Method Article

Desarrollo rápido de circuitos de identificación del estado celular con politransfección

DOI:

10.3791/64793

⸱

February 24th, 2023

 ,  ,  , 
1Department of Biological Engineering, Massachusetts Institute of Technology, 2School of Biological Engineering, University of British Columbia, 3Department of Electrical Engineering and Computer Science, Massachusetts Institute of Technology

In This Article

Summary

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Los circuitos genéticos complejos requieren mucho tiempo para diseñar, probar y optimizar. Para facilitar este proceso, las células de mamíferos se transfectan de una manera que permite la prueba de múltiples estequiometrías de los componentes del circuito en un solo pozo. Este protocolo describe los pasos para la planificación experimental, la transfección y el análisis de datos.

Abstract

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Los circuitos genéticos de mamíferos han demostrado el potencial para detectar y tratar una amplia gama de estados de enfermedad, pero la optimización de los niveles de los componentes del circuito sigue siendo un desafío y requiere mucha mano de obra. Para acelerar este proceso, nuestro laboratorio desarrolló la politransfección, una extensión de alto rendimiento de la transfección tradicional de mamíferos. En la politransfección, cada célula de la población transfectada esencialmente realiza un experimento diferente, probando el comportamiento del circuito en diferentes números de copias de ADN y permitiendo a los usuarios analizar un gran número de estequiometrías en una reacción de un solo recipiente. Hasta ahora, se han demostrado politransfecciones que optimizan las proporciones de circuitos de tres componentes en un solo pocillo de células; En principio, el mismo método se puede utilizar para el desarrollo de circuitos aún más grandes. Los resultados de la politransfección se pueden aplicar fácilmente para encontrar proporciones óptimas de ADN a cotransfecto para circuitos transitorios o para elegir niveles de expresión para componentes de circuitos para la generación de líneas celulares estables.

Aquí, demostramos el uso de la politransfección para optimizar un circuito de tres componentes. El protocolo comienza con los principios de diseño experimental y explica cómo la politransfección se basa en los métodos tradicionales de cotransfección. A continuación, se lleva a cabo la politransfección de células y seguida de citometría de flujo unos días después. Finalmente, los datos se analizan examinando cortes de los datos de citometría de flujo de una sola célula que corresponden a subconjuntos de células con ciertas proporciones de componentes. En el laboratorio, la politransfección se ha utilizado para optimizar clasificadores celulares, controladores de retroalimentación y feedforward, motivos biestables y muchos más. Este método simple pero poderoso acelera los ciclos de diseño para circuitos genéticos complejos en células de mamíferos.

Introduction

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

El campo de la biología sintética de mamíferos ha progresado rápidamente, desde el desarrollo de partes simples de detección y respuesta en líneas celulares cultivadas hasta la optimización de redes complejas de genes para abordar los desafíos del mundo real en diagnóstico y terapéutica1. Estos sofisticados circuitos son capaces de detectar entradas biológicas desde perfiles de microARN hasta citoquinas y fármacos de moléculas pequeñas, e implementar circuitos de procesamiento lógico que incluyen transistores, filtros de paso de banda, interruptores de palanca y osciladores. También han mostrado resultados prometedores en modelos animales de enfermedades como el cáncer, la artritis, la diabetes y muchos más 1,2,3,4,5. Sin embargo, a medida que crece la complejidad de un circuito, optimizar los niveles de cada uno de sus componentes se vuelve cada vez más desafiante.

Un tipo particularmente útil de circuito genético es un clasificador celular, que puede programarse para detectar y responder a los estados celulares. La producción selectiva de proteínas o salidas de ARN en estados celulares específicos es una herramienta poderosa para guiar y programar la diferenciación de células y organoides, identificar y destruir células enfermas y/o tipos de células indeseables, y regular la función de las células terapéuticas 1,2,3,4,5 . Sin embargo, la creación de circuitos en células de mamíferos que puedan clasificar con precisión los estados celulares de múltiples especies celulares de ARN y / o proteínas ha sido muy desafiante.

Uno de los pasos más lentos del desarrollo de un circuito de clasificación celular es optimizar los niveles de expresión relativos de los genes componentes individuales, como sensores y factores de procesamiento, dentro del circuito. Para acelerar la optimización de circuitos y permitir la construcción de circuitos más sofisticados, trabajos recientes han utilizado modelos matemáticos de circuitos clasificadores celulares y sus componentes para predecir composiciones y topologías óptimas 6,7. Si bien esto ha mostrado resultados poderosos hasta ahora, el análisis matemático está limitado por la necesidad de caracterizar sistemáticamente el comportamiento de entrada-salida de los genes componentes en el circuito, lo que lleva mucho tiempo. Además, una miríada de problemas dependientes del contexto pueden surgir en circuitos genéticos complejos, haciendo que el comportamiento de un circuito completo desafíe las predicciones basadas en caracterizaciones de partes individuales 8,9.

Para desarrollar y probar más rápidamente circuitos complejos de mamíferos, como los clasificadores de estado celular, nuestro laboratorio desarrolló una técnica llamada politransfección10, una evolución de los protocolos de cotransfección de plásmidos. En la cotransfección, múltiples especies de ADN plásmido se complejan junto con un reactivo lipídico o polimérico cargado positivamente, y luego se entregan a las células de manera correlacionada (Figura 1A). En la politransfección, los plásmidos se complejan por separado con el reactivo, de modo que el ADN de cada complejo de transfección se entrega a las células de manera descorrelacionada (Figura 1B). Usando este método, las células dentro de la población transfectada están expuestas a numerosas combinaciones de proporciones de dos o más cargas útiles de ADN que transportan diferentes componentes del circuito.

Para medir las proporciones de los componentes del circuito entregados a cada célula, cada complejo de transfección dentro de una politransfección contiene un reportero fluorescente expresado constitutivamente que sirve como un proxy para la absorción celular del complejo. El ADN de relleno que no contiene ningún elemento activo dentro de una célula de mamífero se utiliza para ajustar la cantidad relativa del reportero fluorescente y los componentes del circuito entregados a una célula en un solo complejo de transfección y se discute con más detalle en la discusión. Un ejemplo de ADN de relleno utilizado en el laboratorio de Weiss es un plásmido que contiene una secuencia terminadora, pero no promotor, secuencia codificante, etc. Las células con diferentes proporciones de componentes del circuito se pueden comparar para encontrar proporciones óptimas para la función del circuito génico. Esto a su vez produce predicciones útiles para elegir promotores y otros elementos del circuito para lograr niveles óptimos de expresión génica cuando se combinan componentes del circuito en un solo vector para la integración genética (por ejemplo, un lentivirus, transposón o plataforma de aterrizaje). Por lo tanto, en lugar de elegir relaciones entre los componentes del circuito basadas en la intuición o mediante un proceso de prueba y error que consume mucho tiempo, la politransfección evalúa una amplia gama de estequiometrías entre partes genéticas en una reacción de un solo bote.

En nuestro laboratorio, la politransfección ha permitido la optimización de muchos circuitos genéticos, incluidos clasificadores celulares, controladores de retroalimentación y feedforward, y motivos biestables. Este método simple pero poderoso acelera significativamente los ciclos de diseño para circuitos genéticos complejos en células de mamíferos. Desde entonces, la politransfección se ha utilizado para caracterizar varios circuitos genéticos para revelar sus funciones multidimensionales de transferencia de entrada-salida a alta resolución 10, optimizar una topología de circuito alternativo para la clasificación del estado celular11 y acelerar varios proyectos publicados 12,13 y en curso.

Aquí describimos y describimos el flujo de trabajo para usar la politransfección para optimizar rápidamente un circuito genético (Figura 2). El protocolo muestra cómo generar datos de politransfección de alta calidad y evitar varios errores comunes en el protocolo de politransfección y el análisis de datos (Figura 3). Luego demuestra cómo usar la politransfección para caracterizar componentes de circuitos simples y, en el proceso, comparar los resultados de la politransfección con la cotransfección (Figura 4). Finalmente, los resultados de la politransfección muestran una optimización del circuito clasificador de cáncer (Figura 5).

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Protocol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

NOTA: La Tabla 1 y la Tabla 2 sirven como referencias significativas para este protocolo. La Tabla 1 muestra la escala de reactivos para las reacciones, y la Tabla 2 muestra la aritmética de la relación de ADN para un ejemplo de politransfección descrita en el protocolo (mitad superior) y para un posible experimento de seguimiento (mitad inferior).

1. Preparación de células para la transfección

  1. Asegúrese de que el cultivo de células de riñón embrionario humano (HEK293) sea 60% -80% confluente antes de iniciar el protocolo. Para ello, sembrar 1 x 106 células en un cultivo de tejido de 100 mm x 15 mm en placa de Petri 2 días antes, e incubar a 37 °C con 5% deCO2.
    NOTA: Aunque nuestro protocolo se centra en las células HEK293, otros tipos de células pueden ser sustituidas.
  2. Prepare los medios y las células para las transfecciones como se describe a continuación.
    1. Precaliente al menos 20 ml de una solución del medio de águila modificado de Dulbecco (DMEM) con 10% de suero bovino fetal (FBS) y 1% de aminoácidos no esenciales (NEAA; ver Tabla de materiales) a 37 °C. Precaliente al menos 2,4 ml de tripsina y 2,4 ml de solución salina tamponada con fosfato (PBS) a 37 °C también. Precalentamiento reducido del medio sérico a ~16 °C.
      NOTA: Todo el trabajo de cultivo de tejidos debe realizarse con cuidado en un gabinete de bioseguridad.
  3. Vuelva a suspender las células en la solución DMEM como se describe a continuación.
    1. Aspirar y desechar los medios actuales. Dispense 2 ml de PBS en el cultivo celular HEK293 para lavar las células. Aspirar y desechar el PBS.
    2. Dispensar 2 ml de tripsina en el cultivo celular HEK293. Coloque la placa de Petri en una incubadora a 37 °C durante 3 minutos o hasta que las células ya no se adhieran a la placa. Devuelva el plato al gabinete de bioseguridad y diluya la solución celular dispensando 8 ml de solución DMEM en la placa.
    3. Mezcle la solución pipeteando suavemente hacia arriba y hacia abajo varias veces. Aspirar todos los medios y colocarlos en un tubo cónico de 15 ml.
  4. Centrifugar las células a 300 x g durante 3 min para granularlas. Aspirar el medio (teniendo cuidado de no aspirar las células) y desecharlo. Resuspender las células en 5 ml de solución DMEM, mezclando pipeteando suavemente hacia arriba y hacia abajo.
  5. Calcule la concentración actual de células utilizando un contador de células automatizado (enumerado en la Tabla de materiales). Siembre seis pocillos (en este ejemplo) en una placa de 24 pocillos con 1 x 105 celdas (para una densidad de siembra de 50,000 células / cm2).
  6. Agregue la solución DMEM hasta 500 μL (agregue primero la solución DMEM a los pocillos) y luego etiquete un pocillo por tratamiento como el siguiente: sin control de color, control mKO2, control TagBFP, control NeonGreen, control de todo color y politransfección 1. Los pocillos de control TagBFP, mKO2 y NeonGreen son controles de un solo color para todas las proteínas fluorescentes incluidas en la politransfección.

2. Realización de la transfección

  1. Prepare tubos para cada agregado de ADN. Deje a un lado los tubos de microcentrífuga de 1,5 ml y etiquete los tubos como: sin control de color, control de mKO2, control de TagBFP, control de NeonGreen, control de todo color, mezcla de politransfección 1 y mezcla de politransfección 2.
    1. Agregue 36 μL de medio sérico reducido al control sin color, el control mKO2, el control TagBFP, el control NeonGreen y todos los tubos de control de color. Añadir 18 μL de medio sérico reducido a cada uno de los tubos de la mezcla de politransfección 1 y de la mezcla de politransfección 2.
      NOTA: Se supone que las concentraciones de plásmidos son de 150 ng/μL.
    2. Agregue 600 ng de plásmido de relleno al tubo sin control de color. Agregue 300 ng de mKO2 y 300 ng de plásmido de relleno al tubo de control de color mKO2. Agregue 300 ng de TagBFP y 300 ng de plásmido de relleno al tubo de control de color TagBFP.
    3. Agregue 300 ng de plásmido constitutivo NeonGreen y 300 ng de plásmido de relleno al tubo de control de color NeonGreen. Agregue 100 ng de mKO2, TagBFP y NeonGreen constitutivo, así como 300 ng de plásmido de relleno, al tubo de control de todo el color.
    4. Añadir 150 ng de mKO2 a la mezcla de politransfección 1 tubo. Agregue 75 ng de plásmido reportero NeonGreen y 75 ng de plásmido de relleno a la mezcla de politransfección 1 tubo.
    5. Añadir 150 ng de TagBFP a la mezcla de poli-transfección de 2 tubos. Agregue 75 ng de plásmido L7ae y 75 ng de plásmido de relleno al tubo de mezcla de politransfección 2.
  2. Cree la mezcla maestra de transfección en un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml combinando 216 μL de medio sérico reducido con 9,48 μL de reactivo de transfección (consulte la Tabla 1 para conocer las proporciones de reactivos y la escala de reacción). Mezclar bien pipeteando arriba y abajo, y reservar.
  3. Agregue 1.58 μL de reactivo potenciador a cada uno de los tubos sin control de color, control de color único y todos los tubos de control de color. Añadir 79 μL de reactivo potenciador a cada uno de los tubos de mezcla de politransfección. Mezclar cada tubo individualmente pipeteando vigorosamente.
  4. Agregue la mezcla maestra de transfección a cada tubo que contenga ADN.
    1. Agregue 37.58 μL de mezcla maestra de transfección a cada uno de los tubos sin control de color, control de color único y todos los tubos de control de color. Mezclar cada tubo individualmente pipeteando vigorosamente.
    2. Añadir 18,79 μL de mezcla maestra de transfección a cada uno de los tubos de mezcla de politransfección. Mezclar cada tubo individualmente pipeteando vigorosamente.
  5. Dispense las mezclas de transfección en los pozos.
    1. Pipetear 65,97 μL de cada mezcla de transfección para los controles sin color, de un solo color y de todos los colores en los pocillos correspondientes.
    2. Pipetear 32,98 μL de la mezcla de politransfección 1 en el pocillo de politransfección y agitar la placa rápida pero suavemente en un patrón apretado en forma de ocho a lo largo de una superficie plana para distribuir los complejos de manera efectiva. A continuación, pipetear 32,98 μL de la mezcla de politransfección 2 en el mismo pocillo de politransfección y agitar la placa de la misma manera.
  6. Colocar la placa en una incubadora a 37 °C, con un 5% deCO2 y sin agitar, durante un período de 48 h.
    NOTA: Para aumentar la viabilidad celular, los medios celulares se pueden reemplazar cada 6 h después de la transfección (aunque esto no siempre es necesario, y con las células HEK293 y sus derivados, se debe tener cuidado de no separar las células de la placa al cambiar el medio).
ReactivoImporteEscalada
Medio sérico reducido para la mezcla de ADN36 μL por tubo de control, 18 μL por tubo de politransfección0,05 μL Medio sérico reducido/ng de ADN por tubo, con un volumen adicional del 10-20% para tener en cuenta el pipeteo
ADN300-600 ng por tubo
P30001,58 μL por tubo de control, 0,79 μL por tubo de politransfección0,0022 μL P3000/ng de ADN por tubo, con un 10-20% adicional
Medio sérico reducido para Lipo master mix36 μL por tubo de control, 18 μL por tubo de politransfección0,05 μL de medio sérico reducido/ng de ADN total, con un volumen adicional del 10-20% para tener en cuenta el pipeteo
Reactivo de transfección y potenciador1,58 μL por tubo de control, 0,79 μL por tubo de politransfección0.0022 μL Lipofectamina 3000/ng ADN, con 10-20% extra

Tabla 1: Incrustación de reactivos para transfecciones. La tabla indica la proporción correcta de reactivo a incluir para la cantidad de ADN incluida en un solo pozo. Esto se puede usar para escalar reacciones de manera efectiva y formar mezclas maestras. Las cantidades de reactivo se han escalado para incluir un exceso del 20%.

3. Preparación de células para citometría de flujo

  1. Precaliente al menos 4,2 ml de la solución DMEM a 37 °C. Precaliente al menos 4,2 ml de tripsina y 4,2 ml de PBS a 37 °C. Mantenga la solución tampón de clasificación celular activada por fluorescencia (FACS) a 4 °C hasta que esté lista para usar.
  2. Resuspender las células en la solución tampón FACS (PBS suplementado con BSA al 1%, ácido etilendiaminotetraacético [EDTA] de 5 mM y azida de sodio al 0,1% [NaN3], para reducir la aglutinación; consulte la Tabla de materiales) como se describe a continuación.
    1. Aspirar y desechar los medios actuales en cada pozo. Dispense 5 ml de PBS en cada pocillo para lavar las células. Aspirar y desechar el PBS.
    2. Dispense 5 ml de tripsina en cada pocillo. Coloque el plato en una incubadora a 37 °C durante 3 minutos, o hasta que las células ya no se adhieran al plato. Devuelva la placa al gabinete de bioseguridad y diluya las soluciones celulares dispensando 5 ml de solución DMEM en cada pocillo.
    3. Para cada pocillo, mezcle la solución pipeteando suavemente hacia arriba y hacia abajo varias veces. Para cada pocillo, aspire todos los medios y colóquelos en un tubo cónico de 15 ml.
  3. Centrifugar las células a 300 x g durante 3 min para granularlas. Aspirar el medio, teniendo cuidado de no aspirar las células y desecharlo. En cada tubo, resuspender las células en 5 ml de solución tampón FACS, mezclando pipeteando suavemente hacia arriba y hacia abajo.
  4. Pase cada solución de suspensión celular a través de un colador (para eliminar grumos) en tubos cónicos de citometría de flujo separados. Mantenga estos tubos en hielo durante no más de 1 h y realice la citometría de flujo lo antes posible.

4. Realización de citometría de flujo

NOTA: El funcionamiento de un citómetro de flujo requiere una capacitación adecuada y el conocimiento de las tareas necesarias. Como el software y el equipo pueden variar y los usuarios deben ser entrenados en general, esta sección se refiere a operaciones específicas que son útiles para realizar.

  1. Primero, examine las células transfectadas con el control del plásmido de relleno (sin control de color) para seleccionar las características celulares y evitar anomalías (incluidos agregados, desechos, etc.). Si bien hay muchas combinaciones de parámetros para distinguir celdas, utilice las siguientes tres opciones generales como una buena manera de visualizar las características distintivas.
    1. Mire el área de dispersión lateral (escala logarítmica o lineal por preferencia/tipo de celda) frente al área de dispersión directa (escala lineal).
    2. Mire la altura de dispersión lateral (escala logarítmica) frente al ancho de dispersión lateral (escala lineal).
    3. Mire el ancho de dispersión hacia adelante (escala lineal) frente a la altura de dispersión hacia adelante (escala lineal).
  2. A continuación, observe los controles de un solo color. Utilice el control de todo el color para ajustar los voltajes del instrumento, de modo que las señales de cada proteína fluorescente se normalicen a unidades arbitrarias equivalentes (u.a.) de fluorescencia. A continuación, ejecute los controles de color único para cada proteína fluorescente, que se utilizan para establecer la matriz de compensación, lo que permite la corrección del sangrado.
    NOTA: Idealmente, el rango dinámico completo de los valores de fluorescencia debería ser visible. Se puede hacer una mayor normalización de las señales de proteínas fluorescentes mediante la conversión a unidades estandarizadas (por ejemplo, moléculas de fluoresceína equivalente [MEFL; ver Beal et al.15]). Para habilitar la conversión MEFL durante el análisis, ejecute perlas de calibración arco iris. Dicha calibración también es útil para reducir la variación de la señal de instrumento a instrumento y del día a día16.
  3. Haga funcionar el tubo de muestra de politransfección.
    NOTA: Siempre que sea posible, se recomienda ejecutar celdas de 1,000 x 10^ (^ = mezclas), ya que las politransfecciones de dimensiones superiores deben subdividirse en más contenedores durante el análisis, y cada contenedor necesita suficientes celdas (idealmente >10) para hacer comparaciones estadísticamente significativas.

5. Realización de análisis post-experimento

  1. Inicialmente, utilice los datos de los controles (y, si corresponde, las cuentas) para garantizar resultados precisos. Utilice una de las herramientas de software disponibles para realizar la activación de células vivas (utilizando las puertas descritas anteriormente), la compensación y la corrección de autofluorescencia.
    NOTA: Normalmente utilizamos código MATLAB personalizado (por ejemplo, https://github.com/jonesr18/MATLAB_Flow_Analysis o Cytoflow17), que tiene una interfaz gráfica de usuario y una biblioteca de Python adecuada para la fase de preprocesamiento y para el análisis de politransfección.
MétodoComplejong Marcador fluorescenteng L7ae (fracción)ng Reportero (fracción)ng ADN de relleno (fracción)Total (ng)
Politransfección 1600
→115075 (½)75 (½)300
→215075 (½)75 (½)300
Politransfección 2600
→115025 (1/6)125 (5/6)300
→2150125 (5/6)25(1/6)300

Tabla 2: Cantidades de ADN para poli-transfección demostradas en el protocolo, y un ejemplo de experimento de seguimiento con proporciones de plásmidos sintonizados. La mitad superior de la tabla muestra la composición de los plásmidos utilizados en un experimento simple de politransfección. La mitad inferior muestra la composición de un experimento actualizado que ajusta las proporciones de plásmidos para submuestrear mejor un espacio de concentración hipotético, donde el modulador de la expresión génica está en una proporción más óptima de 1: 5 en relación con su reportero, produciendo más células transfectadas para muestrear alrededor de esta relación.

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Results

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

En la Figura 1, comparamos la co-transfección con la poli-transfección. En una co-transfección, todos los plásmidos se entregan en la misma mezcla de transfección, lo que resulta en una alta correlación entre la cantidad de cada plásmido que recibe cualquier célula individual (Figura 1A). Si bien el número total de plásmidos entregados a cada célula varía significativamente, la fluorescencia de las dos proteínas reporteras en las células individuales en toda la ...

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Discussion

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Los métodos de creación rápida de prototipos, como el diseño asistido por computadora (CAD), el breadboard y la impresión 3D, han revolucionado las disciplinas mecánicas, eléctricas y de ingeniería civil. La capacidad de buscar rápidamente a través de muchas soluciones posibles a un desafío dado acelera enormemente el progreso en un campo. Creemos que la politransfección es una tecnología análoga para la ingeniería biológica, que permite la creación rápida de prototipos de circuitos genéticos. Además, otras tecnologías d...

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Disclosures

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

R.W. es cofundador de Strand Therapeutics y Replay Bio; R.W. y R.J. presentaron una patente provisional relacionada con un clasificador de tipo celular.

Acknowledgements

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Nos gustaría agradecer a los antiguos miembros de Weiss Lab que lideraron o contribuyeron al desarrollo del método de politransfección y su aplicación a los clasificadores celulares: Jeremy Gam, Bre DiAndreth y Jin Huh; otros miembros del laboratorio Weiss que han contribuido a un mayor desarrollo / optimización de métodos: Wenlong Xu, Lei Wang y Christian Cuba-Samaniego; Prof. Josh Leonard y miembros del grupo, incluidos Patrick Donahue y Hailey Edelstein, por probar la politransfección y proporcionar retroalimentación; y la profesora Nika Shakiba por invitar a este manuscrito y proporcionar comentarios. También nos gustaría agradecer a los Institutos Nacionales de Salud [R01CA173712, R01CA207029, P50GM098792]; Fundación Nacional de Ciencias [1745645]; Subvención de apoyo al Centro Oncológico (principal) [P30CCA14051, en parte] del NCI y de los Institutos Nacionales de la Salud [P50GM098792] para financiar este trabajo.

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Tubos cónicos Corning Falcon de 15 mlThermoFisher Scientific14-959-53A
Placa de Petri de 24 pocillosCualquier empresa de elección(no pirógeno, estéril, RNasa, DNasa, ADN y libre de pirógenos)
Albbúmina sérica bovinaCentrífuga NEBB9000S
Cualquier empresa de elecciónCapaz de exponer tubos Falcon de 15 ml a 300 rcf
Countess 3 Contador de células automatizadoThermoFisher ScientificAMQAX2000
Countess Portaobjetos de cámara de recuento de célulasThermoFisher ScientificC10228
CytoflowPaquetehttps://cytoflow.readthedocs.io/en/stable/# 
DMEMVWR10-013-CVUtilice el medio correcto para su tipo de célula
EDTA ThermoFisher Scientific03690-100ML
Suero fetal bovinoSigma AldrichF4135
Células HEKATCCCRL-1573Utilice el tipo de célula correspondiente para sus experimentos. Las células HEK tienden a transfectar de manera muy eficiente.
Celdas HeLaATCCCRL-12401Utilice el tipo de célula correspondiente para sus experimentos.
Lipofectamina 3000 y potenciador P3000ThermoFisher ScientificL3000001Utilice el reactivo correcto para su tipo de célula; reactivo de transfección y potenciador
LSRFortessa citómetro de flujoBD BiosciencesN/A
MEM Solución de aminoácidos no esencialesGibco11140050
Tubos de microcentrífuga, 1,5 mLCualquier empresa de su elección
Opti-MEMThermoFisher Scientific31985070medio sérico reducido
Solución salina tamponada con fosfatoThermoFisher Scientific70011044
Rainbow Perlas de calibraciónSpherotechURCP-100-2H
Azida sódicaSigma AldrichS2002
TripsinaVWR25-053-CI
de software no comercial

References

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