Los melanocitos son células especializadas derivadas de la cresta neural presentes en la piel epidérmica. Estas células sintetizan pigmento de melanina que protege el genoma de las radiaciones ultravioletas dañinas. Las perturbaciones en el funcionamiento de los melanocitos conducen a trastornos pigmentarios como piebaldismo, albinismo, vitiligo, melasma y melanoma. El pez cebra es un excelente sistema modelo para comprender las funciones de los melanocitos. La presencia de melanocitos pigmentados conspicuos, la facilidad de manipulación genética y la disponibilidad de líneas fluorescentes transgénicas facilitan el estudio de la pigmentación. Este estudio emplea el uso de líneas de pez cebra transgénicas y de tipo salvaje que impulsan la expresión de proteínas fluorescentes verdes (GFP) bajo promotores mitfa y tyrp1 que marcan varias etapas de los melanocitos.
El silenciamiento basado en morfolino de genes candidatos se logra para evaluar el resultado fenotípico en la pigmentación larvaria y es aplicable a la detección de reguladores de pigmentación. Este protocolo demuestra el método desde la microinyección hasta la disección de fenotipos basada en imágenes y clasificación celular activada por fluorescencia (FACS) utilizando dos genes candidatos, anhidrasa carbónica 14 (Ca14) y una variante de histona (H2afv), para evaluar exhaustivamente el resultado de la pigmentación. Además, este protocolo demuestra la segregación de genes candidatos en especificadores y diferenciadores de melanocitos que alteran selectivamente el número de melanocitos y el contenido de melanina por célula, respectivamente.