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Research Article
Milad Almasian1, Alireza Saberigarakani1, Xinyuan Zhang1, Brian Lee1, Yichen Ding1,2,3
1Department of Bioengineering,The University of Texas at Dallas, 2Center for Imaging and Surgical Innovation,The University of Texas at Dallas, 3Hamon Center for Regenerative Science and Medicine,UT Southwestern Medical Center
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
El protocolo utiliza microscopía avanzada de lámina de luz junto con métodos de limpieza de tejidos adaptados para investigar estructuras cardíacas intrincadas en corazones de roedores, con un gran potencial para la comprensión de la morfogénesis y la remodelación cardíaca.
La microscopía de lámina óptica (LSM) desempeña un papel fundamental en la comprensión de la intrincada estructura tridimensional (3D) del corazón, proporcionando información crucial sobre la fisiología cardíaca fundamental y las respuestas patológicas. A continuación, profundizamos en el desarrollo e implementación de la técnica LSM para dilucidar la microarquitectura del corazón en modelos de ratón. La metodología integra un sistema LSM personalizado con técnicas de limpieza de tejidos, mitigando la dispersión de la luz dentro de los tejidos cardíacos para la obtención de imágenes volumétricas. La combinación de LSM convencional con costura de imágenes y enfoques de deconvolución multivista permite la captura de todo el corazón. Para abordar la compensación inherente entre la resolución axial y el campo de visión (FOV), introducimos un método de microscopía de lámina de luz de barrido axial (ASLM) para minimizar la luz desenfocada e iluminar uniformemente el corazón en toda la dirección de propagación. Mientras tanto, los métodos de limpieza de tejidos, como iDISCO, mejoran la penetración de la luz, lo que facilita la visualización de estructuras profundas y garantiza un examen exhaustivo del miocardio en todo el corazón. La combinación de los métodos de LSM y limpieza de tejidos propuestos presenta una plataforma prometedora para los investigadores en la resolución de estructuras cardíacas en corazones de roedores, con un gran potencial para la comprensión de la morfogénesis y la remodelación cardíaca.
La insuficiencia cardíaca sigue siendo la principal causa de mortalidad en todo el mundo, principalmente debido a la falta de capacidad regenerativa de los cardiomiocitos maduros1. La intrincada arquitectura del corazón desempeña un papel crucial en su función y proporciona información sobre los procesos de desarrollo. Una comprensión profunda de la estructura cardíaca es esencial para dilucidar los procesos fundamentales de la morfogénesis y la remodelación cardíaca en respuesta al infarto de miocardio. Avances recientes han demostrado que los ratones neonatos pueden restaurar la función cardíaca después de una lesión, mientras que los ratones adultos carecen dedicha capacidad regenerativa. Esto establece una base para investigar las señales asociadas con anomalías estructurales y funcionales en modelos de ratón. Los métodos de imagen tradicionales, como la microscopía confocal, tienen limitaciones técnicas, incluida la profundidad de penetración restringida, el esquema de escaneo de punto lento y el daño fotográfico por la exposición prolongada a la luz láser. Esto dificulta la obtención de imágenes tridimensionales (3D) completas del corazón intacto. En este contexto, la microscopía de lámina óptica (LSM) surge como una solución poderosa, que ofrece las ventajas de la obtención de imágenes de alta velocidad, la reducción del daño fotográfico y las capacidades excepcionales de corte óptico 3,4,5. Las características únicas de la LSM lo posicionan como un método prometedor para superar las limitaciones de las técnicas convencionales, proporcionando conocimientos sin precedentes sobre el desarrollo cardíaco y los procesos de remodelación 6,7,8.
En este protocolo, introducimos una estrategia de imagen que combina LSM avanzado con enfoques de limpieza de tejidos adaptados9, lo que permite la obtención de imágenes de corazones de ratón completos sin la necesidad de un etiquetado específico y un corte mecánico. Además, proponemos que las imágenes convencionales de LSM se pueden mejorar a través de técnicas de deconvolución multivista10 o microscopía de lámina de luz de barrido axial (ASLM) 11,12,13,14,15 para mejorar la resolución axial. Además, la integración de la unión de imágenes con cualquiera de estos métodos puede superar eficazmente el equilibrio entre la resolución espacial y el campo de visión (FOV), avanzando así en la obtención de imágenes de corazones de ratón adultos. La incorporación de numerosos enfoques de limpieza de tejidos, incluidos los métodos hidrofóbicos, hidrófilos y basados en hidrogel, permite una penetración más profunda de la luz para capturar la morfología de todo el corazón 16,17,18,19.
Si bien los múltiples métodos de eliminación son compatibles con los sistemas LSM actuales, el objetivo es minimizar la dispersión de fotones y mejorar la penetración de la luz en los tejidos, como el corazón, reemplazando los lípidos con un medio que coincida estrechamente con su índice de refracción. iDISCO fue elegido como el representativo20,21 y adaptado para la obtención de imágenes de autofluorescencia en este protocolo debido a su rápido procesamiento y alta transparencia (Figura 1A). En conjunto, la integración del enfoque avanzado de LSM con las técnicas de limpieza de tejidos ofrece un marco prometedor para desentrañar la intrincada anatomía cardíaca en corazones de roedores, con un potencial significativo para avanzar en nuestra comprensión de la morfogénesis y la patogénesis cardíacas.
Los protocolos y experimentos con animales han sido aprobados y llevados a cabo bajo la supervisión del Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales de la Universidad de Texas en Dallas (IACUC # 21-03). En este estudio se utilizaron ratones C57BL6, incluidos neonatos en el día postnatal 1 (P1) y adultos de 8 semanas de edad. No se observaron diferencias entre machos y hembras. Toda la adquisición de datos y el post-procesamiento de imágenes se llevaron a cabo utilizando software de código abierto o plataformas con licencias de investigación o educativas. Los recursos están disponibles a través de los autores previa solicitud razonable.
1. Preparación de la muestra y limpieza de tejidos (6 - 10 días)
2. Montaje de la muestra (1 día)
NOTA: En caso de que se utilice un sistema LSM comercial, siga su protocolo específico proporcionado por la compañía para reparar el corazón y omita los pasos 2.1 - 2.9.

3. Costura de imágenes (4-8 h)
4. Deconvolución multivista (5 días)
5. Herrajes del sistema de lámina de luz de barrido axial (1 día)
6. Sincronización del sistema de lámina de luz de barrido axial (7 días)


Se ha demostrado que la LSM fomenta los estudios cardíacos 31,32,33,34,35,36,37 debido al riesgo mínimo de daño fotográfico, alta resolución espacial y seccionamiento óptico en comparación con otros métodos de imagen óptica como las técnicas de campo claro y escaneo puntual 6,8,38,39,40 . Por lo tanto, para comprender mejor la arquitectura miocárdica 3D, hemos establecido el protocolo basado en enfoques primarios que incluyen el aclarado iDISCO adaptado, la unión de imágenes, la deconvolución multivista y ASLM. Si bien presentamos los resultados utilizando modelos de ratones, es importante tener en cuenta que los modelos de ratas y otros roedores también son adecuados para los métodos propuestos. El protocolo de limpieza de tejidos adaptado permite hacer transparente el corazón de ratón P1 en 4 días y el corazón de ratón de 8 semanas de edad en 7 días (Figura 1B). Este paso sirve como punto de partida para minimizar la absorción y dispersión de fotones en el corazón intacto. La deconvolución multivista permite mejorar la resolución axial mediante la fusión de imágenes de múltiples perspectivas en un solo modelo. Después de registrar secuencialmente imágenes de 6 vistas del mismo corazón, el método de deconvolución multivista logra una resolución casi isotrópica con un lateral de 4,68 μm y un axial de 5,06 μm, después de 15 h de cálculo (Figura 8A). Para obviar la complejidad computacional, personalizamos aún más un ASLM basado en ETL para obtener imágenes de corazones de ratones neonatos a adultos. Este método nos permite escanear el miocardio con un rayo láser muy enfocado, minimizando el fondo desenfocado y mejorando el contraste de la imagen en comparación con los métodos convencionales de LSM (Figura 8B). Con el diseño actual de ASLM, las resoluciones lateral y axial promediadas del sistema alcanzan 2,18 μm y 2,88 μm, respectivamente, lo que permite una exploración en profundidad de la trabeculación miocárdica en los ventrículos. Además, la unión de imágenes se puede utilizar de forma independiente o en combinación con la deconvolución multivista o ASLM para expandir el campo de visión para tamaños de muestra más grandes. La integración de la sutura con ASLM nos permite cubrir todo el corazón del ratón de 8 semanas con una resolución uniforme (Figura 8C), proporcionando una solución eficaz para investigar la sección transversal de todo el corazón.

Figura 1: Proceso de limpieza de tejidos. (A) El método hidrofóbico implica la deshidratación de tejidos, la extracción de lípidos y la coincidencia del índice de refracción utilizando éter dibencilo (DBE) como solvente orgánico. (B) Sumerja el corazón en una mezcla de solución de formaldehído (PFA) al 4% y deshidrételo con un gradiente de mezclas de metanol y agua desionizada (DI). Blanquear el corazón con 5% H2O2 en metanol a 4 °C. Delipidar el corazón con diclorometano (DCM) y solución de metanol hasta que la muestra se hunda hasta el fondo del tubo. Por último, incubar el corazón en DBE para obtener el índice de refracción deseado. Líneas de cuadrícula de 5 mm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Esquema de la microscopía de lámina de luz de barrido axial. (A) Cámara impresa en 3D personalizada, (B) imán de cámara, (C) soporte de abrazadera y (D) sistema ASLM. Abreviaturas: CL: lente cilíndrica; ETL: lente electrónica sintonizable; IL: lente de iluminación; DL: lente de detección; FW: rueda de filtros; TL: lente de tubo. Esta figura ha sido modificada de la Ref16. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Costura de imágenes y deconvolución multivista. (A-B) La unión de imágenes se utiliza para cubrir todos los corazones del ratón, y cada mosaico tiene una superposición de FOV del 10% con sus mosaicos adyacentes. (C) Patrón de movimiento del corazón del ratón para la unión de imágenes. (D) Las perlas fluorescentes se fijan al extremo del tubo de vidrio para facilitar el registro de la imagen, mientras que el corazón se coloca dentro del tubo de vidrio que contiene DBE, lo que permite obtener imágenes simultáneas tanto del corazón del ratón como de las perlas fluorescentes. (E) La deconvolución multivista implica la adquisición de imágenes desde seis perspectivas distintas, cada una de las cuales reúne imágenes desde direcciones únicas. (F) Datos sin procesar del corazón de ratón P1 y las cuentas en diferentes ángulos de 0 °, 60 °, 120 °, 180 °, 240 ° y 300 °. Barras de escala: 500 μm. Esta cifra ha sido modificada de16. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Diagrama de bloques del sistema ASLM. Utilizando la tarjeta DAQ para sincronizar la cámara ETL y sCMOS. La carcasa del controlador ETL se ha abierto para soldar los cables de señal y tierra a la PCB. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5: Panel de control de LabView. Panel de control de LabVIEW para generar disparadores para sincronizar ETL y píxeles activados de la cámara sCMOS. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 6: Sincronización del foco de la hoja de luz con los píxeles activados. (A) La identificación de los puntos de inicio y finalización del rango de escaneo de la hoja de luz se logra configurando el voltaje apropiado para el disparador ETL. (B) El resultado sincrónico de las perlas fluorescentes es evidente a lo largo de la diagonal de la imagen. (C-F) La resolución espacial no uniforme en todo el campo de visión surge del funcionamiento asíncrono del ETL con la cámara sCMOS. El ETL inicia el escaneo (C) más tarde o (D) antes que el píxel activado. (E-F) El área focal no es paralela a la diagonal de la imagen, lo que indica una incompatibilidad entre las velocidades de escaneo y activación. ETL escanea (E) más rápido o (F) más lento que el barrido de píxeles activos en sCMOS. Barra de escala: 200 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 7: Resolución de problemas de ASLM. (A) La lámina de luz se coloca exactamente a la distancia focal de la lente de detección. El ETL escanea el foco de la lámina de luz a lo largo de la dirección de propagación mientras se sincroniza con el píxel activado del sensor sCMOS. (B) Vista XY de perlas fluorescentes cuando el ETL está correctamente alineado y sincronizado. (C-D) Resultados de perlas fluorescentes en el plano focal y desenfocadas en imágenes transversales, lo que indica la desalineación entre el escaneo ETL y la propagación del láser. Barras de escala: 200 μm y 10 μm en el recuadro. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 8: Imagen en hoja de luz de corazones de ratón. (A) Imagen renderizada en volumen del corazón de ratón P1 con deconvolución multivista que destaca la trabeculación dentro de la cavidad ventricular. (B) Imágenes transversales del corazón de un ratón de 8 semanas de edad generadas por LSM convencional (izquierda) y ASLM (derecha). Las imágenes se presentan como datos sin procesar. (C) Combinación de costura de imagen y ASLM para obtener imágenes de un corazón de ratón de 8 semanas de edad, compuesto por 12 mosaicos dispuestos en 3 mosaicos horizontalmente y 4 mosaicos verticalmente. Barra de escala: 500 μm. Abreviaturas: VI: ventrículo izquierdo, LA: aurícula izquierda, VD: ventrículo derecho y AR: aurícula derecha. Esta figura ha sido modificada de la Ref16. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Procedimiento | Tiempo (corazón de ratón P1) | Time (corazón de ratón de 8 semanas) | Temperatura | |
| Fijación en 4% PFA | Toda la noche | Toda la noche | 4°C | Preparación de la muestra |
| Lavar con 1x PBS | 30 minutos | 30 minutos | RT | |
| Lavar con 1x PBS | 30 minutos | 30 minutos | RT | |
| Lavar con 1x PBS | 30 minutos | 30 minutos | RT | |
| Incrustar con gel de agarosa | 1 h | 2 h | RT | |
| Incubar en 20% de metanol/80% de agua desionizada | 1 h | 2 h | RT | Deshidratación |
| Incubar en 40% de metanol/60% de agua desionizada | 1 h | 2 h | RT | |
| Incubar en 60% de metanol/40% de agua desionizada | 1 h | 2 h | RT | |
| Incubar en 80% de metanol/20% de agua desionizada | 1 h | 2 h | RT | |
| Incubar en metanol 100% | 1 h | 2 h | RT | |
| Incubar en metanol fresco 100% | 1 h | 2 h | RT | |
| Incubar en metanol fresco 100% | 10 minutos | 10 minutos | 4°C | Despigmentación |
| Lejía con 5% H2O2/metanol | Toda la noche | Toda la noche | 4°C | |
| Incubar en metanol 100% | 1 h | 1 h | RT | |
| Delipidato con 66% DCM/33% metanol en el agitador | 3 h | 3 h | RT | Delipemiación |
| Incubar en DBE en el agitador | 2 días | 5 días | RT | Coincidencia de instancias reservadas |
Tabla 1: Pasos de limpieza de tejidos personalizados para imágenes de autofluorescencia.
Los autores no tienen ningún conflicto de intereses que revelar.
El protocolo utiliza microscopía avanzada de lámina de luz junto con métodos de limpieza de tejidos adaptados para investigar estructuras cardíacas intrincadas en corazones de roedores, con un gran potencial para la comprensión de la morfogénesis y la remodelación cardíaca.
Expresamos nuestra gratitud al grupo del Dr. Eric Olson en UT Southwestern Medical Center por compartir generosamente los modelos animales. Agradecemos todos los comentarios constructivos proporcionados por los miembros de la incubadora D en UT Dallas. Este trabajo fue apoyado por NIH R00HL148493 (Y.D.), R01HL162635 (Y.D.) y el programa UT Dallas STARS (Y.D.).
| fusión Thermo | Fisher | 16520050 | |
| Agua desionizada | - | -< | |
| fuerte>Productos químicos para la limpieza de tejidos | |||
| 5-Amino-1,3,3-trimetilciclohexanemetilamina, mezcla de cis y trans | Sigma-Aldrich | 118184 | |
| D.E.R.&comercio; 332 | Sigma-Aldrich | 31185 | |
| D.E.R.&comercio; 736 | Sigma-Aldrich | 31191 | |
| Éter dibencílico (DBE) | Sigma-Aldrich | 33630 | |
| Diclorometano (DCM) | Sigma-Aldrich | 270997 | |
| Perlas fluorescentes | Spherotech | FP-0556-2 | |
| Peróxido de hidrógeno (H2O2) | Sigma-Aldrich | 216736 | |
| Metanol | Sigma-Aldrich | 439193 | |
| Paraformaldehído (PFA) | Thermo Fisher | 47392 | |
| Solución salina tamponada con fosfato (PBS) | Sigma-Aldrich | 79383 | |
| Cloruro de potasio (KCl) | Sigma-Aldrich | P3911 | |
| Software y algoritmos | |||
| Amira | Thermo Fisher Scientific | 2021.2 | |
| BigStitcher | Hö rl et al.22 | ||
| Fiji-ImageJ | Schindelin et al.20 | 1.54f | |
| HCImage Live | Hamamatsu Photonics | 4.6.1.2 | |
| LabVIEW | National Instruments Corporation | 2017 SP1 | |
| Key components of the customized light-sheet system | |||
| Cuerpo con zoom de 0,63 - 6,3X | Olympus | MVX-ZB10 | |
| Objetivo de iluminación 10X | Nikon MRH00105 | ||
| 1X objetivo de detección | Olympus | MV PLAPO 1X/0.25 | |
| Láser DPSS de 473 nm Tecnologías | debrillo láser | LRS-0473-PFM-00100-05 | |
| Láser DPSS de 532 nm | Tecnologías de brillo láser | LRS-0532-PFM-00100-05 | |
| 589 y delgado; Láser DPSS | nm Laserglow Technologies | LRS-0589-GFF-00100-05 | |
| Conector BNC | National Instrument | BNC-2110 | |
| Lente cilíndrica | Thorlabs | ACY254-050-A | |
| Controlador de motor de CC, 4 ejes | Physik Instrumente | C-884.4DC | |
| ETL | Optotune | EL-16-40-TC-VIS-5D-1-C | |
| Cable ETL | Optotune | CAB-6-300 | |
| ETL Controlador de lente | Optotune | EL-E-4i | |
| Filtro | Chroma | ET525/30 | |
| Filtro | Chroma | ET585-40 | |
| Filtro | Chroma | ET645-75 | |
| Rueda de filtros | Instrumento de obturación | LAMBDA 10-B | |
| Platina de traslación motorizada | Physik Instrumente | L-406.20DG10 | |
| Platina de traslación motorizada | Physik Instrumente | L-406.40DG10 | |
| Platina de traslación motorizada | Physik Instrumente | M-403.4PD | |
| NI E/S multifunción | National Instrument | PCIe-6363 | |
| Cámara sCMOS | Hamamatsu | C13440-20CU | |
| Motor paso a paso | Pololu | 1474 | |
| Lente | de tubo Olympus | MVX-TLU |