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Artículo de método

Un protocolo eficiente para evaluar la modulación de la actividad de ERK en modelos tempranos de síndrome de Noonan de pez cebra mediante microscopía FRET en vivo e inmunofluorescencia

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DOI:

10.3791/67831

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2 de mayo de 2025

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Autores correspondientes: Antonella Lauri <antonella.lauri@opbg.net>

En este artículo

Resumen

Las rasopatías son síndromes genéticos multisistémicos causados por la hiperactivación de la vía RAS-MAPK. Las variantes potencialmente patógenas que están a la espera de validación surgen continuamente, mientras que la escasa evidencia preclínica limita el tratamiento. Aquí, describimos nuestro protocolo in vivo para probar y validar los niveles de activación de ERK asociados a RASopatía y su modulación farmacológica durante la embriogénesis mediante imágenes FRET en vivo en pez cebra reportero.

Resumen

Las rasopatías son síndromes genéticos causados por la hiperactivación de ERK y que dan lugar a enfermedades multisistémicas que también pueden conducir a la predisposición al cáncer. A pesar de la amplia heterogeneidad genética, en la mayoría de los casos subyacen mutaciones de ganancia de función de la línea germinal en reguladores clave de la vía RAS-MAPK y, gracias a técnicas de secuenciación avanzadas, se siguen identificando variantes potencialmente patógenas que afectan a la vía RAS-MAPK. La validación funcional de la patogenicidad de estas variantes, esencial para un diagnóstico preciso, requiere protocolos rápidos y fiables, preferiblemente in vivo. Dada la escasez de tratamientos eficaces en la primera infancia, estos protocolos, especialmente si son escalables en modelos animales rentables, pueden ser fundamentales para ofrecer una base preclínica para el reposicionamiento/readaptación de fármacos.

Aquí describimos paso a paso el protocolo para la generación rápida de modelos transitorios de RASopatía en embriones de pez cebra y la inspección directa de los cambios vivos en la actividad de ERK asociados a enfermedades que ocurren ya durante la gastrulación a través de imágenes multiespectrales de transferencia de energía por resonancia de Förster (FRET) en tiempo real. El protocolo utiliza un reportero ERK transgénico recientemente establecido e integrado con el hardware de los microscopios comerciales. Proporcionamos un ejemplo de aplicación para modelos de pez cebra con síndrome de Noonan (SN) obtenidos por expresión del Shp2D61G. Describimos un método sencillo que permite el registro del cambio de señal de ERK en el modelo de peces NS antes y después de la modulación de la señal farmacológica por los inhibidores de MEK de dosis baja disponibles. Detallamos cómo generar, recuperar y evaluar señales FRET ratiométricas a partir de adquisiciones multiespectrales antes y después del tratamiento y cómo validar los resultados mediante inmunofluorescencia clásica en embriones enteros en etapas tempranas. A continuación, describimos cómo, mediante el examen de los parámetros morfométricos estándar, se pueden consultar los cambios tardíos en la forma del embrión, indicativos de un deterioro resultante de la gastrulación, en los mismos embriones cuya actividad de ERK se evalúa mediante FRET vivo a las 6 h después de la fertilización.

Introducción

Las rastopías son síndromes genéticos que alteran el desarrollo normal y afectan a diversos órganos y tejidos. Estas afecciones a menudo son causadas por mutaciones de ganancia de función (GoF) de la línea germinal en los genes clave y los actores involucrados en la señalización de RAS/MAK, lo que resulta en una hiperactivación (aumento de la fosforilación) de la quinasa regulada por señales extracelulares (ERK). ERK regula algunos procesos fundamentales importantes durante el desarrollo, como el crecimiento de los tejidos, mediante la translocación al núcleo 1,2. Las....

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Protocolo

Todos los procedimientos experimentales relacionados con el alojamiento y la cría de animales se llevaron a cabo de acuerdo con las directrices de ARRIVE para el uso de pez cebra en la investigación animal y autorizadas por el Ministerio de Salud italiano (Direzione Generale della Sanità Animale e dei Farmaci veterinari - DGSAF). Todas las reacciones de ADN/ARN y las sesiones de imágenes pueden ampliarse o reducirse según se desee, en función del material final necesario o del número de genes y variantes analizados.

1. Generación y tratamiento farmacológico de modelos transitorios de RASopatía de pez ....

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Resultados

Este protocolo muestra un flujo de trabajo simple para generar rápidamente modelos transitorios de RASopatía en embriones de pez cebra y evaluar las fluctuaciones de ERK en mutantes tempranos con un método estándar de imágenes FRET en vivo aplicado a un sensor de pez cebra ERK recientemente establecido 6,9. Como se ha demostrado recientemente 6,7 dentro del mismo flujo de.......

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Discusión

A pesar de décadas de investigación y de una miríada de mutaciones que conducen a formas muy heterogéneas de rasopatías ahora mapeadas, siguen surgiendo variantes genéticas de significado desconocido a partir de los esfuerzos de secuenciación en pacientes no diagnosticados. De hecho, en muchos casos, el diagnóstico basado únicamente en las características clínicas puede ser un desafío y los enfoques genómicos funcionales para validar los resultados de la secuenciación siguen siendo cruci.......

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Agradecimientos

Agradecemos al Dr. Jeroen den Hertog (Instituto Hubrecht, Utrecht, Países Bajos) por proporcionar amablemente pCS2+_eGFP-2a-Shp2a de la que se extrajo el CDS completo de shp2 para generar la plantilla de plásmido que utilizamos7. Agradecemos al Instituto de Ciencia y Tecnología de Nara (Takaaki Matsui), al Instituto Nacional de Genética (NIG/ROIS) (Koichi Kawakami), por proporcionar la línea de reporteros adolescentes transgénicos. Este trabajo fue apoyado por el Ministerio de Salud italiano - Fondos de Investigación Corriente 2021 y Fondos de Investigación Corriente 2024 y Ricerca Finalizzata....

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Plásticos
1,7 L Acuario de cría - Diseño estilo playaTecniplast1.7L INCLINADOAcuario reproductor
Capilares GC100F-10Aparato de Harvard30-0019Microinyección embrionaria en etapa unicelular
Placas de cultivo celular y tisular - 12 pozosBIOFILTCP011012Recogida y tratamiento de embriones
Placas de cultivo celular y tisular - 6 pozosBIOFILTCP011006Recogida y tratamiento de embriones
Plato de cultivo celularSPL Ciencias de la Vida20100Colección de embriones  
Platos de vidrio Nunc 12mmThermo Fisher150680Imagen espectral FRET de embriones
Pipeta PasteurCorning357524Transferencia embrionaria
Tubos Lobind de proteínas 2 mlEppendorf30108450Ensayo IHC
reactivos y otros
Caviar 500-800 y micro; mRettenmaier ItaliaBE2269 (500-800)Pienso seco para peces
Quistes de artemia azul del Gran Lago SaladoSanders00004727Alimento para peces vivos
Sal oceánica instantáneaTecniplastXPSIO25RSal marina deshidratada para la preparación de alimentos vivos
Tg(EF1a:ERK Biosensor-nes) (Teen)Contactos para pedido*:
Proyecto Nacional de Recursos Biológicos Zebrafish, Unidad de Apoyo para el Desarrollo de Recursos Animales, RRD, RIKEN Center for Brain Science, Japón. https://shigen.nig.ac.jp/zebra/index_en.html *sobre la firma de la MTA. 
-Proveedor de la línea de pez cebra ERK Reporter. Los embriones de peces pueden obtenerse mediante la firma MTA del Proyecto Nacional de Recursos Biológicos de Japón para pez cebra (RIKEN, Japón). La línea de pez cebra es depositada por el Instituto de Ciencia y Tecnología de Nara (Takaaki Matsui) y el Instituto Nacional de Genética (NIG/ROIS) (Koichi Kawakami, patente para el sistema Tol2) (Wong et al., 2018, Urasaki et al., 2006, Okamoto e Ishioka, 2010).
6x tinte de cargaSeñalización celularB7024SElecroforesis en gel
Escalera de ADN de 100 pbNEBN3231SElecroforesis en gel
AgaroseSigma-Aldrich1,01,236Elecroforesis en gel
Agarosa, baja temperatura de gelificaciónSigma-AldrichA9414-10GMontaje del embrión para imágenes espectrales FRET y ensayo IHC
Albúmina sérica bovina (BSA)Sigma-AldrichA8022Ensayo IHC
Cloruro de calcioSigma-Aldrich223506Componente medio E3
Nitrato de calcioSigma-Aldrich237124Componente de solución de acción Danieau
Dimetilsulfóxido (DMSO)Sigma-AldrichD8418-100MLEnsayo IHC
EDTASigma-AldrichE9884Componente tampón TBE para la preparación del gel
Etanol 99%+Fisher Scientific10048291Purificación in vitro de ARN
Formaldeide 16%Thermo Fisher28908Fijación embrionaria
Formamida y nbsp;Sigma-AldrichF9037Elecroforesis en gel
Buffer de Carga de Gel II (PÁGINA de Desnaturalización)Thermo FisherAM8546GTranscripción in vitro de ARN
Ácido acético glaciarSigma-Aldrich695092Componente tampón TBE para la preparación del gel
Glicerol y nbsp;Sigma-AldrichG6279-1LEnsayo IHC
Alexa Fluor 488 anti-ratón para cabraThermo FisherA11001Ensayo IHC
Anti-conejo para cabras Alexa Fluor 633Thermo FisherA21070Ensayo IHC
HEPESSigma-AldrichH3375Componente de solución de acción Danieau
KpnI - HF (Enzima + buffer rCutSmart)NEBR3142Linealización de plásmidos  
Sulfato de magnesioSigma-Aldrich230391Componente medio E3/componente de solución Danieau stock
Marcadores de ARN del MilenioThermo FisherAM7150Elecroforesis en gel
Kit de purificación de ADN Genómico MonarchNEBT3010LLinealización de plásmidos  
MAPK monoclonal de ratón p44/42Señalización celular4696SEnsayo IHC
Kit de transcripción mMACHINE SP6  Thermo FisherAM1340Transcripción in vitro de ARN
Suero normal de cabra (NGS)Sigma-AldrichG9023Ensayo IHC
Ambión de agua libre de nucleasasThermo FisherAM9937Transcripción in vitro de ARN
PD0325901Sigma-AldrichPZ0162Inhibidor MEK
Solución de fenol rojoSigma-AldrichP0290Componente de mezcla de microinyección  
Kit de relaves Poly AThermo FisherAM1350Transcripción in vitro de ARN
Cloruro de potasio bioxtra Sigma-AldrichP9333Componente medio E3/componente de solución Danieau stock/componente de solución stock PBS
Dihidrógeno fosfato de potasioSigma-AldrichP0662Componente de solución stock PBS
Proteinasa KSigma-AldrichP2308Ensayo IHC
Fosfo-p44/42 policlonal de conejo MAPK Señalización celular4695SEnsayo IHC
Tinción en gel de ADN seguro para SYBRThermo FisherS33102Elecroforesis en gel
Cloruro de sodioSigma-Aldrich31434-MComponente medio E3/componente de solución Danieau stock/componente de solución stock PBS
Dibásico fosfato de sodioSigma-Aldrich71643Componente de solución stock PBS
Base de TrizmaSigma-AldrichT1503Componente tampón TBE para la preparación del gel
Triton X-100Sigma-AldrichT8787Componente búfer PBSTr
Equipo
Alliance Mini HD9 y nbsp;Uvitec-Sistema de imagen
Centrífuga 5430 REppendorf5428000205Microcentrífuga
Eppendorf ThermoMixer CEppendorf-Montaje de embriones y nbsp;
FemtoJet 4xEppendorf-Sistema de microinyección
Infinite M Plex Tecan-Lector de placas multimodo
Leica M205FALeica Microsystems-Microscopio estereoscópico de fluorescencia
Leica TCS-SP8X equipada con incubadora (OkoLab)Leica Microsystems-Microscopio confocal
Sistema de electroforesis horiziontal GT Mini-subcélula  Bio-Rad1704406Elecroforesis en gel
PC-100 Tirador verticalNarishige-Extractor de agujas
Fuente de alimentación universal PowerPacBio-Rad1645070Elecroforesis en gel
Stellaris 5 Leica Microsystems-Microscopio confocal
Vortex MiniStar silverlineVWR-Preparación de plásmidos
Softwares
BiorenderBiorenderLicencia CC-BY 4.0Elaboración de caricaturas para figuras
ExcelMicrosoft Office Professional Plus 2019-Análisis de datos
Software de FiyiImageJ15.3tRenderizado de imágenes y análisis cuantitativos (mediciones de señales FRET, intensidad de fluorescencia ERK en el ensayo IHC, longitud de ejes embrionarios)
GraphPad Prism GraphPad Software LLCv. 9Análisis estadísticos de datos
Software de espectrofotómetro iControlTecanv. 2.0Cuantificación de ARN
IlustradorAdobe26.0.3 (64 bits)Montaje de figuras
Software LASXLeica Microsystemsv. 4.5 (Stellaris 5), v. 3.0 (M205FA), v. 3.5 (TCS-SP8X)Adquisición de imágenes para experimentos espectrales con FRET y imagen de embriones para mediciones de longitud de ejes
Software Q9 Mini 18.02-SNUvitec-Adquisición de imágenes en gel

Referencias

  1. Iroegbu, J. D., Ijomone, O. K., Femi-Akinlosotu, O. M., Ijomone, O. M. ERK/MAPK signalling in the developing brain: Perturbations and consequences. Neurosci Biobehav Rev. 131, 792-805 (2021).
  2. Tartaglia, M., Aoki, Y., Gelb, B. D.

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