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Neuroscience
Producción de neuronas humanas inducibles por neurogenina 2 en un biorreactor de suspensión tridi...

Research Article

Producción de neuronas humanas inducibles por neurogenina 2 en un biorreactor de suspensión tridimensional

DOI: 10.3791/65085

March 17, 2023

Jeanette Wihan1, Isabell Karnatz1, Isabelle Sébastien1, Ralf Kettenhofen1, Benjamin Schmid2, Christian Clausen2, Benjamin Fischer1, Rachel Steeg3, Heiko Zimmermann1,4,5,6, Julia C. Neubauer1,4

1Fraunhofer Project Center for Stem Cell Process Engineering,Fraunhofer Institute for Biomedical Engineering IBMT, 2Bioneer A/S, 3Fraunhofer UK Research Ltd, Technology and Innovation Centre, 4Fraunhofer Institute for Biomedical Engineering IBMT, 5Department of Molecular and Cellular Biotechnology,Saarland University, 6Facultad de Ciencias del Mar,Universidad Católica del Norte

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In This Article

Summary Abstract Introduction Protocol Representative Results Discussion Disclosures Acknowledgements Materials References Reprints and Permissions

Erratum Notice

Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice

Retraction Notice

The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice

Summary

Este artículo describe un protocolo para la generación de neuronas derivadas de células madre pluripotentes inducidas por humanos en un biorreactor de suspensión 3D de sobremesa.

Abstract

La derivación de células de linaje neuronal a partir de células madre pluripotentes inducidas por humanos (hiPSC) marcó un hito en la investigación del cerebro. Desde su primer advenimiento, los protocolos se han optimizado continuamente y ahora se utilizan ampliamente en la investigación y el desarrollo de fármacos. Sin embargo, la larga duración de estos protocolos convencionales de diferenciación y maduración y la creciente demanda de hiPSC de alta calidad y sus derivados neuronales plantean la necesidad de la adopción, optimización y estandarización de estos protocolos para la producción a gran escala. Este trabajo presenta un protocolo rápido y eficiente para la diferenciación de hiPSCs genéticamente modificadas que expresan neurogenina 2 (iNGN2) inducibles por doxiciclina en neuronas utilizando un biorreactor de suspensión tridimensional (3D) de sobremesa.

En resumen, se permitió que las suspensiones unicelulares de iNGN2-hiPSCs formaran agregados dentro de las 24 h, y el compromiso del linaje neuronal se indujo mediante la adición de doxiciclina. Los agregados se disociaron después de 2 días de inducción y las células fueron criopreservadas o rechapadas para la maduración terminal. Las neuronas iNGN2 generadas expresaron marcadores neuronales clásicos desde el principio y formaron redes neuríticas complejas dentro de 1 semana después del replacado, lo que indica una madurez creciente de los cultivos neuronales. En resumen, se proporciona un protocolo detallado paso a paso para la generación rápida de neuronas derivadas de hiPSC en un entorno 3D que tiene un gran potencial como punto de partida para el modelado de enfermedades, exámenes fenotípicos de fármacos de alto rendimiento y pruebas de toxicidad a gran escala.

Introduction

Los trastornos neurológicos son la principal causa de discapacidad en todo el mundo1. Una de cada seis personas se ve afectada, y la incidencia sigue aumentando. La carga financiera asociada para las sociedades y sus sistemas de atención de la salud es enorme. Una evaluación de 30 países europeos en 2010 estimó los costes anuales de 800.000 millones de euros relacionados con trastornos mentales y neurológicos2. La creciente carga socioeconómica exige estrategias de tratamiento efectivas, y aunque nuestra comprensión de la fisiopatología de la enfermedad ha aumentado sustancialmente, la traducción a las clínicas a menudo es insuficiente. En general, solo el 12% de los productos farmacéuticos entran en ensayos clínicos, de los cuales más del 80% fracasan en etapas posteriores, principalmente debido a la ineficacia o toxicidad imprevista 3,4. Las razones son variadas, pero la transferibilidad limitada de las pruebas con animales en etapas preclínicas a los ensayos en humanos ha pasado a primer plano cada vez más5. Los modelos humanos de células y tejidos in vitro pueden cerrar la brecha de la traducción entre especies, y los avances en la tecnología de células madre pluripotentes inducidas por humanos (hiPSC) poseen un gran potencial en este sentido. Las hiPSC son ampliamente utilizadas en la investigación básica y comparten características esenciales con las células madre embrionarias (hESCs), como una capacidad de autorrenovación casi ilimitada y la capacidad de diferenciarse en las tres capas germinales6, al tiempo que eluden las preocupaciones éticas asociadas con la destrucción embrionaria.

La derivación de células neuronales a partir de hESCs, y más tarde hiPSCs, marcó un hito en la investigación del cerebro. Los protocolos iniciales de diferenciación se basaron en la aplicación de factores de crecimiento que imitan pasos críticos durante la embriogénesis, la mayoría de ellos con doble inhibición de SMAD en cultivos en suspensión o adherentes 7,8,9. Las neuronas maduras se han generado con éxito, pero varios inconvenientes de estos protocolos aún dificultan su amplio uso en el desarrollo de fármacos, como el bajo rendimiento y la alta variabilidad de lote a lote de las neuronas generadas, así como la extensa carga de trabajo relacionada con los largos tiempos de cultivo. Se han logrado mejoras mediante la expresión forzada de factores de transcripción críticamente implicados en la neurogénesis, y los miembros de la familia de las neurogeninas (NGN), en particular la NGN2, han sido identificados como impulsores efectivos10. La expresión ectópica mediada por lentivirus de NGN2 en hiPSCs aceleró significativamente las primeras etapas de la diferenciación neuronal e indujo el destino celular neuronal en solo 1 semana11. La maduración terminal posterior en cocultivos con astrocitos produjo neuronas funcionales en alta pureza y cantidad con propiedades reproducibles. Luego se aplicó la edición génica dirigida al sitio del locus de puerto seguro del sitio de integración de virus adenoasociados 1 (AAVS1) para crear líneas hiPSC con un casete de expresión estable e inducible por doxiciclina para NGN212,13, minimizando así los efectos secundarios no deseados de la administración lentiviral.

La diferenciación robusta y eficiente de las neuronas de neurogenina 2 inducibles por doxiciclina (iNGN2) tiene un gran potencial para los exámenes fenotípicos de fármacos de alto rendimiento y los ensayos de toxicidad10,14,15; y se han logrado avances sustanciales en el bioprocesamiento durante la última década implementando biorreactores para una expansión y diferenciación celular escalable16,17,18,19. Sin embargo, la mayoría de los protocolos de diferenciación están optimizados para culturas adherentes, y la traducción a un entorno tridimensional (3D) a menudo requiere modificaciones esenciales. Recientemente, se ha reportado el uso exitoso de un biorreactor 3D de sobremesa con características de esfuerzo cortante reducido para la expansión de hiPSCs y para la diferenciación reproducible en hepatocitos, cardiomiocitos y neuronas20. Aquí, se proporciona un protocolo detallado para la generación y caracterización de neuronas iNGN2 utilizando el biorreactor 3D de sobremesa idéntico.

Protocol

NOTA: Todas las manipulaciones celulares, así como las placas de cultivo y las preparaciones del medio, deben realizarse en condiciones estériles. La campana de flujo laminar debe limpiarse a fondo antes de su uso y después del procesamiento limpiando todas las superficies con etanol al 70%. El protocolo descrito está optimizado para diferenciaciones neuronales en una Incubadora y Biorreactor 3D CERO (en lo sucesivo denominado biorreactor de sobremesa). Este biorreactor de sobremesa ofrece cuatro ranuras para tubos de biorreactores especializados, cada uno con una capacidad máxima de 50 ml. La temperatura y los niveles deCO2 se controlan continuamente, y los parámetros de cultivo (por ejemplo, velocidad y tiempo de rotación) se regulan para cada tubo de forma independiente. Todos los pasos de aspiración se han realizado utilizando una pipeta de aspiración y una bomba de vacío, si no se indica lo contrario.

1. Cultivo y expansión de hiPSCs

NOTA: En este protocolo se utiliza la línea NGN2 hiPSC bionª inducible por doxiciclina El protocolo de expansión proporcionado aquí está optimizado para placas de Petri de 6 cm, pero se pueden usar formatos de cultivo alternativos si se prefiere.

  1. Cubrir las placas de Petri de 6 cm con la matriz de la membrana basal diluida en el medio de Eagle modificado de Dulbecco (DMEM)/F12 (-/-) a una concentración final de 0,083 mg/ml/10 cm2. Incubar los platos recubiertos a 37 °C durante al menos 30 min.
    NOTA: Puede encontrar un protocolo detallado para la preparación de la solución de matriz de membrana basal en las instrucciones del fabricante. Las hiPSCs se pueden cultivar en matrices extracelulares alternativas para su expansión.
  2. Descongelar hiPSCs criopreservados según el EBiSC Cell line UserProtocol 21 en medio de mantenimiento iPSC sin alimentador + inhibidor ROCK de 10 μM (Y-27632). Se recomienda una densidad de siembra de 1 × 106 células viables por plato de 60 mm.
  3. Cambie el medio al día siguiente a un medio de mantenimiento iPSC sin alimentador sin inhibidor de ROCK, y realice cambios diarios de medios.
  4. Comience a pasar cuando los cultivos hiPSC alcancen una confluencia del 60%-80%. Verifique las áreas diferenciadas y limpie las colonias manualmente si el área supera el 5%.
    NOTA: Las hiPSC indiferenciadas aparecen como células redondas con un nucléolo prominente y menos citoplasma. Las colonias planas y apretadas se forman temprano después de la descongelación o el paso. En la Figura 1 se muestran imágenes ejemplares de campo claro de cultivos hiPSC. Se proporciona más información en el Protocolo de usuario de línea celular EBiSC21. Para el paso, prepare platos recubiertos con matriz de membrana basal y medio de mantenimiento iPSC sin alimentador.
  5. Aspirar el medio a partir de cultivos de hiPSC y enjuagar las células 2x con ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) 0,5 mM en 1x solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco (DPBS) sin Ca 2+ y Mg2+ (DPS [-/-], ver Tabla de materiales).
  6. Retire el sobrenadante y agregue 2 ml de EDTA de 0,5 mM en 1x DPBS (-/-) a las placas de Petri de 6 cm. Incubar las células a 37 °C durante 3 min en la incubadora.
  7. Aspirar 1,5 ml de la solución de EDTA y continuar la incubación durante 3-5 min.
  8. Golpee suavemente los platos para facilitar el desprendimiento de células.
    NOTA: Verifique el desprendimiento mediante evaluación visual. Las colonias de hiPSC deben comenzar a desprenderse después de 5 minutos, pero puede ser necesario un tiempo de incubación más largo con cultivos de hiPSC de mayor confluentidad. Si las colonias no se desprenden, aumente el tiempo de incubación hasta 10 minutos, pero no exceda este marco de tiempo.
  9. Añadir 5 ml de medio de mantenimiento iPSC sin alimentador a las placas de Petri de 6 cm y resuspender suavemente las colonias 2x con una pipeta serológica de 10 ml o utilizando puntas de pipeta de gran calibre. Transfiera las células a un tubo de 15 ml.
    NOTA: las hiPSC son altamente sensibles al estrés mecánico; Por lo tanto, se debe evitar la resuspensión múltiple. La suspensión celular final debe consistir en pequeños fragmentos de colonia (50-200 μm).
  10. Aspirar el sobrenadante de las placas de cultivo recubiertas y preparar 4 ml de medio de mantenimiento iPSC sin alimentador por plato de 6 cm.
  11. Transfiera pequeños fragmentos de colonia a los platos de cultivo recién preparados en proporciones divididas de 1:10 a 1:40, y cultive a 37 °C y 5% deCO2 con cambios diarios de medios.
    NOTA: Las colonias pequeñas deben adherirse dentro de 1 o 2 h después del paso.

Figure 1
Figura 1: Morfología de cultivos de células madre pluripotentes inducidos por humanos . (A,B) Cultivos de hiPSC de buena calidad de diferentes confluencias que muestran colonias compactas de hiPSC con una morfología homogénea y aristas definidas. (C) cultivo de hiPSC con grupos emergentes de células diferenciadas alrededor de los bordes de la colonia (línea blanca discontinua). Barra de escala = 200 μm. Abreviatura: hiPSC = célula madre pluripotente inducida por humanos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

2. Precultivo de hiPSCs en el sistema de biorreactor de sobremesa (día-2)

NOTA: Comience el precultivo cuando los cultivos hiPSC alcancen una confluencia entre 60% y 80%. Verifique las colonias de hiPSC para ver las áreas diferenciadas. Durante esta fase de precultivo, las hiPSC se mantienen en un medio de mantenimiento iPSC sin alimentador durante 2 días.

  1. Preparar el medio de cultivo, que consiste en medio de mantenimiento iPSC sin alimentador e inhibidor ROCK de 10 μM (Y-27632).
  2. Aspire el medio completamente de las hiPSC y enjuague suavemente las celdas con 1x DPBS (-/-) dos veces.
  3. Añadir 2,0 ml de solución de tripsina-EDTA precalentada a las placas de Petri de 6 cm e incubar las células durante 3 min a 37 °C en la incubadora.
  4. Golpee suavemente los platos para facilitar el desprendimiento de células, o incube durante 1-2 minutos más.
  5. Resuspender las células en 5 ml de medio de mantenimiento iPSC sin alimentador + inhibidor ROCK por placa. Transfiera la suspensión celular a un tubo de 15 ml o 50 ml y mezcle suavemente pipeteando para garantizar la singularización celular.
  6. Determine el número de células en 100 μL de suspensión celular utilizando un contador de células automatizado como se describió anteriormente20. Transfiera el volumen correspondiente para 15 × 106 células por tubo de biorreactor a un tubo de 50 ml.
  7. Centrifugar las células a 300 × g durante 3 min.
  8. Aspirar el sobrenadante y resuspender las células en 2 ml de medio de mantenimiento iPSC libre de alimentador + inhibidor de ROCK.
  9. Llene cada tubo de 50 ml con 18 ml de medio (densidad de siembra celular de 0,75 × 106 células/ml). Dispensar la suspensión celular en los tubos del biorreactor (20 ml por tubo).
  10. Coloque los tubos en el sistema del biorreactor. Establezca los siguientes parámetros de cultivo: período de rotación de 2 s, velocidad de rotación de 60 rpm, sin pausa de agitación, 37 °C y 5% deCO2 para una duración ilimitada20.
  11. Inicie el programa de cultivo a través de la pantalla del biorreactor.
  12. Cambie los medios al día siguiente. Deje que los agregados se asienten en los tubos del biorreactor durante ~ 5 min. Aspire cuidadosamente el sobrenadante.
    NOTA: No permita que los agregados se asienten durante más de 10 minutos, ya que podrían adherirse entre sí y crear una suspensión de agregados heterogéneos. Se recomienda dejar ~5 mL de medio de cultivo en el tubo del biorreactor.
  13. Añadir 15 ml de medio de mantenimiento iPSC fresco sin alimentador sin inhibidor de ROCK por tubo, y continuar el cultivo en el biorreactor de sobremesa durante 24 h.

3. Diferenciación de hiPSCs en neuronas tempranas (día 0)

  1. Preparar medio neurobasal (NBM): 50% DMEM/F-12 con L-alanil-L-glutamina dipéptido estabilizado, 50% medio neurobasal, 0.5x suplemento sin suero (50x), 0.5x suplemento sin suero basado en la formulación N-1 de Bottenstein (100x), 0.5x dipéptido estabilizado L-alanil-L-glutamina, solución de aminoácidos no esenciales 0.5x MEM (100x), piruvato de sodio 500 nM (100 mM), 50 nM 2-mercaptoetanol (50 mM), solución de insulina humana al 0.025% y 5 U/ml penicilina-estreptomicina.
    NOTA: NBM debe almacenarse a 4 °C y puede utilizarse hasta 2 semanas.
  2. Comience la diferenciación neuronal agregando doxiciclina (DOX) a los cultivos de hiPSC. Para esto, deje que los agregados se asienten en los tubos del biorreactor. Aspire cuidadosamente el sobrenadante de las células, dejando ~ 5 ml en el tubo, y agregue 35 ml de medio de inducción neural (NIM) que consiste en NBM y 2 μg / ml DOX.
    NOTA: Como DOX es sensible a la luz, se recomienda apagar la luz mientras trabaja.
  3. Coloque los tubos de nuevo en el biorreactor de sobremesa y continúe el cultivo.
  4. Realice cambios de medios todos los días durante 2 días, como se describe en el paso 3.2.
    NOTA: Después de 4 días en cultivo en suspensión, los agregados pueden disociarse y las neuronas tempranas pueden criopreservarse o replatearse directamente para la maduración terminal.

4. Criopreservación de neuronas tempranas (día 2)

NOTA: La criopreservación no es necesaria y no es crítica para el proceso de diferenciación, pero es muy recomendable ya que se pueden producir y almacenar grandes reservas de neuronas tempranas para su posterior maduración y análisis.

  1. Deje que los agregados se asienten en el tubo del biorreactor. Aspire el sobrenadante como se describió anteriormente.
  2. Transfiera los agregados a un tubo estéril de 15 ml o 50 ml y enjuague suavemente los agregados 2x con 1x DPBS (-/-). Aspire cuidadosamente el sobrenadante tanto como sea posible sin alterar los agregados.
  3. Añadir 2-5 ml de enzima de disociación celular precalentada, dependiendo del tamaño del pellet, e incubar las células durante aproximadamente 10 min a 37 °C en un baño maría. Resuspender suavemente los agregados sedimentados cada 2 min hasta que los agregados se disocien.
    NOTA: Se debe obtener una suspensión celular casi homogénea después de 7-10 minutos de incubación.
  4. Agregue el triple volumen de medio NBM precalentado y resuspenda las células cuidadosamente para asegurar la singularización celular.
  5. Determine el número de células y transfiera el volumen correspondiente para la criopreservación a un tubo de 15 ml o 50 ml.
    NOTA: Se recomienda una densidad celular de 5-10 × 106 células/ml de medio de congelación.
  6. Centrifugar las células a 300 × g durante 3 min.
  7. Aspire el sobrenadante y resuspenda suavemente el pellet celular en el volumen correspondiente de medio de congelación que contenga 10% de dimetilsulfóxido (DMSO).
  8. Alícuota la suspensión celular en viales adecuados para la criopreservación (1 mL/vial).
  9. Transfiera los viales inmediatamente a un recipiente de congelación preenfriado de velocidad lenta lleno de 2-propanol y coloque el recipiente a -80 °C durante la noche. Colocar los viales a -150 °C al día siguiente para su almacenamiento a largo plazo.
    NOTA: El líquido 2-Propanol es altamente inflamable y puede causar daño ocular al contacto. Manténgase alejado del calor y use guantes protectores, así como gafas.

5. Maduración de neuronas derivadas de hiPSC en cultivos monocapa

  1. Preparar placas de cultivo recubiertas de poli-L-ornitina/laminina para el cultivo a largo plazo de neuronas derivadas de hiPSC.
    1. Diluir la solución madre de poli-L-ornitina al 0,001% en 1x DPBS (-/-) y cubrir los platos durante la noche a 4 °C, o durante 4 h a 37 °C. Aspire la solución de poli-L-ornitina y lave las placas una vez con 1x DPBS (-/-).
    2. Diluir la solución de laminina en 1x DPBS (-/-) hasta una concentración final de 10 μg/ml e incubar los platos durante la noche a 4 °C, o durante 4 h a 37 °C.
      NOTA: Se recomienda un volumen de 0.1-0.15 ml por cm 2 para los procedimientos de recubrimiento y 0.2 ml por cm2 para todos los pasos de lavado respectivos. Se pueden utilizar sustratos de recubrimiento alternativos, pero se deben evaluar los efectos potenciales sobre la unión celular y la maduración.
  2. Descongelar las células criopreservadas. Para ello, coloque el criovial en un baño maría (ajustado a 37 °C) y gírelo durante aproximadamente 1 min, hasta que quede un pequeño grupo de suspensión de células congeladas.
  3. Transfiera cuidadosamente la suspensión celular gota a gota a un tubo de 15 ml preparado con 10 ml de NBM precalentado. Enjuague el criovial con 1 ml de NBM y transfiera la suspensión celular al tubo idéntico de 15 ml.
  4. Centrifugar las células a 300 × g durante 3 min.
  5. Aspirar el sobrenadante y añadir 1-2 ml de NIM suplementado con 10 μM inhibidor de ROCK.
  6. Resuspenda el pellet celular con cuidado y determine el número de células.
  7. Aspirar la solución de laminina restante de las placas de cultivo celular recubiertas y sembrar las células a una densidad de siembra de 1 × 105 células/cm2 en NIM suplementado con un inhibidor ROCK de 10 μM.
  8. Cambie el medio después de 24 h a NIM sin inhibidor de ROCK.
  9. Realizar cambios medios diarios durante 4 días.
  10. Después de esta fase inicial de inducción de NGN2, omitir el DOX y cultivar las células en NBM, con cambios de medio 2x a la semana hasta alcanzar la etapa de maduración deseada.
    NOTA: Se recomienda el cocultivo de neuronas iNGN2 con astrocitos para aumentar la supervivencia celular, la unión, la madurez y la actividad eléctrica13,22.

6. Caracterización de neuronas derivadas de hiPSC

NOTA: La diferenciación en derivados neuronales puede evaluarse mediante las siguientes técnicas.

  1. Inmunocitoquímica e imágenes
    1. Aspirar el medio de las neuronas derivadas de hiPSC y lavar las células una vez con 1x DPBS con Ca 2+ y Mg2+ (+/+).
      NOTA: Pipetear cuidadosamente, preferentemente en los bordes del pozo, ya que las células pueden desprenderse muy fácilmente de la superficie. Se recomienda un volumen de 0,2 ml por cm2 para todos los pasos de lavado para garantizar una cobertura completa de las celdas con 1x DPBS (+/+).
    2. Fijar las células neuronales utilizando una solución de fijación que contenga paraformaldehído al 4% en DPBS (+/+) durante 15 min a temperatura ambiente (RT). Se recomienda un volumen de 0,1 mL porcm2 .
      NOTA: El paraformaldehído (4%) en DPBS es una solución peligrosa e irritante de la piel con toxicidad aguda y carcinogenicidad potencial. Manténgase alejado del calor, use guantes y anteojos protectores, evite la inhalación y use la solución solo en un ambiente ventilado.
    3. Enjuague suavemente las celdas 2 veces en 1x DPBS (+/+) y proceda con la tinción.
      NOTA: Las celdas fijas se pueden almacenar en DPBS (+/+) a 4 °C durante un máximo de 1 mes hasta su posterior procesamiento.
    4. Aspirar el DPBS (+/+) a partir de muestras. Permeabilizar las células y bloquear sitios de unión no específicos con 1x DPBS (+/+) que contiene 1% BSA y 0,2% Triton-X-100 durante 60 min en RT.
      NOTA: Se recomienda un volumen de 0,2 mL porcm2 .
    5. Retirar el sobrenadante e incubar las células durante la noche a 4 °C, con los respectivos anticuerpos primarios diluidos en tampón de tinción (1x DPBS [+/+] que contiene 1% de BSA) (ver Tabla de materiales). Asegúrese de que las células estén completamente cubiertas por la solución.
      NOTA: Se recomienda un volumen de 0.1-0.15 mL por cm2 .
    6. Aspire el tampón de tinción y enjuague las células 3 veces en 1x DPBS (+/+).
    7. Diluir los anticuerpos secundarios correspondientes (ver Tabla de materiales) en tampón de tinción a una concentración final de 1:1.000.
    8. Incubar las células en solución de anticuerpos diluidos durante 1 h a RT en la oscuridad. Asegúrese de que las células estén completamente cubiertas por la solución.
      NOTA: Se recomienda un volumen de 0.1-0.15 mL por cm2 .
    9. Aspirar la solución de anticuerpos secundarios y enjuagar las células 2x en 1x DPBS (+/+).
    10. Contrarrestar la tinción de los núcleos con 4',6-diamidino-2-fenilindol (DAPI), diluido en DPBS (+/+) durante 5 min a RT.
      NOTA: Se recomienda un volumen de trabajo de 0.1-0.15 mL por cm2 .
    11. Enjuague las celdas 2 veces en 1x DPBS (+/+).
    12. Almacene las células en DPBS (+/+) a 4 °C hasta obtener imágenes.
      NOTA: Las imágenes de campo claro son adecuadas para rastrear los cambios morfológicos y el crecimiento de neuritas. Además, la expresión de marcadores estereotipados puede evaluarse mediante microscopía de fluorescencia. Mientras que las hiPSC indiferenciadas expresan OCT 3/4 y NANOG, la beta-III-tubulina (TUBB3) y la proteína 2 asociada a microtúbulos (MAP2) pueden servir como marcadores neuronales para visualizar neuritas y axones. La red neurítica se puede evaluar aún más determinando la longitud de la neurita en imágenes de campo claro o fluorescentes.
  2. Análisis de expresión génica mediante reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qPCR)
    1. Aspire el medio y enjuague las células una vez en 1x DPBS (-/-).
      NOTA: Se recomienda un volumen de 0,2 mL porcm2 .
    2. Agregue tampón de lisis de ARN frío y coseche las células rascando.
    3. Aísle el ARN utilizando un kit adecuado basado en columnas y determine las concentraciones de ARN mediante fotoespectrometría UV.
    4. Generar ADNc utilizando 250 ng de ARN total y un kit adecuado para la transcripción inversa.
    5. Preparar reacciones de qPCR de baliza molecular que contengan 2,5 ng de ADNc por duplicado. Utilice una mezcla maestra apropiada y los ensayos de imprimación correspondientes20 (consulte la Tabla de materiales).
    6. Ejecutar la qPCR aplicando 45 ciclos con recocido de imprimación a 60 °C durante 20 s.
    7. Normalizar los niveles relativos de expresión génica a la media de los genes de mantenimiento GAPDH, HPRT1 y GUSB. Aplicar el método ΔΔCt23, utilizando hiPSCs indiferenciadas como calibrador.

Representative Results

Durante los pasos iniciales, los cultivos adherentes de hiPSCs se separan, singularizan y transfieren a suspensión (Figura 2). Los agregados se forman en 24 h y crecen continuamente en tamaño. Después de 2 días de inducción transgénica, las neuronas tempranas pueden ser criopreservadas para experimentos posteriores.

La proliferación persistente durante los primeros días en suspensión produce un aumento en el número de células, alcanzando su pico después de 2 días de inducción (Figura 3A, B). Junto con la proliferación, los agregados comienzan a crecer. En comparación con el día 0, el diámetro muestra un aumento del 50% en el día 2, y casi se duplica en el día 5 (Figura 3D). Aunque un diámetro creciente limita el suministro de nutrientes dentro de los agregados, la viabilidad de las células no se ve afectada en el día 2 o en el día 5 de diferenciación (Figura 3C). Sin embargo, un cultivo prolongado durante más de 4 días en suspensión no mejora aún más el rendimiento celular, ya que los agregados se vuelven cada vez más resistentes a la singularización enzimática (Figura 3B).

Tras la criopreservación, las células del día 2 se descongelan y se colocan en platos recubiertos de poli-L-ornitina (PLO) laminina para su maduración terminal. En general, las células se adhieren muy bien después de la descongelación y comienzan a extender las neuritas desde el principio. El perfil de expresión génica temporal, así como la tinción inmunocitoquímica para los marcadores neuronales TUBB3 y MAP2, confirma la identidad celular neuronal (Figura 4A,B). Además del aumento de los niveles de TUBB3 y MAP2, los cultivos neuronales están enriquecidos en transcripciones de proteínas tau asociadas a microtúbulos (MAPT), que codifican una proteína neuronal implicada en la estabilización del axón, y muestran una disminución concomitante en la expresión del factor de transcripción regulador de la pluripotencia POU5F1. Además, se forma una densa red neurítica dentro de la primera semana después de la descongelación (Figura 4C). Estos cambios morfológicos, junto con el perfil transcripcional, sugieren una maduración creciente de los cultivos neuronales.

Figure 2
Figura 2: Generación de neuronas iNGN2 derivadas de hiPSC utilizando un biorreactor de sobremesa. (A) Visión general esquemática del paradigma de diferenciación, destacando los pasos clave del cultivo celular. (B-F) Las imágenes de campo claro visualizan (B) hiPSCs y (C,D) la formación de agregados en el biorreactor de sobremesa. (E,F) Las neuronas iNGN2 extienden las neuritas y sufren cambios morfológicos durante la diferenciación. Barra de escala = 100 μm. Abreviaturas: BMM = matriz de membrana basal; iPSC-MM = medio de mantenimiento iPSC; PLO = poli-L-ornitina. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figure 3
Figura 3: Rendimiento celular y viabilidad durante la formación y el crecimiento agregado. (A) Las imágenes de campo claro muestran la formación de agregados dentro de los 2 días posteriores al cultivo en el biorreactor de sobremesa, así como el aumento en el tamaño del agregado con el tiempo. Barra de escala = 500 μm. (B) Cuantificación del rendimiento celular y (C) viabilidad sobre el curso de diferenciación. Los gráficos de barras representan la media + SD de cuatro experimentos independientes. (D) El diámetro, indicativo del tamaño de los agregados, se determinó semiautomáticamente utilizando el software de código abierto ImageJ (versión 1.53). Primero, las imágenes de campo claro se convirtieron en imágenes binarias y luego se evaluaron más a fondo utilizando la herramienta analizar partículas, aplicando los siguientes parámetros: tamaño > 2.500 μm2, circularidad 0.45-1, excluir bordes e incluir agujeros. Las líneas horizontales indican la media ± DE de cinco diferenciaciones independientes. Los puntos individuales representan la media de los experimentos de diferenciación individuales con al menos 20 agregados por punto de tiempo. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figure 4
Figura 4: Caracterización de neuronas iNGN2 derivadas de hiPSC. Perfil de expresión génica temporal para los genes neuronales TUBB3, MAP2 y MAPT, así como el gen pluripotente asociado a células madre POU5F1. Los niveles de expresión relativos se normalizaron a los genes de referencia GAPDH, HPRT1 y GUSB. Se eligieron hiPSC indiferenciadas (día-2) como calibrador. Los símbolos geométricos indican la media ± SD de cuatro diferenciaciones independientes. (B) Imágenes representativas de neuronas iNGN2 en el día 7 después de la descongelación (día-2 + 7), teñidas para beta-III-tubulina (TUBB3, magenta) y proteína 2 asociada a microtúbulos (MAP2, cian). Los núcleos celulares fueron teñidos con DAPI. Barras de escala = 100 μm. (C) Evaluación de la red neurítica en imágenes de campo claro de cultivos neuronales después de la descongelación. La longitud total de las neuritas se determinó en un área de 930,82 × 698,11μm2 utilizando ImageJ (versión 1.53). Después de ajustar el brillo y el contraste, las imágenes se convirtieron en imágenes de 8 bits y los colores se invirtieron. Las neuritas fueron posteriormente esqueletizadas y luego analizadas usando los plugins de ImageJ 'Skeletonize' y 'Analyze Skeleton', respectivamente. La longitud total de las neuritas se dividió por el número de somas en la región de interés para obtener la longitud / célula promedio de neurita. Los gráficos de barras representan la media + SD de tres experimentos independientes. Abreviaturas: DAPI = 4',6-diamidino-2-fenilindol. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Discussion

Los autores declaran que no hay intereses contrapuestos.

Disclosures

Este artículo describe un protocolo para la generación de neuronas derivadas de células madre pluripotentes inducidas por humanos en un biorreactor de suspensión 3D de sobremesa.

Acknowledgements

El proyecto EBiSC2 ha recibido financiación de la Empresa Común (JU) de la Iniciativa sobre Medicamentos Innovadores 2 en virtud del acuerdo de subvención nº 821362. La Empresa Conjunta recibe apoyo del programa de investigación e innovación Horizonte 2020 de la Unión Europea y de la EFPIA. Agradecemos a Nadine J. Smandzich, Helene D. M. Hemmer, Johnn-Majd Balsters y Vanessa M. Nalewaja por su ayuda en los análisis inmunocitoquímicos y de expresión génica, así como a Heike Arthen por su excelente apoyo técnico. Además, agradecemos a Stephanie Bur por el establecimiento del programa de biorreactores. La figura 2A se creó con BioRender.com.

Materials

1152892610400745Biorender.com12330023123335531114003510095714 sin 554723 11620099 11620099
2-Mercaptoetanol 50 mMGibco 
60 mm Nunclon Delta SurfaceNunc734-2040
Anticuerpo anti-beta III Tubulina [TU-20] (dilución 1:1.000)Abcam   AB7751 
Biosistemas Aplicados  Kit de transcripción inversa de ADNc de alta capacidadThermo Fisher Scientific   
Suplemento B-27 (50x) Gibco11530536suplemento sin suero (50x)
BIONi010-C-13 línea hiPSCBanco Europeo para Células Madre pluripotentes inducidas (EBiSC), BIONEER como depositanteSAMEA103988285Bioneer es depositante en EBiSC y propietario de la línea hiPSC.
Biorender 
Grado de cultivo celular BSAThermo Fisher Scientific   
Incubadora 3D CERO & BiorreactorOLS OMNI Life Science2800000
CEROtubes Tubos de cultivo celular 50mL OLS OMNI Life Science2800005
Citavi 6Swiss Academic Software
CryoStor CS10Stemcell7930medio de congelación que contiene 10% DMSO
Solución de fijación Cytofix BDBiosciences 554655solución de fijación que contiene un 4% de paraformaldehído 
DAPI (TINCIÓN DE CÉLULAS FIJAS NUCBLUE) Thermo Fisher Scientific   
Clorhidrato de doxiciclina (DOX)Sigma-AldrichD3447
DPBS sin Calcio y Magnesio (DPBS -/-) Gibco14190250
DPBS con Calcio y Magnesio (DPBS +/+) Gibco11580456
DMEM/F12 (-/-)Gibco21331-020
DMEM/F-12, Suplemento GlutaMAXGibco31331-028
EVOS XL Sistema de Adquisición de ImágenesCelulares Thermo Fisher Scientific
Goat anti-Mouse IgG (H+L) Anticuerpo secundario altamente adsorbido cruzado, Alexa Fluor 555Thermo Fisher Scientific   A21424
Suplemento GlutaMAX Gibco 35050-038L-alanil-L-glutamina dipéptido estabilizado
ImageJ 1.51v Instituto Nacional de Salud
Solución de insulina humanaSigma-AldrichI9278l
LamininaMerckL2020
MACSQuante AnalizadorMiltenyi
MAP2 Anticuerpo monoclonal (dilución 1: 300)Thermo Fisher Scientific   13-1500  
Matrigel Factor de crecimiento reducido, libre de fenol-rojo Ciencias de la Vida de Corning 356231matriz de membrana basal
MEM Solución de aminoácidos no esenciales (100x)Gibco 
Kit de película adhesiva óptica MicroAmp Thermo Fisher Scientific   
mTeSR1Stemcell85850alimentador iPSC medio de mantenimiento 
N-2 Suplemento (100x)Gibco17502-048Suplemento sin sérum a base de Bottenstein' s Formulación N-1
Medio NeurobasalGibco11570556
Nikon Eclipse TS2Nikon Instruments Europe B.V.
NucleoCounter-NC200ChemoMetec A/S
Origin 2021OriginLab
Penicilina-EstreptomicinaGibco11548876
Tampón de permanente/lavado BD Biociencias 
Ensayo de cebador TUBB3(Hs00801390_s1)Thermo Fisher Scientific
Ensayo de cebador GAPDH (Hs99999905_m1)Thermo Fisher Scientific11620099
Ensayo de cebador GUSB (Hs99999908_m1)Thermo Fisher Scientific
Ensayo de cebador HPRT1 (Hs99999909_m1)Thermo Fisher Scientific11620099
Ensayo de cebador MAP2 (Hs00258900_m1)Thermo Fisher Scientific11620099
Ensayo de cebador MAPT (Hs00902194_m1)Thermo Fisher Scientific11620099
Ensayo de cebador POU5F1 (Hs04260367_gH)Thermo Fisher Scientific 11620099
Poli-L-ornitina 0,01%MerckP4957
RNeasy Plus Micro Kit (50)-KitQiagen74034kit de aislamiento de ARN basado en columna
Tampón RLTQiagen79216tampón de lisis celular
Piruvato de sodio (100 mM)Gibco12539059
StemPro AccutaseGibco11599686enzima de disociación celular
TAQMAN FAST ADVANCED MASTER MIXThermo Fisher Scientific   11380912Mezcla maestra de qPCR
Triton-X-100Sigma-AldrichT8787
TrypLE Select EnzymGibco12563-011Solución de tripsina-EDTA
UltraPure 0,5 M EDTA, pH 8,0Thermo Fisher ScientificAM9260G
Via1-CassetteChemoMetec A/S941-0012
Puntas de pipeta filtradas de diámetro anchoThermo Fisher Scientific10088880
X20 OPTICAL 96WELL PLACAS DE REACCIÓN CLARA RÁPIDA Thermo Fisher Scientific15206343
Y-27632 diclorhidrato, inhibidor de la Rho quinasa (inhibidor de ROCK)Abcamab120129

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Producción de neuronas humanas inducibles por neurogenina 2 en un biorreactor de suspensión tridimensional
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