El presente protocolo explica la generación de una monocapa 2D de células cerebelosas a partir de células madre pluripotentes inducidas para investigar las primeras etapas del desarrollo cerebeloso.
Artículo de método
El presente protocolo explica la generación de una monocapa 2D de células cerebelosas a partir de células madre pluripotentes inducidas para investigar las primeras etapas del desarrollo cerebeloso.
El desarrollo preciso y oportuno del cerebelo es crucial no solo para la coordinación y el equilibrio motor precisos, sino también para la cognición. Además, la interrupción en el desarrollo cerebeloso se ha implicado en muchos trastornos del desarrollo neurológico, como el autismo, el trastorno por déficit de atención con hiperactividad (TDAH) y la esquizofrenia. Las investigaciones del desarrollo cerebeloso en humanos anteriormente solo han sido posibles a través de estudios post-mortem o neuroimágenes, sin embargo, estos métodos no son suficientes para comprender los cambios moleculares y celulares que ocurren in vivo durante el desarrollo temprano, que es cuando se originan muchos trastornos del desarrollo neurológico. La aparición de técnicas para generar células madre pluripotentes inducidas por humanos (iPSC) a partir de células somáticas y la capacidad de volver a diferenciar aún más las iPSC en neuronas han allanado el camino para el modelado in vitro del desarrollo temprano del cerebro. El presente estudio proporciona pasos simplificados hacia la generación de células cerebelosas para aplicaciones que requieren una estructura monocapa de 2 dimensiones (2D). Las células cerebelosas que representan las primeras etapas del desarrollo se derivan de iPSC humanas a través de los siguientes pasos: primero, los cuerpos embrioides se hacen en cultivo tridimensional (3D), luego se tratan con FGF2 e insulina para promover la especificación del destino cerebeloso, y finalmente, se diferencian terminalmente como una monocapa en sustratos recubiertos de poli-l-ornitina (PLO) / laminina. A los 35 días de diferenciación, los cultivos de células cerebelosas derivadas de iPSC expresan marcadores cerebelosos que incluyen ATOH1, PTF1α, PAX6 y KIRREL2, lo que sugiere que este protocolo genera precursores neuronales cerebelosos glutamatérgicos y GABAérgicos, así como progenitores de células de Purkinje. Además, las células diferenciadas muestran una morfología neuronal distinta y son positivas para marcadores de inmunofluorescencia de identidad neuronal como TUBB3. Estas células expresan moléculas de guía axonal, incluyendo semaforina-4C, plexina-B2 y neuropilina-1, y podrían servir como modelo para investigar los mecanismos moleculares del crecimiento de neuritas y la conectividad sináptica. Este método genera neuronas cerebelosas humanas útiles para aplicaciones posteriores, incluyendo expresión génica, estudios fisiológicos y morfológicos que requieren formatos monocapa 2D.
Comprender el desarrollo cerebeloso humano y las ventanas de tiempo críticas de este proceso es importante no solo para decodificar las posibles causas de los trastornos del desarrollo neurológico, sino también para identificar nuevos objetivos para la intervención terapéutica. Modelar el desarrollo cerebeloso humano in vitro ha sido un desafío, sin embargo, con el tiempo, han surgido muchos protocolos que diferencian las células madre embrionarias humanas (hESC) o iPSC con destinos de linaje cerebeloso 1,2,3,4,5,6,7,8 . Además, es importante desarrollar protocolos que generen resultados reproducibles, sean relativamente simples (para reducir el error) y no sean pesados en costos monetarios.
Los primeros protocolos para la diferenciación cerebelosa se generaron a partir de cultivos 2D a partir de cuerpos embrioides (EB) en placas, induciendo el destino cerebeloso con varios factores de crecimiento similares al desarrollo in vivo, incluyendo WNT, BMPs y FGFs 1,9. Los protocolos publicados más recientes indujeron la diferenciación principalmente en el cultivo de organoides 3D con FGF2 e insulina, seguido de FGF19 y SDF1 para estructuras rómbicas similares a labios3,4, o utilizaron una combinación de FGF2, FGF4 y FGF85. Ambos métodos de inducción de organoides cerebelosos dieron como resultado organoides cerebelosos 3D similares, ya que ambos protocolos informaron una expresión similar de marcadores cerebelosos en puntos de tiempo idénticos. Holmes y Heine ampliaron su protocolo 3D5 para mostrar que las células cerebelosas 2D se pueden generar a partir de hESCs e iPSCs, que comienzan como agregados 3D. Además, Silva et al.7 demostraron que las células que representan neuronas cerebelosas maduras en 2D pueden generarse con un enfoque similar al de Holmes y Heine, utilizando un punto de tiempo diferente para cambiar de 3D a 2D y extender el tiempo de crecimiento y maduración.
El protocolo actual induce el destino cerebeloso en iPSC libres de alimentador mediante la generación de cuerpos embrioides (EB) flotantes libres utilizando insulina y FGF2 y luego colocando los EB en platos recubiertos de OLP / laminina el día 14 para el crecimiento y diferenciación 2D. Para el día 35, se obtienen células con identidad cerebelosa. La capacidad de recapitular las primeras etapas del desarrollo cerebeloso, especialmente en un entorno 2D, permite a los investigadores responder preguntas específicas que requieren experimentos con una estructura monocapa. Este protocolo también es susceptible de modificaciones adicionales, como superficies con micropatrones, ensayos de crecimiento axonal y clasificación celular para enriquecer las poblaciones celulares deseadas.
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La investigación con sujetos humanos fue aprobada bajo el número de aprobación de la Junta de Revisión Institucional de la Universidad de Iowa número 201805995 y el número de aprobación del Comité de Células Madre Pluripotentes Humanas de la Universidad de Iowa 2017-02. Las biopsias de piel se obtuvieron de los sujetos después de obtener el consentimiento informado por escrito. Los fibroblastos se cultivaron en DMEM con 15% de suero fetal bovino (FBS) y 1% de solución de aminoácidos no esenciales MEM a 37 °C y 5% deCO2. Los fibroblastos se reprogramaron utilizando un kit de reprogramación episomal siguiendo el protocolo del fabricante (ver Tabla de materiales) utilizando un nucleofector para electroporación. Todos los procedimientos se realizaron en un gabinete de seguridad biológica Tipo A2 de Clase II ("capucha" para abreviar). Todos los medios de cultivo celular estaban libres de antibióticos; Por lo tanto, cada componente que entró en la campana se limpió con etanol al 70%. Todos los medios y componentes de cultivo celular se filtraron estérilmente o se abrieron en la campana para mantener su esterilidad.
1. Preparación experimental
2. Cultura iPSC sin alimentador
3. Diferenciación cerebelosa
NOTA: Antes de comenzar la diferenciación, las iPSC se pasan a seis platos de 35 mm y están listas para la diferenciación cuando están al 70% de confluencia. Cada placa de 35 mm se transferirá a un pocillo de la placa de 6 pocillos.
4. Preparación de la muestra para el aislamiento de ARN
5. Preparación de células para la tinción inmunofluorescente
NOTA: Para una placa de 24 pocillos, un EB por pocillo es suficiente.
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Descripción general de la diferenciación cerebelosa 3D a 2D
Las células cerebelosas se generan a partir de iPSCs. La figura 1A muestra el flujo de trabajo general y la adición de componentes principales para la diferenciación. El día 0, los EB se fabrican levantando suavemente las colonias iPSC (Figura 1B) utilizando una pipeta de vidrio tirado en CDM que contiene SB431542 e Y-27632 y se colocan en placas de fijación ultrabaja. FGF2 se añade ...
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La capacidad de modelar el desarrollo cerebeloso humano in vitro es importante para el modelado de enfermedades, así como para promover la comprensión del desarrollo normal del cerebro. Los protocolos menos complicados y rentables crean más oportunidades para la generación de datos replicables y una amplia implementación en múltiples laboratorios científicos. Aquí se describe un protocolo de diferenciación cerebelosa utilizando un método modificado de generación de EB que no requiere enzimas o agentes de disocia...
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Los autores no tienen conflictos de intereses que declarar.
Agradecemos a Jenny Gringer Richards por su minucioso trabajo en la validación de nuestros sujetos de control, a partir de los cuales generamos las iPSC de control. Este trabajo fue apoyado por NIH T32 MH019113 (a D.A.M. y K.A.K.), el Nellie Ball Trust (a T.H.W. y A.J.W.), NIH R01 MH111578 (a V.A.M. y J.A.W.), NIH KL2 TR002536 (a A.J.W.) y Roy J. Carver Charitable Trust (a V.A.M., J.A.W. y A.J.W.). Las figuras fueron creadas con BioRender.com.
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| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| 10 mL Pipeta serológica | Fisher Scientific | 13-678-26D | |
| 1-tio-glicerol | Sigma | M6145 | |
| 2 mL Pipeta serológica | Fisher Scientific | 13-678-26B | |
| 250 mL Unidad de filtro, 0,2 y micro; m aPES, 50 mm Dia | Fisher Scientific | FB12566502 | |
| 35 mm Plato de clutura de tejidos de fácil agarre | Falcon | 353001 | |
| 4D Unidad central Nucleofector | Lonza | 276885 | Nucleofector |
| 5 mL Pipeta serológica | Fisher Scientific | 13-678-25D | |
| 60 mm Plato de cultivo de tejidos de fácil agarre | Falcon | 353004 | |
| 6 pocillos placas de fijación ultra bajas | Corning | 3471 | |
| Pasteur desechables de 9" Fisher | Scientific | 13-678-20D | |
| Apo-transferrina | Sigma | T1147 | |
| Albúmina sérica bovina (BSA) | Sigma | A9418 | |
| Agua de grado de cultivo celular | Cytiva | SH30529.02 | |
| Concentrado lipídico químicamente definido | Gibco | 11905031 | |
| Chroman 1 | Cayman | 34681 | |
| Clase II, Tipo A2, Gabinete de seguridad biológica | NuAire, Inc. | NU-540-600 | Campana, luz ultravioleta |
| Placa Costar de 24 pocillos, tratada | TC Corning | 3526 | |
| Costar Placa de 6 pocillos, tratada TC | Solución Corning | 3516 | |
| DAPI Thermo | Scientific | 62248 | |
| DMEM | Gibco | 11965092 | |
| DMEM/F12 | Gibco | 11320033 | |
| DMSO (Dimetlisulfóxido) | Sigma | D2438 | |
| DPBS+/+ | Gibco | 14040133 | |
| Emricasan | Cayman | 22204 | |
| Epi5 Kit de reprogramación episomal iPSC | Life Technologies | A15960 | |
| Essential 8-Flex | Gibco | A2858501 | medio PSC con sistema de imagen FGF2 |
| EVOS XL Core termoestable Life | Technologies | AMEX1000 | |
| Suero fetal bovino - Premium | Select Atlanta Biologicals | S11150 | |
| FGF2 | Peprotech | 100-18B | |
| Suplemento GlutaMAX | Gibco | 35050061 | Suplemento de L-alanina-L-glutamina |
| Ham's F12 Nutrient Mix | Gibco | 11765054 | |
| HERAcell VIOS 160i Incubadora de CO2 | Thermo Scientific | 50144906 | |
| Anti-EN2 humano, ratón | Santa Cruz Biotechnology | sc-293311 | |
| Anti-Ki67/MKI67 humano, conejo | R& D Systems | MAB7617 | |
| Humano anti-PTF1a, conejo | Novus Biologicals | NBP2-98726 | |
| Anti-TUBB3 humano, ratón | Biolegend | 801213 | |
| IMDM | Gibco | 12440053 | |
| Insulina | Gibco | 12585 | |
| Laminina Proteína de ratón | Gibco | 23017015 | |
| Matrigel Matrix | Corning | 354234 | Matriz de membrana basal |
| MEM-NEAA | Gibco | 11140050 | |
| Mini centrífuga | Labnet International | C1310 | Mini centrífuga de sobremesa |
| Kit de limpieza de ARN monarca (50 µ g) | New England BioLabs | T2040 | Columnas de centrifugación de sílice |
| Monarch Total RNA Miniprep Kit | England BioLabs | T2010 | Columnas de espín de sílice |
| N-2 suplemento | Gibco | 17502-048 | |
| Medio neurobasal | Gibco | 21103049 | |
| PBS, pH 7.4 | Gibco | 10010023 | |
| PFA 16% | Ciencias de la Microscopía Electrónica | 15710 | |
| Suplemento de poliamina | Sigma | P8483 | |
| Poly-L-Ornithine (PLO) | Sigma | 3655 | |
| Cloruro de potasio | Sigma | 746436 | |
| SB431542 | Sigma | 54317 | |
| Bolsas transparentes autosellables | Steriking | SS-T2 (90x250) | Bolsas de autoclave |
| Sodio citrato dihidratado | Fisher Scientific | S279-500 | |
| Filtros de jeringa, estériles, PES 0.22 y micro; m, 30 mm Dia | Research Products International | 256131 | |
| Trans-ISRIB | Cayman | 16258 | |
| TRIzol Reactivo | Invitrogen | 15596018 | Fenol e isotiocianato de guanidina |
| Enzima TrypLE Express (1x) | Gibco | 12604039 | Reactivo de disociación celular |
| Osmómetro de presión de vapor | Wescor, Inc. | Osmómetro | modelo 5520 |
| Y-27632 | Biogems | 1293823 |
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