La electroacupuntura mejora la función cardíaca y atenúa la lesión miocárdica en ratas con insuficiencia cardíaca crónica
Para evaluar los efectos de la EA sobre la IC, se estableció el modelo de rata mediante ligadura de la arteria coronaria descendente anterior (LAD), seguida de intervenciones específicas de EA o EA simulada. Se realizaron evaluaciones sistemáticas, incluyendo ecocardiografía, ensayos bioquímicos y tinción histológica (Figura 2A). Funcionalmente, el grupo con IC presentó dilatación ventricular y deterioro de la contractilidad. El tratamiento con EA mejoró las reducciones en la FEVI y en la FSVI observadas en las ratas con IC, mientras que el grupo con EA simulada mostró niveles de función cardíaca comparables a los del grupo con IC (Figura 2B y Figura 2C).
Además, la AE redujo los niveles séricos de NT-proBNP y cTnT, lo que indica una disminución de la sobrecarga cardíaca y una atenuación de la lesión miocárdica. En contraste, el grupo de AE simulada mostró parámetros bioquímicos similares a los del grupo con ICC (Figura 2E,F). El análisis histológico mostró que el grupo con ICC presentaba daño estructural miocárdico y fibrosis. El tratamiento con AE mejoró la arquitectura miocárdica y redujo la FVC, mientras que el grupo de AE simulada mantuvo cambios patológicos y niveles de FVC similares a los del grupo con ICC (Figura 2D). En general, la AE ejerció efectos cardioprotectores frente a la ICC, mientras que la intervención con AE simulada no produjo resultados terapéuticos similares.
La electroacupuntura activa neuronas en el núcleo del tracto solitario de ratas con insuficiencia cardíaca crónica
Para determinar si el SNT media la respuesta central al tratamiento con AE, se evaluó la activación neuronal mediante tinción para c-Fos, un marcador de excitación neural. La imagen de inmunofluorescencia (Figura 3A) y el recuento cuantitativo de células (Figura 3B) revelaron que el número de neuronas positivas para c-Fos en el SNT fue menor en el grupo ICC en comparación con el grupo Falso. Sin embargo, el tratamiento con AE aumentó la expresión de c-Fos hasta niveles comparables a la línea base del grupo Falso. En paralelo con los resultados funcionales periféricos, el grupo Falso AE mostró niveles de expresión de c-Fos similares a los del grupo ICC.
Para evaluar el estado funcional de estas neuronas del SNT, se registraron señales electrofisiológicas in vivo. Los trazos del disparo de potenciales de acción (Figura 3C) y la frecuencia media cuantitativa de descarga (Figura 3D) coincidieron con los hallazgos histológicos. La frecuencia de disparo espontáneo de las neuronas del SNT se redujo bajo condiciones de IC. En contraste, la intervención con AE aumentó la frecuencia de disparo neuronal, mientras que el procedimiento de AE simulado no produjo cambios electrofisiológicos de este tipo.
Este patrón de activación neuronal fue respaldado por el análisis del potencial de campo local. Como se muestra en los espectrogramas de color de LFP en 2D y en los mapas tridimensionales de densidad espectral de potencia (Figura 3E), la energía oscilatoria neuronal dentro del NST se atenuó durante el estado de IC. Tras el tratamiento con AE, se observó un aumento en la intensidad de potencia a lo largo del espectro de frecuencia neuronal, lo que indica una activación de la red, la cual estuvo ausente en el grupo control de AE simulada.
Para examinar la relevancia fisiológica de esta activación central, se realizó un análisis de correlación de Pearson, integrando métricas cardíacas periféricas con la actividad neuronal central en el núcleo del tracto solitario (Figura 3F). El análisis demostró que la frecuencia media de disparo y la expresión de c-Fos en el NTS se correlacionaron positivamente con la FEVI. Por el contrario, estos indicadores de actividad neural central mostraron una correlación negativa con el marcador sérico de insuficiencia cardíaca NT-proBNP. Estas correlaciones indican que la activación neural del NTS modulada por la EA está relacionada con su eficacia cardioprotectora periférica.
La electroacupuntura altera el perfil proteómico global en el núcleo del tracto solitario
Debido a la falta de eficacia terapéutica observada en el grupo de EA simulada durante las evaluaciones funcionales previas, la fase de proteómica incluyó únicamente los grupos de simulación (Sham), IC y EA. Antes de la recolección de tejidos, 12 ratas por grupo se sometieron a evaluación ecocardiográfica para valorar los efectos terapéuticos de la EA, y estos resultados se presentan en la Figura suplementaria 1A. Tras esta evaluación, 6 réplicas biológicas de cada grupo se sometieron a un análisis proteómico cuantitativo basado en espectrometría de masas.
Se realizaron análisis multivariantes y de control de calidad para evaluar la fiabilidad y la distribución general de los datos proteómicos. El número total de proteínas identificadas fue de 5.914 en el grupo Sham, 5.980 en el grupo CHF y 5.836 en el grupo EA, lo que indica una detección de proteínas comparable entre los tres grupos experimentales (Figura 4A y Tabla Suplementaria 1). El análisis de discriminación por mínimos cuadrados parciales mostró una clara separación entre los grupos Sham, CHF y EA, lo que indica perfiles proteómicos globales distintos asociados con el estado de la enfermedad y la intervención EA (Figura 4B).
El análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales por pares ortogonales demostró además la separación entre los grupos Sham y CHF (Figura 4C) y entre los grupos CHF y EA (Figura 4D). Las pruebas de permutación correspondientes respaldaron la fiabilidad de los modelos respectivos. Además, el mapa de calor de correlación de Pearson mostró altas correlaciones dentro de los grupos y patrones intergrupales distintos entre las muestras proteómicas, lo que apoya la reproducibilidad de los réplicas biológicas (Figura 4E). En conjunto, estos análisis de control de calidad y multivariantes indicaron que el conjunto de datos proteómicos era suficientemente robusto para la identificación posterior y el análisis bioinformático de las proteínas diferencialmente expresadas.
La electroacupuntura modula las proteínas expresadas diferencialmente principales y las vías de señalización en el núcleo del tracto solitario
Para explorar los objetivos moleculares de la AE, se analizaron las alteraciones proteicas. Los gráficos de volcanes mostraron la distribución de proteínas reguladas al alza y reguladas a la baja en las comparaciones entre Falso y ICC, y entre ICC y AE (Figura 5A, Tabla Suplementaria 2 y Tabla Suplementaria 3). Para identificar los objetivos terapéuticos, se realizó un análisis de intersección. Como se ilustra en los diagramas de Venn, se identificaron 58 proteínas reguladas al alza en el grupo ICC pero reguladas a la baja tras el tratamiento con AE, junto con 27 proteínas reguladas a la baja en el grupo ICC y reguladas al alza mediante la intervención con AE (Figura 5B y Tabla Suplementaria 4). Este cribado arrojó un total de 85 proteínas expresadas diferencialmente clave. El mapa de calor de agrupamiento jerárquico demostró que la intervención con AE moduló los patrones de expresión anormal de estas 85 proteínas, desplazando sus perfiles hacia la línea base del grupo Falso (Figura 5C).
Para determinar las funciones biológicas de estos objetivos principales, se realizaron análisis de enriquecimiento GO y KEGG por separado para los dos subconjuntos distintos de proteínas. Para el subconjunto de 58 proteínas reguladas a la baja por EA, el gráfico de burbujas GO mostró un enriquecimiento significativo en procesos biológicos, incluyendo la organización de la matriz extracelular y la organización de estructuras extracelulares, junto con componentes celulares como la estructura encapsulante externa y el trímero de colágeno, y funciones moleculares, incluyendo la unión al colágeno y la unión al receptor de glutamato (Figura 5D y Tabla Suplementaria 5). El análisis subsiguiente de vías KEGG, visualizado mediante diagramas de acordes y de Sankey, reveló que estas 58 proteínas participan en cascadas que incluyen la digestión y absorción de proteínas, el citoesqueleto en células musculares y la vía de señalización de TGF-β (Figura 5E y Tabla Suplementaria 6). Estas visualizaciones topológicas destacaron proteínas específicas, incluyendo COL3A1, COL14A1, MYH11, DCN y DPF2, como nodos prominentes que conectan múltiples vías patológicas.
Por el contrario, se realizó una anotación funcional para el subconjunto de 27 proteínas reguladas positivamente por la intervención con EA. El análisis de enriquecimiento de GO indicó su participación en procesos biológicos como la regulación del crecimiento celular y la regulación positiva de la elongación de la transcripción templada por ADN, así como funciones moleculares que incluyen unión a proteínas dependiente de calcio y unión a tetrapirrol (Figura 5F y Tabla Suplementaria 7). Los diagramas circulares y de Sankey de KEGG correspondientes asignaron estas proteínas a vías críticas, incluyendo el remodelado de cromatina dependiente de ATP y el complejo represor policombo (Figura 5G y Tabla Suplementaria 8). Destacablemente, este mapeo de red aisló proteínas clave como YY1, E2F2 y ENTPD5, conectando estas redes de señalización centrales. Esta estratificación funcional integral sentó las bases estructurales para la validación posterior de los objetivos principales.
La topología de la red y el perfilado de expresión identifican a YY1 como un objetivo candidato asociado con los efectos de la intervención mediante electroacupuntura
Para determinar el gen central entre las 85 proteínas expresadas diferencialmente, se construyó una red de interacción proteína-proteína. El análisis topológico identificó 18 nodos con altas puntuaciones de conectividad (Figura 6A y Tabla Suplementaria 9). Posteriormente, se realizó un análisis de vías KEGG específicamente para estas 18 proteínas centrales. Los diagramas de acordes y de Sankey correspondientes representaron las relaciones complejas entre estos centros y las cascadas de señalización enriquecidas, incluyendo el remodelado de la cromatina dependiente de ATP, el complejo represor policombo y la vía de señalización de TGF-β (Figura 6A y Tabla Suplementaria 10). Basándose en este perfil funcional, se seleccionaron las 10 proteínas más enriquecidas para un cribado adicional. Dado que el objetivo terapéutico de EA se encuentra en el sistema nervioso central, estos 10 candidatos se evaluaron utilizando la base de datos de expresión tisular humana GTEx (Figura 6B y Figura Suplementaria 1B–J). Los resultados indicaron que solo YY1 (Figura 6B), DMAP1 (Figura Suplementaria 1C) y DPF2 (Figura Suplementaria 1D) se expresaban en tejidos cerebrales.
Para aislar el candidato objetivo altamente sensible de la EA, se realizaron experimentos moleculares in vivo utilizando tejidos del SNT. Se empleó PCR cuantitativa en tiempo real para evaluar la respuesta transcripcional de los 3 candidatos enriquecidos en el cerebro. La expresión de mRNA de YY1 se redujo en condiciones de ICC y aumentó tras el tratamiento con EA, mientras que los niveles de expresión de mRNA de DPF2 y DMAP1 no mostraron cambios estadísticamente significativos entre los grupos experimentales (Figura 6C). Este cribado transcripcional excluyó a DPF2 y DMAP1 de futuras validaciones y respaldó a YY1 como el candidato sensible principal. Un análisis posterior mediante inmunotransferencia indicó que los niveles de la proteína YY1 se redujeron en el grupo de ICC en comparación con la línea base Sham, mientras que la intervención con EA contrarrestó esta tendencia, aumentando la expresión de la proteína YY1 (Figura 6D y Figura 6E). Estos resultados experimentales indican que la EA regula al alza la expresión de YY1 dentro del SNT.
Para investigar los mecanismos reguladores upstream que controlan la expresión de YY1, se analizaron sus modificaciones histonas relacionadas y los factores de transcripción. Es importante señalar que estos hallazgos se basan exclusivamente en predicciones bioinformáticas computacionales derivadas del Cistrome Data Browser y no representan una validación experimental directa mediante ChIP-seq. La predicción epigenética destacó modificaciones en las histonas, incluyendo H3K27ac, H3K27me3 y H3K4me3, con altas puntuaciones de potencial regulador para el locus YY1 (Figura 6F). Al mismo tiempo, la puntuación de potencial regulador identificó factores de transcripción como CDK9, PRDM1 y ELL2 como reguladores upstream de YY1 (Figura 6G). Estas predicciones bioinformáticas describen las posibles redes epigenéticas y transcripcionales que controlan la expresión de YY1 en el NTS.
En resumen, los datos presentados demuestran que la intervención con EA mejora eficazmente la función cardíaca sistémica y atenúa la lesión miocárdica en ratas con ICC. Estos efectos cardioprotectores periféricos van acompañados centralmente por la restauración de la actividad de disparo neuronal y de la energía oscilatoria neural en el NST. Además, el cribado proteómico cuantitativo identificó 85 proteínas diferencialmente expresadas clave y destacó al factor de transcripción YY1 como un candidato objetivo altamente sensible. En conjunto, estos hallazgos sugieren que la eficacia terapéutica de la EA frente a la ICC está estrechamente asociada con la restauración de la función neural del NST y que la sobreexpresión de YY1 podría estar involucrada en este proceso neurobiológico central.
Disponibilidad de datos
Todos los datos generados y analizados para respaldar los hallazgos de este estudio se incluyen dentro del manuscrito y su Archivo Suplementario 1. Para cumplir con el requisito de accesibilidad pública de los datos, todos los datos brutos disponibles que sustentan esta investigación se han depositado en el repositorio público Zenodo y son libremente accesibles a través del siguiente enlace: https://doi.org/10.5281/zenodo.22030720. Datos adicionales de apoyo están disponibles bajo solicitud razonable a los autores correspondientes.

Figura 1: Diseño experimental, establecimiento del modelo de rata con insuficiencia cardíaca crónica e intervención con electroacupuntura. (A) Diagrama de flujo experimental general, que incluye la cronología y la asignación de grupos para las dos series experimentales independientes. (B) Registros representativos del electrocardiograma antes y después de la ligadura de la arteria coronaria descendente anterior (LAD), con flechas que indican el ascenso del segmento ST que confirma la isquemia miocárdica. (C) Análisis cuantitativo de la FEVI 4 semanas después de la cirugía para confirmar un modelado exitoso (réplicas biológicas n = 6, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham. (D) Intervención con EA en los puntos de acupuntura HT7 bilaterales. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: La electroacupuntura mejora la función cardíaca y atenúa la lesión miocárdica en ratas con insuficiencia cardíaca crónica. (A) Ecocardiogramas representativos en modo M junto con imágenes de tinción con hematoxilina y eosina y tricrómica de Masson de tejidos miocárdicos en los 4 grupos experimentales (barra de escala = 50 µm). (B) Análisis cuantitativo del FEVI entre los grupos (réplicas biológicas n = 6, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. (C) Análisis cuantitativo del FSVC entre los grupos (réplicas biológicas n = 6, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. (D) Análisis cuantitativo del CVF entre los grupos (réplicas biológicas n = 3, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ##p < 0,01 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. (E) Análisis cuantitativo de los niveles séricos de NT-proBNP entre los grupos (réplicas biológicas n = 6, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. (F) Análisis cuantitativo de los niveles séricos de cTnT entre los grupos (réplicas biológicas n = 6, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: La electroacupuntura restaura la actividad neuronal en el núcleo del tracto solitario en ratas con insuficiencia cardíaca crónica. (A) Imágenes representativas de inmunofluorescencia de la expresión de c-Fos en el NTS entre los grupos. Los núcleos se contratinjan con DAPI, y las células positivas para c-Fos se tiñen de verde. Las líneas discontinuas delimitan la región anatómica, y las flechas blancas indican neuronas representativas positivas para c-Fos (barra de escala = 30 µm). (B) Análisis cuantitativo del recuento de células positivas para c-Fos entre los grupos (réplicas biológicas n = 3, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. (C) Registros representativos de descargas de potenciales de acción mediante electrofisiología in vivo en el NTS entre los grupos. (D) Análisis cuantitativo de la frecuencia media de disparo neuronal entre los grupos (réplicas biológicas n = 3, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. (E) Espectrogramas locales representativos de potenciales de campo en 2D y topografías tridimensionales de densidad espectral de potencia que ilustran la energía oscilatoria neural dentro del NTS. (F) Matriz de correlación que evalúa las relaciones entre los fenotipos cardiovasculares periféricos y los parámetros de actividad neural central. Los círculos rojos y azules indican correlaciones positivas y negativas, respectivamente. **p < 0,01; ***p < 0,001. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Control de calidad y evaluación estadística multivariante de los perfiles proteómicos en el núcleo del tracto solitario. (A) Vista cuantitativa general de las proteínas identificadas en los 3 grupos experimentales (réplicas biológicas n = 6). (B) Gráfico de puntuaciones de análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales que ilustra la distribución espacial general y la separación entre los grupos. (C) Gráfico de puntuaciones de análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales ortogonales y la prueba de permutación correspondiente que valida la fiabilidad del modelo para la comparación entre Sham y CHF (200 permutaciones). (D) Gráfico de puntuaciones de análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales ortogonales y la prueba de permutación correspondiente que valida la fiabilidad del modelo para la comparación entre CHF y EA (200 permutaciones). (E) Mapa de calor de agrupamiento jerárquico de los coeficientes de correlación de Pearson que evalúa la reproducibilidad intra-grupo y la varianza inter-grupos en todas las muestras proteómicas. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5: Identificación y análisis de enriquecimiento funcional de las proteínas centrales diferencialmente expresadas moduladas por electroacupuntura en el núcleo del tracto solitario. (A) Gráficos de volcan que ilustran la distribución de proteínas reguladas al alza y reguladas a la baja en las comparaciones de Falso frente a ICC y ICC frente a EA. (B) Diagramas de Venn que representan el análisis de intersección para identificar las proteínas centrales reguladas a la baja y reguladas al alza tras la intervención con EA. (C) Mapa de calor de agrupamiento jerárquico de los perfiles de expresión de las proteínas centrales diferencialmente expresadas. (D) Gráficos de burbujas de GO que detallan los procesos biológicos, componentes celulares y funciones moleculares enriquecidos para el subconjunto de proteínas reguladas a la baja. (E) Diagramas de acordes y de Sankey de KEGG que representan las vías de señalización enriquecidas por las proteínas reguladas a la baja. (F) Gráficos de burbujas de GO que detallan los procesos biológicos, componentes celulares y funciones moleculares enriquecidos para el subconjunto de proteínas reguladas al alza. (G) Diagramas de acordes y de Sankey de KEGG que representan las vías de señalización enriquecidas por las proteínas reguladas al alza. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 6: La topología de la red, el perfil de expresión tisular y la validación molecular identifican a YY1 como un objetivo candidato asociado con la electroacupuntura. (A) Red de interacción proteína-proteína, diagrama de acordes y diagrama de Sankey de las proteínas centrales identificadas. (B) Perfil de expresión tisular humana de YY1 derivado de la base de datos GTEx, donde el recuadro rojo resalta los tejidos cerebrales. (C) Análisis cuantitativo de la expresión de ARNm de YY1, DPF2 y DMAP1 en el NTS entre los grupos (réplicas biológicas n = 6, media ± DE). **p < 0,01, ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF; ns, no significativo frente al grupo CHF. (D) Bandas representativas de inmunotransferencia de Western de YY1 y β-actina en el NTS entre los grupos. (E) Análisis cuantitativo de la expresión proteica de YY1 entre los grupos (réplicas biológicas n = 3, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; #p < 0,05 frente al grupo CHF. (F) Predicción bioinformática de modificaciones epigenéticas de histonas que regulan el locus de YY1 basada en puntajes de potencial regulador. (G) Predicción bioinformática de factores de transcripción upstream que regulan el locus de YY1 basada en puntajes de potencial regulador. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 7: Modelo propuesto de la asociación entre la electroacupuntura en HT7, la sobreexpresión de YY1, la recuperación de la actividad neuronal en el núcleo del tracto solitario y la mejora de la insuficiencia cardíaca crónica. (Izquierda) Estado patológico: En el modelo de ICC inducido por ligadura de la arteria coronaria descendente anterior (LAD), la actividad neuronal dentro del NTS se reduce, acompañada por la supresión del factor de transcripción YY1. Esta inhibición neural central se asocia con el remodelado cardíaco patológico, manifestado como disminución de la FEVI, aumento de la fibrosis miocárdica y elevación de los marcadores séricos de insuficiencia cardíaca. (Derecha) Tratamiento con EA: La intervención con EA en el punto de acupuntura HT7 aumenta la expresión de YY1 en el NTS y restaura la actividad de disparo neuronal. Esta neuromodulación central ejerce efectos cardioprotectores, atenuando el remodelado patológico y mejorando la función cardíaca sistémica. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura suplementaria 1: Evaluación de la función cardíaca de la cohorte proteómica y perfiles de expresión tisular humana de los genes centrales candidatos. (A) Análisis cuantitativo del FEVI y del FSIV en los diferentes grupos (réplicas biológicas n = 12, media ± DE). ***p < 0,001 frente al grupo Sham; ###p < 0,001 frente al grupo CHF. (B-J) Perfiles de expresión tisular humana de los genes centrales candidatos derivados de la base de datos GTEx, incluyendo COL3A1 (B), DMAP1 (C), DPF2 (D), FMOD (E), MYH11 (F), E2F2 (G), LUM (H), DCN (I) y COL14A1 (J).Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 1: Matriz completa de identificación y cuantificación del proteoma global en el núcleo del tracto solitario. Esta tabla presenta el conjunto completo de datos de proteómica cuantitativa en todas las cohortes experimentales. Las columnas importantes incluyen ID de proteína (número de acceso de UniProt), Gen (símbolo del gen), Primera.descripción.de.proteína (anotación funcional) y los valores de intensidad proteica normalizados para cada réplica biológica en los grupos Sham, IC y AE (n = 6 por grupo).Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 2: Puntuaciones de importancia variable en la proyección OPLS-DA para proteínas en la comparación entre Sham y CHF. Esta tabla enumera las características que distinguen los grupos Sham y CHF según el modelo OPLS-DA. Las columnas principales incluyen característica (que representa el identificador de la proteína/gen específica) y el valor VIP (Importancia Variable en la Proyección), que indica la contribución de cada característica a la separación entre grupos (umbral VIP > 1,0).Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 3: Puntuaciones de importancia de variables en proyección (VIP) del OPLS-DA para proteínas en la comparación entre CHF y EA. Esta tabla enumera las características que diferencian los grupos CHF y EA según el modelo OPLS-DA. De forma similar a la Tabla S2, incluye la columna de características y el valor VIP correspondiente, resaltando las características más sensibles a la intervención EA.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 4: Lista detallada de las 85 proteínas centrales con expresión diferencial moduladas por electroacupuntura. Esta tabla proporciona la intersección de proteínas que se alteraron significativamente por la ICC y luego se invirtieron mediante la intervención de EA. Las columnas importantes incluyen Protein_ID, Gene, log2FC (cambio de la razón log2 que indica variación en la expresión), P_value para la significancia estadística (umbral p < 0,05) y VIP_value que evalúa la contribución al modelo.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 5: Análisis de enriquecimiento de la ontología genética del subconjunto de proteínas centrales reguladas a la baja. Esta tabla muestra la anotación funcional de la ontología genética (GO) para las 58 proteínas reguladas a la baja por EA. Las columnas importantes incluyen ONTOLOGÍA (categorizada en Proceso Biológico [BP], Componente Celular [CC] y Función Molecular [MF]), Descripción funcional, p.adjust (valor p ajustado para pruebas múltiples) y geneID, que corresponde a los genes específicos enriquecidos en cada término.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 6: Análisis de enriquecimiento de vías del Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes para el subconjunto de proteínas centrales reguladas a la baja. Esta tabla muestra las cascadas de señalización enriquecidas para las 58 proteínas reguladas a la baja. Las columnas clave incluyen el Término de la vía, el valor de p ajustado que indica la significancia estadística del enriquecimiento y los genes específicos que participan en cada vía.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 7: Análisis de enriquecimiento de la Ontología Genética del subconjunto de proteínas centrales reguladas positivamente. Esta tabla muestra la anotación funcional de la Ontología Genética (GO) para las 27 proteínas reguladas positivamente por EA. El formato y las definiciones de las columnas (ONTOLOGÍA [BP, CC, MF], Descripción, p.adjust, geneID) son idénticos a los detallados en la Tabla S5.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 8: Análisis de enriquecimiento de vías del Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes para el subconjunto de proteínas centrales reguladas hacia arriba. Esta tabla muestra las cascadas de señalización enriquecidas para las 27 proteínas reguladas hacia arriba. El formato y las definiciones de las columnas (Término, valor p ajustado, Genes) son idénticos a los detallados en la Tabla S6.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 9: Puntuaciones de conectividad topológica de las 18 proteínas centrales derivadas de la red de interacción proteína-proteína. Esta tabla resume los parámetros topológicos de red utilizados para identificar los genes centrales principales. Las columnas clave incluyen el nombre del gen y métricas centrales de la red, como Grado, Centralidad de Intermediación y Centralidad de Cercanía, que cuantifican la importancia relativa y la conectividad de cada nodo dentro de la red biológica.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Tabla suplementaria 10: Análisis de enriquecimiento de vías del Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes de las 18 proteínas centrales de la red. Esta tabla presenta las vías de señalización específicas enriquecidas exclusivamente por las 18 proteínas centrales identificadas. Las columnas clave incluyen el Término de la vía, el valor p ajustado para la significancia y los respectivos Genes responsables del enriquecimiento funcional.Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo suplementario 1: Secuencias de comandos de R utilizadas para el análisis y visualización de datos e imágenes no recortadas de inmunotransferencias tipo Western. El archivo suplementario contiene las secuencias de comandos de R utilizadas para el análisis de correlación de Pearson, la generación de gráficos de doble volcán e identificación de proteínas revertidas por EA, el análisis de enriquecimiento de Ontología Genética (GO), la generación de mapas de calor mediante agrupamiento jerárquico, la visualización del enriquecimiento en la Enciclopedia de Kioto de Genes y Genomas (KEGG), el análisis discriminante ortogonal de mínimos cuadrados parciales (OPLS-DA) y pruebas de permutación, el análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales (PLS-DA), la generación de mapas de calor de correlación de muestras proteómicas y el análisis de diagramas de Venn.Haga clic aquí para descargar este archivo.