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Research Article
Moustafa Elkalaf1,2, Karolína Vaněčková1,2, Pavla Staňková1, Zuzana Červinková1, Jan Polák*2,3, Otto Kučera*1
1Department of Physiology, Faculty of Medicine in Hradec Králové,Charles University, 2Department of Pathophysiology, Third Faculty of Medicine,Charles University, 3Department of Internal Medicine,University Hospital Kralovske Vinohrady
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
En este trabajo, describimos un protocolo modificado para probar el flujo del sustrato respiratorio mitocondrial utilizando perfringolisina O recombinante en combinación con respirometría basada en microplacas. Con este protocolo, mostramos cómo la metformina afecta la respiración mitocondrial de dos líneas celulares tumorales diferentes.
El flujo de sustrato mitocondrial es una característica distintiva de cada tipo de célula, y los cambios en sus componentes, como transportadores, canales o enzimas, están involucrados en la patogénesis de varias enfermedades. El flujo de sustrato mitocondrial se puede estudiar utilizando células intactas, células permeabilizadas o mitocondrias aisladas. La investigación de células intactas encuentra varios problemas debido a la oxidación simultánea de diferentes sustratos. Además, varios tipos de células contienen almacenes internos de diferentes sustratos que complican la interpretación de los resultados. Métodos como el aislamiento mitocondrial o el uso de agentes permeabilizantes no son fácilmente reproducibles. Aislar mitocondrias puras con membranas intactas en cantidades suficientes a partir de muestras pequeñas es problemático. El uso de permeabilizadores no selectivos causa varios grados de daño inevitable de la membrana mitocondrial. La perfringolisina O recombinante (rPFO) se ofreció como un permeabilizante más apropiado, gracias a su capacidad para permeabilizar selectivamente la membrana plasmática sin afectar la integridad mitocondrial. Cuando se usa en combinación con la respirometría de microplacas, permite probar el flujo de varios sustratos mitocondriales con suficientes réplicas dentro de un experimento mientras se usa un número mínimo de células. En este trabajo, el protocolo describe un método para comparar el flujo de sustrato mitocondrial de dos fenotipos o genotipos celulares diferentes y se puede personalizar para probar varios sustratos o inhibidores mitocondriales.
La respirometría basada en microplacas ha revolucionado la investigación mitocondrial al permitir el estudio de la respiración celular de un tamaño de muestra pequeño1. La respiración celular generalmente se considera como un indicador de la función mitocondrial o "disfunción", a pesar del hecho de que el rango mitocondrial de funciones se extiende más allá de la producción de energía2. En condiciones aeróbicas, las mitocondrias extraen la energía almacenada en diferentes sustratos descomponiendo y convirtiendo estos sustratos en intermedios metabólicos que pueden alimentar el ciclo del ácido cítrico3 (Figura 1). El flujo continuo de sustratos es esencial para que el flujo del ciclo del ácido cítrico genere 'donantes de electrones' de alta energía, que entregan electrones a la cadena de transporte de electrones que genera un gradiente de protones a través de la membrana mitocondrial interna, lo que permite que la ATP-sintasa fosforila ADP a ATP4. Por lo tanto, un diseño experimental para evaluar la respiración mitocondrial debe incluir la naturaleza de la muestra (células intactas, células permeabilizadas o mitocondrias aisladas) y sustratos mitocondriales.
Las células mantienen un almacén de sustratos autóctonos5,y las mitocondrias oxidan varios tipos de sustratos simultáneamente6,lo que complica la interpretación de los resultados obtenidos de los experimentos realizados sobre células intactas. Un enfoque común para investigar la capacidad mitocondrial para oxidar un sustrato seleccionado es aislar las mitocondrias o permeabilizar las células investigadas5. Aunque las mitocondrias aisladas son ideales para estudios cuantitativos, el proceso de aislamiento es laborioso. Se enfrenta a dificultades técnicas como la necesidad de un gran tamaño de muestra, la pureza del rendimiento y la reproducibilidad de la técnica5. Las células permeabilizadas ofrecen una solución para las desventajas del aislamiento mitocondrial; sin embargo, los agentes permeabilizantes rutinarios de naturaleza detergente no son específicos y pueden dañar las membranas mitocondriales5.
La perfringolisina O recombinante (rPFO) se ofreció como agente permeabilizante selectivo de la membrana plasmática7,y se utilizó con éxito en combinación con un analizador de flujo extracelular en varios estudios7,8,9,10. Hemos modificado un protocolo utilizando rPFO para detectar el flujo de sustrato mitocondrial utilizando el analizador de flujo extracelular XFe96. En este protocolo, se comparan cuatro vías oxidantes de sustrato diferentes en dos fenotipos celulares mientras se tienen suficientes réplicas y el control adecuado para cada material probado.
1. Un día antes del ensayo
2. El día del ensayo
Comience por normalizar los resultados a la segunda medición de la respiración basal para mostrar los valores como porcentaje de tasa de consumo de oxígeno (OCR%). Los resultados del ensayo se muestran en las Figuras 5,Figura 6, Figura 7 y Figura 8. Es importante asignar los pozos de fondo adecuados para cada grupo e inactivar los pozos de fondo de otros grupos. La Figura 5 muestra que el grupo tratado tiene una mayor tasa de respiración inducida por succinato. La respuesta de las células A549 al tratamiento con metformina(Figura 5A)fue mayor que la de las células HepG2(Figura 5B). Los pozos de control de fondo fueron solo los de las mismas filas del grupo comparado, en este caso, los pozos A1, B1, A12 y B12. La Figura 6 muestra los cambios en la respiración inducida por piruvato/malato. La Figura 7 muestra los cambios en la respiración inducida por glutamato/malato, y la Figura 8 muestra los cambios en la respiración inducida por palmitoil carnitina/malato.

Figura 1: Una representación esquemática del ciclo del ácido cítrico. Los sustratos utilizados para probar el flujo de sustrato mitocondrial están en rojo. El malato no se usa solo, sino que se usa en combinación con piruvato, palmitoil carnitina y glutamato. El papel del malato en la respiración inducida por piruvato/malato y palmitoil carnitina/malato es proporcionar oxaloacetato a través de la acción de la enzima malato deshidrogenasa. En la respiración inducida por glutamato/malato, el malato participa en el transbordador malato-aspartato. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Ilustración del plan de siembra celular en la microplaca de cultivo celular. Los pozos en blanco de las columnas 1 y 12 deben dejarse vacíos sin celdas. Las columnas 7-11 se utilizan para tratar el grupo experimental. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Ilustración de la estrategia de inyección. El puerto A de las filas A y B se carga con una mezcla de succinato/rotenona. El puerto A de las filas C y D se carga con mezcla de piruvato/malato. El puerto A de las filas E y F se carga con una mezcla de glutamato/malato. El puerto A de las filas G y H se carga con la mezcla de palmitoil carnitina/malato. Para toda la placa, los puertos B, C y D están cargados con oligomicina, FCCP y rotenona/antimicina A, respectivamente. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Nombres de grupos y mapa de placas. Cada grupo se nombra de acuerdo con el fenotipo (control o tratado) y el sustrato utilizado para inducir la respiración. (S), respiración inducida por succinato. (P/M), respiración inducida por piruvato/malato. (G/M), respiración inducida por glutamato/malato. (CP/M), respiración inducida por palmitoil carnitina/malato. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5: Respiración inducida por succinato. (A) A549 y (B) HepG2. El grupo analizado fue tratado con 1 mM de clorhidrato de metformina durante 16 horas. Solo se utilizan los pozos de fondo A1, B1, A12 y B12 para la corrección. Los resultados se muestran como OCR promedio% ± SD. El gráfico y la cuadrícula de placas se crearon y exportaron como archivos de imagen mediante el software de diseño de ensayos, análisis de datos y administración de archivos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 6: Respiración inducida por piruvato/malato. (A) A549 y (B) HepG2. El grupo analizado fue tratado con 1 mM de clorhidrato de metformina durante 16 horas. Solo se utilizan los pozos de fondo C1, D1, C12 y D12 para la corrección. Los resultados se muestran como OCR promedio% ± SD. El gráfico y la cuadrícula de placas se crearon y exportaron como archivos de imagen mediante el software de diseño de ensayos, análisis de datos y administración de archivos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 7: Respiración inducida por glutamato/malato. (A) A549 y (B) HepG2. El grupo analizado fue tratado con 1 mM de clorhidrato de metformina durante 16 horas. Solo los pozos de fondo E1, F1, E12 y F12 se utilizan para la corrección. Los resultados se muestran como OCR promedio% ± SD. El gráfico y la cuadrícula de placas se crearon y exportaron como archivos de imagen mediante el software de diseño de ensayos, análisis de datos y administración de archivos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 8: Respiración inducida por palmitoil carnitina/malato. (A) A549 y (B) HepG2. El grupo analizado fue tratado con 1 mM de clorhidrato de metformina durante 16 horas. Solo los pozos de fondo G1, H1, G12 y H12 se utilizan para la corrección. Los resultados se muestran como OCR promedio% ± SD. El gráfico y la cuadrícula de placas se crearon y exportaron como archivos de imagen mediante el software de diseño de ensayos, análisis de datos y administración de archivos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Medio de ensayo mitocondrial | ||||
| Stock (mM) | Volumen de stock por litro (ml) | 2x MAS (mM) | MAS (mM) | |
| Sacarosa | 1000 | 140 | 140 | 70 |
| Manitol | 1000 | 440 | 440 | 220 |
| KH2PO4 | 1000 | 20 | 20 | 10 |
| MgCl2 | 200 | 50 | 10 | 5 |
| HEPES | 200 | 20 | 4 | 2 |
| EGTA | 200 | 10 | 2 | 1 |
| ADP | 200 | 20 | 4 | 2 |
Tabla 1: Solución de ensayo mitocondrial. Mezclar el volumen indicado de cada solución madre de ingredientes para preparar (2x MAS). Caliente la solución a 37 °C, luego ajuste el pH con 5 N KOH a 7.4. Agregue agua destilada para llevar el volumen hasta 1 L. Filtre-esterilice y luego almacene las alícuotas a -20 ° C. Preparar el medio de ensayo y las soluciones de trabajo de sustratos e inhibidores mitocondriales utilizando 2x MAS.
| Mandar | Duración | Compuesto inyectado |
| Calibración | por defecto | |
| Equilibrado | Sí | |
| Referencia | ||
| 2 Ciclos | ||
| Mezclar | 30 s | |
| Esperar | 30 s | |
| Medir | 2 min | |
| Inyectar puerto A | Sustratos | |
| 2 Ciclos | ||
| Mezclar | 30 s | |
| Esperar | 30 s | |
| Medir | 2 min | |
| Puerto de inyección B | Oligomicina | |
| 2 Ciclos | ||
| Mezclar | 30 s | |
| Esperar | 30 s | |
| Medir | 2 min | |
| Puerto de inyección C | FCCP | |
| 2 Ciclos | ||
| Mezclar | 30 s | |
| Esperar | 30 s | |
| Medir | 2 min | |
| Puerto de inyección D | Rotenona + Antimicina A | |
| 2 Ciclos | ||
| Mezclar | 30 s | |
| Esperar | 30 s | |
| Medir | 2 min |
Tabla 2: Comandos del protocolo de ensayo.
| Volumen en 5 mL | ||||||
| Sustratos | Stock conc. | Funcionamiento conc. | Acción | 2x MAS | dH2O | Final conc. |
| Succinato/rotenona | 1 M/20 mM | 100 mM/10 μM | 500 μL/ 2,5 μL | 2,5 ml | 1997,5 μL | 10 mM/1 μM |
| Piruvato/malato | 1 M/100 mM | 100 mM /10 mM | 500 μL/500 μL | 2,5 ml | 1500 μL | 10 mM /1 mM |
| Glutamato/malato | 1 M/100 mM | 100 mM /10 mM | 500 μL/500 μL | 2,5 ml | 1500 μL | 10 mM /1 mM |
| Palmitoil carnitina/malato | 10 mM/100 mM | 400 μM /10 mM | 200 μL/500 μL | 2,5 ml | 1800 μL | 40 μM /1 mM |
| Inhibidores | ||||||
| Oligomicina | 25 mM | 15 μM | 3 μL | 2,5 ml | 2497 μL | 1,5 μM |
| FCCP | 50 metros | 40 μM | 4 μL | 2,5 ml | 2496 μL | 4 μM |
| Rotenona/antimicina A | 20 mM/20 mM | 10 μM/ 10 μM | 2,5 μL/2,5 μL | 2,5 ml | 2495 μL | 1 μM/ 1 μM |
Tabla 3: Lista de sustratos e inhibidores mitocondriales que se cargarán en los puertos de inyección de los cartuchos sensores como se discutió anteriormente en la Figura 3. Mezcle los volúmenes indicados de soluciones madre, 2x MAS y agua destilada para preparar los 5 ml de la concentración de trabajo de cada sustrato o mezcla inhibidora. La concentración final se logra en los pozos después del proceso de inyección.
Los autores no tienen ningún conflicto de intereses que declarar.
En este trabajo, describimos un protocolo modificado para probar el flujo del sustrato respiratorio mitocondrial utilizando perfringolisina O recombinante en combinación con respirometría basada en microplacas. Con este protocolo, mostramos cómo la metformina afecta la respiración mitocondrial de dos líneas celulares tumorales diferentes.
Los autores agradecen a los miembros del personal del Departamento de Fisiología de la Facultad de Medicina de Hradec Králové y del Departamento de Fisiopatología de la Tercera Facultad de Medicina por la ayuda con los productos químicos y la preparación de muestras. Este trabajo fue apoyado por los programas de subvenciones de la Universidad Charles PROGRES Q40/02, la subvención NU21-01-00259 del Ministerio de Salud de la República Checa, la subvención de la fundación científica checa 18-10144 y el proyecto INOMED CZ.02.1.01/0.0/0.0/18_069/0010046 financiado por el Ministerio de Educación, Juventud y Deportes de la República Checa y por la Unión Europea.
| Adenosina 5′ -difosfato sal monopotásica dihidratado | Merck | A5285 | almacenar a -20 ° C |
| Antimicina A | Merck | A8674 | tienda a -20 ° C |
| Albúmina sérica bovina | Merck | A3803 | tienda en 2 - 8 ° C |
| Cianuro de carbonilo 4-(trifluorometoxi)fenilhidrazona | Merck | C2920 | almacenado a -20 & grados; C |
| Dimetilsulfóxido Merck | D8418 | tienda en RT | |
| D-Manitol | Tienda Merck | 63559 | en RT |
| Solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco | Gibco | 14190-144 | en RT |
| Etilenglicol-bis(2-aminoetiloéter)-N,N,N′,N′-ácido tetraacético | Merck | 03777 | en RT |
| HEPES | Merck | H7523 | tienda en RT |
| L(-)Sal disódica de ácido málico | Merck | M9138 | tienda en RT |
| Ácido L-glutámico sodio sal hidratado | Merck | G5889 | tienda en RT |
| Cloruro de magnesio hexahidratado | Merck | M2670 | tienda en RT |
| Oligomicina | Merck | O4876 | tienda en -20 & deg; C |
| Cloruro de palmitoil-DL-carnitina | Merck | P4509 | tienda a -20 ° C |
| Hidróxido de potasio Tienda Merck | 484016 | en RT | |
| Fosfato de potasio monobásico | Merck | P5655 | tienda en RT |
| Rotenona | Tienda Merck | R8875 | en -20 ° C |
| Seahorse Wave Software de escritorio Tecnologías | Agilent Descargar | desde www.agilent.com | |
| Analizador Seahorse XFe96 Tecnologías | Agilent | ||
| Seahorse XFe96 FluxPak | Tecnologías Agilent | 102416-100 | Cartuchos de sensor XFe96 y microplacas de cultivo celular XF96 |
| Piruvato de sodio | Merck | P2256 | tienda en 2 - 8 & deg; C |
| Succinato de sodio dibásico hexahidratado | Merck | S2378 | tienda en RT |
| Sacarosa | TiendaMerck | S7903 | en RT |
| Water | Tienda Merck | W3500 | en RT |
| XF calibrador | Agilent technologies | 100840-000 | tienda en RT |
| XF Perpermeabilizante de membrana plasmática | Agilent technologies | 102504-100 | Perfringolisina O recombinante (rPFO) - Alícuota y almacenar a -20 ° C |