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Research Article
Yuu Ohno1, Riley Murphy2, Matthew Choi3, Weijun Ou4, Rachita K. Sumbria4,5
1Henry E. Riggs School of Applied Life Sciences,Keck Graduate Institute, 2Crean College of Health and Behavioral Sciences,Chapman University, 3Keck Science Department,Claremont McKenna College, 4Department of Biomedical and Pharmaceutical Sciences, School of Pharmacy,Chapman University, 5Department of Neurology,University of California, Irvine
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
El presente protocolo describe y compara el procedimiento para realizar un análisis de región o subregión de interés completa de secciones cerebrales de ratón sagitales para cuantificar la carga beta amiloide en el modelo de ratón transgénico APP / PS1 de la enfermedad de Alzheimer.
La acumulación extracelular de placas de beta-amiloide (Aβ) es una de las principales características patológicas de la enfermedad de Alzheimer (EA), y es el objetivo del único tratamiento modificador de la enfermedad aprobado por la FDA para la EA. En consecuencia, el uso de modelos de ratones transgénicos que sobreexpresan la proteína precursora de amiloide y, por lo tanto, acumulan placas cerebrales de Aβ se utilizan ampliamente para modelar la EA humana en ratones. Por lo tanto, los inmunoensayos, incluido el ensayo de inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA) y la inmunotinción, comúnmente miden la carga de Aβ en los tejidos cerebrales derivados de ratones transgénicos con EA. Aunque los métodos para la detección y cuantificación de Aβ han sido bien establecidos y documentados, no se ha informado del impacto del tamaño de la región de interés seleccionada en el tejido cerebral en las mediciones de carga de Aβ después de la inmunotinción. Por lo tanto, el protocolo actual tenía como objetivo comparar las mediciones de carga Aβ en todas las regiones y subregiones de interés utilizando un software de análisis de imágenes. Los pasos involucrados en la preparación del tejido cerebral, la inmunotinción de la sección cerebral de flotación libre, las imágenes y la cuantificación de la carga de Aβ en subregiones de interés completas versus subregiones de interés se describen utilizando secciones cerebrales derivadas de ratones machos transgénicos dobles APP / PS1 de 13 meses de edad. El protocolo actual y los resultados proporcionan información valiosa sobre el impacto del tamaño de la región de interés en la cuantificación del área Aβ-positiva, y muestran una fuerte correlación entre el área Aβ-positiva obtenida utilizando los análisis completos y subregiones de interés para secciones cerebrales derivadas de ratones MACHO APP / PS1 de 13 meses de edad que muestran una deposición generalizada de Aβ.
La enfermedad de Alzheimer (EA), la sexta causa principal de muerte en los Estados Unidos, sigue siendo una amenaza para la salud pública, con un estimado de 6.2 millones de estadounidenses que viven con EA. Se espera que esto alcance los 13,8 millones para 20601. Hasta la fecha, el manejo sintomático a través de medicamentos como los inhibidores de la colinesterasa y la memantina es el curso primario del tratamiento2. La EA se caracteriza por manifestaciones neuropatológicas como la deposición extracelular de placas de beta-amiloide (Aβ) y la acumulación intracelular de tau hiperfosforilada en forma de ovillos neurofibrilares 3,4. Formado por una escisión endoproteolítica de la proteína precursora de amiloide (APP) a través de beta- y gamma-secretasa, Aβ se agrega para formar oligómeros y fibrillas, lo que lleva a efectos neurotóxicos5. Se ha planteado la hipótesis de que Aβ cumple un papel patológico primario desde la década de 1980, y es el objetivo terapéutico de la única terapia modificadora de la enfermedad aprobada por la FDA para la EA6. Como resultado, los modelos de ratones transgénicos con EA que albergan mutaciones en genes que resultan en una acumulación cerebral robusta de Aβ se han utilizado ampliamente para la investigación preclínica de la EA desde principios de la década de 19907.
La detección de especies de Aβ en estos cerebros de ratones transgénicos con EA generalmente se realiza mediante dos inmunoensayos: ensayo de inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA) e inmunotinción. El primer ensayo permite la determinación cuantitativa de diferentes especies de Aβ y consume menos tiempo en comparación con la inmunotinción, que requiere varios pasos secuenciales de procesamiento de tejidos e imágenes, que incluyen seccionamiento de tejidos, inmunotinción, imágenes y cuantificación8. Además, los resultados obtenidos tras la inmunotinción sonsemicuantitativos 8. Sin embargo, la capacidad de localizar espacialmente Aβ hace que la inmunotinción sea un enfoque atractivo para la detección de Aβ en tejidos cerebrales8.
Durante el uso de la inmunotinción Aβ, diferentes grupos de investigación han empleado varios paradigmas de cuantificación diferentes. Por ejemplo, algunos grupos de investigación cuantifican la carga de Aβ en toda la región de interés (corteza o hipocampo), mientras que otros cuantifican la carga de Aβ en una subregión de interés específica (una parte de la corteza o el hipocampo)9,10,11. Aunque los métodos para la detección y cuantificación de Aβ han sido bien establecidos y documentados, no se ha informado del impacto del tamaño de la región de interés en las mediciones de carga de Aβ después de la inmunotinción. Por lo tanto, el protocolo actual tenía como objetivo comparar las mediciones de carga de Aβ en todas las regiones y subregiones de interés utilizando un software de análisis de imágenes, ImageJ.
El estudio actual utilizó ratones machos transgénicos dobles APP / PS1 de 13 meses de edad, que expresan un APP quimérico de ratón / humano y una presenilina mutante 1, para modelar el inicio temprano de AD12. Los depósitos de Aβ comienzan a desarrollarse a los 6-7 meses de edad, y se observa una abundante acumulación de Aβ tanto en la corteza como en el hipocampo de estos ratones a los 9-10 meses de edad12. Los péptidos amiloides transgénicos y la holoproteína pueden ser detectados por 6E10-inmunotinción13, lo que lo convierte en un modelo animal deseable para el presente protocolo. El procedimiento cubierto en este documento incluye la preparación del tejido cerebral, la inmunotinción de secciones que flotan libremente, la obtención de imágenes y la cuantificación de la carga de Aβ en subregiones completas versus subregiones de interés. El análisis muestra una fuerte correlación entre la cuantificación completa y subregional, lo que indica un acuerdo sólido entre estos dos métodos en las secciones de tejido cerebral derivadas de ratones machos APP / PS1 de 13 meses de edad que muestran abundantes depósitos de Aβ.
Todos los experimentos con animales se llevaron a cabo de conformidad con los Recursos Animales de Laboratorio de la Universidad bajo protocolos aprobados por el Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales de la Universidad de California, Irvine. Los experimentos se realizaron con ratones machos B6C3-Tg(APPswe, PSEN1dE9)85Dbo/Mmjax (APP/PS1) (13 meses de edad, n = 35). Los ratones se obtuvieron de fuentes comerciales (ver Tabla de Materiales).
1. Preparación del tejido cerebral
2. Inmunofluorescencia
3. Imágenes
4. Análisis de la región completa de interés
NOTA: Las dos regiones de interés del presente trabajo son el hipocampo y la isocorteza. El análisis de la región completa de interés representa el análisis de toda la isocorteza (conocida como la corteza en el futuro) o el hipocampo en la sección de tejido cerebral fotografiada.
5. Análisis de la subregión de interés
NOTA: El análisis de subregión de interés representa el análisis de una parte de la corteza o el hipocampo en la sección de tejido cerebral fotografiada.
Aquí, se comparan dos métodos diferentes para cuantificar el área 6E10 positiva en el hipocampo y la corteza de los tejidos cerebrales del ratón. Los dos métodos son los análisis de región completa y subregión de interés (Figura 1). El análisis de la región completa de interés, como su nombre indica, implica delinear toda la región de interés (en este caso, ya sea la isocorteza o el hipocampo) para determinar el área 6E10 positiva (Figura 1A, B). El análisis de la subregión de interés implica seleccionar una región predefinida dentro de la región de interés para determinar el área 6E10 positiva (Figura 1C, D). El protocolo StepWise ImageJ para los dos métodos se muestra en la Figura 2, figura 3 y Figura 4.
Este estudio utilizó tres lectores; dos lectores independientes realizaron el análisis de la subregión de interés, y el tercer lector realizó el análisis de la región completa de interés. Como se ve en la Figura 5A,B, hubo una fuerte correlación positiva significativa (p < 0,0001) entre el área 6E10 positiva reportada por los dos lectores que realizaron el análisis de la subregión de interés (coeficiente de correlación de Pearson r = 0,97 para la corteza y r = 0,96 para el hipocampo). Se promediaron las áreas 6E10 positivas reportadas por los dos lectores para el análisis de la subregión de interés, y el área promedio de la subregión de interés 6E10 positiva compartió una fuerte correlación positiva significativa (p < 0.0001) con el área 6E10 positiva obtenida utilizando el análisis de la región completa de interés para ambas cortezas (coeficiente de correlación de Pearson r = 0.96; Figura 5C) y el hipocampo (coeficiente de correlación de Pearson r = 0,95; Figura 5D). La media del área cortical e hipocampal-6E10 positiva obtenida por los análisis de región completa y subregión de interés fue comparable sin diferencias significativas, confirmando la concordancia entre los dos métodos (Figura 5E). Además, el Aβ1-42 insoluble se midió en homogeneizados de todo el cerebro en un subconjunto de ratones y el área cortical (Figura 5F) e hipocampal (Figura 5G) 6E10 positiva determinada por el análisis de la región completa de interés se correlacionó significativamente (p < 0,01) con la carga insoluble de Aβ1-42 utilizando ELISA (ver Tabla de Materiales).

Figura 1: Selección completa versus subregiones de interés. Imágenes representativas que muestran la isocorteza completa (corteza) y el hipocampo delineadas para el análisis de la región completa de interés en (A) y (B), respectivamente. Las imágenes representativas muestran la selección de la subregión/s de la corteza y el hipocampo para el análisis de la subregión de interés en (C) y (D), respectivamente. Barra de escala = 200 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Protocolo para la cuantificación de áreas 6E10 positivas de toda la región de interés. Pasos de análisis de imagen que muestran la imagen original (A), la imagen después del ajuste de brillo/contraste (B), la selección del área de interés (C), el borrado (D), el ajuste de umbral (E) y la imagen final lista para el análisis (F). Los números de la figura designan los números de paso en el protocolo. Barra de escala = 200 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Protocolo para la subregión de interés 6E10-cuantificación de área positiva. Pasos de análisis de imagen que muestran la imagen original (A), la imagen después del ajuste de brillo/contraste (B), la selección del área de interés (C), la duplicación de la imagen de la región de interés (D), el cambio de la imagen a 8 bits y la inversión de la imagen (E), el ajuste del umbral (F) y la imagen final lista para el análisis (G). Los números de la figura designan los números de paso en el protocolo. Barra de escala = 200 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Protocolo para la rotación de la región de interés. Pasos de análisis de imagen que muestran la selección del área de interés y la rotación del cuadro de selección para ajustarse a la curvatura del tejido (A), la imagen de la región de interés después de la duplicación (B) y la imagen después de despejar el área exterior (no región de interés) (C). Los números de la figura designan el número de paso en el protocolo. Barra de escala = 200 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5: Correlación entre los análisis completos y las subregiones de interés. Los gráficos de dispersión muestran la correlación entre el área 6E10 positiva por los dos lectores independientes que realizan el análisis de la subregión de interés para la corteza (A) y el hipocampo (B). Se observa una fuerte correlación positiva entre el área 6E10 positiva resultante del análisis de la subregión de interés y el análisis de la región completa de interés tanto para la corteza (C) como para el hipocampo (D). No hay diferencias estadísticamente significativas en el área media 6E10 positiva por la región completa de interés y la subregión de interés analizan en la corteza y el hipocampo (E). Se observa una correlación significativa entre las mediciones de Aβ1-42 insoluble homogeneizada de todo el cerebro utilizando ELISA y el análisis de la región completa de interés tanto para la corteza (F) como para el hipocampo (G). Los datos se analizaron utilizando el coeficiente de correlación de Pearson, r, en (A-D) y (F-G), y utilizando ANOVA de medidas repetidas bidireccionales en (E) utilizando un software de gráficos y estadísticas. Los datos se presentan como media ± error estándar de la media (SEM) de n = 35 ratones en (E), y un p de dos colas < 0,05 se consideró estadísticamente significativo. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Los autores no tienen nada que revelar.
El presente protocolo describe y compara el procedimiento para realizar un análisis de región o subregión de interés completa de secciones cerebrales de ratón sagitales para cuantificar la carga beta amiloide en el modelo de ratón transgénico APP / PS1 de la enfermedad de Alzheimer.
La investigación reportada en esta publicación fue apoyada por el Instituto Nacional de Envejecimiento de los Institutos Nacionales de Salud bajo los números de premio R01AG062840 (a RKS) y R01AG072896 (a RKS). El contenido es responsabilidad exclusiva de los autores y no representa necesariamente las opiniones oficiales de los Institutos Nacionales de Salud. Aproximadamente $ 200k (100%) de fondos federales apoyaron este proyecto. También nos gustaría agradecer al Dr. Joshua Yang por su ayuda con la edición de manuscritos.
| Tubos cónicos de 15 mL | ThermoFisher Scientific, MA, EE. UU | . 339650 | |
| placas de 24 pocillos | Fisher Scientific, NH, EE. UU. | FB012929 | |
| Kit ELISA humano de beta amiloide 42 | ThermoFisher Scientific, MA, EE. UU. | KHB3441 | |
| Medios de montaje acuosos | Laboratorios vectoriales, CA, EE. UU. | H-5501-60 | |
| Albúmina | sérica bovinaSigmaaldrich, MO, EE. UU | .A2153-50G | |
| BZ-X710 Microscopio de fluorescencia todo en uno | Keyence Keyence, IL, EE. UU | .BZ-X710 | |
| Poilsh de uñas transparentes | Preferencia del usuario | NA | |
| Cryostat | Leica Biosystems, IL, EE. UU | .Leica CM1860 Criostato | |
| Ácido fórmico | Sigmaaldrich, MO, EE. UU | .F0507-500ML | |
| Cubreobjetos de vidrio | VWR, PA, EE. UU. | 48393-081 | |
| Prisma | GraphPad Software GraphPad, CA, EE. UU. | Versión 8 | |
| ImageJ 1.51k | Institutos Nacionales de Salud, MD, EE. UU. | Versión 1.53e | |
| Ratones Jackson Laboratories, ME, EE. UU | .034829-JAX | ||
| Paraformaldehído | Sigmaaldrich, MO, EE. UU | .P6148-500G | |
| Fenitoína/ anestésico a base de pentobarbital (Euthasol) | Patterson Veterinary, MA, EE. UU | . 07-805-9296 | |
| Solución salina tamponada con fosfato | Fisher Scientific, NH, EE. UU. | BP661-50 | |
| Plus (+) portaobjetos de microscopio | Ted Pella, Inc., CA, EE. UU. | 260100 | |
| Anticuerpo primario (6E10) | Biolegend, CA, EE. UU. | 803013 | |
| Sacarosa | Sigmaaldrich, MO, EE. UU | .47289 | |
| Triton X 100 | Sigmaaldrich, MO, EE. UU | .T8787-100ML |