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Un componente esencial del tratamiento de la periimplantitis es la descontaminación eficaz de las superficies del implante. La técnica ideal de descontaminación debe eliminar la biopelícula de forma segura y eficiente sin dañar la superficie del implante. Este estudio piloto tuvo como objetivo evaluar la eficacia de la limpieza y las alteraciones superficiales asociadas a tres protocolos mecánicos de descontaminación. Aquí, 12 implantes fueron teñidos con tinta roja imborrable y montados en bloques de acrílico para simular defectos periimplantales horizontales. La descontaminación superficial se realizó durante 2 minutos por el mismo examinador utilizando uno de los siguientes dispositivos: cepillo de titanio (TiB), cepillo de quitosano (ChB) o curette de titanio (TiC). No se usaron agentes químicos de descontaminación en combinación con las herramientas mecánicas. Se tomaron fotografías estandarizadas antes y después de la descontaminación desde las vistas bucales y orales frontales, así como en angulaciones de 30° y 60°. La superficie del implante sin limpiar se calculó digitalmente. Se utilizó microscopía electrónica de barrido (SEM) para evaluar la morfología superficial. Ninguno de los métodos probados logró eliminar completamente la mancha de tinta. Aunque el 75,98% ± el 2,42% de la mancha permaneció, el TiB mostró la mayor eficacia de limpieza en las vistas bucal y oral frontal (p = 0,027), seguido de TiC (80,3% ± restante 0,86% de tinción) y ChB (90,34% ± 6,07% de mancha restante). Se observaron diferencias significativas entre los grupos ChB y TiB (p = 0,022). El análisis SEM reveló que el TiC causaba el mayor daño superficial, mientras que el TiB producía alteraciones mínimas. Dentro de las limitaciones de este estudio piloto, TiB demostró una limpieza eficaz mientras preservaba la morfología superficial del implante. Estos hallazgos sugieren que los cepillos de titanio pueden representar una opción de descontaminación mecánica más segura y eficiente durante el tratamiento de la periimplantitis. Sin embargo, se requieren estudios adicionales para evaluar combinaciones de técnicas mecánicas y químicas que mejoren la eficacia de la limpieza.