Bajo estado estacionario, las células madre hematopoyéticas (HSC) permanecen en gran medida inactivas y se cree que dependen predominantemente de la glucólisis para satisfacer sus necesidades energéticas. Sin embargo, en condiciones de estrés como la infección o la pérdida de sangre, las HSC se vuelven proliferativas y producen rápidamente células progenitoras aguas abajo, que a su vez se diferencian aún más, produciendo en última instancia células sanguíneas maduras. Durante este proceso de transición y diferenciación, las HSC salen de la inactividad y se someten rápidamente a un cambio metabólico de la glucólisis a la fosforilación oxidativa (OxPHOS). Varias condiciones de estrés, como el envejecimiento, el cáncer, la diabetes y la obesidad, pueden afectar negativamente la función mitocondrial y, por lo tanto, pueden alterar la reprogramación metabólica y la diferenciación de las HSC y los progenitores durante la hematopoyesis. Se pueden obtener información valiosa sobre las funciones glucolíticas y mitocondriales de las HSC y los progenitores en condiciones normales y de estrés a través de la evaluación de su tasa de acidificación extracelular (ECAR) y la tasa de consumo de oxígeno (OCR), que son indicadores de la glucólisis celular y la respiración mitocondrial, respectivamente.
Aquí, se proporciona un protocolo detallado para medir ECAR y OCR en poblaciones de células negativas de linaje derivadas de la médula ósea de ratón, que incluyen células madre hematopoyéticas y células progenitoras primitivas (HSPC), utilizando el analizador de flujo extracelular. Este protocolo describe enfoques para aislar células de linaje negativo de la médula ósea de ratón, explica la optimización de la densidad de siembra celular y las concentraciones de 2-desoxi-D-glucosa (2-DG, un análogo de glucosa que inhibe la glucólisis) y varios medicamentos dirigidos a OxPHOS (oligomicina, FCCP, rotenona y antimicina A) utilizados en estos ensayos, y describe las estrategias de tratamiento farmacológico. Los parámetros clave del flujo glicolítico, como la glucólisis, la capacidad glucolítica y la reserva glucolítica, y los parámetros de OxPHOS, como la respiración basal, la respiración máxima, la fuga de protones, la producción de ATP, la capacidad respiratoria excedente y la eficiencia de acoplamiento, se pueden medir en estos ensayos. Este protocolo permite mediciones de ECAR y OCR en HSPC no adherentes y se puede generalizar para optimizar las condiciones de análisis para cualquier tipo de células de suspensión.