Artículo de método

Modelos de heridas en ratones y preparación de suspensiones de células únicas

2.1K visualizaciones

DOI:

10.3791/66499

27 de septiembre de 2024

En este artículo

Resumen

Este estudio presenta dos técnicas experimentales cruciales: la construcción de un modelo de herida murina para evaluar el cierre de la herida y la preparación de suspensiones unicelulares de piel murina para preservar la viabilidad celular.

Resumen

El tratamiento de las lesiones cutáneas agudas de espesor total presenta un desafío considerable en la práctica clínica. La complejidad de la cicatrización de heridas, que involucra diversas poblaciones celulares y el intrincado microambiente de la herida, complica la evaluación de los efectos del tratamiento y sus interacciones utilizando enfoques experimentales tradicionales. La tecnología de secuenciación del transcriptoma de una sola célula ha revolucionado la comprensión de las funciones y mecanismos celulares durante la cicatrización de heridas. Sin embargo, la variabilidad en las metodologías para crear modelos de heridas de ratón introduce factores de confusión que pueden afectar los resultados experimentales. Además, el proceso de disociación de los tejidos de la piel de ratón presenta importantes obstáculos técnicos, lo que pone de manifiesto la necesidad crítica de suspensiones unicelulares de alta calidad para una secuenciación precisa del transcriptoma. Por lo tanto, este estudio tiene como objetivo optimizar la construcción de modelos de heridas en ratones para evaluar con precisión los cambios en el cierre de la herida y eliminar las variables que podrían influir en el resultado de la secuenciación posterior. Además, la preparación de suspensiones unicelulares se realizó utilizando protocolos de preparación de enzimas y protocolos de kits de prueba para optimizar el costo y la efectividad.

Introducción

El ratón es un modelo animal ampliamente reconocido en investigación por su secuencia genética altamente homóloga a la de los humanos, su rápida reproducción, su rentabilidad y su tamaño manejable1. Sin embargo, existen diferencias en la estructura de la piel entre ratones y humanos. Los ratones tienen una capa de membrana cutánea distinta que contribuye a la contracción de la piel, desempeñando un papel crucial en la cicatrización de heridas en esta especie. Por el contrario, la cicatrización de heridas humanas implica principalmente la reepitelización y la formación de tejido de granulación1.

A pesar de estas diferencias entre especies en la estructura de la piel, el modelo de ratón sigue siendo la opción preferida en la investigación de reparación de heridas y conserva una importancia significativa en comparación con otros modelos animales2,3. Cuando se utiliza piel de ratón para imitar los procesos de cicatrización de heridas humanas, es esencial tener en cuenta cuidadosamente los diversos factores que influyen. Estos factores incluyen la selección de sitios apropiados para procedimientos quirúrgicos, la contabilidad del ciclo del folículo piloso del ratón y la comprensión de los efectos de la contracción de la membrana cutánea4,5. La implementación de las medidas correspondientes es vital para optimizar las condiciones experimentales y mejorar la precisión de los resultados observacionales.

La secuenciación de ARN de una sola célula (scRNA-seq) secuencia las células a un nivel mucho más refinado que la secuenciación de ARN convencional y tiene un requisito mucho mayor de calidad de muestra con diferencias intragrupo mínimas. Se llevaron a cabo múltiples experimentos para refinar un modelo estable de defecto cutáneo agudo de espesor completo. Estos experimentos utilizaron una combinación de métodos establecidos de la literatura y enfoques innovadores para evaluar la cicatrización de heridas de manera integral2,5. Para desarrollar el modelo de cicatrización de heridas, se utilizó la escisión de piel de espesor completo en ratones para replicar el proceso fisiológico de reparación y regeneración de heridas. Su objetivo fue evaluar las posibles alteraciones inducidas por diversos tratamientos que utilizan scRNA-seq. La disociación del tejido cutáneo de ratones plantea desafíos, incluyendo baja viabilidad celular y altas tasas de agregación, durante la preparación de suspensiones unicelulares6. Estas dificultades pueden dar lugar a problemas como la obstrucción de los instrumentos y la captura de células anómalas, lo que puede comprometer la calidad de los datos. Dado el considerable costo de la secuenciación de una sola célula, la realización de múltiples experimentos preliminares es crucial para garantizar la estabilidad y confiabilidad de la suspensión de una sola célula. Este estudio evaluó la eficacia de la disociación enzimática mixta y el método de disociación del kit de tejido para identificar el enfoque óptimo para la disociación de tejidos6,7. Este estudio establece una base sólida para investigaciones más profundas.

Protocolo

Todos los procedimientos fueron aprobados por el Comité de Ética del séptimo Centro Médico del Hospital General PLA de China, China. Se utilizaron ratones machos C57/BL6 de 6 semanas de edad.

1. Modelo de cicatrización de heridas de ratón

  1. Agrupamiento de animales
    1. Asigne aleatoriamente ratones a grupos experimentales y de control (6 cada uno). Ratones domésticos en una instalación de animales libres de patógenos específicos (SPF), con una temperatura mantenida a 23-25 °C, humedad al 50%-60% y un ciclo de luz-oscuridad de 12 h.
    2. Proporcione a los ratones acceso sin restricciones a alimentos estándar y agua del grifo esterilizada en autoclave.
  2. Preparación preoperatoria
    1. Sujete suavemente el ratón con un sujetador o sujetándolo de forma segura en posición prona. Cargue la jeringa con pentobarbital sódico al 1% restaurado a temperatura ambiente, administrado a una dosis de 0,1 mL/20 g de peso corporal.
      NOTA: La solución de pentobarbital sódico al 1% debe almacenarse en un ambiente oscuro a 4 °C.
    2. Limpie el abdomen del ratón con hisopos de algodón con alcohol. Inserte la jeringa en un ligero ángulo dentro del abdomen. Aspire antes de la inyección para evitar la administración inadvertida en la vejiga o los intestinos. Espere 10 min.
    3. Después de que el ratón deje de temblar y ya no responda a los estímulos, aplique vaselina blanca en ambos ojos para evitar la sequedad. Usa una afeitadora para recortar el pelaje dorsal más largo.
    4. Aplique la crema depilatoria en la espalda, espere 2 minutos y limpie suavemente con una gasa húmeda para evitar dañar la piel del ratón. Asegúrese de que la crema depilatoria no se deje actuar durante un período prolongado.
    5. Desinfecte suavemente la piel circundante con tres hisopos alternos de betadine y alcohol al 70%.
    6. Punzón de biopsia de piel en autoclave, tijeras, fórceps y otros instrumentos para la esterilización. Mantenga un espacio de trabajo estéril. Realizar la cirugía posterior con un paño quirúrgico nuevo.
  3. Escisión cutánea de espesor completo
    NOTA: Se utilizó el modelo de férula para heridas para evaluar la efectividad del tratamiento para la cicatrización de heridas.
    1. Con un rotulador permanente, marque la zona central superior de la región dorsal del ratón con un círculo de 8 mm de diámetro.
    2. Levante la piel dorsal con pinzas limpias y haga el primer corte con unas tijeras quirúrgicas finas. Después del primer corte, sostenga el área de la piel parcialmente eliminada con pinzas y corte con cuidado los círculos marcados.
    3. Utilice un anillo de acero inoxidable diseñado a medida (diámetro interno 15 mm, diámetro externo 18 mm). Sutura el anillo metálico a la periferia del sitio de la incisión con suturas no absorbibles 5-0, evitando la contracción de la piel del sitio de la incisión (Figura 1A). Utilice acero inoxidable como material del anillo para evitar la oxidación y la deformación.
    4. Administrar una única inyección subcutánea de 0,1 mL de dilución de clorhidrato de buprenorfina al 10% cerca de la herida para tratar el dolor postquirúrgico.
    5. Vuelva a introducir el ratón para limpiar jaulas individuales. Coloque el ratón en posición prona. No deje al ratón desatendido antes de que recupere la conciencia.
    6. Observe y fotografíe la herida del ratón cada 2 días para medir el tamaño de la herida después de la anestesia como se describe en el paso 1.2.
  4. Marcado de sellos de heridas para obtener tejido de biopsia
    1. Prepárese para el experimento como se describe en los pasos 1.1 y 1.2.
    2. Cree sellos de marcado personalizados para heridas de ratón con un diámetro de círculo de 8 mm y una longitud de lado cuadrado de 10 mm (Figura 1B).
    3. Coloque al ratón en una postura prona y desinfecte la piel dorsal con hisopos de algodón con alcohol. Sumerge el sello en tinta. Haz una marca en la parte media-superior de la parte posterior del ratón con el sello.
    4. Extirpe con cuidado toda la capa de piel de la espalda a lo largo de la marca circular con unas tijeras quirúrgicas, exponiendo la capa muscular por completo. Deje la herida abierta sin apósito para evitar interferir con el estado de la herida. Mantenga la esterilidad de la herida colocando al ratón en un entorno limpio y desinfectado y permitiendo que la herida forme una costra de forma natural.
    5. Administrar una única inyección subcutánea de 0,1 mL de dilución de clorhidrato de buprenorfina al 10% cerca de la herida para tratar el dolor postquirúrgico.
    6. Vuelva a introducir el ratón para limpiar jaulas individuales. Coloque el ratón en posición prona. No deje al ratón desatendido antes de que recupere la conciencia.
    7. Observe y fotografíe la herida del ratón cada 2 días para medir el tamaño de la herida después de la anestesia como se describe en el paso 1.2.
    8. Realizar la administración del tratamiento como se describe en 1.4
  5. Administración del tratamiento
    1. A las 4 h después de que el ratón recupere la conciencia, realice la anestesia como se describe en los pasos 1.2.2-1.2.3.
    2. Inyecte por vía subcutánea el tratamiento deseado, en este caso 100 μg de exosoma derivado de células madre mesenquimales del cordón umbilical humano (hucMSC-Exo) disuelto en 200 μL de PBS alrededor del sitio de la incisión para el grupo de tratamiento.
    3. Inyecte por vía subcutánea 200 μL de PBS alrededor del sitio de la incisión para el grupo de control.
    4. Repita los pasos 1.5.2 y 1.5.3 cada dos días durante un máximo de 14 días. Inspeccione el sitio de la inyección en busca de hinchazón, enrojecimiento o signos de infección.

2. Preparación para la secuenciación de ARN unicelular

  1. Recolección y preparación de tejidos
    1. Realice la anestesia como se describe en los pasos 1.2.2-1.2.3.
    2. Levante la piel dorsal con pinzas limpias y retire las costras. Corta aproximadamente 2cm2 de piel cerca de la herida, recortando el tejido adiposo y los vasos sanguíneos grandes.
    3. Transfiera la biopsia de piel con pinzas estériles a un pocillo de una placa de 6 pocillos llena de 4 mL de PBS preenfriados.
    4. Lavar con PBS transfiriendo secuencialmente la biopsia a nuevos pocillos (placa de 6 pocillos) llenos de 4 mL de PBS hasta que no haya sangre visible.
    5. Cortar la piel con un bisturí en trozos de aproximadamente 2 mm, lavándola posteriormente con DPBS que contenga un 0,04% de BSA y eliminando cualquier residuo.
  2. Disociación enzimática (Figura 2)
    1. Combine 1 mL de colagenasa I (10 mg/mL), 1 mL de colagenasa IV (5 mg/mL), 1 mL de colagenasa D + Dispasa II (15 mg/mL), 1 mL de DNasa I (5 mg/mL) y 6 mL de DPBS en un tubo cónico estéril para preparar la solución de digestión. Mezcle bien los componentes para garantizar la homogeneidad.
    2. Coloque el tubo cónico en un baño de agua a 37 °C durante 10 minutos para precalentar la solución de digestión.
    3. Añadir 2,5 mL de solución de digestión al tejido y digerir a 37 °C durante 70 min, volteando el tubo de ensayo cada 10 min para una mezcla completa.
    4. Humedecer previamente un colador de 70 μm con tampón de lavado (0,2% BSA en PBS). Transfiera la mezcla de reacción, incluidas las células disociadas y los fragmentos de tejido residual, utilizando una punta de pipeta de diámetro ancho de 1 mL en el colador.
    5. Filtre esta mezcla a través del filtro de celdas prehumedecido de 70 μm en un tubo de centrífuga de 15 mL.
    6. Centrifugar la mezcla de reacción con tejido digerido a 300 x g, temperatura ambiente durante 5 min. Deseche el sobrenadante y guarde el pellet (células) para el siguiente paso de disociación.
  3. Lisis de glóbulos rojos
    1. Diluir la solución de lisis de glóbulos rojos (10x) en una proporción de 1:10 con agua bidestilada. Diluir las células con 1x solución de lisis de glóbulos rojos en una proporción de 1:10 en un tubo cónico.
    2. Agitar la mezcla durante 5 s, incubar a temperatura ambiente durante 2 min y luego centrifugar a 300 x g durante 5 min. Aspirar el sobrenadante, resuspender las células en DPBS de igual volumen y almacenarlas en hielo.
  4. filtración
    1. Recupere la suspensión celular y fíltrela a través de un filtro de 40 μm en un nuevo tubo cónico.
    2. Enjuague el tubo 2 veces con 4,5 mL de RPMI (10% FCS) para asegurar la recolección de las células restantes.
    3. Proceda a centrifugar la suspensión de la célula a 300 x g a temperatura ambiente durante 5 min.
    4. Deseche el sobrenadante, agite suavemente el pellet y vuelva a suspender las células con puntas de diámetro ancho en 50 μL de 0,04% BSA PBS. Mantenga las células en hielo durante todo este proceso.
  5. Eliminación de células muertas
    1. Mezcle el kit de eliminación de células muertas 20x tampón de stock con agua sin nucleasas en una proporción de 1:20 para obtener un tampón de unión 1x.
    2. Centrifugar la muestra a 300 x g, eliminar el sobrenadante y añadir 10 μL de microperlas de eliminación de células muertas para obtener 60 mg de muestra de piel.
    3. Incubar durante 15 min a temperatura ambiente. Añada el tampón de stock hasta que alcance los 500 μL. Cargue la muestra en la columna preparada del kit y conéctela al disociador.
    4. Ejecute el programa disociador para separar las células vivas. Una vez finalizado el programa, filtre la suspensión a través de un filtro de 30 μm y dilúyala con un volumen igual de D-PBS.
      NOTA: Si la velocidad de goteo disminuye notablemente, reemplace rápidamente la columna para evitar que las impurezas bloqueen los poros y afecten la recuperación celular.
    5. Realice la tinción y el recuento de células con naranja de acridina/yoduro de propidio (AO/PI) mediante un contador de células automatizado. Utilice los siguientes criterios de aceptación: viabilidad celular ≥ 85%, tasa de agregación celular < 20% y ausencia de glóbulos rojos o fragmentos de células visibles.
  6. Procedimiento de disociación para el kit de disociación multitejido (Alternativa)
    1. Mezcle 2,5 ml de RPMI 1640, 100 μl de enzima D, 50 μl de enzima R y 12,5 μl de enzima A1 en un tubo MACS C suave (componentes del kit de disociación de tejidos múltiples).
    2. Transfiera el tejido al tubo suave MACS C que contiene la mezcla de enzimas y ciérrelo herméticamente.
    3. Coloque el tubo a 37 °C en un baño de agua durante 90 minutos con una inversión suave cada 10 minutos para garantizar una exposición adecuada del tejido a la solución de disociación.
    4. Deseche la solución de disociación y lave los tejidos con DPBS.
    5. Pase secuencialmente suspensiones unicelulares a través de filtros celulares de 70 μm y 40 μm y centrifugar a 4 °C durante 10 min a 300 x g.
    6. Lisar los glóbulos rojos utilizando el reactivo de lisis de glóbulos rojos siguiendo el mismo procedimiento que el paso 2.3.
    7. Elimine las células muertas utilizando el kit de eliminación de células muertas siguiendo el mismo procedimiento que en el paso 2.58.
    8. Realice la tinción AO/PI y el recuento de células mediante un contador de células automatizado. Utilice los siguientes criterios de aceptación: viabilidad celular ≥ 85%, tasa de agregación celular < 20% y ausencia de glóbulos rojos o fragmentos de células visibles.

Resultados

Se exploraron múltiples variaciones del procedimiento. Se prefirieron los protocolos de tipo "stamp" porque presentan una interferencia mínima en el proceso de cicatrización y mantienen la integridad de la herida frente a factores como el rascado o los puntos de sutura. Esto permite evitar la introducción de ruido a nivel de célula individual en el secuenciamiento posterior. Colocar heridas en ambos lados de un ratón dio lugar a diferencias notables en el área de la herida debido a la elasticidad inherente de la piel del ratónFigura 3A, B). Las punciones bilaterales colocaron las heridas más cerca de los bordes, una región susceptible al comportamiento autológico de rascado en el ratón. Los ratones de 7 semanas de edad o mayores se consideraron inadecuados para el estudio, ya que un subgrupo de ellos presentó oscurecimiento irregular de la piel dorsal alrededor del día 10th día posterior a la cirugía, lo que indica el inicio del crecimiento del vello (Figura 4A). Esto introdujo una variable adicional que no era deseada.

Cuando se utilizaron anillos de goma, independientemente de si se empleaba goma blanda o dura, estos anillos tendían a desprenderse y a menudo se salían del sitio de la herida en aproximadamente 12 h debido a los movimientos frecuentes de los ratones y a las propiedades adhesivas limitadas de los anillos. Los anillos de goma fijados mediante suturas eran propensos a rasgarse, lo que requería suturas repetidas para su estabilización. Este procedimiento iterativo de sutura, a su vez, provocaba un trauma adicional en los ratones (Figura 4B,C). En contraste, los anillos metálicos demostraron una estabilidad superior y mejores propiedades de retención, permitiendo la evaluación de los efectos de reepitelización sin interferencia del cierre por contracción de la herida.

Dado el potencial del soporte con anillo metálico y sutura para causar daño cutáneo adicional más allá del área de la herida y para aplicar tensiones mecánicas no uniformes a través de la herida, se empleó un sello estandarizado de dimensiones fijas para facilitar los análisis posteriores.

La investigación reveló que el grupo con el tratamiento de ejemplo (hucMSC-Exo) presentó un ritmo de curación más rápido en comparación con el grupo control (Figura 5A). Aunque la cicatrización completa se produjo más rápidamente en el modelo de estampado que en el grupo con anillo metálico suturado, que limita la contracción de la herida, no se observó una diferencia estadísticamente significativa en las tasas de curación durante el período inicial de 7 días (Figura 5B). Estos hallazgos coinciden con investigaciones previas de Lin et al., lo que sugiere que los primeros 10 días de la cicatrización cutánea en ratones implican principalmente reepitelización en lugar de contracción9.

Comparación de la disociación
Después de la optimización exhaustiva de la composición enzimática, la combinación de la Dispasa II y la colagenasa mostró un rendimiento superior en comparación con el uso de una sola enzima (Tabla 1). Es importante destacar que la presencia de glóbulos rojos o restos celulares fue mínima, cumpliendo así con los criterios esenciales para el uso en máquinas, que incluyen una viabilidad celular superior al 85 % y una tasa de agregación inferior al 20 %.

En contraste, el enfoque con el kit de prueba mostró resultados prometedores, con una viabilidad celular relativamente mayor y una tasa más baja de agregación celular (Tabla 1). Además, no se observaron glóbulos rojos ni fragmentos celulares, lo que indica una calidad celular general superior en comparación con otros métodos.

Dispositivo quirúrgico sobre la piel de un animal; diagrama de incisión circular; herida con medición con regla.
Figura 1: Modelo finalizado de herida en ratón. (A) Imagen representativa del anillo metálico personalizado suturado. (B) Imagen representativa del sello cutáneo y la herida escindida. Diámetro: 8 mm. Borde: 1 cm. (C) Tasa de cierre de la herida. Barra de error: error estándar. Prueba T de dos colas (n=6). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Proceso de preparación de células: preparación de la muestra, disociación, lisis de glóbulos rojos, eliminación de células muertas, suspensiones de células individuales.
Figura 2: Esquema para la preparación de suspensiones de células individuales. Los pasos incluyen la recolección de la muestra, disociación, lisis de glóbulos rojos, eliminación de células muertas y obtención de suspensión de células individuales. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Experimento de cicatrización de heridas en ratas; imágenes cronológicas, día 1 y 6 después de la operación; regla de medición.
Figura 3: Modelo de herida en ratón con heridas en cada lado. (A) Se muestra una imagen representativa del modelo de herida en ratón con heridas en cada lado. Diámetro de referencia blanco redondo: 8 mm. (B) Imagen representativa de la cicatrización de heridas en diferentes momentos para heridas en cada lado. La piel en la espalda del ratón cerca de la cola sanó más rápido que la cercana al cuello. Arista del objeto de referencia blanco cuadrado: 1 cm. Diámetro del objeto de referencia blanco redondo: 8 mm. Abreviaturas: POD = días postoperatorios. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Diagrama del experimento de cicatrización de heridas con mediciones, desde el POD 1 hasta el POD 10, estudio de incisión en piel de rata.
Figura 4: Modelo de herida en ratón con heridas individuales. (A) Imagen representativa de la cicatrización de heridas en diferentes etapas del crecimiento del pelo en ratones de 7 semanas de edad. Los ratones se encuentran en diferentes etapas del crecimiento del pelo en el día 10 postoperatorio. La piel más oscura sanó más rápidamente. (B) Imagen representativa de anillos adhesivos de goma. Borde del objeto de referencia cuadrado blanco: 1 cm. (C) Imagen representativa de líneas de sutura. Diámetro del objeto de referencia redondo blanco: 8 mm. Abreviaturas: POD = días postoperatorios. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Tasa de cierre de heridas a lo largo del tiempo; gráficos de barras experimentales que comparan la eficacia del tratamiento; análisis estadístico.
Figura 5: Tasa de cierre de heridas. (A) Comparación entre los grupos control y hucMSC-Exo. Las barras de error representan los errores estándar. Prueba T de dos colas (n=6). (B) Comparación entre los grupos de sello y anillo metálico. Las barras de error representan los errores estándar. La significancia se calculó mediante la prueba t de dos colas (n=6). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Tasa de viabilidad celularTasa de agregación celular
Enfoque interno86.90%18.50%
Enfoque con kit de prueba90.65%13.73%

Tabla 1: Viabilidad y tasa de agregación de los dos enfoques de preparación celular.

Discusión

Varios pasos cruciales fueron esenciales para el éxito del protocolo. Estos pasos incluyeron una preparación precisa del área de la herida mediante un afeitado y limpieza a fondo, la creación de heridas estandarizadas de tamaño y profundidad específicos, y un cuidado diligente posterior a la herida para controlar las infecciones y administrar los tratamientos adecuados. La estandarización de estos procedimientos aseguró la consistencia en todas las condiciones experimentales, mejorando así la confiabilidad y reproducibilidad de los resultados10.

Empleamos el marcado de heridas para la secuenciación, ya que otros métodos introducen variables adicionales como el rasguño de la herida del ratón y el desgarro de la sutura 2,5. El modelo de sello mejora la consistencia inicial de las heridas en ratones y proporciona un punto de referencia estandarizado para evaluar la cicatrización de heridas, reduciendo posibles imprecisiones en la estimación de la tasa de cicatrización de heridas en modelos murinos. Además, la marca del sello facilita el uso de software como ImageJ. Sin embargo, debido a que no se usa un apósito para cubrir la herida, el método de estampado tiene requisitos de desinfección mucho más altos para el medio ambiente. El experimento deberá repetirse si ocurre una infección.

La variabilidad biológica entre ratones individuales puede introducir variabilidad en los resultados experimentales, lo que requiere tamaños de muestra más grandes para análisis estadísticos sólidos. Este modelo se puede extender a otras técnicas de secuenciación, como la secuenciación espacial, para mejorar aún más su utilidad.

La optimización de las condiciones para la disociación de scRNA-Seq y la selección de métodos de disociación apropiados son pasos críticos en el flujo de trabajo experimental. Actualmente, las metodologías comúnmente utilizadas incluyen la digestión enzimática junto con el enfoque recomendado basado en reactivos genómicos10x 11. En particular, la digestión enzimática es significativamente más rentable que el método basado en reactivos; sin embargo, requiere múltiples iteraciones preexperimentales para optimizar la selección de enzimas y la duración de la digestión.

En este estudio, se realizaron experimentos preliminares utilizando varias combinaciones de enzimas. El método seleccionado cumplió con los requisitos básicos para el control de calidad posterior a pesar de carecer de un kit de reactivos genómicos 10x diseñado específicamente para la disociación de la piel de espesor total del ratón. En su lugar, se utilizó el kit de disociación multitejido 1 para obtener suspensiones unicelulares de alta calidad. Sin embargo, es importante tener en cuenta el costo relativamente alto asociado con este método, aunque ofrece una estabilidad superior en comparación con las técnicas internas de digestión enzimática. Para muestras valiosas, se recomienda el uso del método de disociación basado en reactivos de genómica 10x.

Es crucial considerar el impacto potencial de la variabilidad interindividual en la viabilidad celular, ya que esto puede dar lugar a que algunas muestras no cumplan con los criterios requeridos y, por lo tanto, afectar la calidad de los datos posteriores12.

En el lado positivo, este método brinda oportunidades para la integración con transcriptómica espacial u otros enfoques multiómicos, ofreciendo así un marco analítico más completo13. Además, sus potenciales aplicaciones clínicas ponen de manifiesto su versatilidad y relevancia más allá de los contextos de investigación básica.

Divulgaciones

Los autores declaran no tener ningún conflicto de intereses.

Agradecimientos

Esta investigación fue financiada por la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (#82373494).

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
75% AlcolcholLiuheJIUJING500ML
ratones C57/BL6JCharles River Laboratories
Colagenasa D + Dispasa IIRoche11088858001
Colagenasa IRoche5349907103
Colagenasa IVRoche5267439001
Hisopos de algodónHaishiMIANQIAN
Kit de eliminación de células muertasMiltenyi Biotec130-090-10
DNasa IRoche10104159001
gentleMAC DisociatorMiltenyi Biotec130-093-235
Hilo de nylon médicoJinlongHM507
Kit de disociación multitejido 1punzón Miltenyi Biotec130-110-201
aguja de biopsiaIntegra Miltex
solución de lisis de glóbulos rojosMiltenyi Biotec130-094-183
tijera quirúrgicaJingluJIANDAO
Vaselina blancaShangyuanBAIFANSHILIN

Referencias

  1. Zomer, H. D., Trentin, A. G. Skin wound healing in humans and mice: Challenges in translational research. J Dermatol Sci. 90 (1), 3-12 (2018).
  2. Wu, J., Landén, N. X. Investigation of skin wound healing using a mouse model. Meth Mol Biol. 2154, 239-247 (2020).
  3. Reinke, J. M., Sorg, H. Wound repair and regeneration. Eur Surg Res. 49 (1), 35-43 (2012).
  4. Dunn, L., et al. Murine model of wound healing. J Vis Exp. (75), e50265(2013).
  5. Ganguli-Indra, G. Protocol for cutaneous wound healing assay in a murine model. Meth Mol Biol. 1210, 151-159 (2014).
  6. Burja, B., et al. An optimized tissue dissociation protocol for single-cell rna sequencing analysis of fresh and cultured human skin biopsies. Front Cell Dev Biol. 10, 872688(2022).
  7. Levenberg, S., Ferreira, L. S., Chen-Konak, L., Kraehenbuehl, T. P., Langer, R. Isolation, differentiation and characterization of vascular cells derived from human embryonic stem cells. Nat Protoc. 5 (6), 1115-1126 (2010).
  8. Dead cell removal kit. , Available from: https://static.miltenyibiotec.com/asset/150655405641/document_9ndq9pouph0pvf6lmr5osgv41s?content-disposition=inline (2015).
  9. Chen, L., Mirza, R., Kwon, Y., Dipietro, L. A., Koh, T. J. The murine excisional wound model: Contraction revisited. Wound Repair Regen. 23 (6), 874-877 (2015).
  10. Rowland, M. B., Moore, P. E., Bui, C., Correll, R. N. Assessing wound closure in mice using skin-punch biopsy. STAR Protoc. 4 (1), 101989(2023).
  11. Gao, C., Zhang, M., Chen, L. The comparison of two single-cell sequencing platforms: Bd rhapsody and 10x genomics chromium. Curr Genomics. 21 (8), 602-609 (2020).
  12. Nguyen, Q. H., Pervolarakis, N., Nee, K., Kessenbrock, K. Experimental considerations for single-cell rna sequencing approaches. Front Cell Dev Biol. 6, 108(2018).
  13. Denisenko, E., et al. Systematic assessment of tissue dissociation and storage biases in single-cell and single-nucleus rna-seq workflows. Genome Biol. 21 (1), 130(2020).

Reimpresiones y permisos

Etiquetas

Suspensi n de c lulas individualesdisociaci n de tejidoscicatrizaci n de heridaslesi n de espesor totalc lulas madre mesenquimalesves culas extracelularessecuenciaci n de c lulas individualespreparaci n de enzimasbiopsia cut nea por punch