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El estudio fue aprobado y el paciente fue reclutado en el Departamento de Enfermedades Infecciosas del Hospital Dongzhimen de la Universidad de Medicina China de Pekín, en Pekín, China. El paciente se sometió a una resonancia magnética abdominal de rutina de Dixon después de dar su consentimiento informado. En esta investigación, se emplea un enfoque de modelado de distribución 3D para reconstruir la fracción de grasa hepática (LFF) en un paciente estándar con esteatosis hepática diagnosticada médicamente. Además, el estudio proporciona una evaluación cuantitativa comparando el hígado del paciente con un hígado sano. Las herramientas de software utilizadas en esta investigación se enumeran en la Tabla de Materiales.
1. Preparación y recogida de datos
NOTA: La varianza en los parámetros no se ve afectada por el enfoque de investigación. En esta investigación, se obtuvieron datos DICOM genuinos a partir de imágenes clínicas. Los datos se adquirieron utilizando un aparato de resonancia magnética con una intensidad de campo de 1,5 Tesla. El conjunto de datos comprende cuatro fases distintas derivadas de la secuencia de Dixon, específicamente en fase, fuera de fase, agua y grasa.
- Verifique la secuencia de Dixon para la parte superior del abdomen.
- Copie todos los datos DICOM en un directorio de trabajo personalizado.
NOTA: El directorio de trabajo es el mismo tanto en el sistema operativo como en MATLAB.
- Vaya al directorio que contiene los datos dentro del directorio de trabajo actual de MATLAB (como se muestra en la Figura 1).
- Confirme que los datos de DIXON muestran una resolución horizontal de 520 píxeles por 704 píxeles, con un espaciado de píxeles de 0,5682 mm y un grosor de corte de 5 mm.
- Compruebe rápidamente las imágenes de Dixon.
- Cambie el directorio para acceder a las carpetas de las diferentes fases, que incluyen las fases de entrada, fase de salida, agua y grasa, cada una almacenada en carpetas distintas para la obtención de imágenes de Dixon.
- Utilice la función Slice_View para visualizar las imágenes de cada fase.
- Consulte la Figura 2 para ver una imagen de la interfaz gráfica de usuario (GUI) interactiva de la secuencia MRI-Dixon. Utilice la barra de desplazamiento situada en la parte inferior de la interfaz gráfica de usuario para navegar de manera eficiente a través de las distintas secuencias.
- Emplee la secuencia en fase MRI-Dixon para mejorar las descripciones de los límites del tejido hepático.
NOTA: En la Figura 2, se pueden encontrar iconos ubicados en la esquina superior derecha de la GUI. Estos iconos ofrecen funciones como alejar, acercar, volver a la vista global y marcar las coordenadas del píxel seleccionado. Utilice la función de zoom para examinar de cerca las características locales de la lesión.
- Utilice la función Marcar coordenadas de píxel para calcular la distancia entre dos puntos, lo que ayuda a medir el tamaño de los nódulos.
- La barra de color inicial utiliza el mapa de colores jet, que significa un cambio de color de azul a rojo, lo que significa valores bajos a altos respectivamente. Para cambiar al mapa de colores gris estándar y restablecer toda la interfaz gráfica de usuario, haga clic con el botón derecho en la barra de colores y seleccione la opción en el menú emergente.
- Si la ventana de filtro predeterminada no es adecuada, ajústela arrastrando hacia arriba y hacia abajo en el centro de la figura con el botón izquierdo del ratón para modificar el nivel de la ventana. Al arrastrar hacia la izquierda y hacia la derecha, se ajusta el ancho de la ventana, y el rango de filtrado preciso se mostrará en la barra de color.
NOTA: Las operaciones posteriores se centrarán en la utilización de la secuencia en fase de DIXON para representar la región 3D del hígado.
2. Extracción de la región 3D del hígado
NOTA: Para calcular la fracción de grasa hepática (LFF), cada vóxel dentro de la región hepática 3D actúa como un portador espacial, con su valor de fracción de grasa obtenido de los datos de MRI-Dixon. Antes de calcular la LFF, es crucial extraer la región hepática 3D. Aunque los métodos de aprendizaje profundo podrían lograr esto de manera más eficiente, el enfoque aquí está en el uso de herramientas de software maduras como MIMICS para la extracción de la región hepática.
- Abra el software MIMICS y elija Nuevo proyecto. En el cuadro de diálogo siguiente, localice la carpeta que contiene las imágenes de fase de salida de DIXON. Continúe haciendo clic en SIGUIENTE y luego presione Convertir para ingresar al modo de edición de secuencia.
- Genere una máscara vacía haciendo clic en Nuevo dentro del cuadro de diálogo MÁSCARA situado en el lado derecho, y opte por el umbral máximo.
- Utilice la herramienta Editar máscaras ubicada debajo de la etiqueta "Segmento" para delinear el área del hígado en todas las vistas horizontales.
- Cree una representación espacial en 3D del hígado eligiendo la máscara de hígado representada anteriormente y haciendo clic en Calcular parte de la máscara. Se presentará la región hepática 3D resultante (consultar la Figura 3).
- Vaya a Archivo, luego seleccione Exportar y elija la opción DICOM . En el cuadro de diálogo emergente, seleccione la máscara hepática, especifique la ruta y los nombres del archivo y, a continuación, haga clic en Aceptar para exportar la región hepática 3D a los archivos DICOM designados.
3. Generación de Mapa de Fracción de Grasa (FF-Map)
NOTA: El mapa de fracciones de grasa (FF-Map) tiene un rango de valores de 0-1. En este estudio, el FF de cada vóxel se calcula dividiendo el valor del vóxel de In-phase menos Water-only por el de In-phase utilizando Dixon MRI.
- Cambie el directorio a la carpeta de imágenes en fase y seleccione la función Volume_In para generar el volumen en fase.
- Cambie el directorio a la carpeta de imágenes de solo agua y seleccione la función Volume_Water para generar el volumen de solo agua.
- Seleccione la función FF_Volume utilizando los dos volúmenes generados en los pasos 3.1 y 3.2 como entradas para obtener el volumen FF de la resonancia magnética abdominal, visualizado como se muestra en la Figura 4.
- El mapa de fracción de grasa (FF) que se muestra en la Figura 4 se presenta como una imagen RGB de color verdadero con una estructura de datos de 520 por 704 por 44 matriz. En esta representación, cada píxel se compone de tres valores, que representan los canales rojo, verde y azul. Tome nota de la barra de color en el lado izquierdo, que proporciona una referencia visual para los valores de fracción de grasa asociados con píxeles de diferentes colores.
NOTA: La interfaz gráfica de usuario que se muestra en la Figura 4 permite observar más de cerca el hígado del paciente a través de la herramienta de zoom en la esquina superior derecha y obtener los valores exactos de FF utilizando la herramienta de sondaje. Al arrastrar la barra de desplazamiento en la parte inferior, los usuarios pueden observar los mapas FF de todas las posiciones de escaneo en el plano horizontal.
Distribución de la fracción de grasa hepática en 4. 3D volumen
NOTA: La Figura 4 muestra el mapa de LFF calculado en base a las imágenes de resonancia magnética de Dixon de la parte superior del abdomen. En combinación con la región hepática 3D de la Figura 3, el volumen 3D-LFF de todo el hígado se puede calcular por separado.
- Utilice la función LFF_Volume , proporcionándole la región hepática 3D (como se muestra en la Figura 3) y el mapa de rigidez hepática (que se muestra en la Figura 4) como parámetros de entrada. Esto dará como resultado la creación de la representación de volumen 3D de la fracción de grasa hepática, como se ilustra en la Figura 5.
- Para examinar el mapa de rigidez de cada capa hepática, simplemente use la barra de desplazamiento ubicada debajo de la interfaz gráfica de usuario que se muestra en la Figura 5.
NOTA: En esta vista, solo el tejido hepático se representa con precisión.
- Preste atención a los iconos ubicados en la esquina superior derecha de la GUI (como se muestra en la Figura 5). Estos iconos proporcionan funcionalidades para alejar, acercar, volver a la vista global y marcar las coordenadas del píxel seleccionado.
NOTA: La barra de color predeterminada utiliza el mapa de colores "jet", donde los colores pasan de azul a rojo para representar valores variables (medidos en unidades de kPa) de bajo a alto.
- Ejecute la función LFF_Distribution utilizando los parámetros de entrada idénticos a "LFF_Volume" para producir la distribución espacial de la fracción de grasa hepática 3D (3D-LFF), como se muestra en la Figura 6.
Análisis cuantitativo 5. 3D-LFF
NOTA: Vóxeles hepáticos normales: LFF < 5%; Vóxeles de hígado graso leve: 5%-10%; Vóxeles moderados de hígado graso: 10%-20%; Vóxeles de hígado graso severo: LFF ≥ 20%11,12,13,14,15. Un enfoque cuantitativo clave de este estudio es determinar la proporción de vóxeles en diferentes estadios de LFF en el hígado del paciente. La figura 6 muestra la distribución espacial desigual de la fracción de grasa hepática en el paciente. La falta de síntomas clínicos distintivos se atribuye principalmente a una proporción sustancial de tejido hepático normal. Por lo tanto, es imprescindible cuantificar con precisión las diferencias entre los pacientes y los individuos sanos. Esto representa un concepto cuantitativo vital en este caso.
- Calcule la distribución 3D-LFF para un hígado sano repitiendo los pasos 1-4.
NOTA: La función de barra incorporada de MATLAB permite la comparación de las distribuciones 3D-LFF para hígados sanos y grasos (Figura 7).