La remodelación de la matriz extracelular pulmonar (MEC) es una característica clave de las lesiones y enfermedades pulmonares. Las fibras elásticas son un componente central de la ECM pulmonar, proporcionando la resistencia y el retroceso necesarios para la función respiratoria normal, y su alteración contribuye a una mecánica tisular deteriorada. Este protocolo describe un flujo de trabajo robusto y reproducible para la preparación y análisis del tejido pulmonar murino, con un enfoque en la visualización y el perfilado cuantitativo de fibras elásticas. Describe métodos optimizados de procesamiento tisular y tinción histológica para preservar y detectar las estructuras de elastina. Además, el protocolo detalla una canalización de análisis de imágenes que permite la evaluación cuantitativa de la abundancia, organización y distribución espacial de fibras elásticas dentro del pulmón. El flujo de trabajo incorpora además la estimación del vector de tinción en QuPath, la deconvolución de color en Fiyi/ImageJ y el análisis de imágenes basado en TWOMBLI para permitir una evaluación cuantitativa de la abundancia de fibras elásticas, ramificación y complejidad de la red. Se incluyen estrategias para la adquisición de imágenes, selección de regiones de interés, optimización de parámetros y control de calidad para garantizar la reproducibilidad y minimizar el sesgo dependiente del usuario. Utilizando este flujo de trabajo, identificamos con éxito alteraciones en la organización de fibras elásticas y en la arquitectura de la red en los pulmones de ratones obesos, demostrando su aplicabilidad para detectar la remodelación de ECM asociada a enfermedades. En conjunto, estos enfoques proporcionan un marco integral para investigar la remodelación de fibras elásticas y su contribución a la arquitectura tisular en condiciones fisiológicas y patológicas. Este método facilita el estudio de los cambios estructurales impulsados por fibroblastos y apoya la comprensión mecanicista de las alteraciones de la ECM subyacentes a las enfermedades pulmonares.