La forma más significativa en que el modelo descrito aquí difiere de los modelos de inoculación vaginal publicados anteriormente es el uso de bacterias cultivadas anaeróbicamente, que requieren consideraciones especiales para la preparación de inóculo viable y la recuperación de bacterias de los ratones. Los pasos específicos en el protocolo anterior pueden variar ligeramente dependiendo de la especie/cepa de bacterias utilizada, como se sugiere en el Archivo Suplementario 1. Además, este manuscrito describe un nuevo método de procedimiento para la administración de bacterias y lavados vaginales que requiere menos experiencia por parte del investigador y menos restricción para los ratones. Si el experimentador no se siente cómodo con la forma de restricción descrita en el paso 3.2. y paso 3.3., los ratones pueden ser desaliñados como se describió anteriormente34 con o sin anestesia de acuerdo con el diseño experimental y las directrices institucionales de IACUC.
Una advertencia importante para el uso de bacterias cultivadas anaeróbicamente en modelos murinos es que ciertos pasos (como los que involucran animales vivos) deben realizarse fuera de la cámara anaeróbica. Por lo tanto, los pasos más críticos en este protocolo son aquellos en los que las bacterias de interés estarán expuestas a un ambiente aeróbico, como durante la inoculación de los ratones. El uso de cualquier anaerobio nuevo en este modelo requerirá una investigación preliminar sobre su capacidad para mantener la viabilidad tras la exposición al oxígeno (como la comparación de UFC antes y después de la inoculación como se describe en el paso 2.5. y el paso 3.4.). Dependiendo del grado de sensibilidad al oxígeno y al PBS del organismo, se deben considerar diferentes métodos de preparación del inóculo (Archivo complementario 1, paso 2.4.5.). Para las inoculaciones con G. vaginalis JCP8151B, hemos encontrado que se puede preparar un solo tubo de inóculo en PBS y usarse para infectar a todos los ratones. Si se utiliza una bacteria anaeróbica diferente que es más sensible al oxígeno, el inóculo se puede preparar en tubos separados para cada ratón, de modo que no sea necesario abrir / cerrar repetidamente el tubo. Del mismo modo, si la especie bacteriana de interés es más exigente / menos capaz de sobrevivir en PBS que G. vaginalis, la inoculación puede prepararse en medios de cultivo. Si el medio utilizado contiene agentes reductores, como el medio anaerobio CDC utilizado para cultivar Prevotella bivia (Archivo complementario 1, paso 2.1. y paso 2.2.), entonces las bacterias también tendrán una mayor protección contra la exposición al oxígeno.
También se pueden considerar métodos alternativos para la homogeneización, como el batido de perlas22,35, que se realiza con la tapa del tubo cerrada y, por lo tanto, puede introducir menos oxígeno que el homogeneizador de mano. Además, los organismos más sensibles al oxígeno pueden requerir un tiempo de equilibrio más largo para los medios. Se puede utilizar un indicador de oxígeno como la resazurina para comprobar que se han alcanzado las condiciones anaeróbicas (paso 2.1.). Los métodos alternativos, como los frascos anaeróbicos, pueden afectar los resultados y deben examinarse para determinar su viabilidad bacteriana antes de su uso.
La sensibilidad al oxígeno y la meticulosidad del organismo experimental también pueden desempeñar un papel en la recuperación exitosa de bacterias viables del ratón durante los lavados / homogeneización (Archivo complementario 1, paso 3.2. y paso 5.1.). Para organismos altamente sensibles, el tiempo entre el lavado que se toma y el plateado puede conducir a una pérdida de viabilidad y causar una estimación artificialmente baja de la colonización vaginal bacteriana. Para mitigar este efecto, los lavados recolectados se pueden diluir inmediatamente en medios de cultivo anaeróbicos frescos (con agente reductor). Del mismo modo, la homogeneización de órganos se puede hacer en medios de cultivo frescos en lugar de PBS para aumentar la viabilidad bacteriana y también se puede hacer en la propia cámara anaeróbica para minimizar la exposición al oxígeno.
Dependiendo del propósito de un experimento dado, el experimentador debe prestar atención a los grupos de control. Para probar hipótesis, las medidas basales de ratones de control no infectados que son tratados simuladamente solo con vehículo ayudarán a establecer si hay inducción de quimiocinas / citoquinas u otros resultados específicos de la infección. El vehículo de control utilizado debe ser el mismo que el vehículo utilizado para la inoculación, por lo que si las bacterias se inoculan en medios de cultivo, deben utilizarse medios de cultivo no inoculados como control (Archivo complementario 1, paso 2.4.5.).
Los métodos descritos en este protocolo también podrían aplicarse a bacterias facultativas capaces de crecer anaeróbicamente pero que tradicionalmente se estudian utilizando condiciones de cultivo aeróbico (como Escherichia coli o Streptococcus del grupo B). Esto podría ser especialmente relevante para las infecciones por estos organismos en sitios del cuerpo que se cree que contienen bajos niveles de oxígeno, como el cuello uterino. Puede ser que un organismo facultativo infecte con más éxito los sitios con menos oxígeno cuando el inóculo se prepara anaeróbicamente en comparación con aeróbicamente. En tal experimento, la recuperación de bacterias viables para la enumeración de UFC puede no requerir condiciones anaeróbicas.