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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
La respirometría de alta resolución acoplada a sensores de fluorescencia determina el consumo de oxígeno mitocondrial y la generación de especies reactivas de oxígeno (ROS). El presente protocolo describe una técnica para evaluar la frecuencia respiratoria mitocondrial y la producción de ROS en el nervio ciático permeabilizado.
La disfunción mitocondrial en los nervios periféricos acompaña a varias enfermedades asociadas con la neuropatía periférica, que puede desencadenarse por múltiples causas, incluidas enfermedades autoinmunes, diabetes, infecciones, trastornos hereditarios y tumores. La evaluación de la función mitocondrial en los nervios periféricos del ratón puede ser un desafío debido al pequeño tamaño de la muestra, un número limitado de mitocondrias presentes en el tejido y la presencia de una vaina de mielina. La técnica descrita en este trabajo minimiza estos desafíos mediante el uso de un protocolo de permeabilización único adaptado de uno utilizado para las fibras musculares, para evaluar la función mitocondrial del nervio ciático en lugar de aislar las mitocondrias del tejido. Al medir la producción fluorimétrica de especies reactivas con Amplex Red/Peroxidasa y comparar diferentes sustratos e inhibidores mitocondriales en nervios permeabilizados con saponina, fue posible detectar estados respiratorios mitocondriales, especies reactivas de oxígeno (ROS) y la actividad de complejos mitocondriales simultáneamente. Por lo tanto, el método presentado aquí ofrece ventajas en comparación con la evaluación de la función mitocondrial mediante otras técnicas.
Las mitocondrias son esenciales para mantener la viabilidad celular y realizan numerosas funciones celulares, como el metabolismo energético (vías de metabolismo de glucosa, aminoácidos, lípidos y nucleótidos). Como sitio principal de producción de especies reactivas de oxígeno (ROS), las mitocondrias son centrales en varios procesos de señalización celular como la apoptosis y participan en la síntesis de grupos de hierro-azufre (Fe-S), la importación y maduración de proteínas mitocondriales y el mantenimiento de su genoma y ribosomas 1,2,3. La red de dinámica de membranas mitocondriales está controlada por procesos de fusión y fisión, y también cuentan con maquinaria para el control de calidad y mitofagia 4,5,6.
La disfunción mitocondrial se asocia con la aparición de varias afecciones patológicas como el cáncer, la diabetes y la obesidad7. Se detectan alteraciones en la función mitocondrial en trastornos neurodegenerativos que afectan al sistema nervioso central, como en la enfermedad de Alzheimer 8,9, la enfermedad de Parkinson10,11, la esclerosis lateral amiotrófica12,13 y la enfermedad de Huntington 14,15 . En el sistema nervioso periférico, la pérdida de la función mitocondrial en los axones se observa en neuropatías inmunes, como el síndrome de Guillain-Barré16,17, y en asociación con una alta producción de ROS mitocondriales en axones, estos eventos conducen a la activación de la MAP quinasa en las células de Schwann18. Esto demuestra que la fisiología mitocondrial puede ser esencial no solo para una célula específica del sitio, sino para un tejido completo. En la polineuropatía sensorial distal asociada al VIH (HIV-DSP), las mitocondrias tienen un papel en el mecanismo por el cual la proteína transactivadora de la transcripción (HIV-TAT) permite que el VIH se replique de manera eficiente, así como varias otras funciones en la patogénesis de la infección por VIH19,20.
La evaluación de la fisiología mitocondrial del nervio ciático se ha convertido en un objetivo esencial para la investigación de la neuropatía 7,21,22. En la neuropatía diabética, los análisis proteómicos y metabolómicos sugieren que la mayoría de las alteraciones moleculares en la diabetes afectan a la fosforilación oxidativa mitocondrial del nervio ciático y al metabolismo lipídico7. Estas alteraciones también parecen ser signos tempranos de diabetes inducida por la obesidad21. En un modelo de ratón de neuropatía dolorosa inducida por quimioterapia, el deterioro mitocondrial en el nervio ciático se detecta como una disminución en la fosforilación oxidativa22 y una reducción de las actividades de los complejos mitocondriales, el potencial de membrana y el contenido de ATP23. Sin embargo, aunque varios grupos han citado la disfunción mitocondrial en neuropatías, estos estudios se limitan a las mediciones de la actividad en complejos mitocondriales sin preservación de las membranas mitocondriales, careciendo de evaluación de la integridad mitocondrial o mediciones del contenido de ATP como parámetro para la producción de ATP mitocondrial. En general, una evaluación adecuada del consumo de oxígeno mitocondrial y la producción de ROS requiere el aislamiento de las mitocondrias por centrifugación diferencial en un gradiente percol/sacarosa. El aislamiento de las mitocondrias también puede ser un factor limitante para el tejido nervioso ciático debido a la gran cantidad de tejido necesario y la pérdida e interrupción de las mitocondrias.
El presente estudio tiene como objetivo proporcionar un protocolo para medir la fisiología mitocondrial como el consumo de oxígeno mitocondrial y la producción de ROS en el nervio ciático, preservando las membranas mitocondriales y sin necesidad de aislar las mitocondrias. Este protocolo se adapta a partir de mediciones de consumo de oxígeno en fibras musculares permeabilizadas24 mediante respirometría de alta resolución (HRR). Las ventajas de este procedimiento son la posibilidad de evaluar las mitocondrias en pequeñas cantidades de tejido como el nervio ciático y evaluar los parámetros mitocondriales in situ, preservando así el entorno mitocondrial, la estructura y el perfil bioenergético, para obtener un resultado fisiológicamente confiable. Los estados respiratorios mitocondriales se determinaron con sustratos e inhibidores después de la permeabilización del nervio ciático para evaluar adecuadamente la bioenergética mitocondrial y el coeficiente del citocromo c para la integridad de la membrana mitocondrial, proporcionando una guía para los pasos de la evaluación del sistema de transporte de electrones mitocondrial (ETS) y el cálculo de los parámetros esenciales. Este estudio puede proporcionar herramientas para responder preguntas sobre mecanismos fisiopatológicos en los que está implicado el metabolismo del nervio ciático, como las neuropatías periféricas.
El presente protocolo está aprobado por el Comité de Ética sobre el Uso de Animales en la Investigación, CCS/UFRJ (CEUA-101/19), y las directrices de los Institutos Nacionales de Salud para el cuidado y uso de animales de experimentación. El nervio ciático se aísla de ratones machos C57BL/6 de cuatro meses de edad, sacrificados por luxación cervical según las pautas institucionales. Los pasos del protocolo están optimizados para evitar el deterioro mitocondrial. Por lo tanto, en este protocolo, la calibración de los sensores polarográficos de oxígeno se realizó antes de la disección y permeabilización del tejido nervioso ciático del ratón.
1. Preparación de reactivos
2. Calibración de sensores polarográficos de oxígeno para respirometría de alta resolución (HRR)
3. Disección y permeabilización del nervio ciático
4. Consumo de oxígeno y determinación de la producción de ROS
El consumo de oxígeno mitocondrial por el nervio ciático permeabilizado está representado en la Figura 2. La traza roja representa el flujo de O2 por unidad de masa en pmol/s.mg. Después de registrar un consumo basal de oxígeno con sustratos endógenos (respiración de rutina), se inyecta succinato (SUCC) para registrar la respiración impulsada por el complejo II (succinato deshidrogenasa), lo que resulta en un aumento en la tasa de consumo de oxígeno. En secuencia, se agrega una concentración saturante de ADP, activando la ATP sintasa e impulsando la fosforilación oxidativa. Esto resulta en un estado fosforilativo de la respiración mitocondrial. La respiración en estado fosforilativo significa que la ATP sintasa puede producir ATP a partir de ADP + Pi (fosfato inorgánico) utilizando el potencial de membrana formado por el gradiente de protones como una fuerza protón-motriz para generar ATP26. Con la disminución del potencial de membrana promovida por la actividad de la ATP sintasa, el consumo de oxígeno se acelera y se observa un aumento en el flujo de oxígeno. La adición de citocromo c exógeno (CYTC) promovió solo una estimulación mínima de la respiración, certificando la integridad de la membrana externa mitocondrial para esta preparación. La permeabilización de los tejidos puede dañar la integridad de la membrana y la pérdida del citocromo c. El aumento de las tasas de respiración de más del 10%-15% indica mitocondrias dañadas y una preparación inadecuada de los tejidos28,29. En este resultado representativo, hay un aumento del 8,7% en la respiración, lo que indica una buena calidad de la preparación del tejido (Tabla 1). La titulación con oligomicina (OLIGO) debe realizarse con dosis mínimas para evitar alcanzar una concentración de OLIGO que pueda interferir en la evaluación de la capacidad máxima30. La inhibición de la ATP sintasa por OLIGO - o la respiración de estado 4 por oligomicina26 - resultó en una disminución del flujo de consumo de oxígeno. La titulación con FCCP, un reactivo desacoplador mitocondrial, disipa el potencial de la membrana mitocondrial, estimulando el flujo respiratorio y mostrando la capacidad máxima para la transferencia de electrones (capacidad máxima ETS). Al final del experimento, se inyecta antimicina A (AA), un inhibidor del complejo III, para inhibir la respiración mitocondrial y registrar el consumo de oxígeno no mitocondrial (respiración residual) (Figura 2). Los flujos absolutos de oxígeno registrados en este experimento representativo se calculan en la Tabla 1.
La posibilidad de analizar el consumo de oxígeno mitocondrial simultáneamente con la producción reactiva de oxígeno (ROS) -determinada mediante la detección de peróxido de hidrógeno (H2O2) por Amplex Red con sensores de fluorescencia- es una gran ventaja para determinar un perfil bioenergético y una herramienta estándar para la detección de disfunción mitocondrial en diversas patologías. La adición de diferentes sustratos para diferentes complejos para alimentar el ETS mitocondrial también puede proporcionar más información sobre los sitios específicos para la disfunción mitocondrial. La Figura 3 se muestra con la medición simultánea del consumo de oxígeno (Figura 3A) y la producción de ROS (Figura 3B) en presencia de diferentes sustratos que proporcionan combustible para el ETS. Después de registrar la respiración basal, se agrega piruvato + malato (PM) a la cámara como sustrato para el complejo mitocondrial I, aumentando el flujo del consumo de oxígeno. La adición de SUCC, el sustrato del complejo II, también aumenta la respiración, pero la adición adicional de palmitoil-carnitina (PC) no aumenta el flujo de oxígeno en comparación con las adiciones de sustrato anteriores, lo que sugiere que PM y SUCC ya pueden haber saturado el sitio mitocondrial de ubiquinona o una falta de oxidación de ácidos grasos. Como era de esperar, la producción de ROS también aumenta después de la adición de sustratos, lo que representa la fuga de oxígeno que escapa de ETS y forma ROS (Figura 3B, traza verde). La adición de ADP en la concentración de saturación aumenta el consumo de oxígeno, impulsando la formación de ATP (traza roja en la Figura 3A) y disminuyendo la producción de ROS (Figura 3B, traza verde). La adición de CYTC solo aumenta el flujo de oxígeno en un 6,8%, confirmando la integridad de la membrana mitocondrial. La titulación con OLIGO disminuye el flujo de consumo de oxígeno (traza roja en la Figura 3A) y aumenta la producción de ROS (traza verde en la Figura 3B). Los efectos ADP y OLIGO sugieren que el nervio ciático permeabilizado en este protocolo puede replicar la relación estándar en la fisiología mitocondrial, en la que un aumento en el consumo de oxígeno conduce a una disminución en el potencial de membrana e impide la producción de ROS31,32.
La adición de FCCP, como se espera para un desacoplador, aumenta el consumo de oxígeno a su velocidad máxima y, como resultado de la disipación del potencial de membrana, la producción de ROS disminuye. La adición de rotenona, un inhibidor de los complejos I y AA, reduce el consumo de oxígeno y aumenta la formación de ROS (Figura 3A, B), confirmando que se conservan la fisiología mitocondrial y el perfil bioenergético en el nervio ciático permeabilizado. Los valores absolutos para los flujos de oxígeno registrados en este experimento se calculan en la Tabla 2.

Figura 1: Preparación del nervio ciático para la permeabilización de las mitocondrias. Todos los procedimientos deben realizarse sobre hielo. (A) El nervio ciático se extrae de un ratón sacrificado y se coloca en una placa de Petri que contiene tampón de preservación de tejidos a 4 ° C. (B) Separación de los haces de nervios ciáticos con fórceps. (C,D) El tejido está listo cuando se disecciona en mechones translúcidos, en lugar de la estructura tubular opaca blanca (A) original. Barra de escala = 1 cm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Resultado representativo del consumo de oxígeno mitocondrial en el nervio ciático permeabilizado del ratón. El experimento es un rastro representativo de un extracto de nervio ciático de un ratón sacrificado. El nervio ciático se permeabilizó antes, como se describe en la sección de protocolo. Las inyecciones están indicadas como flechas en momentos específicos. SUCC: succinato; ADP: difosfato de adenosina; Cyt c: citocromo c; OLIGO: oligomicina; FCCP: cianuro de carbonilo 4-(trifluorometoxi)fenilhidrazona; AA: antimicina A. Se muestra la concentración de oxígeno en tiempo real como [nmol/mL] (traza azul) y la tasa de consumo de oxígeno como flujo por unidad de masa [pmol/(s.mg)] (traza roja). Los brackets negros representan ventanas de las tasas de consumo de oxígeno seleccionadas para los resultados después de cada inyección. Basal se refiere a la respiración sin sustratos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: El resultado del consumo de oxígeno mitocondrial acoplado a la producción de ROS en el nervio ciático de ratón permeabilizado. Se muestra un rastro representativo de un extracto de nervio ciático de un ratón sacrificado. El nervio ciático se permeabilizó antes, como se describe en la sección de protocolo. Las inyecciones están indicadas como flechas en momentos específicos. H2O2: peróxido de hidrógeno; PM: piruvato/malato; SUCC: succinato; PC: palmitoil-carnitina; ADP: difosfato de adenosina; Cyt c: citocromo c; OLIGO: oligomicina; FCCP: cianuro de carbonilo 4-(trifluorometoxi)fenilhidrazona; ROT: rotenona; AA: antimicina A. (A) Se muestra la concentración de oxígeno en tiempo real como [nmol/mL] (traza azul) y la tasa de consumo de oxígeno como flujo por unidad de masa [O2 pmol/(s.mg)] (traza roja). (B) La producción de ROS se demuestra como fluorescencia H2O2 (traza púrpura) y pendiente de producción H2O2 [pmol/(s.mg)] (traza verde), después de la calibración. Los brackets negros representan ventanas de las tasas de consumo de oxígeno seleccionadas para los resultados después de cada inyección. Basal se refiere a la respiración sin sustratos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Sustratos | Adiciones | Tasa de consumo de oxígeno |
| Flujo por masa (pmol/[s.mg]) | ||
| Basal (sin adición) | ninguno | 5.9 |
| Succinato (SUCC) | Una adición de 10 mM | 16.9 |
| ADP | Una adición de 1 μM | 28.5 |
| Citocromo c (CYTC) | Una adición de 10 μM | 31 |
| Oligomicina A (OLIGO) | Valoración con adiciones de 0,2 μg/ml | 21.9 |
| FCCP | Valoración con adiciones de 0,5 μM | 31.1 |
| Antimicina A (AA) | Una adición de 5 μM | 11.3 |
Tabla 1: Protocolo sustratos/desacoplador/inhibidores/titulación (SUIT) y resultados de las tasas de consumo de oxígeno en el nervio ciático permeabilizado de ratón. El consumo de oxígeno se representa en [O2pmol/(s.mg)], después de cada adición del protocolo SUIT. Los resultados se obtienen por el promedio de ventanas seleccionadas marcado en la Figura 2.
| Sustratos | Adiciones | Consumo de oxígeno (O2 pmol/[s.mg]) | Producción de ROS (H2O2 pmol/[s.mg]) |
| Basal (sin adición) | ninguno | 5.77 | 0.53 |
| Piruvato + Malato (PM) | Un pulso de 5 mM + 2,5 mM | 7.17 | 0.58 |
| Succinato (SUCC) | Una adición de 10 mM | 14.06 | 0.75 |
| Palmitoil carnitina (PC) | Dos pulsos de 25 μM | 14.68 | 0.79 |
| ADP | Una adición de 1 μM | 22.9 | 0.25 |
| Citocromo c (CYTC) | Una adición de 10 μM | 24.36 | 0.09 |
| Oligomicina A (OLIGO) | Valoración con adiciones de 0,2 μg/ml | 17.03 | 0.5 |
| FCCP | Valoración con adiciones de 0,5 μM | 23.98 | 0.16 |
| Rotenona (ROT) | Una adición de 1μM | 19.75 | 0.48 |
| Antimicina A (AA) | Una adición de 5 μM | 4.08 | 0.53 |
Tabla 2: Protocolo sustratos/desacoplador/inhibidores/titulación (SUIT) y resultados de la producción de ROS acoplado a las tasas de consumo de oxígeno del nervio ciático permeabilizado del ratón. El consumo de oxígeno está representado en [O2 pmol/(s.mg)] y la producción de ROS por [H2O2 pmol/(s.mg)] después de cada adición del protocolo SUIT. Los resultados se obtienen por el promedio de ventanas seleccionadas marcado en la Figura 3.
| Parámetros para la función mitocondrial | Cálculos a partir de las tasas de consumo de oxígeno |
| Respiración basal | Respiración basal (flujo sin adición de sustratos)28 |
| Consumo residual de oxígeno (ROX) | [Flujo después de la adición de AA] 28 |
| Complejo I fuga de respiración | [Flujo después de la adición de PM] – [ROX]28,37 |
| Respiración por fugas del Complejo II | [Flujo después de la adición de SUCC] – [ROX]28,37 |
| Estado fosforilativo ( capacidad de Oxphos) | [Flujo después de la adición de ADP] – [ROX]28,43 |
| Estado no fosforilativo (respiración por fugas) | [Flujo después de la adición de oligomicina] – [ROX]28 |
| Relación de control respiratorio | [Estado fosforilativo / No -fosforilativo] 28,43 |
| Capacidad de ETS | [Flujo después de la adición de FCCP] – [ROX]28,37 |
Tabla 3: Cálculo de parámetros para la evaluación de la función mitocondrial en nervio ciático permeabilizado de ratón. Parámetros para la fórmula de evaluación de la fisiología mitocondrial por tasas de consumo de oxígeno.
Los autores no tienen nada que revelar.
La respirometría de alta resolución acoplada a sensores de fluorescencia determina el consumo de oxígeno mitocondrial y la generación de especies reactivas de oxígeno (ROS). El presente protocolo describe una técnica para evaluar la frecuencia respiratoria mitocondrial y la producción de ROS en el nervio ciático permeabilizado.
Este estudio fue financiado por el Instituto Serrapilheira, la Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ), el Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) y la Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior-Brasil (CAPES). Agradecemos al Dr. Antonio Galina Filho, a la Dra. Mónica Montero Lomeli y al Dr. Claudio Masuda por el apoyo con las instalaciones del laboratorio, y a la Dra. Martha Sorenson por los amables y valiosos comentarios para mejorar el artículo.
| Adenosina 5' trifosfato sódico sodio hidrato | Sigma-Aldrich | A26209 | |
| Adenosina 5′-difosfato sodio sal | Sigma-Aldrich | A2754 | |
| Amplex Red Reactivo | Thermo Fisher scientific | A12222 | Amplex Red se prepara en DMSO de acuerdo con la ficha técnica |
| del producto Antimicina A (de Streptomyces sp.) | Sigma-Aldrich | A8674 | |
| Albúmina sérica bovina | Sigma-Aldrich | A7030 | fracción de choque térmico, libre de proteasa, libre de ácidos grasos, esencialmente libre de globulina, pH 7, ≥ 98% |
| Carbonato de calcio | Sigma-Aldrich | C6763 | |
| Cianuro de carbonilo 4-(trifluorometoxi)fenilhidrazona (FCCP) | Sigma-Aldrich | C2920 | |
| Citocromo c | Sigma-Aldrich | C7752 | (de corazón equino; hemoproteína pequeña) |
| DataLab versión 5.1.1.91 | OROBOROS INSTRUMENTS, Austria | Copyright (c) 2002 - 13 por el Dr. Erich Gnaiger | |
| Agitador de microplacas orbital digital 120V | Thermo Fisher scientific | 88882005 | |
| DL-Dithiothreitol | Sigma-Aldrich | 43819 | |
| EGTA sal sódica | Sigma-Aldrich | E8145 | |
| Jeringa Hamilton | Sigma-Aldrich HAM80075 | 10 uL, 25 uL y 50 uL | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | |
| Hidrógeno solución de peróxido 30% p/p | Merck | H1009 | |
| Imidazol | Sigma-Aldrich | I2399 | |
| L-(−)-Ácido málico | Sigma-Aldrich | M7397 | |
| Cloruro de magnesio hexahidratado | Sigma-Aldrich | M2393 | |
| MES sal sódica | Sigma-Aldrich | M3885 | |
| Pinza de microdisección, curvada | Sigma-Aldrich | F4142 | |
| Pinza de microdisección, recta | Sigma-Aldrich | F4017 | |
| O2K - Juego de filtros Amplex Rojo | OROBOROS INSTRUMENTS, Austria | 44321-01 | Fasching M, Sumbalova Z, Gnaiger E (2013) O2k-Fluorometry: HRR y producción de H2O2 en mitocondrias cerebrales de ratón. Red Mitocondral Physiol 17.17. |
| O2K - Fluorescencia LED2 - componente del módulo Sensor de fluorescencia verde | OROBOROS INSTRUMENTS, Austria | 44210-01 | |
| Oligomicina | Sigma-Aldrich | O4876 | (de Streptomyces diastatochromogenes; mezcla de oligomicinas A, B y C |
| OROBOROS Oxygraph-2k | OROBOROS INSTRUMENTS, Austria | http://www.oroboros.at | |
| Palmitoilcarnitina (Palmitoyl-DL-carnitina-HCl) | Sigma-Aldrich | P4509 | |
| Peroxidasa de rábano picante | Sigma-Aldrich | P8375 | |
| Placas de Petri, poliestireno | MERCK | P5606 | |
| Hidrato de sal disódica de fosfocreatina | Sigma-Aldrich | P7936 | |
| Dihidrógeno fosfato de potasio monobásico | Sigma-Aldrich | PHR1330 | |
| Hidróxido de potasio | Sigma-Aldrich | 221473 | |
| Rotenona | Sigma-Aldrich | R8875 | |
| Saponina | Sigma-Aldrich | SAE0073 | |
| Piruvato de sodio | Sigma-Aldrich | P5280 | |
| Succinato de sodio dibásico hexahidratado | Sigma-Aldrich | S2378 | |
| Sacarosa | Sigma-Aldrich | S9378 | |
| Taurina | Sigma-Aldrich | T0625 |