Se han propuesto varios métodos mecánicos para descontaminar las superficies de los implantes dentales con diverso éxito. Este estudio in vitro evaluó la eficiencia de descontaminación de un sistema de abrasión por aire (AA) con polvo de eritritol, una punta ultrasónica de poliéter-éter-cetona (PEEK) y curetas de titanio (TIT) y sus efectos en la topografía de la superficie del implante mediante microscopía electrónica de barrido (SEM). Un total de 60 implantes se teñieron con tinta roja permanente y se colocaron en defectos de periimplantitis de Clase 1A y Clase 1B impresos en 3D, formando seis grupos (n = 10 por grupo) según el tipo de defecto y el protocolo de tratamiento. Además, se utilizó un implante de control positivo y otro negativo. Se aplicó polvo de eritritol, puntas ultrasónicas de PEEK y curetas de titanio durante 2 minutos en los defectos de clase 1A y 3 minutos en los defectos de clase 1B. Las áreas residuales de tinta roja se cuantificaron con software digital y los cambios en la superficie del implante se analizaron mediante SEM y EDS. Ninguno de los métodos logró una descontaminación completa. Sin embargo, el polvo de eritritol fue significativamente el más efectivo, dejando una tasa de tinta residual del 24% ± 6% (p < 0,001). Las puntas ultrasónicas de PEEK dieron como resultado un 41% ± un 4% de tinta residual, mientras que las curetas de titanio dejaron un 55% ± un 3%. Se observaron diferencias significativas entre todos los métodos. No se encontraron diferencias significativas en la eficacia de la descontaminación entre los defectos de Clase 1A y Clase 1B. El análisis SEM mostró un daño superficial mínimo con polvo de eritritol y puntas de PEEK, mientras que las curetas de titanio causaron daños de moderados a graves. Basándose tanto en la eficiencia de la descontaminación como en la conservación de la superficie, el polvo de eritritol y las puntas de PEEK son opciones seguras y eficaces para el tratamiento de la periimplantitis, mientras que las curetas de titanio son menos eficaces y causan daños considerables en la superficie. Estos hallazgos pueden ayudar a los médicos en la planificación del tratamiento de la periimplantitis.