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Artículo de investigación
Este estudio evalúa la proteína humana wings apart-like (hWAPL) como biomarcador diagnóstico en suero para el cáncer cervical mediante análisis bioinformático integrativo y validación en suero, y demuestra que la combinación de hWAPL en suero con el antígeno de carcinoma de células escamosas mejora el rendimiento diagnóstico.
El cáncer cervical sigue siendo una amenaza importante para la salud de las mujeres en todo el mundo, y los biomarcadores séricos confiables para la detección temprana y la estratificación terapéutica siguen siendo limitados. Se ha implicado a la proteína humana wings-apart-like (hWAPL) en la carcinogénesis cervical, pero su valor diagnóstico y clínico no se ha elucidado completamente. Para abordar esta brecha, este estudio integró conjuntos de datos públicos de multi-ómica, incluidos The Cancer Genome Atlas, GEPIA2, el Human Protein Atlas y datos transcriptómicos de célula individual, para caracterizar la expresión de hWAPL, asociaciones clinicopatológicas, infiltración inmunitaria, redes de coexpresión, modificaciones postraduccionales y predicciones de sensibilidad a fármacos. Estos hallazgos se evaluaron en una cohorte sérica independiente de un solo centro compuesta por 89 pacientes con carcinoma escamoso cervical confirmado histológicamente y 89 controles femeninos sanos. Se midieron los niveles séricos de hWAPL y del antígeno de carcinoma escamoso (SCC), y se evaluó el rendimiento diagnóstico mediante análisis de la curva característica de operación del receptor. In silico, hWAPL mostró una sobreexpresión amplia en múltiples malignidades, particularmente en el cáncer cervical, enriquecido en células epiteliales malignas y monocitos/macrófagos, y asociado con un intervalo libre de progresión más corto, sensibilidad reducida predicha al cisplatino, paclitaxel y 5-fluorouracilo, y sensibilidad predicha a inhibidores de MCL-1 y Wee1. En la cohorte sérica, los niveles de hWAPL fueron significativamente más altos en pacientes que en controles y discriminaron el cáncer cervical con un área bajo la curva de 0,961, superando al SCC aislado. La combinación de hWAPL con SCC mejoró aún más el rendimiento diagnóstico (área bajo la curva, 0,974; sensibilidad, 93,3 %; especificidad, 95,5 %). Estos hallazgos sugieren que el hWAPL sérico es un biomarcador diagnóstico potencialmente novedoso para el carcinoma escamoso cervical cuyo rendimiento se potencia con el SCC, mientras que las asociaciones observadas con resistencia a quimioterapia y remodelación del microentorno inmunitario generan hipótesis que requieren confirmación experimental.
El cáncer cervical ocupa el cuarto lugar entre las malignidades más prevalentes y es la cuarta causa principal de mortalidad relacionada con el cáncer en mujeres a nivel mundial, con aproximadamente 660 000 nuevos diagnósticos y 350 000 muertes registradas en 20221. Esta carga de enfermedad afecta de manera desproporcionada a los países de ingresos bajos y medianos, donde los programas sistemáticos de cribado siguen siendo insuficientes2. Aunque la vacunación contra el VPH y el cribado con la prueba de Papanicolaou han reducido con éxito las tasas de incidencia en numerosos países de altos ingresos, los enfoques diagnósticos actuales presentan limitaciones notables. La detección del ADN del VPH muestra una especificidad subóptima, y la interpretación citológica es inherentemente subjetiva y variable. Estas deficiencias destacan la necesidad urgente de biomarcadores séricos innovadores, objetivos y mínimamente invasivos que complementen los marcos diagnósticos existentes.
El antígeno del carcinoma de células escamosas (SCC-Ag) sirve como el biomarcador serológico predominante para el carcinoma de células escamosas del cuello uterino, un subtipo histológico que comprende aproximadamente el 85–90 % de todos los casos de cáncer cervical3. Una revisión sistemática y un metaanálisis indicaron que niveles elevados de SCC-Ag antes del tratamiento en el carcinoma de células escamosas se asocian con una supervivencia general y libre de progresión notablemente más baja4. En el contexto del monitoreo de recurrencia, el SCC-Ag demuestra una sensibilidad del 78,9 % y una especificidad del 91,2 % para el carcinoma de células escamosas4. Sin embargo, la utilidad del SCC-Ag para la detección temprana es limitada, ya que aumentos en sus niveles se observan solo en el 28–88 % de las personas diagnosticadas con cáncer cervical de células escamosas5. Además, muchos tumores en estadio inicial no presentan concentraciones elevadas de SCC-Ag, y este biomarcador no es relevante para las variantes histológicas no escamosas3. En consecuencia, descubrir nuevos biomarcadores séricos que ofrezcan una sensibilidad diagnóstica mejorada, especialmente para el cáncer cervical en estadio inicial, representa una prioridad clínica importante y aún no resuelta.
Más allá del Ag-CEC, se han evaluado varios otros marcadores circulantes en el cáncer cervical, incluyendo el antígeno carcinoembrionario, el antígeno canceroso CA-125, el fragmento de citoqueratina-19 (CYFRA 21-1) y, más recientemente, el ADN tumoral circulante y el ADN libre de células del VPH. En la práctica, sin embargo, estos marcadores están limitados por una sensibilidad reducida para la enfermedad en estadio temprano, una especificidad deficiente para la histología escamosa que predomina en el cáncer cervical, o por la necesidad de plataformas moleculares especializadas que aún no están ampliamente disponibles. Este panorama deja un espacio considerable para un marcador proteico que esté mecanísticamente vinculado a la carcinogénesis cervical y que pueda medirse mediante un inmunoensayo de rutina.
El gen humano wings apart-like (hWAPL), también conocido como WAPL, codifica un factor de liberación de la cohesina esencial para la separación adecuada de las cromátidas hermanas durante la división mitótica6. Inicialmente identificado por Oikawa et al., hWAPL fue caracterizado como un gen humano novedoso cuya expresión es inducida por las oncoproteínas del VPH E6 y E7. Muestra una expresión elevada en carcinomas del cuello uterino, mientras que solo se observa una expresión mínima en otros tejidos normales y neoplásicos7. Estudios posteriores revelaron que los niveles de ARNm de hWAPL están marcadamente aumentados en el carcinoma cervical en comparación con el epitelio cervical benigno, con una expresión que aumenta en correlación con el grado de neoplasia intraepitelial cervical (CIN)8,9. Desde una perspectiva mecanicista, la sobreexpresión desregulada de WAPL altera los procesos mitóticos y citocinéticos, promoviendo así la inestabilidad cromosómica y facilitando el avance tumoral10. Además, WAPL contribuye significativamente a la tumorigénesis y a la regulación de la progresión del ciclo celular. Se han identificado múltiples isoformas alternativamente empalmadas de WAPL en diversas muestras de epitelio cervical, lo que subraya su diversidad molecular11. Además de su participación ya establecida en el desarrollo del cáncer cervical, evidencias crecientes destacan la utilidad diagnóstica de hWAPL en lesiones cervicales. Asimismo, la inhibición mediada por TAT de hWAPL redujo la expresión de E6 del VPH, suprimió la invasión tumoral y la formación de colonias en células madre del cáncer cervical, y atenuó significativamente el crecimiento tumoral en modelos de ratones desnudos12. Estos hallazgos sugieren que hWAPL actúa como un marcador de la proliferación de células madre del cáncer cervical y representa un objetivo terapéutico potencialmente viable12.
Aunque estos resultados son alentadores, aún quedan varias preguntas importantes sin respuesta. Primero, no se ha evaluado en una población de estudio rigurosamente controlada la capacidad de hWAPL sérico para diferenciar a pacientes con cáncer cervical de individuos sanos, ni su rendimiento en comparación con, o en combinación con, el biomarcador establecido SCC. Segundo, aún no está claro el vínculo entre los niveles séricos de hWAPL y el estado de infección por VPH, así como con características clínico-patológicas clave como el estadio clínico, el grado histológico y la metástasis en ganglios linfáticos. Tercero, no se ha investigado si hWAPL y SCC ofrecen un valor complementario para el diagnóstico.
Aunque se ha estudiado a hWAPL a nivel tisular y celular, ningún trabajo previo ha establecido si la proteína es medible en circulación o si una medición basada en suero puede distinguir el cáncer cervical de una población control; esta es la brecha específica de conocimiento que aborda el presente estudio. Basándonos, en lugar de repetir, en informes previos basados en tejidos, combinamos una encuesta integradora de bioinformática de hWAPL, utilizando datos del Atlas del Genoma del Cáncer y otros repositorios públicamente disponibles, con la primera evaluación basada en suero de la proteína en una cohorte independiente, de un solo centro, compuesta por 89 pacientes con carcinoma escamoso de cuello uterino y 89 controles femeninos sanos. El objetivo principal fue determinar el rendimiento diagnóstico de hWAPL en suero, cuantificado como el área bajo la curva característica de operación del receptor, para distinguir el carcinoma escamoso de cuello uterino de controles sanos, tanto por sí solo como en combinación con SCC-Ag; por lo tanto, la medida del resultado principal fue el área bajo la curva, con sensibilidad y especificidad en el umbral óptimo de Youden como medidas secundarias. Los objetivos secundarios fueron caracterizar la asociación de hWAPL en suero con el estado de VPH y otras características clínico-patológicas, y generar hipótesis mecanicistas respecto al contexto biológico de hWAPL mediante los análisis de bioinformática.
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Este estudio fue aprobado por el Comité de Revisión Institucional del Hospital Popular de la Provincia de Shaanxi (Número de aprobación: 2024-R055) y se llevó a cabo de acuerdo con los principios de la Declaración de Helsinki. Se obtuvo el consentimiento informado por escrito de todos los participantes antes de extraer cualquier muestra de sangre. Todas las muestras humanas de sangre y suero se recolectaron, manipularon y almacenaron cumpliendo con las directrices institucionales del Departamento de Medicina de Laboratorio.
Todas las muestras de sangre venosa y suero se trataron como material biológico potencialmente infeccioso. El procesamiento de las muestras se realizó en un laboratorio de nivel de bioseguridad 2 por personal capacitado que utilizaba equipo de protección personal adecuado. La material plástico desechable, las puntas de pipeta y las microplacas usadas que habían tenido contacto con material biológico se autoclavaron o se recogieron como desechos biopeligrosos y se eliminaron mediante el sistema institucional autorizado para desechos médicos, de acuerdo con la normativa local.
Resumen del diseño del estudio:
El flujo de trabajo de este estudio se resume en un esquema del diseño experimental (Figura Suplementaria S1) y se divide en dos brazos complementarios. En el brazo in silico, se analizaron conjuntos de datos transcriptómicos públicos, de célula única, proteicos, de modificaciones postraduccionales, inmunitarios y de sensibilidad a fármacos para caracterizar el contexto biológico de hWAPL y generar hipótesis mecanicistas. En el brazo experimental, se midieron hWAPL sérica y SCC-Ag en una cohorte independiente de un solo centro, y su rendimiento diagnóstico, individualmente y en combinación, se evaluó mediante análisis de la curva ROC y regresión logística. Ambos brazos solo se integraron a nivel de interpretación, proporcionando el brazo sérico la única validación experimental.
Perfilado de expresión génica en cáncer de células escamosas cervicales y pan-cancero
Se obtuvieron datos de secuenciación de ARN del Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA) mediante el navegador UCSC Xena. Todas las bases de datos públicas y herramientas web utilizadas en este estudio se consultaron entre septiembre y octubre de 2025, y las versiones específicas y fechas de acceso se enumeran en la Tabla de Materiales. Los niveles de expresión de WAPL, cuantificados como fragmentos por kilobase de transcripción por millón de lecturas mapeadas (FPKM), se sometieron a una transformación log₂ con un pseudocuento de 1 añadido. Estos valores transformados se utilizaron posteriormente para realizar análisis comparativos entre tejidos malignos y muestras normales adyacentes apareadas en múltiples tipos de cáncer. Para la investigación enfocada en las malignidades cervicales, se aislaron los datos de expresión de WAPL específicos del carcinoma de células escamosas cervicales y del adenocarcinoma endocervical (CESC). El perfil de expresión en estas muestras tumorales se visualizó y comparó posteriormente con los niveles de expresión en tejidos de control epiteliales cervicales normales.
Análisis de isoformas del transcrito de WAPL
Los perfiles de expresión de las isoformas del transcrito de WAPL se examinaron utilizando la base de datos GEPIA2. Las isoformas específicas se definieron mediante sus identificadores de transcritos Ensembl correspondientes (ENST). Los niveles de expresión se calcularon como el logaritmo en base 2 de los transcritos por millón más uno [log₂(TPM+1)] y se presentan gráficamente como gráficos de violín.
Análisis de secuenciación de ARN a nivel de célula individual
El conjunto de datos de secuenciación de ARN a nivel de célula individual GSE168652 se obtuvo del repositorio Gene Expression Omnibus (GEO). El preprocesamiento de los datos, la evaluación de la calidad, la normalización y el agrupamiento se realizaron con la plataforma scCancerExplorer. Se eliminaron las células que expresaban menos de 200 genes y los genes detectados en menos de tres células. La normalización se llevó a cabo mediante el método de Log-Normalización con un factor de escala de 10.000.
Se identificaron los 2.000 genes más variables mediante transformación estabilizadora de la varianza y posteriormente se utilizaron para el análisis de componentes principales (PCA). Se aplicó la aproximación y proyección uniforme de variedades (UMAP) para la reducción de dimensionalidad, basándose en los primeros 30 componentes principales. La agrupación basada en grafos se implementó mediante el algoritmo de Louvain con una resolución de 0,8. Los grupos celulares se anotaron según genes marcadores establecidos. Se midieron los niveles de expresión de WAPL en diferentes poblaciones celulares, y las etapas del ciclo celular se determinaron utilizando el método CellCycleScoring.
Expresión proteica y análisis de modificaciones postraduccionales
La expresión y distribución subcelular de WAPL en el CSCC se evaluaron utilizando la base de datos Human Protein Atlas. Los sitios de modificación postraduccional (PTM) se identificaron mediante PhosphoSitePlus. Además, se investigaron posibles asociaciones entre los niveles de expresión de WAPL y genes implicados en procesos de modificación proteica, específicamente AKT1, AKT2, KAT2B, EP300, USP7 y KAT5, dentro del CSCC, utilizando la herramienta Xiantao Academic13,14,15,16,17.
Red de coexpresión y análisis de enriquecimiento funcional
Los datos de secuenciación de ARN para TCGA-CSCC, procesados utilizando el alineador STAR y normalizados a transcritos por millón (TPM), se obtuvieron del portal Genomic Data Commons (GDC). Para identificar los genes coexpresados con WAPL, se aplicó un umbral de selección basado en un coeficiente de correlación de Pearson absoluto mayor a 0,6 y un nivel de significancia estadística de P < 0,05.
Para investigar las funciones biológicas asociadas con WAPL, primero se realizó un análisis de expresión diferencial tras estratificar a los pacientes en grupos de expresión alta y baja de WAPL utilizando el valor mediano de expresión como punto de corte. Los genes diferencialmente expresados se identificaron mediante la plataforma Xiantao Academic y posteriormente se sometieron a un análisis de enriquecimiento de Ontología Genética, que incluyó las categorías de proceso biológico, componente celular y función molecular, junto con un análisis de vías de la Enciclopedia de Kyoto de Genes y Genomas. De forma independiente, se exploraron las relaciones de interacción proteica que involucran a WAPL utilizando STRING, y la red de interacciones resultante se reconstruyó y analizó en Cytoscape.
Se realizó un análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes (GSEA) utilizando las bases de datos Reactome, WikiPathways y KEGG, con criterios de selección establecidos en una puntuación de enriquecimiento normalizada absoluta (|NES|) > 1 y una tasa de descubrimientos falsos (FDR) < 0,25.
Análisis de infiltración inmunitaria
Se utilizaron las herramientas computacionales TIMER 2.0 y xCell para analizar los datos transcriptómicos del cohorte TCGA-CESC, lo que permitió la evaluación cuantitativa del estado de infiltración de 24 poblaciones distintas de células inmunitarias.
Predicción de sensibilidad a fármacos
Las predicciones de sensibilidad a fármacos se obtuvieron a partir de la base de datos GDSC2 utilizando el paquete R oncoPredict. Se calculó la concentración inhibitoria media (IC50) para un panel de 86 compuestos quimioterapéuticos.
Análisis de supervivencia y diagnóstico
Las curvas de supervivencia global (OS) y del intervalo libre de progresión (PFI) se construyeron utilizando la plataforma analítica Xiantao, con las cohortes de pacientes divididas en dos grupos según el nivel mediano de expresión de WAPL. La significancia pronóstica de las variables se evaluó mediante modelos de regresión de riesgos proporcionales de Cox univariados y multivariados. Para evaluar la capacidad diagnóstica de WAPL y SCC (SERPINB3) para distinguir el CSCC del tejido normal adyacente, se aplicó un análisis de la curva característica de operación del receptor (ROC) a datos transcriptómicos, expresados como transcritos por millón (TPM), obtenidos del Atlas del Genoma del Cáncer.
Recolección de muestras de suero y ELISA
Este estudio recibió la aprobación del Comité de Revisión Institucional del Hospital Provincial de Shaanxi (Número de aprobación: 2024-R055) y se realizó cumpliendo con la Declaración de Helsinki. Se obtuvieron un total de 89 especímenes de suero de pacientes con CSCC confirmado histopatológicamente, junto con 89 controles femeninos sanos emparejados por edad. La edad mediana fue de 54 años, rango de 31 a 77 años, en la cohorte con CSCC y de 41 años, rango de 30 a 52 años, en la cohorte de control. Todos los casos de cáncer cervical fueron recién diagnosticados y sin tratamiento al momento de la recolección de sangre; los especímenes se obtuvieron antes de iniciar cualquier cirugía, quimioterapia o radioterapia. Cabe señalar que, aunque ambos grupos procedían de un entorno clínico comparable, las edades medianas diferían en 13 años. Esta diferencia se analiza directamente en la sección de Resultados y en un análisis de sensibilidad ajustado por edad, y se reconoce como una limitación en la sección de Discusión.
Se recogió sangre venosa en tubos sin anticoagulante, se dejó coagular a temperatura ambiente durante 10–20 min y posteriormente se centrifugó a 2.000–3.000 × g durante 20 min. El suero se separó dentro de la primera hora tras la recolección, se aliquotó inmediatamente y se almacenó a −20 °C; el intervalo entre la punción venosa y la congelación no superó las 2 h en ninguna muestra. Los alícuotas sufrieron un único ciclo de congelación-descongelación antes del análisis, y todas las mediciones se completaron dentro de los tres meses posteriores al almacenamiento. El suero resultante se dividió en alícuotas y se conservó a −20 °C. Se excluyeron del análisis todas las muestras hemolizadas o lipémicas.
La cuantificación de los niveles séricos de la proteína hWAPL se realizó utilizando un kit comercial de ensayo por inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA) basado en el principio de doble anticuerpo en sándwich. En resumen, tanto los estándares de calibración como las muestras de prueba se dispensaron por duplicado en pocillos de microplaca previamente recubiertos con un anticuerpo de captura específico para hWAPL, seguido de una incubación de 30 min a 37 °C. Después de una serie de pasos de lavado para eliminar el material no unido, se añadió un anticuerpo de detección marcado con peroxidasa de rábano picante (HRP) dirigido contra hWAPL y se incubó en condiciones idénticas.
Después de lavados adicionales, se combinaron 50 µL de cada solución cromogénica de sustrato A y B en los pocillos y se dejaron desarrollar a 37 °C en la oscuridad durante 10 min. Se añadieron 50 µL de solución de parada para finalizar la reacción enzimática. La densidad óptica se midió a una longitud de onda principal de 450 nm, con una lectura de referencia a 630 nm, dentro de los 15 min posteriores a la interrupción de la reacción. Se construyó una curva patrón utilizando calibradores diluidos en serie que abarcaban un rango de concentración de 10–450 pg/mL. La concentración de hWAPL de cada muestra desconocida se determinó mediante interpolación a partir de esta curva patrón y se ajustó según cualquier dilución previa al análisis. El ensayo se realizó estrictamente según las instrucciones del fabricante. Según las especificaciones del fabricante, el rango de detección funcional del kit es de 10–450 pg/mL. Las muestras se analizaron con una dilución final de 5 veces, y los especímenes cuya densidad óptica superó la del calibrador más alto se diluyeron adicionalmente y se volvieron a analizar, aplicando el factor total de dilución durante el cálculo inverso. El rendimiento analítico se verificó en matriz de suero antes de analizar las muestras del estudio: una alícuota de suero de alta concentración diluida en serie mostró linealidad aceptable a lo largo del rango de calibración, y la recuperación tras adición del calibrador recombinante en tres pools de suero estuvo dentro de un margen aceptable, lo cual es consistente con el diseño del kit basado en sándwich de doble anticuerpo. El límite inferior de cuantificación correspondió al calibrador más bajo (10 pg/mL). Hacemos hincapié en que este kit está etiquetado por el fabricante únicamente para uso en investigación y no constituye un dispositivo de diagnóstico in vitro clínicamente validado; por lo tanto, las concentraciones absolutas y el punto de corte derivado deben interpretarse como específicos de la plataforma y provisionales, como se discute a continuación.
Al mismo tiempo, los niveles séricos de Ag-CEC se cuantificaron utilizando la plataforma Abbott Alinity i mediante un inmunoensayo de micropartículas quimioluminiscente (CMIA), con un límite superior de referencia de 1,5 ng/mL. Todos los procedimientos analíticos se realizaron por duplicado por personal de laboratorio que desconocía el estado de la enfermedad y todas las variables clínicas, incluyendo el estadio clínico, el grado histológico y el estado de VPH. Tanto los coeficientes de variación entre ensayos como dentro de los ensayos para las metodologías empleadas se mantuvieron por debajo del 10 %.
Análisis estadístico
Dado que las concentraciones séricas de hWAPL no cumplieron con el supuesto de normalidad según la prueba de Shapiro-Wilk (todos los valores de P < 0,05), los análisis posteriores se realizaron utilizando métodos no paramétricos. Por lo tanto, las variables continuas se presentan como medianas con rangos intercuartílicos (RIC). Las diferencias entre dos grupos independientes se evaluaron mediante la prueba U de Mann-Whitney, mientras que las comparaciones entre tres o más grupos se realizaron con la prueba H de Kruskal-Wallis. Las correlaciones entre variables se evaluaron mediante el análisis de correlación de rangos de Spearman para datos continuos u ordinales y el coeficiente de correlación biserial puntual para variables binarias, como el estado de infección por VPH. Los resultados de supervivencia se compararon utilizando la prueba log-rank, y las razones de riesgo con intervalos de confianza del 95 % se estimaron a partir de modelos de regresión de riesgos proporcionales de Cox.
El rendimiento diagnóstico se evaluó mediante análisis de la curva ROC, determinándose el punto de corte óptimo para cada biomarcador al maximizar el índice de Youden. Las diferencias en el área bajo la curva (AUC) se probaron utilizando el método de DeLong. Para investigar la utilidad diagnóstica combinada, se construyó un modelo de regresión logística binaria con el estado de la enfermedad (CSCC = 1; control = 0) como variable dependiente y el hWAPL sérico y el antígeno de células escamosas como predictores independientes. Las probabilidades predichas resultantes se guardaron como una puntuación compuesta para un análisis posterior de la curva ROC.
La sensibilidad diferencial a fármacos entre los grupos con alta y baja expresión de WAPL se evaluó con el paquete limma, aplicando umbrales de P ajustado < 0,05 y |cambio en la expresión log₂| > 0,3. La significancia estadística se definió como un valor de P bilateral < 0,05. Todos los análisis se realizaron utilizando SPSS, R o las herramientas en línea especificadas. Los paquetes de R incluyeron survival, survminer, pROC, ggplot2, oncoPredict y limma. Para todos los análisis de alta dimensión en los que se probaron múltiples hipótesis simultáneamente, es decir, las comparaciones pan-cáncer, la detección de coexpresión, los análisis de expresión diferencial y enriquecimiento funcional, y el análisis de sensibilidad a fármacos, los valores de P se ajustaron por comparaciones múltiples utilizando la tasa de descubrimientos falsos de Benjamini–Hochberg, y se reportan los valores de P ajustados cuando corresponde; las correlaciones por pares entre hWAPL y genes individuales o fracciones de células inmunitarias se reportan con valores de P nominales, y estos resultados correlacionales se consideran generadores de hipótesis más que confirmatorios. Debido a que un número reducido de campos clínico-patológicos en la cohorte pública no estaban completamente completados, los casos con datos faltantes se excluyeron del análisis correspondiente de forma por pares en lugar de imputarlos, y el número de casos evaluables se indica para cada variable en Tabla 1. Para abordar la diferencia de edad entre las cohortes de suero, se realizó un análisis de sensibilidad mediante regresión logística binaria ajustada por edad, y se calculó la correlación de Spearman entre el hWAPL sérico y la edad dentro de cada grupo.
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Amplia sobrexpresión de hWAPL en diversas neoplasias humanas, especialmente en tejidos de cáncer cervical
El análisis pan-cáncer de conjuntos de datos del TCGA reveló que WAPL presenta una expresión significativamente elevada en la mayoría de los tumores sólidos en comparación con sus tejidos normales correspondientes (Figura 1A). En particular, hWAPL estuvo significativamente sobreexpresado en carcinoma escamoso de cuello uterino y adenocarcin...
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Nuestro análisis pan-canceroso de los datos de TCGA reveló que la expresión de WAPL está marcadamente elevada en la mayoría de los tumores sólidos en comparación con los tejidos normales, con una sobreexpresión más pronunciada observada en CESC. Esta observación concuerda con hallazgos previos según los cuales el ARNm de hWAPL se expresa predominantemente en el cáncer cervical, con expresión mínima en otros tejidos normales y malignos7. Oikawa et al. caracterizaron inicialmente a...
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Los autores no tienen conflictos de intereses que declarar.
Los autores desean agradecer a todos los participantes y al personal clínico involucrado en este estudio. Este trabajo fue financiado por el Programa de Investigación Básica en Ciencias Naturales de la Provincia de Shaanxi (Concesión No. 2021JM-552).
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| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| Abbott GmbH, Wiesbaden, Alemania | No proporcionado | Utilizado para la detección de SCC-Ag | |
| Rayto Life and Analytical Sciences Co., Ltd., Shenzhen, China | Modelo RT-3100 | Utilizado para el lavado de placas | |
| Fábrica de Instrumentos Científicos Shanghai Anting, Shanghai, China | Modelo centrífuga de baja velocidad TLXY-IIC | Utilizado para la centrifugación de muestras de suero | |
| Consortium Cytoscape | Versión 3.9.1 | Utilizado para la visualización de redes; visualización de redes | |
| Instituto Nacional del Cáncer | https://portal.gdc.cancer.gov; acceso en octubre de 2025 | Utilizado para la recuperación de datos TPM alineados STAR de TCGA-CSCC; RRID:SCR_014514 | |
| Plataforma/datos en línea | No aplicable | Utilizado para la predicción de sensibilidad a fármacos; datos de referencia de sensibilidad a fármacos | |
| Centro Nacional de Información Biotecnológica | GPL24676 Illumina NovaSeq 6000 (Homo sapiens) | Utilizado para la recuperación de conjuntos de datos de secuenciación de ARN de célula única; conjunto de datos de ARN-seq de célula única | |
| Plataforma en línea | No aplicable | Utilizado para el análisis de isoformas de transcritos y expresión génica; análisis de isoformas de transcritos y expresión | |
| Paquete R | Versión 3.4.4 | Utilizado para la visualización de datos | |
| Plataforma/datos en línea | No aplicable | Utilizado para el análisis de expresión proteica y localización subcelular; expresión y localización proteica | |
| Shanghai Fusheng Biotechnology Co., Ltd. | A977261-96T | A977261-96T; ELISA de doble anticuerpo en sandwich; rango de detección 10-450 pg/mL; solo para uso en investigación (www.affandi-e.com) | |
| Paquete R | Versión 3.54.0 | Utilizado para análisis diferencial | |
| Rayto Life and Analytical Sciences Co., Ltd., Shenzhen, China | Modelo RT-6100 | Utilizado para la medición de densidad óptica | |
| Paquete R | Versión 0.2 | Utilizado para la predicción de sensibilidad a fármacos (IC50); RRID:SCR_023220 | |
| Plataforma/datos en línea | No aplicable | Utilizado para el análisis de modificaciones postraduccionales; análisis de sitios de modificación postraduccional | |
| Paquete R | Versión 1.18.0 | Utilizado para el análisis de curvas ROC | |
| Foundation R para la Computación Estadística | Versión 4.2.1 | Utilizado para análisis estadístico y análisis bioinformático; análisis estadístico y bioinformático | |
| Abbott GmbH, Wiesbaden, Alemania | REF 09P3374 | Utilizado para la cuantificación sérica de SCC-Ag | |
| Plataforma en línea | No aplicable | Utilizado para el análisis de secuenciación de ARN de célula única | |
| Sanli Medical Technology Development Co., Ltd., Liuyang, Hunan, China | No proporcionado | Utilizado para la recolección de sangre venosa | |
| IBM Corp. | Versión 26.0 | Utilizado para análisis estadístico; análisis estadístico | |
| Consortium STRING | Versión 11.5 | Utilizado para el análisis de redes de interacción proteína-proteína; redes de interacción proteína-proteína | |
| Paquete R | Versión 3.4 | Utilizado para análisis de supervivencia | |
| Paquete R | Versión 0.4.9 | Utilizado para la visualización de curvas de supervivencia | |
| Instituto Nacional del Cáncer | https://www.cancer.gov/tcga; acceso en octubre de 2025 | RRID:SCR_003193; datos transcriptómicos de cáncer | |
| Plataforma en línea | http://timer.cistrome.org; acceso en octubre de 2025 | RRID:SCR_018737; análisis de infiltración inmune | |
| UCSC Xena Browser | https://xenabrowser.net; acceso en octubre de 2025 | Utilizado para la recuperación de datos de TCGA; recuperación de datos de TCGA | |
| Plataforma/herramienta en línea | Versión 1.0 | Utilizado para la estimación de infiltración de células inmunes | |
| Plataforma en línea | https://www.xiantaoxueshu.com; acceso en octubre de 2025 | Utilizado para análisis de expresión diferencial, correlación, supervivencia y diagnóstico |
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