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Durante la última década, el desarrollo de terapias dirigidas e inmunoterapias ha aumentado significativamente la supervivencia global (SG) del cáncer de pulmón de células no pequeñas no escamosas (NSCLC)1,2. En este sentido, el número de genes y dianas moleculares obligatorias a analizar en el tratamiento del CPNM-NS ha aumentado en los últimos años 3,4.
Las guías internacionales actuales recomiendan realizar pruebas de EGFR, ALK, ROS1, BRAF, NTRK, RET y MET en el diagnóstico de NSCLC avanzado5. Además, dado que los nuevos fármacos han dado recientemente resultados muy prometedores en ensayos clínicos, en breve se detectarán alteraciones genómicas adicionales en una serie de genes adicionales, en particular KRAS y HER2, junto con BRAC1/BRAC2, PI3KA, NRG1 y NUT 6,7,8,9. Además, el estado de diferentes genes asociados, como STK11, KEAP1 y TP53, puede ser de gran interés para una mejor predicción de la respuesta o resistencia a algunas terapias dirigidas y/o inhibidores de puntos de control inmunitario (ICI)10,11,12.
Es importante destacar que las alteraciones moleculares deben notificarse sin demora significativa para garantizar una toma de decisiones clínicas cuidadosa. La ausencia de caracterización molecular de un tumor puede llevar al inicio de terapias no dirigidas, como la quimioterapia con/sin inmunoterapia, lo que lleva a una estrategia de tratamiento subóptima, ya que la respuesta a la quimioterapia es limitada en pacientes con alteraciones procesables, como mutaciones en EGFR o fusiones génicas13.
Además, el desarrollo actual de terapias dirigidas/inmunoterapias en entornos neoadyuvantes y/o adyuvantes podría llevar a la búsqueda sistemática, al menos, de alteraciones de EGFR y ALK en el NSCLC en estadio temprano, ya que los ICI deben administrarse solo en tumores de tipo salvaje para EGFR y ALK14. Ahora también es obligatorio realizar pruebas para detectar la presencia de mutaciones en el CPNM-EGFR en estadio temprano, ya que el osimertinib (un inhibidor de la tirosina cinasa del EGFR de tercera generación) puede utilizarse como terapia adyuvante en el CPNM-NS-mutante en EGFR 15.
La estrategia para la evaluación de los diferentes biomarcadores en la predicción de la respuesta a diferentes terapias dirigidas y/o inmunoterapias en pacientes con CPNM-NS está avanzando rápidamente, lo que dificulta secuencialmente la identificación de estos biomarcadores 3,16. En este sentido, la secuenciación de nueva generación (NGS) es ahora el enfoque óptimo para la evaluación paralela de alto rendimiento de las alteraciones genéticas en el NSCLC 5,17.
Sin embargo, el flujo de trabajo de NGS puede ser difícil de dominar y puede llevar a un TAT18,19 más largo. Así, muchos centros siguen realizando abordajes secuenciales (inmunohistoquímica (IHQ), hibridación fluorescente in situ (FISH) y/o secuenciación dirigida). Sin embargo, esta estrategia es limitada en caso de que la muestra sea pequeña y, sobre todo, debido al mayor número de mutaciones accionables que deben analizarse en el NS-NSCLC20. Por lo tanto, los métodos de prueba ultrarrápidos y sencillos que permiten la evaluación rápida de las alteraciones genéticas se han vuelto cada vez más importantes para la toma de decisiones clínicas óptimas. Además, los sistemas aprobados y acreditados para las pruebas moleculares se están convirtiendo en obligatorios para la prescripción de terapias dirigidas específicas.
Aquí, describimos un ensayo NGS de ADN/ARN ultrarrápido y automatizado basado en amplicones para pruebas moleculares de NS-NSCLC que se utiliza en el Laboratorio de Laboratorio de Patología Clínica y Experimental (LPCE) del Hospital Universitario de Niza, Francia y está acreditado según la norma ISO 15189 por el Comité de Acreditación Francés (COFRAC) (https://www.cofrac.fr/). El COFRAC certifica que el laboratorio cumple con los requisitos de la norma ISO 15189 y las reglas de aplicación del COFRAC para las actividades de ensayo/calibración en análisis molecular en NGS automatizado en un secuenciador con el panel realizado por el laboratorio. La acreditación según la reconocida norma internacional ISO 15189 demuestra la competencia técnica del laboratorio para un alcance definido y el correcto funcionamiento de un sistema de gestión adecuado en este laboratorio. Se discuten los beneficios y limitaciones de este flujo de trabajo, desde la preparación de muestras de biopsia de tejido hasta la obtención del informe.