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Existen múltiples etapas en las que se puede evaluar que la diferenciación de los organoides de las vías respiratorias, las células endoteliales, las células inmunitarias y los cocultivos derivados de iPSC se ha completado con éxito. Las diferenciaciones se pueden realizar en diferentes líneas de iPSC, y este protocolo se ha probado en al menos cinco líneas diferentes. El protocolo debe adaptarse a cada nueva línea de iPSC, específicamente modificando y optimizando la densidad de siembra.
El rendimiento exitoso de los organoides de las vías respiratorias derivados de iPSC se puede evaluar a través de campo claro y tendrá cuatro características: límites/bordes definidos, morfología translúcida/quística, capacidad de proliferar/expandirse y ausencia de células necróticas. Los organoides de las vías respiratorias que parecen borrosos no aumentan de tamaño durante las 2 semanas de cultivo y tienen necrosis no deben usarse para experimentos de cocultivo. Organoides con una gruesa capa luminal en la periferia vs. Los organoides translúcidos/quísticos aún se pueden utilizar para experimentos posteriores. Sin embargo, los organoides translúcidos/quísticos de las vías respiratorias están compuestos predominantemente por células basales, mientras que los organoides gruesos de doble membrana están compuestos predominantemente por células club. Debido a que las células basales proliferan y se expanden fácilmente, son más adecuadas para el cultivo y la polarización de la interfase aire-líquido. Otros métodos para evaluar el rendimiento exitoso de los organoides pulmonares derivados de iPSC son el análisis de citometría de flujo en la etapa progenitora pulmonar (día 16 de la diferenciación) para el marcador de superficie CPM (Tabla 1), un rendimiento de diferenciación exitoso >50% de células CPM+.
Para la disociación de organoides de las vías respiratorias y el cultivo de interfase aire-líquido, asegúrese de que se haya eliminado todo el polímero de ECM, o evitará que las células se expandan en la membrana. Las células deben estar confluentes para el día 3 de cultivo, antes del levantamiento aéreo. La confirmación de los tipos de células en las vías respiratorias se puede evaluar mediante la tinción de los respectivos marcadores específicos del tipo de célula: células basales (p63+), células club (SCGB1A1+), células caliciformes (MUC5AC+) y células ciliadas (AcTub+). La caracterización y los marcadores distintivos del tipo de células pulmonares se verifican en LungMAP21. El mesénquima se puede detectar con anticuerpos contra la vimentina o la actina del músculo liso. Para generar más células ciliadas, los cultivos pueden requerir transporte aéreo durante un período de tiempo más largo o la adición de DAPT.
El rendimiento exitoso de las células endoteliales derivadas de iPSC se puede evaluar a través de campo claro, mostrando una morfología similar a un adoquín (día 6 de la diferenciación endotelial derivada de iPSC). Un cultivo endotelial exitoso derivado de iPSC contendrá >50% de células CD31+, y se deben generar suficientes células para que, después de la clasificación, el rendimiento sea de más de 500.000 células. Las células pueden ser conducidas o criopreservadas, y el marcador CD31 debe probarse a través del flujo con cada paso o nuevo cultivo. Las celdas no deben pasar más allá de P4. Como referencia, ver Células endoteliales derivadas de iPSC antes y después de la clasificación de CD31 (Figura 1C). Las células endoteliales serán planas con un cuerpo celular grande con morfología alargada y en forma de huso.
Para la diferenciación de macrófagos, los cuerpos embrioides deben permanecer en el fondo del pocillo de ULA, y solo debe haber un EB en cada pocillo. Deberían mostrar cambios quísticos entre el día 5 y el 7. Si no forman un EB después de la centrifugación, siembre las iPSC en la placa ULA de 96 pocillos sin girar. Puede ser necesario aumentar el número de iPSC. El éxito de las células inmunitarias derivadas de iPSC depende totalmente de la capacidad de los cuerpos embrioides (EB) para convertirse en quistes (día 7 de diferenciación). Las EB inmunitarias derivadas de iPSC que no desarrollan quistes no formarán estroma cuando se coloquen en gelatina y no producirán progenitores mieloides. Después de la transferencia a la placa recubierta de gelatina, los EB deben permanecer unidos a la parte inferior de la placa. El movimiento de la placa debe hacerse con cuidado para no desalojarlos. Las placas deben cambiarse manualmente dos veces por semana y las células suspendidas deben pasar a Mac-CM2 o criopreservadas. Además, después de recolectar los progenitores mieloides suspendidos, deben adherirse al matraz de plástico no recubierto y generar células brillantes en campo claro con vacuolas, lo que indica macrófagos. El marcador de monocitos, CD14+, debe estar en un >90% en las células en suspensión. El marcador de macrófagos, CD68, debería aumentar con el tiempo, con ~50% de macrófagos expresando CD68+ después de 2 semanas (Figura 1D). La eficiencia de adhesión debe determinarse para cada línea celular. Logramos un promedio de 20% de eficiencia de adherencia. Para la polarización, los macrófagos M0 se polarizan a macrófagos M1 (iPSC-M1) o M2 (iPSC-M2) durante 48 h en medio de diferenciación II suplementado con diferentes estímulos: 100 ng/mL LPS y 20 ng/mL IFN-g para la polarización M1 o 50 ng/mL IL-4 y 20 ng/mL IL-13 para la polarización M2. El marcador de polarización M1 es CD80+ y la polarización M2 es CD206+.
El éxito de la generación del triple cocultivo puede evaluarse mediante inmunofluorescencia para los marcadores epiteliales de unión estrecha EPCAM, ECAD o ZO-1, o el marcador de unión estrecha endotelial CD31 (Figura 2C, Tabla 1). La funcionalidad del triple cocultivo también puede evaluarse mediante la resistencia epitelial/endotelial transeléctrica (TEER). Los cocultivos de organoides y endoteliales de las vías respiratorias bien ensamblados tendrán una mayor resistencia eléctrica, lo que indica una comunicación y conexión celular óptimas. Las agresiones ambientales, como los cigarrillos electrónicos o el desafío viral, comprometerán la integridad de la barrera epitelial y endotelial, lo que resultará en una reducción de la resistencia eléctrica del cocultivo (Figura 3A, B) y uniones estrechas desorganizadas (Figura 3C).

Figura 1: Diferenciación y caracterización de cultivos de epitelio, endotelio e inmunitarios de vías respiratorias derivados de iPSC. (A) Esquema de las diferenciaciones dirigidas por iPSC para el montaje de la iAirway. (B) Organoides de epitelio de las vías respiratorias derivados de iPSC caracterizados por campo claro (izquierda) y análisis de citometría de flujo (derecha) para EPCAM y ECAD. (C) Endotelio de las vías respiratorias derivado de iPSC caracterizado por campo claro (izquierda), inmunofluorescencia y análisis de citometría de flujo (derecha) para CD31. A la derecha se muestra el campo claro respectivo después de la clasificación CD31. (D) Los macrófagos derivados de iPSC se caracterizan mediante análisis de campo claro (izquierda) y citometría de flujo (derecha) para el marcador hematopoyético pan-CD45, el marcador de monocitos CD14 y el marcador de macrófagos CD68. Barras de escala: 100 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Cocultivo de células epiteliales, mesenquimales, endoteliales y macrófagos derivadas de iPSC. (A) Esquema del montaje de la vía aérea. (B) Imágenes de campo claro del respectivo monocultivo epitelial y endotelial, el bicultivo epitelial y endotelial, y el cocultivo epitelial, endotelial y macrófago. Macrófagos marcados con citotracker rojo. Barras de escala: 100 μm. (C) Tinción inmunofluorescente para el marcador de unión estrecha ZO-1 en el lado apical del inserto de cultivo celular y CD31 en el lado basolateral. Barras de escala: 100 μm. (D) Sección transversal del inserto de cultivo celular con organoides de vía aérea disociados en el lado apical, 1 semana después del levantamiento aéreo. El panel izquierdo con tinción de H&E con la flecha negra muestra las células ciliadas. El panel central, con imágenes de inmunofluorescencia, muestra el marcador epitelial E-cadherina (ECAD). El panel derecho, con imágenes de inmunofluorescencia, muestra marcadores mesenquimales como la vimentina (VIM) y la actina del músculo liso (SMA). Barras de escala: 100 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Cambios en la función de barrera de las vías respiratorias de las vías respiratorias expuestas a cigarrillos electrónicos y virus. (A) Esquema de la herramienta de medición de resistencia epitelial/endotelial transeléctrica (TEER). (B) Gráfico de barras de TEER después de 7 días de adición de cigarrillos electrónicos mentolados a los medios. Media +/- intervalo de confianza del 95%. N = 5 réplicas biológicas y 3 réplicas técnicas; Valor p <0,001. (C) Tinción inmunofluorescente para la proteína de unión estrecha ZO-1 antes y después de la infección por SARS-CoV-2. Obsérvese el diseño desordenado de ZO-1 después de la infección. Barras de escala: 50 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Anticuerpo | Aplicación | Dilución |
| CD 31 PECAM-1(APC) | citometría de flujo (FC) | 10 μl en tampón de 100 ul |
| EPCAM/CD 326 (APC) | FC | 1:500 |
| E-CAD/CD 324 (APC) | FC | 5 μl en tampón de 100 ul |
| CPM | FC | 1:200 |
| CD 45 (PE) | FC | 5 μl en tampón de 100 ul |
| CD 14 (FITC) | FC | 5 μl en tampón de 100 ul |
| CD 68 (PE) | FC | 5 μl en tampón de 100 ul |
| ZO-1 | Inmunofluorescencia (IF) | 1:300 |
| Vimentina | SI | 1:200 |
| SMA | SI | 1:100 |
Tabla 1: Anticuerpos utilizados en FACS e Inmunofluorescencia.
Archivo complementario 1: Composiciones de medios y búferes. Haga clic aquí para descargar este archivo.