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Características del conjunto de datos de implementación rutinaria
Durante el periodo del estudio, 197 muestras consecutivas superaron el cribado de elegibilidad y la evaluación preanalítica de calidad, y entraron en el flujo de trabajo reportable. La cohorte del estudio incluyó 98 pacientes, 62 (63,3%) con leucemia linfoblástica aguda de células B (B-ALL) y 36 (36,7%) con leucemia mieloide aguda (LMA). La cohorte estaba compuesta por 64 hombres (65,3%) y 34 mujeres (34,7%), con una edad mediana de 32 años (rango intercuartílico [IQR], 13–49 años; rango, 2–73 años). El porcentaje medio de blastos basal fue del 67,2% (IQR, 56,9% – 80,2%).
La mayoría de las muestras analizadas fueron aspiradas de médula ósea (174/197, 88,3%), mientras que las muestras de sangre periférica representaron 23/197 (11,7%). Según los intervalos de monitorización predefinidos, se recogieron 86 muestras (43,7%) al final de la terapia de inducción, 65 (33,0%) durante la terapia de consolidación y 46 (23,4%) antes del trasplante de células madre hematopoyéticas (HSCT) (Tabla 1).
La viabilidad mediana de la muestra fue del 88,3% (IQR, 84,4% – 92,6%). El flujo de trabajo de adquisición produjo una mediana de 1.116.901 eventos totales (IQR, 908.521–1.258.946) antes de la limpieza de datos. Tras la exclusión analítica secuencial de escombros, dobletes coincidentes y células no viables, la estrategia de gating alcanzó una mediana de 907.325 eventos objetivo simples viables positivos para CD45 (IQR, 690,112–1,095,836), con un tiempo medio de adquisición de 11,9 min. La puntuación mediana de hemodilución fue de 0,20 (IQR, 0,14–0,28). Siguiendo la interpretación ajustada por denominador, 41 muestras (20,8%) fueron clasificadas como MRD-positivas y 156 muestras (79,2%) se clasificaron por debajo del límite específico de detección (LOD) específico de la muestra (Tabla 1).
Validación analítica: repetibilidad, linealidad y estabilidad
El rendimiento analítico del flujo de trabajo estandarizado se evaluó mediante estudios de repetibilidad, linealidad dilucional y estabilidad a corto plazo (Figura 2). Las alicuotas duplicadas preparadas a partir de las mismas muestras lisadas a granel demostraron una gran repetibilidad, con un coeficiente mediano de variación duplicada (CV) del 0,101% y un percentil 95 de CV del 0,222%.

Figura 2: Validación analítica del flujo de trabajo MRD de citometría de flujo multicolor estandarizado. (A) Distribución de la viabilidad de la muestra entre las muestras analizadas. (B) Correlación entre los valores esperados y observados de MRD en experimentos de dilución en serie en análisis logarítmico. (C) Acuerdo entre análisis replicados independientes durante la evaluación de la repetibilidad. (D) Estabilidad de las mediciones de MRD tras almacenamiento a temperatura ambiente a 0 h, 24 h y 48 h. Por favor, haga clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.
Para evaluar el comportamiento de detección a bajo nivel, se analizaron 12 experimentos de dilución en serie que comprendieron un total de 72 observaciones en el rango inferior esperado de MRD. Los valores observados de MRD mostraron una fuerte concordancia con los valores esperados en un análisis logarítmico (r = 0,999, ajustadoR 2 = 0,998, pendiente = 1,009, intersección = 0,018), lo que indica una linealidad preservada a lo largo de rangos de eventos de baja frecuencia.
Las pruebas de estabilidad a corto plazo demostraron reducciones progresivas en la viabilidad de la muestra a lo largo del tiempo, con la viabilidad mediana disminuyendo del 89,1% a las 0 h al 84,9% a las 24 h y al 80,6% a las 48 h. En cambio, el cambio relativo absoluto mediano en la carga de MRD se mantuvo limitado en 24 horas (6,2%) y 48 horas (12,0%), apoyando el procesamiento rutinario dentro de un intervalo de 24 horas tras la recogida.
Reproducibilidad entre operadores e interinstrumentos
Se evaluó la reproducibilidad entre operadores e instrumentos utilizando 24 muestras de referencia analizadas entre múltiples operadores y citómetros de flujo armonizados, generando un total de 96 evaluaciones. La desviación relativa absoluta mediana respecto a los valores de referencia fue del 13,7%. Estos hallazgos demuestran un rendimiento analítico consistente tras la estandarización de la preparación de la muestra, los ajustes de adquisición y las estrategias de acceso secuencial (Tabla 2).
Tabla 2: Indicadores analíticos de validación y comparación de métodos para el flujo de trabajo estandarizado de la enfermedad residual medible. Esta tabla se limita a resultados de validación, incluyendo la repetibilidad intraensayos, la linealidad dilucional, la estabilidad a corto plazo, la reproducibilidad entre operadores e instrumentos, y las métricas de comparación de métodos moleculares ortogonales; no duplica la demografía de los pacientes ni las características de las muestras reportadas en la Tabla 1. Por favor, haz clic aquí para descargar esta tabla.
Aplicación clínica y comparación de métodos ortogonales
Se realizó una comparación ortogonal utilizando 117 muestras emparejadas, incluyendo 75 analizadas mediante reacción en cadena cuantitativa de la polimerasa (qPCR) y 42 mediante secuenciación de nueva generación (NGS). Las evaluaciones qPCR supervisaron principalmente los transcripciones de fusión específicas de la enfermedad establecidas en el momento del diagnóstico, incluyendo BCR::ABL1, RUNX1::RUNX1T1 y PML::RARA. Los enfoques NGS evaluaron los reajustes génicos clonales de inmunoglobulina o receptores de células T para leucemia linfoblástica y rastrearon mutaciones somáticas recurrentes utilizando paneles mieloides dirigidos para leucemia mieloide aguda. Los valores de MRD citométricos de flujo demostraron una fuerte correlación con resultados moleculares emparejados a través de niveles medibles de enfermedad (r = 0,893 en análisis logarítmico).
El análisis de Bland-Altman demostró una diferencia logarítmica media de −0,093 con límites de concordancia que oscilan entre −0,848 y 0,663 (Figura 3). Entre los casos discordantes, se identificó un resultado falso negativo entre 25 especímenes molecularmente positivos. El flujo de trabajo demostró una concordancia porcentual positiva del 78,1%, una concordancia porcentual negativa del 97,6% y una tasa global de concordancia del 92,3%.

Figura 3: Aplicación clínica y validación ortogonal de la evaluación estandarizada de la MRD. (A) Distribución de casos positivos para MRD entre grupos de enfermedad e intervalos de monitorización. (B) Correlación entre los valores de MRD citométricos de flujo y los resultados de comparadores moleculares emparejados en análisis logarítmico. (C) Análisis Bland-Altman comparando mediciones citométricas de flujo y MRD molecular emparejada, con líneas horizontales que denotan el sesgo medio y los límites del 95% de concordancia a lo largo del rango analítico. (D) Distribución de los resultados positivos para MRD entre los intervalos de seguimiento del tratamiento. Por favor, haz clic aquí para ver una versión ampliada de esta figura.
Estos hallazgos demuestran que el flujo de trabajo estandarizado de citometría de flujo multicolor alcanzó una fuerte concordancia con los ensayos MRD moleculares ortogonales en muestras clínicas rutinarias.
Tabla suplementaria 1: Parámetros operativos completos para el flujo de trabajo estandarizado de citometría de flujo multicolor medible para enfermedades residuales. Esta tabla unificada delimita los componentes metodológicos esenciales divididos en secciones distintas. La Sección A detalla las configuraciones específicas de paneles de anticuerpos para la enfermedad, en las que la selección CD73 o CD304 se basa en el inmunofenotipo diagnóstico asociado a leucemia de referencia. La Sección B describe los objetivos estandarizados de procesamiento preanalítico de muestras y adquisición citométrica de flujo. La Sección C define los umbrales de reporte ajustados por denominador junto con los criterios de interpretación final. Por favor, haga clic aquí para descargar este archivo.