Helicobacter pylori es una bacteria gramnegativa en forma de espiral que puede infectar de forma persistente el epitelio gástrico humano1. En 1994, la Organización Mundial de la Salud clasificó a H. pylori como un carcinógeno del Grupo 1 para el cáncer gástrico, con ~ 3% de los individuos infectados que finalmente desarrollaron la enfermedad2. Una revisión sistemática recientemente publicada ha indicado que en la última década se observó una tendencia general de aumento de la tasa de resistencia a antibióticos de H. pylori , que ha alcanzado niveles alarmantes en todo el mundo, especialmente la resistencia a la claritromicina3. En China, los datos de la última encuesta mostraron que la prevalencia agregada de H. pylori entre los chinos urbanos es del 27,08%; las tasas de resistencia para claritromicina y levofloxacino fueron del 50,83% y 47,17%4, que son superiores a las de Estados Unidos (levofloxacino 37,6%, claritromicina 31,5%)5y Europa (levofloxacino 15,8% y claritromicina 21,4%)6. En consecuencia, el diagnóstico y el tratamiento tempranos y precisos son cruciales. Sin embargo, el aumento de la resistencia a los antibióticos de H. pylori reduce considerablemente la eficacia del tratamiento, lo que pone de manifiesto la necesidad urgente de realizar investigaciones continuas sobre su diagnóstico y tratamiento.
Los métodos diagnósticos de H. pylori se clasifican en técnicas invasivas y no invasivas7. Los métodos invasivos incluyen el examen histopatológico, la prueba rápida de ureasa (RUT) y el cultivo bacteriano8. El examen histopatológico se basa en el procesamiento y la observación microscópica de las muestras de biopsia, con una precisión limitada por la preparación histológica y la experiencia en patología9. RUT detecta H. pylori a través de la actividad de la ureasa, que hidroliza la urea para producir amoníaco, lo que resulta en un cambio alcalino en el reactivo, lo que indica la presencia de la bacteria9. Es simple y rentable. El cultivo bacteriano, considerado el "estándar de oro", a menudo tiene una tasa de éxito inferior al 50% debido a las características fisiológicas únicas de H. pylori10.
Los métodos no invasivos incluyen la prueba de aliento con urea 13C/14C (UBT), el diagnóstico serológico y la prueba de antígeno en heces (SAT)11. La prueba de aliento funciona según un principio similar al del RUT, detectando CO2 marcado isotópicamente en el aire exhalado para confirmar la infección12. El diagnóstico serológico detecta anticuerpos, que pueden persistir después de la erradicación bacteriana, lo que dificulta la evaluación de la efectividad del tratamiento13. Las pruebas de antígenos en heces detectan antígenos específicos de H. pylori en muestras fecales, proporcionando un método no invasivo confiable con una tasa más baja de falsos positivos y una buena precisión para el diagnóstico de infecciones activas14.
Cada método diagnóstico tiene sus ventajas y limitaciones15. Aparte del cultivo bacteriano, otros métodos tienen dificultades para detectar la resistencia a los antibióticos, mientras que el cultivo se ve obstaculizado por las bajas tasas de éxito16. Recientemente, los métodos de diagnóstico molecular, como la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR), se han aplicado ampliamente a la detección microbiana17. La qPCR puede detectar con precisión H. pylori y analizar las mutaciones de los genes de resistencia, ofreciendo una visión más completa de la infección18.
Las sondas fluorescentes están diseñadas para unirse específicamente a una secuencia objetivo en el ADN durante el proceso de qPCR. Estas sondas generalmente se marcan con un tinte fluorescente, que emite una señal cuando la sonda se une a su objetivo y es escindida por la polimerasa durante la amplificación. Esto proporciona una medición en tiempo real del proceso de PCR. Las sondas fluorescentes son conocidas por su alta especificidad debido al diseño único de la sonda, que garantiza que solo se detecte la secuencia de ADN objetivo, lo que reduce las posibilidades de unión no específica y mejora la especificidad del ensayo. Esto hace que la tecnología de sonda fluorescente sea especialmente útil para detectar objetivos de baja abundancia, como el ADN de Helicobacter pylori en muestras de heces. Si bien SYBR Green es un colorante de unión al ADN comúnmente utilizado en PCR, puede unirse a cualquier ADN bicatenario, lo que puede resultar en una amplificación inespecífica y falsos positivos.
El cultivo de Helicobacter pylori a partir de muestras clínicas no proporciona datos directos sobre la resistencia a los antibióticos. Por el contrario, la qPCR basada en sonda fluorescente es más rápida, más cómoda y puede adaptarse para la detección simultánea de H. pylori y marcadores de resistencia a los antibióticos. Este método no solo ofrece resultados más rápidos que los métodos de cultivo tradicionales, sino que también permite la detección simultánea de genes de resistencia a los antibióticos, lo que mejora en gran medida la eficiencia y la comodidad de la detección. Este método proporciona una forma conveniente, rápida y no invasiva de diagnosticar la infección y la resistencia a H. pylori , a diferencia del cultivo bacteriano tradicional y otras técnicas.
Hay dos cuestiones cruciales que deben tenerse en cuenta para la resistencia a los antibióticos de H. pylori : i) la consistencia del genotipo y el fenotipo, ii) la resistencia a múltiples fármacos. Un estudio multicéntrico a gran escala en China encontró que los patrones de doble resistencia para claritromicina/levofloxacino eran del 26,1%. Los fenotipos y genotipos de H pylori resistentes a claritromicina y levofloxacino mostraron una concordancia satisfactoria (coeficiente kappa = 0,810 y 0,782, respectivamente)19. Por lo tanto, es factible utilizar el método qPCR para detectar la infección por H. pylori y la resistencia a los medicamentos. Los métodos de prueba de antígeno en heces (SAT) y qPCR se utilizan cada vez más debido a la conveniencia del muestreo. La sensibilidad, especificidad y precisión de los métodos para la detección de H. pylori son las siguientes: qPCR > UBT > SAT > RUT> IgG > cultivo20. Todos los métodos no invasivos son adecuados para el cribado primario. Dado que la qPCR también puede detectar genes de resistencia a los fármacos, la qPCR y el cultivo serán más adecuados para guiar el tratamiento.
Otros enfoques innovadores, como los algoritmos de inteligencia artificial (IA) combinados con imágenes endoscópicas21, la microfluídica digital22 y RPA-CRISPR/Cas12a23, muestran teóricamente una buena eficiencia diagnóstica y perspectivas de aplicación prometedoras. Sin embargo, la qPCR es actualmente la técnica de biología molecular más sofisticada con el potencial de proporcionar una solución superior para el diagnóstico y tratamiento de las infecciones por H. pylori .