Honeywell Fluka | 60-014-44 | |
| 10X Dulbecco' solución salina tamponada con fosfato (PBS) | Gibco | SH30028.LS | |
| 16% paraformaldehído (PFA) | Alfa Aesar | 43368-9M | |
| 1X Dulbecco' Solución salina tamponada con fosfato (PBS) | Gibco | 20012027 | |
| 4',6-diamidino-2-fenilindol (DAPI) | Invitrogen | D1306 | |
| placa de 48 pocillos | Falcon | T1048 | |
| Alexa Fluor 647 faloidina | Life Technologies | A20006 | |
| Anti cortactina | anticuerpo Abcam | ab33333 1 | a 200 dilución |
| Anti Anticuerpo E-cadherina | Invitrogen | 13-1900 | Dilución de 1 a 100 |
| Solución de atelocolágeno I bovino (Nutragen) | Advanced Biomatrix | 501050ML | |
| Albúmina sérica bovina (BSA) | Sigma Aldrich | A4503-50G | |
| CellTracker Rojo CMTPX Colorante | Invitrogen | C34552 | |
| Tubos cónicos | Falcon | 352095 | |
| Cubreobjetos | FisherBrand | 12-548-5E | |
| Contenedor desechable | Grapas | Vasos de plástico | |
| Pipeta de transferencia desechable | Thermo Scientific | 202 | |
| DMEM | Fisher Scientific | 11965118 | |
| Cinta de doble cara | Scotch | ||
| Ethanol | Sigma Aldrich | E7023-500ML | |
| Suero fetal bovino (FBS) | Bio-Techne | S11550 | |
| Fluoromount-G | eBioscience | 00-4958-02 | |
| Glutaraldehído | Sigma Aldrich | G5882-100mL | |
| Hoescht tinción nuclear | Thermo Fischer | 62249 | |
| Isopropanol | Thermo Fischer | S25371A | |
| Plato MatTek (plato con fondo de vidrio) | MatTek Corporation | P35G-1.5-14-C | |
| Metilcelulosa | Sigma Aldrich | M6385-100G | |
| MilliQ agua | |||
| Solución de penicilina/estreptomicina | Thermo Fischer | 15140122 | |
| Placa de Petri | Corning | 353003 | |
| Puntas de pipeta | Fisherbrand | 02-707 | |
| Pipetas | Gilson | F167300 | |
| Poly-L-Lisina | Sigma | P8920 | |
| Anticuerpos primarios, específicos | del usuario | ||
| Rat Tail Collagen I | Corning | 47747-218 | |
| Razor Blade | Personna | 74-0001 | |
| Anticuerpos secundarios, específicos | |||
| del usuario Diapositivas Globe | Scientific | 1354W-72 | |
| Sylgard 184 Silicona | Dow Corning | 4019862 | |
| Cinta Scotch | |||
| Triton X100 | Sigma Aldrich | 10789704001 | |
| Tween 20 | Sigma Aldrich | 655204-100ML |