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El método semiautomatizado para cartografiar y clasificar comunidades vegetales está diseñado para generar información precisa sobre la cobertura del suelo para humedales costeros, que están dominados por plantas herbáceas heterogéneas de bajo crecimiento y caracterizadas por microtopografía; véase un ejemplo de tal hábitat en la fotografía de la Figura 1. Se realizó un estudio de caso del humedal costero boreal báltico en la isla de Hiiumaa, Estonia. En el lugar, se muestrearon cuatro comunidades vegetales para entrenar el modelo de clasificación: Open Pioneer (OP), Lower Shore (LS), Upper Shore (EE. UU.) y Tall Grass (TG). La Figura 2 ofrece una visión concisa de la metodología implementada en cuatro fases distintas. En cambio, la Figura 3 ilustra una guía diagramática detallada que delimita pasos numerados y accionables acoplados por flechas para representar el flujo de datos, sintetizando así la metodología a lo largo de los pasos y fases del protocolo. Los resultados finales de este método, utilizando un sensor multiespectral y un sensor RGB, son mapas de comunidades vegetales multiespectrales y basados en RGB, que se almacenan como capas en un proyecto SIG junto con todos los conjuntos de datos intermedios. La calidad de los conjuntos de datos geoespaciales se evaluó al completar cada fase del protocolo, ya que la calidad de los resultados en las fases sucesivas depende de la calidad de los resultados de la fase anterior, culminando en la fase final, donde las entradas comprenden el agregado de todos los pasos previos.
A continuación se resumen los resultados de cada una de las cuatro fases del protocolo:
En la primera fase, el levantamiento aéreo de UAV se realizó a una altitud de 120 m, lo que arrojó una Distancia de Muestreo Terrestre (GSD) de aproximadamente 10 cm/píxel. El levantamiento aéreo produjo imágenes multiespectrales y con la visión RGB. Tras el postprocesado cinemático (PPK), se corrigieron las geoetiquetas para cada imagen de dron y las imágenes se mosaicaron en software profesional de fotogrametría para producir mapas de levantamiento aéreo. El procesamiento fotogramétrico de imágenes aéreas multiespectrales produjo archivos ráster con reflectancia ROJO, VERDE, NIR y Red-edge.
Las imágenes aéreas multiespectrales y RGB se procesaban como proyectos separados debido a las resoluciones inherentemente distintas de las fotografías. Véase la Figura 4 de la configuración de mosaico de imágenes en RGB. Figura 4A. Opciones de procesamiento seleccionando mosaicos fusionados y generando mapas de salida unificados y sin interrupciones. Figura 4B. la selección de cálculos automáticos de índices a partir de imágenes de cámaras RGB produjo cuatro mapas rasterizados: uno por banda (rojo, verde y azul) y el DSM (Digital Surface Model). Figura 4C. demuestra la generación de puntos de unión automáticos para coincidir píxeles comunes entre imágenes superpuestas durante el paso inicial de procesamiento. Junto con 3 índices RGB (rojo, verde, azul) y DSM, el software de fotogrametría generó un raster en escala de grises generado por el software: una representación monocromática de un solo canal que escala y combina las diferentes bandas (por ejemplo, rojo, verde, azul), con los valores bajos de píxeles que aparecen en negro y los valores altos en blanco. La formulación de este índice en escala de grises es específica del software y no está estandarizada en todas las plataformas de fotogrametría.
El software de fotogrametría generó informes de calidad que describen los resultados de procesamiento para ambos conjuntos de proyectos de mosaico de imágenes aéreas: multiespectral y RGB. Estos informes proporcionan métricas clave para validar la precisión. Los indicadores de resultados de alta calidad son el bajo error de reproyección: cuanto más cerca de 0, mejor (cualquier valor inferior a 1,0 generalmente se acepta). Por ejemplo, las "líneas de coincidencia" densas significan coincidencias fuertes entre la mayoría de las imágenes. Los mapas de salida fueron evaluados visualmente y se encontró libres de vacíos y otras discrepancias visuales. Las discrepancias visuales son señal de posibles errores de reflectancia y mosaico, así como de problemas subyacentes en la rejilla de georreferenciación. El informe de fotogrametría, junto con manuales de software específicos y recursos de formación, se utiliza para identificar el problema, encontrar una solución y reprocesar imágenes aéreas.
Los mapas de levantamiento aéreo de UAV sirvieron como base de datos para recalcular información espectral compleja en índices estandarizados basados en píxeles (es decir, índices de vegetación VIs generados en la tercera fase), permitiendo su uso como entradas estructuradas para la clasificación por aprendizaje automático (en la fase final del protocolo).
Se recopilaron observaciones biofísicas in situ como un conjunto de datos de verificación de terreno. En el lugar del estudio de caso (humedal costero boreal báltico), se identificaron y muestrearon cuatro comunidades clave de plantas vasculares: Open Pioneer (OP), Lower Shore (LS), Upper Shore (EE. UU.) y Tall Grass (TG). Utilizando el método de muestreo cuadrático estratificado delineado en la segunda fase del protocolo, la comunidad vegetal OP se identificó por la presencia de especies indicadoras: Salicornia europaea y Suaeda maritima; LS por altos porcentajes de Glaux maritima y Juncus geradii; EE. UU. por sus especies indicadoras: Festuca rubra y Leontodon autumnalis; mientras que TG se distingue por una presencia significativa de hierbas altas: Deschampsia cespitosa, Elytrigia repens y Molinia caerulea. Se recogieron al menos 10 muestras cuadradas para cada comunidad vegetal. Cada muestra cuadrática incluyó las siguientes observaciones biofísicas: composición de especies vegetales (%), humedad del suelo (%), alturas de la vegetación en centímetros y ubicaciones precisas de coordenadas cuadráticas. Estas variables se digitalizaron como un conjunto de datos tabulado, se importaron en GIS Project, se añadieron al archivo shapefile GNSS de cuadratura de muestra y se guardaron como un GeoPackage (.gpkg). Un archivo independiente de la plataforma, que contiene observaciones biofísicas de comunidades vegetales de humedales y datos precisos de coordenadas muestrales, cumple un doble propósito: para una evaluación y modelización adicional de ecosistemas ambientales y ecológicos. Lo más importante es que, para la ejecución exitosa de este protocolo, este archivo GeoPackage sirve como datos de entrenamiento y validación del modelo en el proceso de aprendizaje automático delineado en la fase 4. Codificación de comunidades vegetales: OP, LS, US, TG; se usaban como etiquetas de entrenamiento en el proceso de aprendizaje automático. La precisión (etiquetas de alta fidelidad, auditoría humana, formato consistente) y la estructura (formato limpio y rectangular (filas/columnas)) son cruciales para producir un conjunto de datos de verdad de terreno de alta calidad. Las etiquetas de verdad fundamental deben tener tasas de error casi nulas (por ejemplo, errores tipográficos) para garantizar convenciones de etiquetado consistentes. Por ejemplo, si "OP" es la verdad fundamental, es esencial asegurarse de que no esté etiquetado de otra manera (como "op", "O.P.") para evitar duplicaciones.
Para ejecutar la tercera fase del protocolo, se utilizaron los conjuntos de datos del levantamiento aéreo realizado en la primera fase para recalcular los datos brutos del levantamiento aéreo en índices de vegetación (VIs). Primero, para reducir el tamaño del conjunto de datos y agilizar el proceso informático, las salidas de fotogrametría "recortadas" para omitir datos de píxeles irrelevantes o de baja calidad fuera de los límites del sitio de estudio (véase la Figura 5 como ilustración de las acciones realizadas en un software SIG).
Luego, se calcularon 19 VI multiespectrales utilizando mapas de reflectancia RED, GREEN, NIR y Red-edge. Se generaron e incluyeron los siguientes archivos ráster multiespectrales VI en el Proyecto GIS: índice Datt 4 (Datt4)41, Índice de Vegetación Mejorado (EVI)42, Índice de Clorofila Verde (GCI)43, Índice de Diferencia de Verde (GDI)44, Índices de Vegetación de Diferencias Generalizadas (GDVI)45, Índice de Porcentaje de Vegetación Infrarroja Verde (GIPVI)46, Índice de Vegetación de Diferencia Normalizada Verde (GNDVI)47, Índice de Diferencia Verde-Roja (GRDI)44, Índice de Vegetación Verde-Rojo (GRVI)45, Índice de Vegetación de Diferencias Normalizadas Modificadas (mNDVI)48, Índice de Vegetación Modificado Ajustado enSuelo 49 (MSAVI: véase Figura 6. una captura de pantalla de una calculadora ráster en software SIG con entrada de fórmulas MSAVI), Relación Simple Modificada con borde rojo (MSRred_edge)50, Índice de Diferencia Normalizada del Agua (NDWI)51, Índice de Vegetación Diferencial Normalizada (NDVI)52, NDVI de Borde Rojo (NDVIre)47, Índice de Vegetación Triangulada de Borde Rojo (RTVIcore)50, Índice de Vegetación Ajustada del Suelo (SAVI)53,54, Ratio Simple (SR)55, Relación Simple-Borde Rojo (SRre)47.
Además, se calcularon y guardaron un total de 23 VI basados en RGB como archivos ráster en el proyecto GIS para análisis espaciales adicionales: Índice de Relación Azul–Verde (BGRI)57, Índice de Brillo (BI)58, Índice de Vegetación de Rango Dinámico Azul (BRVI)59, Índice de Color de la Vegetación (CIVE)60, Índice de Vegetación Vista Verde Mejorada (EGVI)61, Índice de Vegetación Mejorado (ERVI)62, Índice verde excedente ExG y ExGI63, índice de combinación (COM)64, Coordenada cromática verde (GCC)34,65, Índice de hoja verde (GLI)66, Índice de Vegetación Verde-Rojo (GRVI)67, Índice de Vegetación Verde Rojo Modificado (MGRVI)68, Índice de Diferencia Verde-Azul Normalizado (NGBDI)69, Índice Normalizado de Diferencia Verde-Rojo (NGRDI)69, Índice de Razón Rojo–Verde–Azul e Índice de Vegetación Rojo-Verde-Azul (RGBRI70) y RGBVI68), Índice de Relación Rojo-Verde (RGRI)57, Índice de Vegetación Ajustada del Suelo Visible (SAVI)53, Índice de Verdor Triangular (TGI)69, Índice Atmosférico Visible de Resistencia (VARI)47, Índice Vegetativo (VEG)71, Índice de Woebbecke (WI)63.
Los resultados finales incluyen dos mapas de clasificación de comunidades vegetales multiespectrales y RGB separados guardados como GeoTIFFs dentro del proyecto GIS, junto con todos los datos geoespaciales anteriores. Se utilizaron 19 VI multiespectrales, junto con el conjunto de datos ground-truth, como predictores a nivel de píxel en un flujo de trabajo de aprendizaje automático (por ejemplo, algoritmo de RF) para clasificar comunidades vegetales costeras boreales (OP, LS, US, TG) y generar un mapa multiespectral de comunidades vegetales. Y predictores basados en RGB (25 RGB VI, índice en escala de grises y56 índices normalizados rojo, azul, verde y DSM), junto con el conjunto de datos de verificación de terreno, para clasificar y generar un mapa de comunidades vegetales basado en RGB (véase la Figura 7). Las salidas finales se representaban en la consola R; La Figura 7A representa el multiespectral, y la Figura 7B representa los mapas de comunidades vegetales basados en RGB).
Para generar resultados finales, se utilizó el entorno R (fase 4 del protocolo) para programar y ejecutar el flujo de trabajo de aprendizaje automático (por ejemplo, algoritmo RF), permitiendo la visualización de salidas intermedias, como las clasificaciones de rendimiento del índice de vegetación (VI) (Figura 8). Al mapear y clasificar comunidades vegetales, la consola R proporcionaba mensajes de error y explicaciones en tiempo real, facilitando la resolución de problemas y asegurando una progresión fluida en cada paso.
Este estudio evaluó dos modelos de algoritmos RF para mapas de clasificación de comunidades vegetales. El primer modelo RF, utilizando VIs multiespectrales como conjunto de datos de entrada, alcanzó una precisión del 92,34% con una puntuación F1 de 0,915 en el conjunto de datos de validación. Este es un resultado válido, ya que las puntuaciones en F1 varían de 0 (peor) a 1 (perfecto), siendo puntuaciones más altas un rendimiento superior. La puntuación F1 en un modelo RF representa la media armónica de precisión y recuerdo. Esta métrica equilibra eficazmente falsos positivos y negativos, es decir, no permite que un tipo de error supere al otro, lo cual es esencial para conjuntos de datos desequilibrados, y con frecuencia se promedia entre clases o se reporta por clase para evaluar el rendimiento global delmodelo 78,79. La tasa de error OOB del modelo multiespectral fue del 7,75%, lo que indica un riesgo moderado de clasificación errónea. Las puntuaciones F1 a nivel de clase en el conjunto de datos de validación oscilaron entre 0,845 en TG y 0,984 en comunidades vegetales OP, lo que indica una variabilidad moderada en el rendimiento entre comunidades.
El segundo modelo de RF evaluado se basó en VIs y DSM derivados de la encuesta aérea del RGB, logrando una precisión del 98,89% con una puntuación global de F1 de 0,987. Su tasa de error OOB fue solo del 1,14%, lo que refleja una fiabilidad muy alta. Las puntuaciones F1 a nivel de clase fueron consistentemente altas (0,986–0,993), lo que indica una clasificación sólida para todas las comunidades.
El gráfico de importancia variable en R (Figura 8A) demostró las capacidades predictivas de cada VI para las comunidades vegetales de humedales costeros boreales. Los VI multiespectrales más influyentes como predictores fueron mNDVI y SR, que indican una fuerte sensibilidad a la vegetación y biomasa del dosel. De manera similar, GRDI, NDVIre y SRre también fueron altamente clasificados, reflejando el papel de los índices de margen rojo y de diferencias normalizadas en la distinción de tipos de vegetación. En cambio, el índice basado en RGB y el gráfico de importancia variable del DSM muestran que el modelo de altura estructural derivado del DSM como predictor es un factor clave de la precisión de la clasificación (Figura 8B). Otros predictores importantes incluyen TGI, escala de grises y VARI, que aprovechan la variabilidad de la reflectancia del RGB. Por tanto, estos resultados indican que el DSM y los índices derivados del RGB mejoran significativamente la fiabilidad de la clasificación y reducen el riesgo de clasificación incorrecta.
El conjunto de datos geoespacial completo se guardó como el Proyecto GIS, una carpeta que incluía mapas de levantamiento de UAV y VI, el GeoPackage de observación biofísica (verdad de terreno) y mapas de comunidades vegetales; todos enlazados como un proyecto QGIS (archivo .qgz). El proyecto es adecuado para uso offline y permite la interoperabilidad entre plataformas SIG.

Figura 1: Lugar de estudio. Fotografía con un pin de ubicación en el mapa global, señalando la isla de Hiiumaa en el archipiélago occidental de Estonia. El yacimiento de estudio, Kõrgessaare rannaniit, está situado en la aldea de Viscosa y es una zona de conservación natural. Tipo de hábitat: prado costero boreal báltico (código Natura 2000 1630). Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.

Figura 2: Diagrama conceptual de flujo de trabajo. (1) encuesta aérea basada en UAV, (2) recogida y georreferenciación de datos de precisión del suelo, (3) cálculo de índices de vegetación y (4) clasificación supervisada usando Random Forest in R. Los mapas reales de la implementación del protocolo ilustran este método de cuatro fases. Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.

Figura 3: Diagrama detallado del flujo de trabajo. El diagrama enumera las 4 fases (y pasos clave) del protocolo en paneles de diferentes colores, junto con conjuntos de datos generados en cada fase. Los arrors simbolizan el flujo de datos. El color azul distingue el conjunto de datos multiespectral del RGB en rojo. Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.

Figura 4: Ejemplo de software de fotogrametría. (A–C) Una captura de pantalla de un proyecto de mosaico de imágenes RGB: (A) Opciones de procesamiento para DSM y ortomosaicos. (B) Opciones de procesamiento para los índices rojo, verde y azul. (C) Vista del progreso del procesamiento, incluyendo imágenes aéreas y ángulos de cámara. Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.

Figura 5. Recorte de archivos raster de mapas en software GIS. Captura de pantalla de un espacio de trabajo QGIS con capas visibles y pestañas abiertas en secuencia que demuestran cómo recortar datos innecesarios: raster extraction-clip por extensión ("extent" en este caso se refiere a una forma de polígono dibujada según se desea y usada para enmascarar píxeles que caen fuera de sus límites) Por favor, haga clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.

Figura 6. Captura de pantalla de la calculadora raster del software GIS. Fórmula de introducción de índice de vegetación modificado ajustado por suelo (MSAVI) como ejemplo. Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.

Figura 7. Entorno de computación estadística para capturas de pantalla de la versión R que demuestran las salidas finales representadas en la consola R (RStudio). (A) mapas de comunidades vegetales multiespectrales y (B) basados en RGB. Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.

Figura 8. Entorno de computación estadística para capturas de pantalla de R que demuestran las clasificaciones de rendimiento VI. (A, B) Vistas de una consola R: (A) Captura de pantalla al usar VIs multiespectrales como conjunto de datos de entrada, y (B) Captura de pantalla al usar un conjunto de datos RGB+DSM. Ambas vistas (A y B) incluyen gráficos de importancia variable llamados "final_rf" (nombre del objeto generado por script). Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.
Archivo suplementario 1: Ecuaciones de índice de vegetación. Lista de ecuaciones multiespectrales y de índice de vegetación (VI) basadas en RGB utilizadas en este protocolo, incluyendo fórmulas para la normalización de bandas RGB antes del cálculo RGB VI. Por favor, haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo suplementario 2: script de clasificación y validación RF. Por favor, haga clic aquí para descargar este archivo.