Todos los experimentos con animales se realizaron cumpliendo con las directrices ARRIVE. El estudio fue aprobado por el Comité de Revisión Ética de Sichuan Scientist Biotechnology Co., Ltd. (IACUC ISSUE SYST-2024-011). Se proporciona una cronología experimental detallada que resume el diseño del estudio en la Figura Suplementaria 1.
Preparación y tratamiento del animal
Los ratones fueron anestesiados profundamente mediante inhalación de isoflurano al 2 %. Bajo anestesia profunda, se recolectó sangre mediante enucleación retroorbital. Inmediatamente después de la recolección de sangre, se enuclearon los ojos para obtener el tejido retiniano. Posteriormente, se realizó la dislocación cervical bajo anestesia profunda para asegurar la eutanasia. A continuación, se diseccionaron los tejidos del colon inmediatamente. Los animales que presentaron eventos adversos fueron retirados inmediatamente del estudio y recibieron la atención veterinaria adecuada.
Randomización y enmascaramiento
Se alojaron ratones macho C57BL/6, de 5 semanas de edad y con un peso entre 20 y 30 gramos, bajo condiciones estrictamente reguladas, incluyendo temperatura y humedad. Después de una semana de aclimatación, los ratones C57BL/6 se asignaron aleatoriamente a tres grupos (grupos control, modelo e intervención) mediante una secuencia de números aleatorios generada por computadora. La secuencia de aleatorización fue generada por un investigador que no participó en el manejo de los animales ni en la evaluación de los resultados.
Para garantizar el enmascaramiento, todos los cuidados animales, la administración de fármacos y la recopilación de datos fueron realizados por investigadores que desconocían la asignación de los grupos. Las asignaciones codificadas de los grupos se revelaron únicamente tras la finalización de todos los experimentos y los análisis estadísticos. El enmascaramiento incluyó: al técnico que realizó la gavaje oral; al patólogo que evaluó la histología retiniana; y al analista que cuantificó las bandas de inmunotransferencia (WB).
Cálculo del tamaño de la muestra
El tamaño de la muestra se determinó en función de un experimento preliminar que evaluaba los conteos de células ganglionares de la retina (RGC) bajo las mismas condiciones experimentales. Suponiendo un nivel de significancia bilateral (α) de 0,05 y una potencia estadística (1-β) de 0,80, se requirió un mínimo de 5 ratones por grupo para detectar una diferencia clínicamente relevante en los conteos de RGC entre los grupos modelo e intervención. Considerando una tasa de abandono potencial de aproximadamente el 20 %, cada grupo se estableció con 6 ratones.
Establecimiento de animales diabéticos
Al grupo control se le administró una dieta estándar, mientras que a los grupos de intervención y modelo se les suministró una dieta alta en grasas y azúcares (HFHSD) durante un período de cuatro semanas. Tras este período alimenticio, los grupos de intervención y modelo recibieron una inyección intraperitoneal con una solución al 1 % de estreptozotocina (STZ) en una dosis de 35 mg/kg17,18,19,20. Setenta y dos horas después de la inyección, los ratones que presentaron niveles de glucosa en sangre en ayunas superiores a 16,7 mmol/L se consideraron como animales con un modelo de DM exitosamente inducido y fueron seleccionados para experimentos posteriores. Los animales con DM continuaron con la dieta alta en grasas y azúcares durante cuatro meses adicionales, mientras que el grupo control mantuvo su dieta estándar.
Validación taxonómica y evaluación de la calidad
Los ocho ingredientes en QMG se validaron taxonómicamente utilizando la herramienta Modernized Plant Names Search (MPNS, http://mpns.kew.org/mpns-portal/). La calidad del informe de composición para el QMG se evaluó utilizando la herramienta ConPhYMP.
Métodos de administración
En el grupo de intervención, los animales recibieron QMG por vía oral. QMG fue adquirido de Zhejiang Sansheng Mandi Pharmaceutical Co., Ltd. (número de aprobación nacional de medicamentos chino Z20090036). La suspensión de QMG se preparó mezclando uniformemente QMG con agua destilada. A los ratones del grupo de intervención se les administró la suspensión mediante sonda oral en un volumen equivalente al de los grupos modelo y control. La dosis se calculó en función de la dosis terapéutica única clínica de 4,5 g por cada 60 kg de peso corporal (la dosis unitaria estándar de la formulación comercializada), utilizando el método de normalización del área de superficie corporal (BSA) recomendado por la FDA y Reagan-Shaw21. El factor de conversión entre adultos humanos (Km = 37) y ratones (Km = 3) fue de 12,33, lo que resultó en una dosis para ratones de 0,9 g/kg de peso corporal. Al grupo modelo y al grupo control se les administró un volumen equivalente de solución salina mediante sonda oral. La administración se realizó diariamente entre las 9:00 y las 11:00 durante un período consecutivo de 3 meses.
Indicadores de observación y pruebas
Monitoreo general de signos vitales
Se observaron y registraron sistemáticamente los signos vitales generales e indicadores fisiológicos, incluyendo el peso corporal, los niveles de glucosa en sangre, el consumo de agua y alimento, la producción de orina, los niveles de actividad y comportamiento, la temperatura corporal, así como el estado del pelaje y la piel, con el fin de evaluar de manera integral las intervenciones terapéuticas y detectar posibles complicaciones.
Observación de los cambios morfológicos en la retina mediante análisis con tinción HE
Todos los especímenes se procesaron mediante un deshidratador automático utilizando una serie de soluciones de etanol y xileno tras la fijación, seguido de inclusión en parafina. Posteriormente, se cortaron secciones de 4 µm en parafina y se tiñeron con HE, y luego se montaron con goma neutra. Las imágenes de la retina se escanearon utilizando un escáner 3DHISTECH Pannoramic SCAN. El análisis de imágenes y la medición de datos se realizaron con Image-Pro Plus.
Detección de IL-6, TNF-α e IL-1β séricas mediante análisis por ELISA
Las muestras de sangre se recolectaron mediante enucleación retroorbital. El suero se separó por centrifugación a 1.000 × g durante 15 min a 4 °C y se almacenó a -80 °C hasta el análisis. Los niveles séricos de IL‑1β, IL‑6 y TNF‑α se midieron según procedimientos estándar, incluyendo equilibrio de reactivos, adición de muestras, incubación, lavado, adición de conjugado y sustrato, terminación de la reacción, medición de la densidad óptica y cálculo de la concentración basado en una curva estándar. La densidad óptica se leyó a 450 nm utilizando un lector de microplacas, y las concentraciones de citocinas se calcularon frente a curvas estándar.
Detección de las proteínas reguladoras clave en la retina y el colon mediante análisis por WB
Se realizaron tres réplicas biológicas independientes en una sola membrana y se analizaron secuencialmente para las proteínas diana. Todas las réplicas se obtuvieron a partir de una única cohorte de animales sacrificados simultáneamente. Cuando el peso molecular de una proteína diana era demasiado cercano al de GAPDH (<5 kDa de diferencia), se analizaron en membranas independientes para evitar el solapamiento de señales. Cada membrana se incubó exclusivamente con la proteína diana o con GAPDH para garantizar una cuantificación precisa. Se utilizaron los siguientes anticuerpos primarios: anticuerpo policlonal contra GAPDH policlonal anticuerpo (1:5000), anticuerpo policlonal contra CMKLR1 (1:1000), anticuerpo policlonal contra Wnt5a (1:1000), anticuerpo policlonal contra TP53 (1:1000), anticuerpo monoclonal contra AP-1 (1:5000) y anticuerpo policlonal contra PPAR gamma (PPAR-γ) (1:1000). Las proteínas totales se obtuvieron mediante lisis celular seguida de centrifugación. Las concentraciones de proteína se determinaron mediante el ensayo BCA. Las proteínas extraídas se separaron mediante electroforesis en gel de SDS-PAGE con un gel separador al 12% y posteriormente se transfirieron a membranas. Las membranas se bloquearon en TBST que contenía leche descremada al 5% e incubaron con los anticuerpos primarios correspondientes durante la noche a 4 °C. Tras lavados, las membranas se incubaron con anticuerpos secundarios conjugados con HRP anti-conejo o anti-ratón en una dilución de 1:10,000. Finalmente, las bandas proteicas se visualizaron y analizaron mediante imágenes de quimioluminiscencia. Durante la visualización y el procesamiento de datos, se recortaron horizontalmente las membranas para eliminar regiones irrelevantes de peso molecular, y se conservaron todas las carreras de muestras sin eliminar áreas intermedias entre carreras. Puede ocurrir una ligera distorsión en los bordes durante el recorte para eliminar regiones irrelevantes del gel.
Detección de la microbiota intestinal mediante análisis de secuenciación del ADNr 16S
Se recolectaron muestras fecales frescas de cada ratón antes de los procedimientos terminales. Los ratones se colocaron individualmente en jaulas estériles durante 10–15 min para permitir la defecación espontánea. Los pellets fecales se recolectaron inmediatamente con pinzas estériles, se transfirieron a tubos estériles de 1,5 mL, se congelaron rápidamente en nitrógeno líquido y se almacenaron a -80 °C hasta la extracción de ADN. Todos los procedimientos se realizaron bajo condiciones estériles para minimizar la contaminación cruzada. El intervalo entre la defecación y el congelamiento se mantuvo dentro de los 10 min para asegurar la integridad microbiana. Las muestras de ADN genómico fecal (ADNg) se purificaron utilizando el kit de extracción de ADNg fecal, seguido de la amplificación completa del gen 16S de ARNr mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con los cebadores universales 8F (5’-AGAGTTTGATCATGGCTCAG-3’) y 1492R (5’-CGGTTACCTTGTTACGACTT-3’). Los productos de PCR se analizaron posteriormente mediante electroforesis en gel de agarosa, se purificaron y cuantificaron para aplicaciones posteriores. La secuenciación de alto rendimiento se realizó en el secuenciador Nanopore GridION. El proceso de análisis de datos incluyó llamada de bases, control de calidad de los datos, anotación de especies, construcción de árboles filogenéticos, análisis de la comunidad, análisis de diversidad alfa y beta, y análisis de especies diferencialmente abundantes y predicción de la función comunitaria. Durante el análisis se utilizaron diversas herramientas y bases de datos, como NanoFilt, Usearch, el lenguaje de programación R, Python y la base de datos SILVA.
Análisis de correlación del eje intestino-retina con inflamación sistémica y microbiota intestinal en múltiples niveles
Para explorar las posibles asociaciones entre la microbiota intestinal multiescalar y las citocinas inflamatorias séricas y las proteínas reguladoras clave, se realizó un análisis de correlación utilizando la plataforma Luoning Bio-Cloud. En primer lugar, se extrajeron del resultado del secuenciamiento los datos de abundancia de especies a nivel de Reino, Filo, Clase, Orden, Familia, Género y Especie. Los factores fisicoquímicos, incluidas las citocinas inflamatorias séricas y los niveles de expresión proteica, se compilaron en un archivo de factores ambientales. Para garantizar la fiabilidad y la visualización de las correlaciones, los datos se normalizaron con el fin de eliminar las diferencias de escala entre la abundancia microbiana y las unidades de medición clínica. Se calcularon los coeficientes de correlación (valores R) y los niveles de significancia correspondientes (valores P). Los resultados se visualizaron mediante un mapa de calor de correlación, en el que los gradientes de color indican la intensidad y dirección de la correlación (rojo representa correlación positiva, azul representa correlación negativa), y los asteriscos (**) indican significancia estadística (P < 0,01).
Métodos estadísticos
Todos los análisis estadísticos y visualizaciones se realizaron utilizando GraphPad Prism. Se empleó la prueba t para comparar medias en datos que seguían una distribución normal. En los casos en que los datos se desviaban de la normalidad, se utilizó la prueba de Kruskal-Wallis. Se realizaron correlaciones de Spearman o de Pearson para evaluar las relaciones entre variables. Todas las pruebas estadísticas se realizaron como pruebas bilaterales, con una significancia estadística establecida en 0,05.